FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8383, 579 aa
1>>>pF1KB8383 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0663+/-0.00214; mu= 11.4589+/- 0.127
mean_var=266.6337+/-50.629, 0's: 0 Z-trim(103.8): 992 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.078545
statistics sampled from 6506 (7577) to 6506 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7194.1 ZNF248 gene_id:57209|Hs108|chr10 ( 579) 4079 477.1 2.6e-134
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1892 229.5 1.2e-59
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1883 228.5 2.5e-59
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CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1875 227.6 4.7e-59
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1875 227.6 4.8e-59
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CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1547 190.2 6.2e-48
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1547 190.2 6.3e-48
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CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1370 170.1 6.5e-42
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1359 169.1 1.9e-41
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1318 164.6 5.5e-40
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1314 163.8 5.6e-40
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1294 161.8 3.2e-39
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1290 161.2 4.1e-39
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1289 161.2 4.6e-39
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1289 161.2 4.7e-39
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1287 160.8 4.7e-39
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1289 161.2 4.8e-39
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1285 160.4 5e-39
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1285 160.6 5.8e-39
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1282 160.1 6.4e-39
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1280 160.1 9e-39
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1266 158.5 2.6e-38
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 1265 158.5 3.1e-38
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1261 157.8 3.6e-38
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1261 157.9 3.6e-38
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1262 158.1 3.7e-38
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1260 157.8 4.3e-38
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1248 156.5 1.1e-37
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1248 156.5 1.1e-37
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1244 155.8 1.2e-37
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1240 155.6 2.2e-37
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1240 155.7 2.3e-37
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1240 155.8 2.5e-37
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1236 155.0 2.5e-37
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1240 155.8 2.6e-37
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1239 155.6 2.6e-37
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1236 155.0 2.6e-37
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1236 155.1 2.7e-37
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1236 155.1 2.7e-37
CCDS74351.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 635) 1234 154.8 3e-37
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1233 154.7 3.3e-37
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1233 154.7 3.4e-37
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1233 154.8 3.8e-37
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1233 154.8 3.8e-37
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1232 154.6 3.8e-37
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1232 154.7 3.8e-37
>>CCDS7194.1 ZNF248 gene_id:57209|Hs108|chr10 (579 aa)
initn: 4079 init1: 4079 opt: 4079 Z-score: 2524.8 bits: 477.1 E(32554): 2.6e-134
Smith-Waterman score: 4079; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGYCITKPEVIFKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGYCITKPEVIFKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNKTVSVENGDRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNKTVSVENGDRGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KTFNLGTDPVSLRNYPYKICDSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFNVCEKLLLDIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KTFNLGTDPVSLRNYPYKICDSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFNVCEKLLLDIRH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQPSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFFTNKRSQIGET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQPSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFFTNKRSQIGET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VCKYNECGRTFIESLKLNISQRPHLEMEPYGCSICGKSFCMNLRFGHQRALTKDNPYEYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VCKYNECGRTFIESLKLNISQRPHLEMEPYGCSICGKSFCMNLRFGHQRALTKDNPYEYN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EYGEIFCDNSAFIIHQGAYTRKILREYKVSDKTWEKSALLKHQIVHMGGKSYDYNENGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EYGEIFCDNSAFIIHQGAYTRKILREYKVSDKTWEKSALLKHQIVHMGGKSYDYNENGSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTECGKAFCQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 FSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTECGKAFCQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 VHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQR
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB8 THTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 THTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
550 560 570
>>CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 (778 aa)
initn: 2363 init1: 1246 opt: 1892 Z-score: 1184.2 bits: 229.5 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 1946; 50.2% identity (71.3% similar) in 603 aa overlap (3-571:7-604)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGYCITKPEV
: : .:::::: : :::::: :::.:. :::::.::::::::::::: ::::
CCDS71 MNKVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCAHKPEV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 IFKIEQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNKTVSVENG
::..::::::: ::. :::: :: : .: . : ::::.. :.::..: ::. .. :.:
CCDS71 IFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEV-WTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DRGSKTFNLGTDPVSLRNYPYKIC--DSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFNVCEKL
. . ::. .. :.. .: :: :.....: :.::: : :: ::::.: ::
CCDS71 NVIGIPFNMDVSSFPSRKM---FCQYDSRGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LLDIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQ----PSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFF
::.:.:.. ::. . ..::....... : .. ..:::: . . ..:.:
CCDS71 LLNIKHDETHTREKN-EVLKNRNTLSHRENTLQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB8 TNKRSQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQRP-----HLE-------------------
: :: . :. : ::: :::: .: .: . : : : :
CCDS71 TRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQIPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 --MEPYGCSICGKSFCMNLRFGH-QRALTKDNPYEYNEYGEIFCDNSAFIIHQGAYT-RK
.. : :. :..: .: ... :.. .. .: :: :. : ..: . :: ..: .:
CCDS71 VPVKHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 ILREYKVSDKTWEKSALLKHQIVHMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFEC
.. . . :::: : ::: : : : .. :: :. ::.:: :: .:.::::: ..:
CCDS71 HFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQC
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390 400 410 420 430 440
pF1KB8 GECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCG
. :::::..::.::.:::::::.::::: ::::.::.. ::: ::::::::::.:: .::
CCDS71 NACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECYECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECG
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450 460 470 480 490 500
pF1KB8 KTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFC
:.:: ::.::.::::: :.::::::::::.: :.:.:: :: ::: ::. : ::::.::
CCDS71 KSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGKTFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFC
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 VKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSV
.::.: .::::::::::. : :::: : .::.:..: :::::::::::. ::: : ..:
CCDS71 LKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSY
540 550 560 570 580 590
570
pF1KB8 LTKHQRIHTRVKALSTS
::::.: ::
CCDS71 LTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVH
600 610 620 630 640 650
>--
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Smith-Waterman score: 925; 71.8% identity (83.3% similar) in 174 aa overlap (376-549:605-778)
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGE
::: .::.:::::: .::.:::::: : ::
CCDS71 HTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGE
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 KPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYE
:::::.:::::::.: : :::::: ::::.:..:::.:::::.: :.: ::::::::
CCDS71 KPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHERKHTGEKPYE
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 CNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNEC
:: ::::: :.:.::::.:.::::: :::::: : ::.: :::.:::::::.:: :
CCDS71 CNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHTGEKPYECNTC
700 710 720 730 740 750
530 540 550 560 570
pF1KB8 GKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
::: .:: : ::::: ::::::
CCDS71 RKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
760 770
>>CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 (811 aa)
initn: 2249 init1: 1176 opt: 1883 Z-score: 1178.5 bits: 228.5 E(32554): 2.5e-59
Smith-Waterman score: 1942; 50.1% identity (70.5% similar) in 601 aa overlap (3-571:7-604)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGYCITKPEV
::::.:::::: : :::::: :::.:. :::::.:::::::::::::. ::::
CCDS44 MNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 IFKIEQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNKTVSVENG
::...:::::: :. :::: :: : .: . : ::::.. :.::..: ::. .. :.:
CCDS44 IFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEV-WTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DRGSKTFNLGTDPVSLRNYPYKICDSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFNVCEKLLL
: . ::. .. :.. . :::: :.....: :.::: : :: ::::.: ::::
CCDS44 DVIGIPFNVDVSSFPSRKM-FCQCDSCGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 DIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQ----PSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFFTN
.:.:.. ::. . ..::....:.. : .. ..:::: . . ..:.: :.
CCDS44 NIKHDETHTQEKN-EVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLEKAVFNTQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB8 KRSQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQ-------------------------RPH-LE
:: . :. : ::: :::. .: .: . : .:: .
CCDS44 KRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 MEPYGCSICGKSFCMNLRFGH-QRALTKDNPYEYNEYGEIFCDNSAFIIHQGAYT-RKIL
:. : :. :..: .: ..: :.. .. .: :: :. : ..: . :: ..: .: .
CCDS44 MKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPF
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
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::::: .::.::.::::::: ::::: ::::.: :: ::::::::::.:: .:::.
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: :::::.::: : :.: ::::::::.: :.: :: :: ::: ::. : ::::.::.:
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:.: ::::::::.::. : :::: : .::.:..: :::::::::::. ::: : ..: ::
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:: ::: : :.:.::::.:.::::: :::::: : ::.: :::.:::::::.:: :
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pF1KB8 HMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGE
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CCDS31 KPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYE
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pF1KB8 CNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNEC
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CCDS31 CNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTC
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pF1KB8 GKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
::: .:: : ::: : ::
CCDS31 RKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ
760 770 780 790 800 810
>>CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 (817 aa)
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pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGY
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CCDS60 MANATRRGSGVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGY
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CCDS60 CVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFP--VWTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNE
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pF1KB8 TVSVENGDRGSKTFNLGTDPVSLRNYPYKICDSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFN
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CCDS60 MLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKM-FCQCDSCGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFN
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pF1KB8 VCEKLLLDIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQ----PSFGQSFEYSKNGQGFHD
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CCDS60 ACGKLLLNIKHDETHTQEKN-EVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLE
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pF1KB8 EAAFFTNKRSQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQ------------------------
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CCDS60 KAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTL
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.:: . :. : :. :..: .: ..: :.. .. .: :: :. : ..: . :: .
CCDS60 SKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRV
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CCDS60 KPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFE
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pF1KB8 CKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNEC
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CCDS60 CLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYEC
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pF1KB8 GKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTF
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CCDS60 GKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIF
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pF1KB8 SQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
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CCDS60 YNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKS
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350 360 370 380 390 400
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CCDS48 KSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTL
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570
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CCDS48 RSHTGDKNL
580
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CCDS55 SQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTG
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CCDS55 EKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFY
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CCDS55 KGIKCTTSSLIYQRIHTSEKP-QCSEHGKASDEKPSPTKHWRTHTKENIYECSKCGKSFR
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CCDS55 GKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKST
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CCDS55 LIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKH
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CCDS55 QRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSH
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CCDS55 TGDKNL
570
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CCDS43 SSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLI
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pF1KB8 QLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTECGKAFCQKPHLTNHQR
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pF1KB8 THTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALTVHQRTHTG
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CCDS43 VHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTG
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pF1KB8 EKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPY
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CCDS43 EKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPY
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pF1KB8 ECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
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CCDS43 QCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
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10 20 30 40
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNL
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CCDS54 MVPAETSSSGLLEEQKMMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHL
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pF1KB8 VSVGYCITKPEVIFKIEQGEEPWILEKGFPSQCHPE---------RK-------------
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CCDS54 VSMGYPVSKPDVISKLEQGEEPWIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGT
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pF1KB8 --------------------WKV---DDVLESSQENEDDHFWELLFHNNKTVSVENGDRG
:: : :. ::.: : .. : :.:::. .: .
CCDS54 VSFHHKILKGVTRDGSLCSILKVCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKY
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pF1KB8 S---KTFN--LGTDPVSLRNYPYKICDSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFNVCEKL
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CCDS54 NPLGKIFQECIETD-ISIQRF-HKY-DAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQ-------
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pF1KB8 LLDIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQPSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFFTNKR
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CCDS54 -------SFGGGKSSSQSEPNSNLEKIHNGVI-P-----FDDNQCGNVFRNTQSLIQYQN
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pF1KB8 SQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQRPHLEMEPYGCSICGKSFCMNLRFG-HQRALTK
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CCDS54 VETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQRTHTG
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CCDS54 EKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPY
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pF1KB8 DYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTE
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CCDS54 ECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQ
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CCDS54 CEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKA
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CCDS54 FCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQK
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pF1KB8 SALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
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CCDS54 SDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
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579 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:25:54 2016 done: Fri Nov 4 12:25:54 2016
Total Scan time: 2.210 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]