Result of FASTA (omim) for
pF1KB8304
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8304, 298 aa
1>>>pF1KB8304 298 - 298 aa - 298 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3990+/-0.000621; mu= -32.6961+/- 0.036
mean_var=668.6213+/-146.784, 0's: 0 Z-trim(114.1): 1830 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.049600
statistics sampled from 21420 (23805) to 21420 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 6.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 ( 298) 1987 157.8 2.4e-38
NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 ( 305) 1552 126.6 5.8e-29
NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 ( 297) 1325 110.4 4.4e-24
NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinas ( 297) 1325 110.4 4.4e-24
XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-depe ( 297) 1325 110.4 4.4e-24
XP_011536034 (OMIM: 116953) PREDICTED: cyclin-depe ( 346) 1277 107.0 5.3e-23
NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-l ( 292) 1183 100.2 5e-21
XP_016885059 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1062 91.8 3e-18
NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 496) 1062 91.8 3e-18
XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1062 91.8 3e-18
XP_016885061 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1062 91.8 3e-18
XP_016885062 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1062 91.8 3e-18
XP_011542227 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1062 91.8 3e-18
XP_011542228 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1062 91.8 3e-18
XP_011542230 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1062 91.8 3e-18
XP_011542229 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1062 91.8 3e-18
XP_011542226 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1062 91.8 3e-18
NP_148978 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 502) 1062 91.8 3e-18
XP_011542225 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 503) 1062 91.8 3e-18
XP_011542224 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 540) 1062 91.8 3.1e-18
XP_016885058 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 543) 1062 91.8 3.1e-18
XP_011542223 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 544) 1062 91.8 3.2e-18
NP_001163931 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinas ( 570) 1062 91.8 3.3e-18
XP_011542222 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 571) 1062 91.8 3.3e-18
NP_439892 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 ( 264) 1043 90.2 4.8e-18
XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 1050 90.9 5.6e-18
NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinas ( 523) 1050 90.9 5.6e-18
XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 1050 90.9 5.6e-18
NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 1 ( 523) 1050 90.9 5.6e-18
NP_997667 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 1034 89.8 1.1e-17
NP_002587 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 1034 89.8 1.1e-17
NP_997668 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 504) 1034 89.8 1.2e-17
XP_011507904 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 542) 1034 89.8 1.3e-17
XP_016856912 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 572) 1034 89.8 1.3e-17
XP_016867811 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 966 84.9 3.1e-16
NP_001274065 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 423) 966 84.9 3.1e-16
XP_016867810 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 966 84.9 3.1e-16
XP_005250496 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 966 84.9 3.1e-16
XP_016867809 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 966 84.9 3.1e-16
XP_005250495 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 966 84.9 3.1e-16
XP_005250493 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 450) 966 84.9 3.2e-16
NP_036527 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinase 1 ( 451) 966 84.9 3.2e-16
XP_011514608 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 469) 966 84.9 3.3e-16
NP_001274064 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 469) 966 84.9 3.3e-16
NP_001790 (OMIM: 601955) cyclin-dependent kinase 7 ( 346) 908 80.6 4.7e-15
NP_277022 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 526) 905 80.6 7.4e-15
NP_277025 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 565) 905 80.6 7.8e-15
XP_011540798 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 578) 905 80.6 7.9e-15
NP_277024 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 748) 905 80.7 9.5e-15
XP_011540797 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 760) 905 80.7 9.6e-15
>>NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 iso (298 aa)
initn: 1987 init1: 1987 opt: 1987 Z-score: 809.3 bits: 157.8 E(85289): 2.4e-38
Smith-Waterman score: 1987; 100.0% identity (100.0% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
250 260 270 280 290
>>NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 [Ho (305 aa)
initn: 1536 init1: 1536 opt: 1552 Z-score: 640.9 bits: 126.6 E(85289): 5.8e-29
Smith-Waterman score: 1552; 76.4% identity (91.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
:. ::::::::::::::::::.:. ::..::::::::: : :::::::::::::::::.:
NP_001 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
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NP_001 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
:::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :.:
NP_001 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
.:::::::.::::::::::.::::::::::::::::: ::::.: .:::::..:::: ::
NP_001 TTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
:::.:. . ..:: :. .::.:: :.:.:::..::.::.:::::.:.. .: : :
NP_001 PKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSS-PEPSPAARQYV
250 260 270 280 290
NP_001 LQRFRH
300
>>NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 iso (297 aa)
initn: 1325 init1: 897 opt: 1325 Z-score: 553.3 bits: 110.4 E(85289): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 1325; 65.8% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (1-296:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::.. :.:::::::::::::.:.: ::.:::.:::::..: ::::::::::::::::: :
NP_001 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTG--IPLPLIKSYLFQLLQGLAFC
::::.: ::. ...:::.:::: .::::..: : : . :.::::.:.:::..::
NP_001 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLD-SIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 HSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCK
::.::::::::::::::. .:.:::::::::::::.:.:.:::::::::::.::.:::
NP_001 HSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 YYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP
::: :::::.: ::::..:.. :: :::::::::::::.::::.. ::: : :. :::
NP_001 RYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
.:::: .... : :::.: .:::.:: ::: ::::.: :: ::.:.:. . . ..
NP_001 TFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
240 250 260 270 280 290
>>NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 (297 aa)
initn: 1325 init1: 897 opt: 1325 Z-score: 553.3 bits: 110.4 E(85289): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 1325; 65.8% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (1-296:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::.. :.:::::::::::::.:.: ::.:::.:::::..: ::::::::::::::::: :
NP_001 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTG--IPLPLIKSYLFQLLQGLAFC
::::.: ::. ...:::.:::: .::::..: : : . :.::::.:.:::..::
NP_001 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLD-SIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 HSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCK
::.::::::::::::::. .:.:::::::::::::.:.:.:::::::::::.::.:::
NP_001 HSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 YYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP
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NP_001 RYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
.:::: .... : :::.: .:::.:: ::: ::::.: :: ::.:.:. . . ..
NP_001 TFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
240 250 260 270 280 290
>>XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-dependen (297 aa)
initn: 1325 init1: 897 opt: 1325 Z-score: 553.3 bits: 110.4 E(85289): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 1325; 65.8% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (1-296:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::.. :.:::::::::::::.:.: ::.:::.:::::..: ::::::::::::::::: :
XP_005 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTG--IPLPLIKSYLFQLLQGLAFC
::::.: ::. ...:::.:::: .::::..: : : . :.::::.:.:::..::
XP_005 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLD-SIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 HSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCK
::.::::::::::::::. .:.:::::::::::::.:.:.:::::::::::.::.:::
XP_005 HSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 YYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP
::: :::::.: ::::..:.. :: :::::::::::::.::::.. ::: : :. :::
XP_005 RYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
.:::: .... : :::.: .:::.:: ::: ::::.: :: ::.:.:. . . ..
XP_005 TFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
240 250 260 270 280 290
>>XP_011536034 (OMIM: 116953) PREDICTED: cyclin-dependen (346 aa)
initn: 1973 init1: 1277 opt: 1277 Z-score: 533.9 bits: 107.0 E(85289): 5.3e-23
Smith-Waterman score: 1762; 85.5% identity (85.5% similar) in 330 aa overlap (1-282:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEM--------------------------------------------
::::::::::::::::
XP_011 STAVDIWSLGCIFAEMHLVGTQHHARCCGEHRRNGRQSLCPLCSYLEVAASQGWGMTAVS
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 ----VTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVV
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XP_011 TPYPVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVV
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260 270 280 290
pF1KB8 PPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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XP_011 PPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
310 320 330 340
>>NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-like (292 aa)
initn: 1025 init1: 524 opt: 1183 Z-score: 498.5 bits: 100.2 E(85289): 5e-21
Smith-Waterman score: 1183; 59.9% identity (82.0% similar) in 294 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
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NP_004 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
:::.: ::.:...:: ::::: :::::..:. : ..::.:::::.::.::::
NP_004 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
70 80 90 100 110
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pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
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NP_004 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
120 130 140 150 160 170
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pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTR-RALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPS
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NP_004 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKP-
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pF1KB8 FPKW-ARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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NP_004 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
240 250 260 270 280 290
>>XP_016885059 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen (496 aa)
initn: 902 init1: 590 opt: 1062 Z-score: 448.7 bits: 91.8 E(85289): 3e-18
Smith-Waterman score: 1062; 53.9% identity (80.5% similar) in 297 aa overlap (1-296:162-456)
10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
.:.. :..:.:::::..:::...::: ..:
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pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
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XP_016 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
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pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
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XP_016 LDDCG-NIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
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pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
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XP_016 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
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220 230 240 250 260
pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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XP_016 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
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>>NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 16 is (496 aa)
initn: 902 init1: 590 opt: 1062 Z-score: 448.7 bits: 91.8 E(85289): 3e-18
Smith-Waterman score: 1062; 53.9% identity (80.5% similar) in 297 aa overlap (1-296:162-456)
10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
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pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
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NP_006 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
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pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
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NP_006 LDDCG-NIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
260 270 280 290 300
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pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
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NP_006 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
310 320 330 340 350 360
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pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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NP_006 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
430 440 450 460 470 480
>>XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen (496 aa)
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10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
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XP_016 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
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XP_016 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
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XP_016 LDDCG-NIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
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XP_016 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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XP_016 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQF
370 380 390 400 410 420
270 280 290
pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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430 440 450 460 470 480
298 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 11:34:16 2016 done: Fri Nov 4 11:34:17 2016
Total Scan time: 6.680 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]