Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8374
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8374, 628 aa
1>>>pF1KB8374 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6849+/-0.00105; mu= 5.8004+/- 0.064
mean_var=202.3269+/-40.584, 0's: 0 Z-trim(111.5): 41 B-trim: 22 in 2/49
Lambda= 0.090167
statistics sampled from 12418 (12451) to 12418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.382), width: 16
Scan time: 3.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47645.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 ( 628) 4224 562.2 7.2e-160
CCDS64718.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 ( 625) 3860 514.9 1.3e-145
CCDS5644.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 ( 645) 3764 502.4 7.5e-142
CCDS47646.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 ( 608) 3438 460.0 4.2e-129
CCDS82533.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 ( 632) 3370 451.2 2e-126
CCDS64719.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 ( 602) 3212 430.6 2.9e-120
CCDS46450.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 ( 638) 3173 425.5 1e-118
CCDS63054.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 ( 630) 3082 413.7 3.8e-115
CCDS63057.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 ( 611) 2785 375.0 1.6e-103
CCDS63056.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 ( 612) 2773 373.5 4.6e-103
>>CCDS47645.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 (628 aa)
initn: 4224 init1: 4224 opt: 4224 Z-score: 2983.7 bits: 562.2 E(32554): 7.2e-160
Smith-Waterman score: 4224; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQLQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVGQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVGQDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIFFDYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIFFDYSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNEDAPHEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNEDAPHEP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSHRRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSHRRTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMELVYNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMELVYNKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVDGMGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVDGMGRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGELAVPHNDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGELAVPHNDE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB8 WTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
610 620
>>CCDS64718.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 (625 aa)
initn: 3878 init1: 3416 opt: 3860 Z-score: 2727.8 bits: 514.9 E(32554): 1.3e-145
Smith-Waterman score: 3996; 94.3% identity (94.3% similar) in 645 aa overlap (1-628:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB8 ALLQSIGISPEPPLV-----------------PTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPL
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ALLQSIGISPEPPLVQPLHFLTWDTCYFHYLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 TRTLQWDTDPSVLQLQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSE
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TR--------------------RRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSE
130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EDEEDEEMVESKVGQDSELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EDEEDEEMVESKVGQDSELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRV
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 IERALAEDSDIFFDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IERALAEDSDIFFDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 ELMVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ELMVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGT
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 YSGQIVLWDNRSHRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YSGQIVLWDNRSHRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 DMLSTPQESMELVYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DMLSTPQESMELVYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVF
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 EGHQGPVTGINCHMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EGHQGPVTGINCHMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMW
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 SPVHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPVHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEG
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620
pF1KB8 RIWVYDVGELAVPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RIWVYDVGELAVPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
590 600 610 620
>>CCDS5644.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 (645 aa)
initn: 3758 init1: 3758 opt: 3764 Z-score: 2660.1 bits: 502.4 E(32554): 7.5e-142
Smith-Waterman score: 4180; 97.4% identity (97.4% similar) in 645 aa overlap (1-628:1-645)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB8 ALLQSIGISPEPPLV-----------------PTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPL
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ALLQSIGISPEPPLVQPLHFLTWDTCYFHYLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 TRTLQWDTDPSVLQLQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TRTLQWDTDPSVLQLQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EDEEDEEMVESKVGQDSELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EDEEDEEMVESKVGQDSELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 IERALAEDSDIFFDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IERALAEDSDIFFDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 ELMVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELMVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 YSGQIVLWDNRSHRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YSGQIVLWDNRSHRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 DMLSTPQESMELVYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DMLSTPQESMELVYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVF
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 EGHQGPVTGINCHMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EGHQGPVTGINCHMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMW
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 SPVHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SPVHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEG
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620
pF1KB8 RIWVYDVGELAVPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RIWVYDVGELAVPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
610 620 630 640
>>CCDS47646.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 (608 aa)
initn: 4076 init1: 3416 opt: 3438 Z-score: 2431.3 bits: 460.0 E(32554): 4.2e-129
Smith-Waterman score: 4040; 96.8% identity (96.8% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-608)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQLQS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTR---------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVGQDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 -----RRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVGQDS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIFFDYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIFFDYSG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNEDAPHEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNEDAPHEP
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSHRRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSHRRTP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMELVYNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMELVYNKS
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVDGMGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVDGMGRL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGELAVPHNDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGELAVPHNDE
530 540 550 560 570 580
610 620
pF1KB8 WTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
590 600
>>CCDS82533.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 (632 aa)
initn: 3193 init1: 2404 opt: 3370 Z-score: 2383.2 bits: 451.2 E(32554): 2e-126
Smith-Waterman score: 3370; 77.3% identity (93.2% similar) in 634 aa overlap (1-628:1-632)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKE---PVQDDSDLDRKRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::: :::..:::..:::
CCDS82 MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETD--QKKEAVAPVQEESDLEKKRR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ETEALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQ
:.::::::.:..:: :.:: :::::::::::::::::::::: . .:::.:::::::::
CCDS82 EAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRTLHWDTDPSVLQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVG
:.:::.::: :::..:.::::: :::.:.:.::::::. .. .:..:::...: :
CCDS82 LHSDSDLGRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEDDDVVAPKPP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QDSELENQDKKQEVKE--APPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIF
. : :. ::.: .. :::.::::::::::::::::: :::.. :..::::.:. .::
CCDS82 IEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNED
::::::.::.:.:..::::.::.::::.::.:::::::.:.::: :::::.:::::::::
CCDS82 FDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNED
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 APHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRS
:::::::::::::::.:::::::::::::.:::. ::.::::::::::::::::::::::
CCDS82 APHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 HRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMEL
..:::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::.::::::::: ::.::::
CCDS82 NKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMEL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 VYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINC
:...:: ::::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::.:::.:
CCDS82 VHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 HMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVD
: ::: .:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS82 HAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPTHPALFACVD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 GMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGE-LA
::::::::::::::::::::...:: :::::::...:.:.:::::::.: .::::: .:
CCDS82 GMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIA
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KB8 VPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
::.::::.::.:::.:: :::::.:::..... :
CCDS82 VPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA
600 610 620 630
>>CCDS64719.1 DYNC1I1 gene_id:1780|Hs108|chr7 (602 aa)
initn: 3846 init1: 3186 opt: 3212 Z-score: 2272.5 bits: 430.6 E(32554): 2.9e-120
Smith-Waterman score: 3814; 95.1% identity (95.7% similar) in 607 aa overlap (1-603:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKEPVQDDSDLDRKRRETE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 ALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQLQS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTR---------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVGQDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 -----RRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVGQDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ELENQDKKQEVKEAPPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIFFDYSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNEDAPHEP
230 240 250 260 270 280
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSHRRTP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMELVYNKS
350 360 370 380 390 400
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pF1KB8 KPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVG
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pF1KB8 PIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVDGMGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVDGMGRL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KB8 DLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGE-LAV-P--
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::. :
CCDS64 DLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGEGLAMLPGW
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600 610 620
pF1KB8 HNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
.. ::.
CCDS64 SQNSWTQAILLCWPPKVLGLQT
590 600
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10 20 30 40 50
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::: :::..:::..:::
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10 20 30 40 50
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pF1KB8 ETEALLQSIGISPEPPLV------PTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDT
:.::::::.:..:: :.: : :::::::::::::::::::::: . .:::.:::
CCDS46 EAEALLQSMGLTPESPIVFSEYWVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRTLHWDT
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 DPSVLQLQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEM
:::::::.:::.::: :::..:.::::: :::.:.:.::::::. .. .:..:::...
CCDS46 DPSVLQLHSDSDLGRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEDDDV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 VESKVGQDSELENQDKKQEVKE--APPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALA
: : . : :. ::.: .. :::.::::::::::::::::: :::.. :..::::.
CCDS46 VAPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EDSDIFFDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVAS
:. .::::::::.::.:.:..::::.::.::::.::.:::::::.:.::: :::::.:::
CCDS46 EQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVAS
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 YNNNEDAPHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIV
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::. ::.::::::::::::::::
CCDS46 YNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIV
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pF1KB8 LWDNRSHRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTP
::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::.::::::::: :
CCDS46 LWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 QESMELVYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGP
:.:::::...:: ::::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::
CCDS46 QDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VTGINCHMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPA
.:::.:: ::: .:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::
CCDS46 ITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPTHPA
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pF1KB8 LFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYD
::::::::::::::::::::::::::...:: :::::::...:.:.:::::::.: .::
CCDS46 LFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620
pF1KB8 VGE-LAVPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
::: .:::.::::.::.:::.:: :::::.:::..... :
CCDS46 VGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA
600 610 620 630
>>CCDS63054.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 (630 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKE---PVQDDSDLDRKRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::: :::..:::..:::
CCDS63 MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETD--QKKEAVAPVQEESDLEKKRR
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB8 ETEALLQSIGISPEPP------------------LVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGD
:.::::::.:..:: : ::: ::::::::::::::::::::::
CCDS63 EAEALLQSMGLTPESPIAEQPLRVVTADTCLFHYLVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGD
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 LGPLTRTLQWDTDPSVLQLQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLAT
. .: : :::..:.::::: :::.:.:.::::::. .
CCDS63 GAVGSR--------------------RGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMA
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160 170 180 190 200 210
pF1KB8 HQSEEDEEDEEMVESKVGQDSELENQDKKQEVKE--APPRELTEEEKQQILHSEEFLIFF
. .:..:::...: : . : :. ::.: .. :::.::::::::::::::::: ::
CCDS63 QPKEDEEEDDDVVAPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFF
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 DRTIRVIERALAEDSDIFFDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMD
:.. :..::::.:. .::::::::.::.:.:..::::.::.::::.::.:::::::.:.:
CCDS63 DHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLD
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 WSLQYPELMVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPN
:: :::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::. ::.::::
CCDS63 WSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPN
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pF1KB8 LVVGGTYSGQIVLWDNRSHRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGK
::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::
CCDS63 LVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGK
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 MCSWSLDMLSTPQESMELVYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKA
.::::::::: ::.:::::...:: ::::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS63 ICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKA
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 GIGEVFEGHQGPVTGINCHMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADY
::.:.:::::::.:::.:: ::: .:::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS63 GISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNADY
460 470 480 490 500 510
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pF1KB8 VYDVMWSPVHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::...:: :::::::...:.:.:
CCDS63 VYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIA
520 530 540 550 560 570
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pF1KB8 VGDSEGRIWVYDVGE-LAVPHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
::::::.: .::::: .:::.::::.::.:::.:: :::::.:::..... :
CCDS63 VGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA
580 590 600 610 620 630
>>CCDS63057.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 (611 aa)
initn: 3139 init1: 2560 opt: 2785 Z-score: 1972.2 bits: 375.0 E(32554): 1.6e-103
Smith-Waterman score: 3214; 74.7% identity (90.2% similar) in 633 aa overlap (1-628:1-611)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKE---PVQDDSDLDRKRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::: :::..:::..:::
CCDS63 MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETD--QKKEAVAPVQEESDLEKKRR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ETEALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQ
:.::::::.:..:: :.:: :::::::::::::::::::::: . .:
CCDS63 EAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSR------------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVG
: :::..:.::::: :::.:.:.::::::. .. .:..:::...: :
CCDS63 --------RGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEDDDVVAPKPP
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QDSELENQDKKQEVKE--APPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIF
. : :. ::.: .. :::.::::::::::::::::: :::.. :..::::.:. .::
CCDS63 IEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNED
::::::.::.:.:..::::.::.::::.::.:::::::.:.::: :::::.:::::::::
CCDS63 FDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNED
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 APHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRS
:::::::::::::::.:::::::::::::.:::. ::.::::::::::::::::::::::
CCDS63 APHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 HRRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLITVSTDGKMCSWSLDMLSTPQESMEL
..:::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::.::::::::: ::.::::
CCDS63 NKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMEL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 VYNKSKPVAVTGMAFPTGDVNNFVVGSEEGTVYTACRHGSKAGIGEVFEGHQGPVTGINC
:...:: ::::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::.:::.:
CCDS63 VHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 HMAVGPIDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKHNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPVHPALFACVD
: ::: .:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS63 HAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNADYVYDVMWSPTHPALFACVD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 GMGRLDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNRVRWAQAGKEVAVGDSEGRIWVYDVGELAV
::::::::::::::::::::...:: :::::::...:.:.:::::::.: .:::::.::
CCDS63 GMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEIAV
520 530 540 550 560 570
600 610 620
pF1KB8 PHNDEWTRFARTLVEIRANRADSEEEGTVELSA
:.::::.::.:::.:: :::::.:::..... :
CCDS63 PRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA
580 590 600 610
>>CCDS63056.1 DYNC1I2 gene_id:1781|Hs108|chr2 (612 aa)
initn: 3067 init1: 2404 opt: 2773 Z-score: 1963.7 bits: 373.5 E(32554): 4.6e-103
Smith-Waterman score: 3202; 74.6% identity (90.1% similar) in 634 aa overlap (1-628:1-612)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSDKSDLKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKEADMQQKKE---PVQDDSDLDRKRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::: :::..:::..:::
CCDS63 MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETD--QKKEAVAPVQEESDLEKKRR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ETEALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDLGPLTRTLQWDTDPSVLQ
:.::::::.:..:: :.:: :::::::::::::::::::::: . .:
CCDS63 EAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSR------------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LQSDSELGRRLHKLGVSKVTQVDFLPREVVSYSKETQTPLATHQSEEDEEDEEMVESKVG
: :::..:.::::: :::.:.:.::::::. .. .:..:::...: :
CCDS63 --------RGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEDDDVVAPKPP
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QDSELENQDKKQEVKE--APPRELTEEEKQQILHSEEFLIFFDRTIRVIERALAEDSDIF
. : :. ::.: .. :::.::::::::::::::::: :::.. :..::::.:. .::
CCDS63 IEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FDYSGRELEEKDGDVQAGANLSFNRQFYDEHWSKHRVVTCMDWSLQYPELMVASYNNNED
::::::.::.:.:..::::.::.::::.::.:::::::.:.::: :::::.:::::::::
CCDS63 FDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNED
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 APHEPDGVALVWNMKFKKTTPEYVFHCQSSVMSVCFARFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRS
:::::::::::::::.:::::::::::::.:::. ::.::::::::::::::::::::::
CCDS63 APHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRS
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360 370 380 390 400 410
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580 590 600 610
628 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]