Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8325
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8325, 206 aa
1>>>pF1KB8325 206 - 206 aa - 206 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3476+/-0.000961; mu= 13.1327+/- 0.058
mean_var=81.1553+/-15.994, 0's: 0 Z-trim(106.0): 217 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.142369
statistics sampled from 8502 (8749) to 8502 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 1.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 206) 1358 288.5 2e-78
CCDS73081.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 235) 985 211.9 2.5e-55
CCDS73080.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 182) 973 209.4 1.2e-54
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 212) 576 127.9 4.6e-30
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 ( 216) 571 126.8 9.5e-30
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 557 124.0 6.7e-29
CCDS58073.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 142) 548 122.0 1.8e-28
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 545 121.5 3.6e-28
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 542 120.9 5.6e-28
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 ( 200) 539 120.2 8.5e-28
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 528 118.0 4.2e-27
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 525 117.4 6.3e-27
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18 ( 244) 521 116.6 1.3e-26
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 518 115.9 1.7e-26
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11 ( 203) 517 115.7 2e-26
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 ( 215) 509 114.1 6.4e-26
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 501 112.5 2e-25
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 ( 220) 500 112.3 2.4e-25
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14 ( 212) 497 111.6 3.5e-25
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 212) 496 111.4 4e-25
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 256) 496 111.5 4.7e-25
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 190) 485 109.1 1.8e-24
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 ( 219) 485 109.2 2e-24
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 216) 479 108.0 4.6e-24
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 ( 218) 478 107.8 5.4e-24
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 223) 476 107.3 7.2e-24
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 196) 475 107.1 7.6e-24
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 228) 475 107.1 8.5e-24
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 ( 218) 473 106.7 1.1e-23
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5 ( 227) 473 106.7 1.1e-23
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 471 106.3 1.4e-23
CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 188) 462 104.4 4.7e-23
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3 ( 215) 462 104.5 5.2e-23
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3 ( 208) 458 103.6 8.9e-23
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 216) 458 103.6 9.2e-23
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 249) 458 103.7 1e-22
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1 ( 213) 457 103.4 1e-22
CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20 ( 194) 456 103.2 1.1e-22
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19 ( 213) 455 103.0 1.4e-22
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12 ( 215) 455 103.0 1.4e-22
CCDS53836.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 152) 452 102.3 1.6e-22
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 453 102.6 1.8e-22
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7 ( 217) 452 102.4 2.2e-22
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 450 102.0 2.8e-22
CCDS14621.1 RAB33A gene_id:9363|Hs108|chrX ( 237) 447 101.4 4.7e-22
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18 ( 195) 439 99.7 1.3e-21
CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4 ( 229) 434 98.7 2.9e-21
CCDS44803.1 CRACR2A gene_id:84766|Hs108|chr12 ( 731) 438 100.0 4e-21
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 155) 428 97.4 5.1e-21
CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2 ( 212) 426 97.1 8.6e-21
>>CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 (206 aa)
initn: 1358 init1: 1358 opt: 1358 Z-score: 1521.5 bits: 288.5 E(32554): 2e-78
Smith-Waterman score: 1358; 100.0% identity (100.0% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-206)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESEN
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KB8 QNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
190 200
>>CCDS73081.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 (235 aa)
initn: 975 init1: 975 opt: 985 Z-score: 1106.7 bits: 211.9 E(32554): 2.5e-55
Smith-Waterman score: 1290; 87.7% identity (87.7% similar) in 235 aa overlap (1-206:1-235)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KB8 IW-----------------------------DTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVT
:: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IWVTLHQQTANFFLKSQIGNSPILKWAMWQYDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLVGNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLVGNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEAS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB8 AKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
190 200 210 220 230
>>CCDS73080.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 (182 aa)
initn: 973 init1: 973 opt: 973 Z-score: 1094.9 bits: 209.4 E(32554): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 1149; 88.3% identity (88.3% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-182)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELA----------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 --DTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESEN
100 110 120 130 140 150
190 200
pF1KB8 QNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
160 170 180
>>CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 (212 aa)
initn: 545 init1: 514 opt: 576 Z-score: 653.3 bits: 127.9 E(32554): 4.6e-30
Smith-Waterman score: 592; 47.6% identity (73.6% similar) in 208 aa overlap (9-203:7-211)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
.: .:::..::::: :::.::: :.: ::::.: .. :..::.. ::
CCDS61 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
:::::::: ::..: :::::: :..::::.:::::: .: .::.. . . . : .: ::.
CCDS61 IWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSN-MVIMLI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 GNKIDKENR-EVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAF----EELVEKIIQTPGL
::: : :.: :: ..:: :::.:...:.:.:::: ..:. :: .:. ::: . :.
CCDS61 GNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQE--GV
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB8 WESENQNKGVKLSHREEG--------QGGGACGGYCSVL
.. .:. .:.:.. .. . ::: :: :
CCDS61 FDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
180 190 200 210
>>CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 (216 aa)
initn: 505 init1: 505 opt: 571 Z-score: 647.6 bits: 126.8 E(32554): 9.5e-30
Smith-Waterman score: 571; 48.4% identity (77.1% similar) in 188 aa overlap (9-191:7-191)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
.: .:::..::::: :::.::: :.: ::::.: .. ...::.. ::
CCDS95 MTYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMVNIDGKQIKLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
:::::::: ::..: :::::: :..::::.:::.:: .: .::.. . . . : .. ::.
CCDS95 IWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLTSWLEDARQHSSSNMVI-MLI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 GNKIDKENR-EVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAF----EELVEKIIQTPGL
::: : :.: .: :.:: :::.:...:.:.:::: .:. :: .:. .:: : ::
CCDS95 GNKSDLESRRDVKREEGEAFAREHGLIFMETSAKTACNVEEAFINTAKEIYRKIQQ--GL
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB8 WESENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
.. .:. .:.:.. ..
CCDS95 FDVHNEANGIKIGPQQSISTSVGPSASQRNSRDIGSNSGCC
180 190 200 210
>>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 (205 aa)
initn: 547 init1: 460 opt: 557 Z-score: 632.4 bits: 124.0 E(32554): 6.7e-29
Smith-Waterman score: 557; 44.6% identity (73.8% similar) in 202 aa overlap (1-199:4-204)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKA
:. . .:.:.::.:::::: :::::.:::. .:::::::..:: .::.
CCDS46 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 KLAIWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVN
:: ::::::::::::.: ::::::.:.:.::::: ...: .. .::.:.. : ..: . .
CCDS46 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASEN-VNK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MLVGNKIDKENREV-DRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQT--PG
.::::: : ...: : . . .:: . .. :.:.:::. .:. .: .. .: . ::
CCDS46 LLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB8 LWESENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
. ....::.. :.::.:
CCDS46 ATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC
180 190 200
>>CCDS58073.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 (142 aa)
initn: 921 init1: 548 opt: 548 Z-score: 624.6 bits: 122.0 E(32554): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 795; 68.9% identity (68.9% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-142)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
::
CCDS58 IW----------------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ------ENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESEN
70 80 90 100 110
190 200
pF1KB8 QNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
120 130 140
>>CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 (201 aa)
initn: 487 init1: 442 opt: 545 Z-score: 619.2 bits: 121.5 E(32554): 3.6e-28
Smith-Waterman score: 545; 46.1% identity (75.6% similar) in 193 aa overlap (1-188:1-191)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
: .: .:.::::.::::::::::::.:.::. .:::::::..:. ..:.:.::
CCDS41 MARDYDHLFKLLIIGDSGVGKSSLLLRFADNTFSGSYITTIGVDFKIRTVEINGEKVKLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
::::::::::::.: .::::..:::.::::: ..::.. ::.:.. : .:. .::
CCDS41 IWDTAGQERFRTITSTYYRGTHGVIVVYDVTSAESFVNVKRWLHEINQNC--DDVCRILV
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 GNKIDKENREV-DRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTP----GL
::: : .:.: . ... ::: . .. ..:.::: .:. :. ..: .... .
CCDS41 GNKNDDPERKVVETEDAYKFAGQMGIQLFETSAKENVNVEEMFNCITELVLRAKKDNLAK
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB8 WESENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
....:: :::.
CCDS41 QQQQQQNDVVKLTKNSKRKKRCC
180 190 200
>>CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 (201 aa)
initn: 515 init1: 466 opt: 542 Z-score: 615.8 bits: 120.9 E(32554): 5.6e-28
Smith-Waterman score: 542; 44.1% identity (73.3% similar) in 202 aa overlap (1-199:1-200)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
:. . .:.:.::.:::::: :::::.:::. .:::::::..:: .::. ::
CCDS31 MNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLV
::::::::::::.: ::::::.:.:.::::: ....... .::.:.. : ..: . ..::
CCDS31 IWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASEN-VNKLLV
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 GNKIDKENREV-DRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQT--PGLWE
::: : ...: : . . .:: . .. :.:.:::. .:. :: .. .: . ::
CCDS31 GNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGA-A
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB8 SENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
: .. ..:.. .::.:
CCDS31 SGGERPNLKIDSTPVKPAGGGCC
180 190 200
>>CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 (200 aa)
initn: 516 init1: 463 opt: 539 Z-score: 612.5 bits: 120.2 E(32554): 8.5e-28
Smith-Waterman score: 539; 44.0% identity (76.7% similar) in 193 aa overlap (9-200:10-194)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKL
.:.:.::.:::::. .:.::.::.:. . .:::.:::.::. ..:.: ::
CCDS17 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 AIWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVNML
::::::::::.:.: ::::::.:..::::.: .: ....:: ... . . .:. ::
CCDS17 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEH-ANEDVERML
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VGNKIDKEN-REVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWES
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CCDS17 LGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEP
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB8 ENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
...: : .: .:::. :
CCDS17 NSEN--VDIS-----SGGGVTGWKSKCC
180 190 200
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]