Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8365
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8365, 472 aa
1>>>pF1KB8365 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3622+/-0.00102; mu= -2.8815+/- 0.061
mean_var=296.4506+/-61.044, 0's: 0 Z-trim(114.5): 71 B-trim: 153 in 1/51
Lambda= 0.074490
statistics sampled from 14979 (15048) to 14979 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.462), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9665.1 FOXA1 gene_id:3169|Hs108|chr14 ( 472) 3216 358.8 7.2e-99
CCDS13147.1 FOXA2 gene_id:3170|Hs108|chr20 ( 457) 1249 147.4 3e-35
CCDS46585.1 FOXA2 gene_id:3170|Hs108|chr20 ( 463) 1249 147.4 3.1e-35
CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19 ( 350) 773 96.1 6.2e-20
CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 ( 465) 623 80.1 5.5e-15
CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 ( 553) 622 80.1 6.7e-15
CCDS35045.1 FOXB2 gene_id:442425|Hs108|chr9 ( 432) 613 79.0 1.1e-14
CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 ( 495) 606 78.3 2e-14
CCDS32255.1 FOXB1 gene_id:27023|Hs108|chr15 ( 325) 558 73.0 5.3e-13
CCDS10958.1 FOXC2 gene_id:2303|Hs108|chr16 ( 501) 554 72.7 9.9e-13
CCDS550.1 FOXE3 gene_id:2301|Hs108|chr1 ( 319) 535 70.5 2.9e-12
CCDS10959.1 FOXL1 gene_id:2300|Hs108|chr16 ( 345) 515 68.4 1.4e-11
CCDS77433.1 FOXI3 gene_id:344167|Hs108|chr2 ( 420) 517 68.7 1.4e-11
CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 ( 376) 514 68.3 1.6e-11
CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 ( 373) 511 68.0 1.9e-11
CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20 ( 330) 491 65.8 7.8e-11
>>CCDS9665.1 FOXA1 gene_id:3169|Hs108|chr14 (472 aa)
initn: 3216 init1: 3216 opt: 3216 Z-score: 1888.5 bits: 358.8 E(32554): 7.2e-99
Smith-Waterman score: 3216; 100.0% identity (100.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLGTVKMEGHETSDWNSYYADTQEAYSSVPVSNMNSGLGSMNSMNTYMTMNTMTTSGNMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MLGTVKMEGHETSDWNSYYADTQEAYSSVPVSNMNSGLGSMNSMNTYMTMNTMTTSGNMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PASFNMSYANPGLGAGLSPGAVAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPSGMGAMGAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 PASFNMSYANPGLGAGLSPGAVAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPSGMGAMGAQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 AASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 MAIQQAPSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MAIQQAPSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GSYWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GSYWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGASELKTPASSTAPPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 SNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGASELKTPASSTAPPI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SSGPGALASVPASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMSSSEQQHKLDFKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 SSGPGALASVPASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMSSSEQQHKLDFKAY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB8 EQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
430 440 450 460 470
>>CCDS13147.1 FOXA2 gene_id:3170|Hs108|chr20 (457 aa)
initn: 1245 init1: 802 opt: 1249 Z-score: 746.2 bits: 147.4 E(32554): 3e-35
Smith-Waterman score: 1597; 55.9% identity (73.9% similar) in 499 aa overlap (1-472:1-457)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLGTVKMEGHETSDWNSYYADTQEAYSSVPVSNMNSGLGSMNSMNTYMTMNTM---TTSG
:::.::::::: :::.::::. :.:::: ::::.::: ::.:::::.:.. . ::
CCDS13 MLGAVKMEGHEPSDWSSYYAEP-EGYSSV--SNMNAGLG-MNGMNTYMSMSAAAMGSGSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 NMTPASFNMS-YANPGLG---AGLSPGA--VAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPS
::. .:.::: :.. :.. ::.:::: .::: :::::: :::..:: ::::
CCDS13 NMSAGSMNMSSYVGAGMSPSLAGMSPGAGAMAGM-GGSAGA------AGVAGMGPHLSPS
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GMGAMGAQQAASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKP
.. .:.: :..:.::.::: :: :::: :. ..:.:.: : ::..::: ::::
CCDS13 -LSPLGGQAAGAMGGLAPYAN-MNS-MSPM-YGQAGLSRAR-----DPKTYRRSYTHAKP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 PYSYISLITMAIQQAPSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKV
::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::
CCDS13 PYSYISLITMAIQQSPNKMLTLSEIYQWIMDLFPFYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFLKV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ARSPDKPGKGSYWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAG-GGGGSGSGGSGAKGG
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: . ..:..::: ..: :.
CCDS13 PRSPDKPGKGSFWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQLALKEAAGAAGSGKKAAAGA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PESRKDPSGASNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGASELK
:. . . :..:....: :. .: .::: .:. :: .:::
CCDS13 QASQAQLGEAAGPASETP------------AGTESPHSSASP-CQEHK----RGGLGELK
290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KB8 -TPASSTAPP-ISSGPG----ALASV--PASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSI
:::.. .:: . .:: : : . : :: :: : . ::: . ::.:::::::
CCDS13 GTPAAALSPPEPAPSPGQQQQAAAHLLGPPHHP--GLPP---EAHLKPEHHYAFNHPFSI
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450
pF1KB8 NNLMSSSEQQH---------KLDFKAYEQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPS
:::::: .:.: :.:.:::::...: ::: .:.:: .: .. : :
CCDS13 NNLMSSEQQHHHSHHHHQPHKMDLKAYEQVMHYPGYGSPMPGSLAMGPVTNKTGLDASPL
380 390 400 410 420 430
460 470
pF1KB8 ALEPAYYQGVYSRPVLNTS
: . .:::::::::..:.:
CCDS13 AADTSYYQGVYSRPIMNSS
440 450
>>CCDS46585.1 FOXA2 gene_id:3170|Hs108|chr20 (463 aa)
initn: 1245 init1: 802 opt: 1249 Z-score: 746.2 bits: 147.4 E(32554): 3.1e-35
Smith-Waterman score: 1597; 55.9% identity (73.9% similar) in 499 aa overlap (1-472:7-463)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLGTVKMEGHETSDWNSYYADTQEAYSSVPVSNMNSGLGSMNSMNTYMTMNTM-
:::.::::::: :::.::::. :.:::: ::::.::: ::.:::::.:..
CCDS46 MHSASSMLGAVKMEGHEPSDWSSYYAEP-EGYSSV--SNMNAGLG-MNGMNTYMSMSAAA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB8 --TTSGNMTPASFNMS-YANPGLG---AGLSPGA--VAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMG
. ::::. .:.::: :.. :.. ::.:::: .::: :::::: :::..::
CCDS46 MGSGSGNMSAGSMNMSSYVGAGMSPSLAGMSPGAGAMAGM-GGSAGA------AGVAGMG
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 TALSPSGMGAMGAQQAASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRS
:::: .. .:.: :..:.::.::: :: :::: :. ..:.:.: : ::..::
CCDS46 PHLSPS-LSPLGGQAAGAMGGLAPYAN-MNS-MSPM-YGQAGLSRAR-----DPKTYRRS
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 YPHAKPPYSYISLITMAIQQAPSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFN
: ::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS46 YTHAKPPYSYISLITMAIQQSPNKMLTLSEIYQWIMDLFPFYRQNQQRWQNSIRHSLSFN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 DCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAG-GGGGSGSGG
:::.:: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: . ..:..:::
CCDS46 DCFLKVPRSPDKPGKGSFWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQLALKEAAGAAGSGK
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SGAKGGPESRKDPSGASNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATG
..: :. :. . . :..:....: :. .: .::: .:. :
CCDS46 KAAAGAQASQAQLGEAAGPASETP------------AGTESPHSSASP-CQEHK----RG
290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KB8 GASELK-TPASSTAPP-ISSGPG----ALASV--PASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSF
: .::: :::.. .:: . .:: : : . : :: :: : . ::: . ::.:
CCDS46 GLGELKGTPAAALSPPEPAPSPGQQQQAAAHLLGPPHHP--GLPP---EAHLKPEHHYAF
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440
pF1KB8 NHPFSINNLMSSSEQQH---------KLDFKAYEQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTR
:::::::::::: .:.: :.:.:::::...: ::: .:.:: .: .. :
CCDS46 NHPFSINNLMSSEQQHHHSHHHHQPHKMDLKAYEQVMHYPGYGSPMPGSLAMGPVTNKTG
380 390 400 410 420 430
450 460 470
pF1KB8 SPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
: : . .:::::::::..:.:
CCDS46 LDASPLAADTSYYQGVYSRPIMNSS
440 450 460
>>CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 973 init1: 754 opt: 773 Z-score: 471.4 bits: 96.1 E(32554): 6.2e-20
Smith-Waterman score: 925; 42.9% identity (58.6% similar) in 473 aa overlap (1-472:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLGTVKMEGHETSDWNSYYADTQEAYSSVPVSNMNSGLGSMNSMNTYMTMNTMTTSGNMT
:::.::::.:. ..: ::: .. :.:: ::. . . : .:.:::.: .. .
CCDS12 MLGSVKMEAHDLAEW-SYYPEAGEVYS--PVTPVPT----MAPLNSYMTLNPLS-----S
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PASFNMSYANPGLGAGLSPGAVAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPSGMGAMGAQQ
: : :: : :: .:.: . : .. .: .. : :.:. :.
CCDS12 P------YPPGGLPA--SP-----LPSGPLAP-----PAPAAPLGPTF-P-GLGVSGG--
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLIT
.: .: : :: : . . : : ..: :::::::::::::
CCDS12 -SSSSGYG---------------AP---GPGLVHGKEMPKGYRRPLAHAKPPYSYISLIT
90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 MAIQQAPSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGK
:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAIQQAPGKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRENQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGK
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GSYWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGA
::::.:::.:::::::::::::::::: :.. ::.:.. . .:. :. : :..
CCDS12 GSYWALHPSSGNMFENGCYLRRQKRFKLEEKVKKGGSGAATTTRNGT-GSAASTTTPAA-
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGASELKTPASSTAPPI
.. :: : : : : :. ..: . :: . .::::: :
CCDS12 ---TVTSP---------------PQPPPPA-PEPEAQGGEDV--GALDCGSPASST--PY
250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KB8 SSGPGALASVPASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMS-SSEQQHKLDFKA
.: .:. .:: : :.:::::::::::: .. :::
CCDS12 FTG----LELPG--------------ELKLDAPYNFNHPFSINNLMSEQTPAPPKLD---
290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 YEQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
. .. ::. :. ::. .::::.::: .::.:
CCDS12 ----VGFGGYGAE-------GG---------EPG----VYYQGLYSRSLLNAS
330 340 350
>>CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 (465 aa)
initn: 504 init1: 504 opt: 623 Z-score: 382.6 bits: 80.1 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 629; 38.7% identity (60.2% similar) in 344 aa overlap (128-454:84-420)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 AAGVTAMGTALSPSGMGAMGAQQAASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGG
: : .: . : : .. : . :::::
CCDS75 RRRRSYAGEDELEDLEEEEDDDDILLAPPAGGSPAPPGPAPAAGAGAGGGGGGGGAGGGG
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 DAKTFKRSYPHAKPPYSYISLITMAIQQAPSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNS
.: . .. : .:::::::.:::::: :.:.: :::::: ..: :::::.. ::::
CCDS75 SAGSGAKN-PLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQNS
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 IRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEK--QPGAG
:::.::.::::::. : : .::::.:::: :.:..::.:: .:::.:::: . :.:.
CCDS75 IRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPESADMFDNGSFLRRRKRFKRQPLLPPNAA
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGASN---PSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASP
.. . :.:: :: ::..:. :. : : .: : : : : : :
CCDS75 AAESLLLRGAGAAGGA---GDPAAAAALFPPAPPPPPHAYGYGPYGCGYGLQLP-PYAPP
240 250 260 270 280
340 350 360 370 380
pF1KB8 QTLDHSGATATGGASELKTPASSTAPPISSGPGA-LASVPASHPAHGLA-----PHESQL
..: ..:.:...:. .. : : :: : .: :: . .. : :. : ..
CCDS75 SAL-FAAAAAAAAAAAFH-PHSPPPPPPPHGAAAELARTAFGYRPHPLGAALPGPLPASA
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 HLKGDPHYSF--NHPFSINNLMSSSEQQHKLDFKAYEQAL--QYSPYGSTLPASLPLGSA
: : : ::::......: : . : : :: : . : ::.
CCDS75 AKAGGPGASALARSPFSIESIIGGSLGPAAAAAAAAQAAAAAQASPSPSPVAAPPAPGSS
350 360 370 380 390 400
450 460 470
pF1KB8 S--VTTRSPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
. .... . :.:
CCDS75 GGGCAAQAAVGPAAALTRSLVAAAAAAASSVSSSAALGTLHQGTALSSVENFTARISNC
410 420 430 440 450 460
>>CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 (553 aa)
initn: 556 init1: 523 opt: 622 Z-score: 380.9 bits: 80.1 E(32554): 6.7e-15
Smith-Waterman score: 645; 37.5% identity (60.7% similar) in 392 aa overlap (109-472:9-369)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 PGAVAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPSGMGA---MGAQQ----AASMNGLGPYA
::...:. .:..: ::. . : :.
CCDS44 MQARYSVSSPNSLGVVPYLGGEQSYYRAAAAAAGGGYT
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KB8 AAMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPH------AKPPYSYISLITMAIQQ
: : :: ... :.. .. :: :... :. .:::::::.:::::::.
CCDS44 AMPAP-MSVYSH-PAH---AEQYPGGMARAYGPYTPQPQPKDMVKPPYSYIALITMAIQN
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 APSKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWT
::.: .::. :::.::: ::.::.:.: :::::::.::.:.::::: :. :::::::::
CCDS44 APDKKITLNGIYQFIMDRFPFYRDNKQGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWT
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LHPDSGNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGA---SN
: ::: :::::: .:::..::: . : . . : .:. : . ..
CCDS44 LDPDSYNMFENGSFLRRRRRFK---KKDAVKDKEEKDRLHLKEPPPPGRQPPPAPPEQAD
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350
pF1KB8 PSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGAS---ELKTPASSTAPP
.: .: :. . . :.. :.: :: :. ..: ..:.:. ....: ::..
CCDS44 GNAPGPQPPPVRIQDIKTENGTCPSP---PQPLSPAAALGSGSAAAVPKIESPDSSSSS-
220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ISSG---PGALASV-PASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMSSSEQQHKL
.::: ::.: :. : : . :: ::.: . ::..:.:.:
CCDS44 LSSGSSPPGSLPSARPLSLDGADSAP-PPPAPSAPPPHHS--QGFSVDNIMTS-------
270 280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 DFKAYEQALQYSPYGST--LPASLPLGSASVTTRSPIEPSALEPAYYQG---VYSRPVLN
:. :: ... : ..: :.::....:. : : :: : .:: : .
CCDS44 --------LRGSPQSAAAELSSGL-LASAAASSRAGIAPPLALGAYSPGQSSLYSSPCSQ
320 330 340 350 360
pF1KB8 TS
::
CCDS44 TSSAGSSGGGGGGAGAAGGAGGAGTYHCNLQAMSLYAAGERGGHLQGAPGGAGGSAVDDP
370 380 390 400 410 420
>>CCDS35045.1 FOXB2 gene_id:442425|Hs108|chr9 (432 aa)
initn: 610 init1: 553 opt: 613 Z-score: 377.2 bits: 79.0 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 639; 38.4% identity (58.4% similar) in 305 aa overlap (163-455:6-306)
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 AMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLITMAIQQAPSKMLT
: :: ::::::::: .::::.. :::
CCDS35 MPRPGKSSYSDQKPPYSYISLTAMAIQHSAEKMLP
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 LSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHPDSGN
::.::..::. :::::.. ::::::.::.:::::::.:. : ::.:::::.:.:::: :.
CCDS35 LSDIYKFIMERFPYYREHTQRWQNSLRHNLSFNDCFIKIPRRPDQPGKGSFWALHPDCGD
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 MFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGASNPSADSPLHRG
::::: .:::.:::: . . .:: ... :: :: .. : .: : .
CCDS35 MFENGSFLRRRKRFKVLRADHTHLHAGSTKSAPGA--GPGGHLHPHHHHHPHHHHHHHAA
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360
pF1KB8 VHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDH----SGATATGGASELKT-----PASSTAPPISSG
.: . . : : : : . : . :: .: . : ... : :
CCDS35 AHHHHHHHPPQPPPPPPPPPPHMVHYFHQQPPTAPQPPPHLPSQPPQQPPQQSQPQQPSH
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PGAL---ASVPASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMSSSEQQHKLDFKAY
:: . :.: :. : . : : .:. : :... . ..: . : : :
CCDS35 PGKMQEAAAVAAAAAAAAAAAVGSVGRLSQFPPYGLGSAAAAAAAAAASTSGFKHPF-AI
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470
pF1KB8 EQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
:. . . : ..:::.:. :. :. :
CCDS35 ENIIGRDYKGVLQAGGLPLASVMHHLGYPV-PGQLGNVVSSVWPHVGVMDSVAAAAAAAA
280 290 300 310 320 330
CCDS35 AAGVPVGPEYGAFGVPVKSLCHSASQSLPAMPVPIKPTPALPPVSALQPGLTVPAASQQP
340 350 360 370 380 390
>>CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 (495 aa)
initn: 605 init1: 494 opt: 606 Z-score: 372.3 bits: 78.3 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 612; 42.9% identity (61.0% similar) in 282 aa overlap (110-381:82-345)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 GAVAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPSGMGAMGAQQAASMNGLGPYAAAMNPCMS
: .... :: ::. .. :: ::: .
CCDS30 LPHGHEPPAEEAEADLAEDEEESGGCSDGEPRALASRGA--AAAAGSPGPGAAAARGAAG
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 PMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLITMAIQQAPSKMLTLSEIYQW
: :: :: : :: : .:::::::.:::::: :.:.: :::::: ..
CCDS30 PGPGPPS---------GGAAT---RS-PLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEF
110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 IMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHPDSGNMFENGCY
: :::::.. :::::::.::.::::::. : : .::::.:::: :.:..::.:: .
CCDS30 ISGRFPYYREKFPAWQNSIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPESADMFDNGSF
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 LRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGA-KGGPESRKDPSGASNPSADSPLHRGV-HGKT
:::.:::: .:: .:: . :: :: :. . : .: .
CCDS30 LRRRKRFK--RQPLPPPHPHPHPHPELLLRGGAAAAGDP-GAFLPGFAAYGAYGYGYGLA
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360
pF1KB8 GQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGAS---ELKTPASSTA-----PPISSGPGALAS
::: :::: :. :. : :...:. .:..: . .: :: .: .. .:
CCDS30 LPAYGAPPPGPAPHPHPHPHAFAFAAAAAAAPCQLSVPPGRAAAPPPGPPTASVFAGAGS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VPASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMSSSEQQHKLDFKAYEQALQYSPY
.:: :: : .:
CCDS30 APAPAPASGSGPGPGPAGLPAFLGAELGCAKAFYAASLSPPAAGTAAGLPTALLRQGLKT
340 350 360 370 380 390
>>CCDS32255.1 FOXB1 gene_id:27023|Hs108|chr15 (325 aa)
initn: 598 init1: 558 opt: 558 Z-score: 347.0 bits: 73.0 E(32554): 5.3e-13
Smith-Waterman score: 579; 38.2% identity (58.6% similar) in 314 aa overlap (163-472:6-294)
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 AMNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLITMAIQQAPSKMLT
. .: ::::::::: .::::..: :::
CCDS32 MPRPGRNTYSDQKPPYSYISLTAMAIQSSPEKMLP
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 LSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHPDSGN
:::::..::: :::::.: ::::::.::.:::::::.:. : ::.:::::.:.:::. :.
CCDS32 LSEIYKFIMDRFPYYRENTQRWQNSLRHNLSFNDCFIKIPRRPDQPGKGSFWALHPSCGD
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 MFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGASNPSADSPLHRG
::::: .:::.:::: :. . .. ...:. .. : .: : :
CCDS32 MFENGSFLRRRKRFKVLKSDHL----APSKPADAAQYLQQQAKLRLSALAAS-------G
100 110 120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 VHGKTGQLEGAPAP-GPAASPQTLDHSGATATGGASELKTPASSTAPPISSGPGALASVP
.: :. .: : .:.:. . : : . : : : :.. . .:. ::
CCDS32 TH--LPQMPAAAYNLGGVAQPSGFKHPFAIENIIAREYKMPGGLAF-------SAMQPVP
150 160 170 180 190
380 390 400 410 420
pF1KB8 ASHP-AHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPFSINNLMSSSEQQHKLDFKAYEQALQY--SP
:..: . :. :.: : :: .. :.. : . :..:: :.
CCDS32 AAYPLPNQLTTMGSSLGT-GWPHV-YGSAGMIDSATPISMASG--DYSAYGVPLKPLCHA
200 210 220 230 240 250
430 440 450 460 470
pF1KB8 YGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS
:.:::: .:. . . : :. : : : :. .
CCDS32 AGQTLPA-IPVPIKPTPAAVPALPALPAPIPTLLSNSPPSLSPTSSQTATSQSSPATPSE
260 270 280 290 300 310
CCDS32 TLTSPASALHSVAVH
320
>>CCDS10958.1 FOXC2 gene_id:2303|Hs108|chr16 (501 aa)
initn: 600 init1: 513 opt: 554 Z-score: 342.0 bits: 72.7 E(32554): 9.9e-13
Smith-Waterman score: 589; 35.7% identity (58.1% similar) in 370 aa overlap (104-436:1-370)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 GAGLSPGAVAGMPGGSAGAMNSMTAAGVTAMGTALSPSGMGAMGAQQAASMNGLGPYAAA
: . : : .:.:. : .. :..
CCDS10 MQARYSVSDPNALGVVPYLSEQNYYRAAGS
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KB8 MNPCMSPMAYAPSNLGRSRAGGGGDAKTFKRSYPHA-----KPPYSYISLITMAIQQAPS
.. :::. .. . :: : . ... : : :::::::.:::::::.::
CCDS10 YGGMASPMGVYSGHPEQYSAGMGRSYAPYHHHQPAAPKDLVKPPYSYIALITMAIQNAPE
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KMLTLSEIYQWIMDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHP
: .::. :::.::: ::.::.:.: :::::::.::.:.::::: :. :::::::::: :
CCDS10 KKITLNGIYQFIMDRFPFYRENKQGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDP
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290
pF1KB8 DSGNMFENGCYLRRQKRFKCE------------KQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKD
:: :::::: .:::..::: . :.: ... :. . : . :..:
CCDS10 DSYNMFENGSFLRRRRRFKKKDVSKEKEERAHLKEPPPAASKGAPATPHLADAPKEAEKK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KB8 ---PSGASNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAP---APGPAASPQ-TL-DHSGATATG--GA
: :..:. . . . . :.:.: : ::.::. .: .: .:. .: :
CCDS10 VVIKSEAASPALPVITKVETLSPESALQGSPRSAASTPAGSPDGSLPEHHAAAPNGLPGF
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390
pF1KB8 SELKTPASSTAPP---ISSGPG--ALASVPASHPAHGLAP----HESQLHLKGDPHYSFN
: . . :.:: .: : : .:. : . : . : . :.. ...
CCDS10 SVENIMTLRTSPPGGELSPGAGRAGLVVPPLALPYAAAPPAAYGQPCAQGLEAGAAGGYQ
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 HPFSINNLMSSSEQQ-HKLDFKAYEQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPIEPSALE
. .:....:. : : ..::. : : : : :
CCDS10 CSMRAMSLYTGAERPAHMCVPPALDEALSDHPSGPTSPLSALNLAAGQEGALAATGHHHQ
340 350 360 370 380 390
460 470
pF1KB8 PAYYQGVYSRPVLNTS
CCDS10 HHGHHHPQAPPPPPAPQPQPTPQPGAAAAQAASWYLNHSGDLNHLPGHTFAAQQQTFPNV
400 410 420 430 440 450
472 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:15:54 2016 done: Fri Nov 4 12:15:54 2016
Total Scan time: 2.710 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]