Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8326
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8326, 366 aa
1>>>pF1KB8326 366 - 366 aa - 366 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8273+/-0.00107; mu= -9.5760+/- 0.064
mean_var=492.0249+/-103.748, 0's: 0 Z-trim(117.1): 38 B-trim: 656 in 2/53
Lambda= 0.057820
statistics sampled from 17765 (17803) to 17765 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.547), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 ( 366) 2489 221.3 1e-57
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CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 393) 661 68.9 8.6e-12
CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 507) 661 69.0 1e-11
CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 475) 647 67.8 2.2e-11
CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 508) 628 66.2 6.9e-11
>>CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 (366 aa)
initn: 2489 init1: 2489 opt: 2489 Z-score: 1149.6 bits: 221.3 E(32554): 1e-57
Smith-Waterman score: 2489; 99.5% identity (99.7% similar) in 366 aa overlap (1-366:1-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
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CCDS11 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKRKALEETMAFTTQALAS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSIKAPATPASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSIKAPATPASA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TLGRPPRIPEPVHLPVVPDGRLSAASSASSLASAGSAEGVGGAPTPKGQAAPPAPPLPSS
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CCDS11 TLGRPPRIPEPVHLPVVPDGRLSAASSAFSLASAGSAEGVGGAPTPKGQAAPPAPPLPSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LDPPPPPAAVEVFQRPPTLEELSPPPPDEELPLPLDLPPPPPLDGDELGLPPPPPGFGPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGTVICVTRRYSDGWCEGVSSEGTGFFPGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGTVICVTRRYSDGWCEGVSSEGTGFFPGN
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 YVEPSC
::::::
CCDS11 YVEPSC
>>CCDS45725.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 (360 aa)
initn: 1899 init1: 1899 opt: 2432 Z-score: 1124.0 bits: 216.6 E(32554): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 2432; 97.8% identity (98.1% similar) in 366 aa overlap (1-366:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS45 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKRKALEETMAFTTQALAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
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CCDS45 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEAR------MVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSIKAPATPASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSIKAPATPASA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TLGRPPRIPEPVHLPVVPDGRLSAASSASSLASAGSAEGVGGAPTPKGQAAPPAPPLPSS
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TLGRPPRIPEPVHLPVVPDGRLSAASSAFSLASAGSAEGVGGAPTPKGQAAPPAPPLPSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LDPPPPPAAVEVFQRPPTLEELSPPPPDEELPLPLDLPPPPPLDGDELGLPPPPPGFGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDPPPPPAAVEVFQRPPTLEELSPPPPDEELPLPLDLPPPPPLDGDELGLPPPPPGFGPD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGTVICVTRRYSDGWCEGVSSEGTGFFPGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGTVICVTRRYSDGWCEGVSSEGTGFFPGN
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YVEPSC
::::::
CCDS45 YVEPSC
360
>>CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (476 aa)
initn: 882 init1: 606 opt: 686 Z-score: 335.4 bits: 71.1 E(32554): 2.3e-12
Smith-Waterman score: 686; 44.1% identity (70.6% similar) in 272 aa overlap (1-264:1-271)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
:::::.: : :::.:..:: ... : :::::::.::.:::::.:::::: :.:::.:::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
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CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRK---SIKAPATP
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CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ASA--TLGR--PPRIPEPVHLPVVPDGRLSAASSASSLASAGSAEGVGGAP-TPKGQAAP
:. :::: : . :::. :.::. ... . .: : : . ... : : .:...
CCDS31 MSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 PAPPLPSSLDPPPPPAAVEVFQRPPTLEELSPPPPDEELPLPLDLPPPPPLDGDELGLPP
. :. . : :: . :::. .:
CCDS31 SGSRENSGSSSIGIPIAVPT-PSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSG
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PPPGFGPDEPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGTVICVTRRYSDGWCEGVSSE
CCDS31 GYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQENIAD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (446 aa)
initn: 920 init1: 606 opt: 684 Z-score: 334.9 bits: 70.9 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 753; 38.6% identity (60.4% similar) in 396 aa overlap (1-320:1-396)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
:::::.: : :::.:..:: ... : :::::::.::.:::::.:::::: :.:::.:::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
::::.. ::...:..::.:.. ::..:. .. ..: :..: ::::::::: :.: .
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRK---SIKAPATP
.:.::: :. . : :.:... :::.:::.: ..: .::::::: . : :. :
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB8 ASA--TLGR--PPRIPEPVHLPVVPD------GRLSAASSASSLAS--------AGSAEG
:. :::: : . :::. :.::. .::.. : . :: .::. :
CCDS53 MSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KB8 VGGAPTPKGQAA--PPAPPLPS--SLDPPPPPA--------AVEV--------------F
:. . ... : : : :: .. : : : . .. .
CCDS53 SGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGY
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290
pF1KB8 QRPPTLE-ELSPPPPDEELPL---------PLDLPPPPPLDG---DELGLPPPPPG----
.: :.. ..: : . :: : ::::: : :. :::::
CCDS53 RRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYE
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340
pF1KB8 ------------FGPDEPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGTVICVTRRYSDG
.. .:.:.: .:.::::..: ::
CCDS53 DEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDG
370 380 390 400 410 420
350 360
pF1KB8 WCEGVSSEGTGFFPGNYVEPSC
CCDS53 WYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
430 440
>>CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (393 aa)
initn: 831 init1: 553 opt: 661 Z-score: 325.2 bits: 68.9 E(32554): 8.6e-12
Smith-Waterman score: 994; 42.6% identity (67.9% similar) in 390 aa overlap (1-363:1-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
:::::.: : :::.:..:: ... : :::::::.::.:::::.:::::: :.:::.:::
CCDS73 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
::::.. ::...:..::.:.. ::..:. .. ..: :..: ::::::::: :.: .
CCDS73 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDL-----STQLSRTGTLSRK---SIK
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CCDS73 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB8 APATPASA--TLGR--PPRIPEPVHLPVVPDGRLSAASSASSLASAG----------SAE
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CCDS73 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GVGGAPTPKGQAAPPAPPLPSSLDPPPPPAAVEVFQRPPTLEELSPPPPDEELPLPLDLP
: .:. . ... . .: .. : ::. : . : :::: ...:. : :
CCDS73 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTP----PPPPPPDDIPMFDDSP
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 PPPP-----LDGDELGLPPPPPGFGPDEPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSFSEGT
:::: . .: .. .. .:.:.: .:.::::..: ::..::.:::: ::.
CCDS73 PPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGA
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KB8 VICVTRRYSDGWCEGVSSEGTGFFPGNYVEPSC
.: : .. .::: ::: .. ::.:::::::
CCDS73 IIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
360 370 380 390
>>CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (507 aa)
initn: 864 init1: 546 opt: 661 Z-score: 323.8 bits: 69.0 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 677; 39.7% identity (60.9% similar) in 345 aa overlap (1-309:1-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
:::::.: : ::: ::.:: ... : :::::::.::.:..:::.::::: :.:::.:::
CCDS63 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
::: ...::...:.:::.:.. ::..:. .. ..: :..: ::::::::: :.: .
CCDS63 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSI---KAPATP
.:.::: :: . : :.:... :::::::.: .::: . : : : . : :. :
CCDS63 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVK-VSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPP
130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB8 ASA--TLGR--PPRIPEPVHLPVVPDG------RLSAASSASSLASAG--------SAEG
:. :::: : : :::. ::::. : : :. : . .:. :. :
CCDS63 MSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VGGAPTPKGQAAPPAPPLPSSLDPP---PPPAAVEVFQRP------PTLEELSPPPPDEE
.:. :..... .:. : : :. :: : : : : :
CCDS63 SSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPAPAGSAGTPPLPATSASAPAPL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB8 LP--LPLDLPPPPPLDGDEL---GLPPP-PPGFGPDEPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKD
.: .: . : : . :. : :: . :. :...
CCDS63 VPATVPSSTAPDAAAGGAQTLADGFTSPTPPVVSSTPPTGHPVQFYSMNRPASRHTPPTI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KB8 NELSFSEGTVICVTRRYSDGWCEGVSSEGTGFFPGNYVEPSC
CCDS63 GGSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPED
360 370 380 390 400 410
>>CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (475 aa)
initn: 878 init1: 546 opt: 647 Z-score: 317.8 bits: 67.8 E(32554): 2.2e-11
Smith-Waterman score: 684; 38.9% identity (58.0% similar) in 386 aa overlap (1-295:1-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELQQLQEFEIPTGREALRGNHSALLRVADYCEDNYVQATDKQKALEETMAFTTQALAS
:::::.: : ::: ::.:: ... : :::::::.::.:..:::.::::: :.:::.:::
CCDS23 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 VAYQVGNLAGHTLRMLDLQGAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLATVQRLPP
::: ...::...:.:::.:.. ::..:. .. ..: :..: ::::::::: :.: .
CCDS23 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSI---KAPATP
.:.::: :: . : :.:... :::::::.: .::: . : : : . : :. :
CCDS23 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVK-VSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPP
130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB8 ASA--TLGR--PPRIPEPVHLPVVPDGRL------------SAASSAS------SLASAG
:. :::: : : :::. ::::. . : . .:: . .:.:
CCDS23 MSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSG
180 190 200 210 220 230
220 230 240
pF1KB8 SAEG-----------------VG---GAPTPKGQAAPPAPPL-------PSSLDPPPPPA
:. : :: ..:::. .. :. :. :.: :: .
CCDS23 SSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGHPVQFYSMNRPASRHTPPTIG
240 250 260 270 280 290
250 260 270
pF1KB8 AVEVFQRPPTLEE--------------------LSPPPPD--EELP-LPL----------
. ..:::.. :.::::. . : :::
CCDS23 GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFVARVQEN
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320
pF1KB8 --DLPPPPP-LDG---DELGLPPPPPGFGPDEPSWVPASYLEKVVTLYPYTSQKDNELSF
: ::::: .. :: :::::
CCDS23 ISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVV
360 370 380 390 400 410
>>CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (508 aa)
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