Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8342, 348 aa
1>>>pF1KB8342 348 - 348 aa - 348 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3028+/-0.00119; mu= 10.2678+/- 0.069
mean_var=147.6190+/-53.835, 0's: 0 Z-trim(103.4): 355 B-trim: 900 in 2/47
Lambda= 0.105561
statistics sampled from 6835 (7402) to 6835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 ( 348) 2347 370.1 1.5e-102
CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 ( 348) 1085 177.9 1.1e-44
CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX ( 364) 1002 165.3 7.2e-41
CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX ( 364) 1002 165.3 7.2e-41
CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX ( 364) 1002 165.3 7.2e-41
CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX ( 364) 994 164.1 1.7e-40
CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 ( 402) 596 103.5 3.2e-22
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 547 96.0 4.9e-20
CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 ( 354) 449 81.1 1.6e-15
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 431 78.3 1.1e-14
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 418 76.4 4.5e-14
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 411 75.4 1.1e-13
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 399 73.6 3.9e-13
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 393 72.6 6e-13
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 387 71.7 1.2e-12
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 383 71.1 2e-12
CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4 ( 350) 378 70.2 2.8e-12
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 378 70.3 3e-12
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 378 70.3 3.1e-12
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 378 70.3 3.1e-12
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 378 70.3 3.1e-12
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 378 70.3 3.1e-12
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 378 70.3 3.1e-12
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 378 70.3 3.2e-12
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 378 70.3 3.2e-12
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 378 70.4 3.3e-12
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 378 70.4 3.6e-12
CCDS44012.1 GPR50 gene_id:9248|Hs108|chrX ( 617) 378 70.5 4.1e-12
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 363 67.9 1.3e-11
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 350 66.0 5.9e-11
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 348 65.7 7.2e-11
>>CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 (348 aa)
initn: 2347 init1: 2347 opt: 2347 Z-score: 1954.4 bits: 370.1 E(32554): 1.5e-102
Smith-Waterman score: 2347; 100.0% identity (100.0% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLY
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CCDS30 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLG
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CCDS30 VTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIP
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CCDS30 GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQES
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CCDS30 EGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAI
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CCDS30 ATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB8 YNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
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CCDS30 YNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
310 320 330 340
>>CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 (348 aa)
initn: 1064 init1: 1038 opt: 1085 Z-score: 915.8 bits: 177.9 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1085; 45.9% identity (77.5% similar) in 338 aa overlap (9-346:9-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLY
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CCDS58 MRKMSEEEFYL-FKNISSV--GPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFMGTVFLIGFPLNAMVLV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLG
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CCDS58 ATLRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVFVASCNGYFVFGRHVCALEGFLGTVA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIP
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CCDS58 GLVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKHALTVVLATWTIGIGVSIPPFFGWSRFIP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQES
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CCDS58 EGLQCSCGPDWYTVGTKYRSESYTWFLFIFCFIVPLSLICFSYTQLLRALKAVAAQQQES
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAI
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CCDS58 ATTQKAEREVSRMVVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGLDLRLVTIPSFFSKSACI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB8 YNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
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CCDS58 YNPIIYCFMNKQFQACIMKMVC-GKA-MTDESDTCSSQKTEVSTVSSTQVGPN
300 310 320 330 340
>>CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 977 init1: 977 opt: 1002 Z-score: 847.2 bits: 165.3 E(32554): 7.2e-41
Smith-Waterman score: 1002; 44.3% identity (74.2% similar) in 345 aa overlap (2-346:21-359)
10 20 30 40
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLA
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CCDS14 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNST---RGPFEGPNYHIAPRWVYHLTS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHG
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CCDS14 VWMIFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 YFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTW
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CCDS14 YFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFF
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CCDS14 IWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 CYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGS
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CCDS14 CYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 NFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTE
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CCDS14 PFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF--GKK-VDDGSELSSASKTE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TSQVAPA
.:.:.
CCDS14 VSSVSSVSPA
360
>>CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 977 init1: 977 opt: 1002 Z-score: 847.2 bits: 165.3 E(32554): 7.2e-41
Smith-Waterman score: 1002; 44.3% identity (74.2% similar) in 345 aa overlap (2-346:21-359)
10 20 30 40
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLA
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CCDS83 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNST---RGPFEGPNYHIAPRWVYHLTS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHG
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CCDS83 VWMIFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 YFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTW
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CCDS83 YFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFF
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CCDS83 IWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 CYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGS
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CCDS83 CYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 NFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTE
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CCDS83 PFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF--GKK-VDDGSELSSASKTE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TSQVAPA
.:.:.
CCDS83 VSSVSSVSPA
360
>>CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 977 init1: 977 opt: 1002 Z-score: 847.2 bits: 165.3 E(32554): 7.2e-41
Smith-Waterman score: 1002; 44.3% identity (74.2% similar) in 345 aa overlap (2-346:21-359)
10 20 30 40
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLA
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CCDS35 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNST---RGPFEGPNYHIAPRWVYHLTS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHG
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CCDS35 VWMIFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 YFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTW
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CCDS35 YFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFF
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CCDS35 IWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 CYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGS
:: :. .... .: ::.:: .::::::::::::..::.:: .:: ::: : . .. :
CCDS35 CYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 NFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTE
: :.. ..::::::::.:::::::..::.:::::.: . ::. . : ...::::
CCDS35 PFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF--GKK-VDDGSELSSASKTE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TSQVAPA
.:.:.
CCDS35 VSSVSSVSPA
360
>>CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 969 init1: 969 opt: 994 Z-score: 840.6 bits: 164.1 E(32554): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 994; 43.5% identity (74.5% similar) in 345 aa overlap (2-346:21-359)
10 20 30 40
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLA
..:.. : ::.: :.::: :.:..: : . . .
CCDS14 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNST---RGPFEGPNYHIAPRWVYHLTS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHG
..:..... . : :.: .:.. :::: :::.::.::::::: .. . : .. ... :
CCDS14 VWMIFVVTASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISIVNQVSG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 YFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTW
:::.: : :::. ..: : .::::.... ::..:::::..: :: . ::.:.::.:
CCDS14 YFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFF
. : . .:::. ::::: :.::. ::: : .. . . .:..: ..:. ::. ::..
CCDS14 IWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCIIPLAIIML
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 CYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGS
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CCDS14 CYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMIFAYCVCWGPYTFFACFAAANPGY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 NFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTE
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CCDS14 AFHPLMAALPAYFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF--GKK-VDDGSELSSASKTE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TSQVAPA
.:.:.
CCDS14 VSSVSSVSPA
360
>>CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 (402 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLY
: : . :: . . .:: :.:.:
CCDS31 NRSGGHGYWDGGGAAGAEGPAPAGTLSPAPLFSPGTYERLALLLGSIGLLGVGNNLLVLV
10 20 30 40 50 60
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. . ..:::: . .:.:....::.. : : : :. . :.. .:. .:: .:: ..:
CCDS31 LYYKFQRLRTPTHLLLVNISLSDLLVSLFGVTFTFVSCLRNGWVWDTVGCVWDGFSGSLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
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: ... .:.::: :::. :: . :: . : .... :...:: :. :: ::.:::
CCDS31 GIVSIATLTVLAYERYIRVVHARVINFSW----AWRAITYIWLYSLAWAGAPLLGWNRYI
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180 190 200 210 220 230
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. .: .:. . ..:. :::...:. ...:. .: :::.......
CCDS31 LDVHGLGCTVDWKS--KDANDSSFVLFLFLGCLVVPLGVIAHCYGHILYSIRMLRCVEDL
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CCDS31 QTIQVIKILKYEKKLAKMCFLMIFTFLVCWMPYIVICFLVVNGHGHLVTPTISIVSYLFA
240 250 260 270 280 290
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CCDS31 KSNTVYNPVIYVFMIRKFRRSLLQLLCLRLLRCQRPAKDLPAAGSEMQIRPIVMSQKDGD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 (337 aa)
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Smith-Waterman score: 547; 29.4% identity (66.2% similar) in 293 aa overlap (36-323:24-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 GPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQH
. ...:.:... .... :...: . ...
CCDS36 MLRNNLGNSSDSKNEDGSVFSQTEHNIVATYLIMAGMISIISNIIVLGIFIKY
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:.:::: : :..::::.:. . :. . ..:.: . :: .::.. . . . : ..
CCDS36 KELRTPTNAIIINLAVTDIGVSSIGYPMSAASDLYGSWKFGYAGCQVYAGLNIFFGMASI
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pF1KB8 WSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQC
:.:.:..::...: : . :. : : . .:. .: : :. ::. : :.
CCDS36 GLLTVVAVDRYLTICLPDVGRRMTTNTYIGLILGAWINGLFWALMPIIGWASYAPDPTGA
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pF1KB8 SCGIDYYTLKPEVNNESFVIY---MFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQ-QESA
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CCDS36 TCTINWRK-----NDRSFVSYTMTVIAINFIVPLTVMFYCYYHVTLSIKHHTTSDCTESL
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pF1KB8 TTQKAEK-EVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAI
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CCDS36 NRDWSDQIDVTKMSVIMICMFLVAWSPYSIVCLWASFGDPKKIPPPMAIIAPLFAKSSTF
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::: ::.. ::.:: ::. . :
CCDS36 YNPCIYVVANKKFRRAMLAMFKCQTHQTMPVTSILPMDVSQNPLASGRI
290 300 310 320 330
>>CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 (354 aa)
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CCDS49 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS
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pF1KB8 QHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLGGEI
..:: : . . .:::: :: . . : :. . . .::: :: :. . . :
CCDS49 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG
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.: ........::. .: . . ..:: . .: :..: .. ::.: . :.:: .
CCDS49 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
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CCDS49 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
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pF1KB8 SATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFY-IFTHQGSNFGPIFMTI-PAFFAKS
... : ..:...... .::: :.::: :. . : . : :: ... :...:::
CCDS49 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSI--PIQLSVVPTLLAKS
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CCDS49 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
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>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
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Smith-Waterman score: 431; 29.4% identity (64.1% similar) in 309 aa overlap (38-336:40-333)
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pF1KB8 NFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLI-VLGFPINFLTLYVTVQHK
..:. ..::. . :. : :..::...
CCDS10 PSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGARAVLVPVLYLLVCAAGLGGNTLVIYVVLRFA
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CCDS10 KMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAA--SFWPFGPVLCRLVMTLDGVNQFTSV
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CCDS10 FCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSL-CMSLPLLVFAD-VQEGGT
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CCDS10 CNASW------PEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCY--LLIVVKVRAAGVRVGC
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CCDS10 VRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYFFVVILSYANS
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CCDS10 CA--NPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGS-GAKDADATEPRPDRIRQQQEATPPAHRAA
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CCDS10 ANGLMQTSKL
360
348 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]