FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8337, 539 aa
1>>>pF1KB8337 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3734+/-0.00165; mu= 10.0907+/- 0.098
mean_var=262.3286+/-49.689, 0's: 0 Z-trim(107.3): 978 B-trim: 44 in 1/49
Lambda= 0.079187
statistics sampled from 8418 (9493) to 8418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1621 199.6 9.4e-51
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CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1581 195.1 2.3e-49
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CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1549 191.2 2.4e-48
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CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1549 191.3 2.6e-48
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1549 191.4 2.8e-48
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1548 191.3 3.1e-48
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CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1547 191.1 3.2e-48
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CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1543 190.5 3.8e-48
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1544 190.8 4.2e-48
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1543 190.8 5e-48
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1543 190.8 5.1e-48
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1538 190.0 5.9e-48
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1538 190.2 6.9e-48
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1536 189.9 7.6e-48
CCDS33089.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19 ( 617) 1534 189.6 8.9e-48
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CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1535 189.9 9.8e-48
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1535 189.9 9.8e-48
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1530 189.1 1.1e-47
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1532 189.5 1.2e-47
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1529 189.0 1.3e-47
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1529 189.0 1.3e-47
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1529 189.1 1.4e-47
>>CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 (539 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLYRDVMLETYGNLVSLGVGPAGP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 KPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRTEYKELTSQETFGEEDPQGSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRTEYKELTSQETFGEEDPQGSEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIRH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 TGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGEK
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pF1KB8 PYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
490 500 510 520 530
>>CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 (560 aa)
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Smith-Waterman score: 3799; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:22-560)
10 20 30
pF1KB8 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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40 50 60 70 80 90
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDVMLETYGNLVSLGVGPAGPKPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 EYKELTSQETFGEEDPQGSEPVEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EYKELTSQETFGEEDPQGSEPVEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGG
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160 170 180 190 200 210
pF1KB8 NLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 DQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGE
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 KPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYK
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400 410 420 430 440 450
pF1KB8 CNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSEC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKAFHNSSRLIHHQRLHHGEKPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAF
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pF1KB8 RHSSNMCQHQRIHLREDFSM
::::::::::::::::::::
CCDS47 RHSSNMCQHQRIHLREDFSM
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>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa)
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Smith-Waterman score: 1685; 46.2% identity (73.1% similar) in 539 aa overlap (10-538:227-747)
10 20 30
pF1KB8 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLY
:: :..::..: ....: : .::.:
CCDS27 FAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDYTQKKWKSLTLSQRALQ
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pF1KB8 RDVMLETYGNLVSLGVGPAGPKPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRT
..: :.. ...:: :: . :.: .: . .:. ... :... .:.
CCDS27 WNMMPENHHSMASL----AGENMMKGSELTPKQEFF----KGSESSN--RTSGGLFGVVP
260 270 280 290 300
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pF1KB8 EYKEL--TSQETFGEEDPQGSEPVEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRES
: . ..:: : . : :. .. :. :... ..... .. : .. .:
CCDS27 GAAETGDVCEDTFKELEGQTSD-----EEGSRLENDFLEITDEDKKKS-TKDRYDKYKEV
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 GGNLRLLSRPVPD------QRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIF
: . : : :: :. ..:: : ..:.. :.: .:.:.: ..: . :. :
CCDS27 GEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTF
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260
pF1KB8 --SANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQ
...:.:. . ::.: . :: :::..:.:..:..:::::. ::::::.::.:::.:
CCDS27 RQTSQLIVH--LRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQ
430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSL
: .. .:.: :.:: ::.:.:::..: : .: .:: .:::.:::::.:::. : . .:
CCDS27 SSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNL
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 IYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQ
: :::::::::::.:..:::::: .. ::::. ::::::..:.::::.:.:.:.::.:.
CCDS27 IDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHE
540 550 560 570 580 590
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pF1KB8 RIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHT
::::::::..:.:: ::: . :..::: :::::::.::.::: :.:..::: ::::::
CCDS27 RIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHT
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:::::.:.::::.: :: :. ::: : :::::.:.:: ::::.:. :: :.:.::::::
CCDS27 GEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKP
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pF1KB8 YKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
:.:::::::: . :.. .::: : : :
CCDS27 YECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
720 730 740 750
>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa)
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Smith-Waterman score: 1643; 59.9% identity (82.1% similar) in 364 aa overlap (171-532:290-651)
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 RGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKK
.::. :. : ..: : : :..:.. : :.:
CCDS64 MSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEK
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250
pF1KB8 TNTVRNSGEIF--SANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPY
. :. : :.::. . :.: .:.: . :: :::.:: :.::.::.: :: :::.
CCDS64 PYECNECGKAFRRSSNLI--QHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPF
320 330 340 350 360 370
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 KCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGE
.: ::::::::: .. .:.:.:.:: ::.:..::: :.: ::.::.:.:::::::::..
CCDS64 ECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSD
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CCDS75 FRQSRSLNEHKNIHTGEKPYTCEKCGKAFNQSSSLIIHRSIHSEQKLYKCEECGKAFTWS
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CCDS75 SSLNKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFYRSSHLAKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSTLI
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CCDS75 LHKRIHSGQKPYKCEECGKAFTRSTTLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFIWSASLNEHKN
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CCDS75 IHTGEKPYKCKECGKAFNQSSGLIIHRSIHSEQKLYKCEECGKAFTRSTALNEHKKIHSG
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CCDS32 KPELIYLLEHGQELWTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSS
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CCDS32 RDSRLGQARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVT
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pF1KB8 PDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKK
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CCDS32 PQDALHECDSQGPGKDPMTDARNNPY--------TCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVK
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