Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8304
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8304, 298 aa
1>>>pF1KB8304 298 - 298 aa - 298 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0905+/-0.00135; mu= 0.8122+/- 0.076
mean_var=239.6911+/-57.328, 0's: 0 Z-trim(106.9): 712 B-trim: 221 in 1/47
Lambda= 0.082842
statistics sampled from 8412 (9261) to 8412 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 1987 251.0 8.2e-67
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 1552 199.0 3.7e-51
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 1325 171.8 5.4e-43
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 1183 154.9 6.9e-38
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 1062 140.6 2.2e-33
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 1062 140.7 2.2e-33
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 1062 140.7 2.4e-33
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 1050 139.2 6.2e-33
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 1050 139.2 6.2e-33
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 264) 1043 138.1 7e-33
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 1034 137.3 2.2e-32
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 1034 137.3 2.3e-32
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 966 129.1 5.6e-30
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 966 129.1 5.9e-30
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 966 129.1 6e-30
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 908 122.1 6e-28
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 905 122.1 1.3e-27
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 905 122.1 1.3e-27
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 905 122.1 1.3e-27
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 899 121.4 2.2e-27
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 899 121.4 2.2e-27
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 899 121.4 2.2e-27
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 899 121.4 2.2e-27
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 890 120.0 2.9e-27
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 890 120.0 2.9e-27
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 890 120.0 3.1e-27
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 886 119.5 3.8e-27
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 879 118.6 6.6e-27
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 851 115.2 6.5e-26
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 830 112.7 3.9e-25
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 765 105.1 1.1e-22
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 762 104.6 1.1e-22
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 765 105.2 1.2e-22
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 750 103.4 4.1e-22
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 750 103.5 4.3e-22
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 750 103.5 4.4e-22
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 743 102.3 4.8e-22
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 740 102.3 1e-21
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 723 99.8 2.3e-21
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 723 99.9 2.6e-21
CCDS76567.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 238) 712 98.5 5.3e-21
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 705 97.7 1e-20
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 707 98.5 1.8e-20
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 685 95.6 8.6e-20
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 682 95.5 1.6e-19
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 682 95.6 1.7e-19
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 672 93.9 1.9e-19
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 663 92.8 4e-19
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 663 92.8 4.2e-19
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 657 91.9 5.2e-19
>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa)
initn: 1987 init1: 1987 opt: 1987 Z-score: 1312.9 bits: 251.0 E(32554): 8.2e-67
Smith-Waterman score: 1987; 100.0% identity (100.0% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
250 260 270 280 290
>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa)
initn: 1536 init1: 1536 opt: 1552 Z-score: 1031.8 bits: 199.0 E(32554): 3.7e-51
Smith-Waterman score: 1552; 76.4% identity (91.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
:. ::::::::::::::::::.:. ::..::::::::: : :::::::::::::::::.:
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
::::.::::.:.: ::::::::: :::::.::.. . .:: ::::::::::::..::::
CCDS11 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
:::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :.:
CCDS11 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
.:::::::.::::::::::.::::::::::::::::: ::::.: .:::::..:::: ::
CCDS11 TTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
:::.:. . ..:: :. .::.:: :.:.:::..::.::.:::::.:.. .: : :
CCDS11 PKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSS-PEPSPAARQYV
250 260 270 280 290
CCDS11 LQRFRH
300
>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 1325 init1: 897 opt: 1325 Z-score: 885.4 bits: 171.8 E(32554): 5.4e-43
Smith-Waterman score: 1325; 65.8% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (1-296:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
::.. :.:::::::::::::.:.: ::.:::.:::::..: ::::::::::::::::: :
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTG--IPLPLIKSYLFQLLQGLAFC
::::.: ::. ...:::.:::: .::::..: : : . :.::::.:.:::..::
CCDS44 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLD-SIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 HSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCK
::.::::::::::::::. .:.:::::::::::::.:.:.:::::::::::.::.:::
CCDS44 HSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 YYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP
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CCDS44 RYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
.:::: .... : :::.: .:::.:: ::: ::::.: :: ::.:.:. . . ..
CCDS44 TFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
240 250 260 270 280 290
>>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 (292 aa)
initn: 1025 init1: 524 opt: 1183 Z-score: 793.7 bits: 154.9 E(32554): 6.9e-38
Smith-Waterman score: 1183; 59.9% identity (82.0% similar) in 294 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
:....:.:::::::::.:.::.:. : :.::::..::: . :::::.:.::: :::::.:
CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
:::.: ::.:...:: ::::: :::::..:. : ..::.:::::.::.::::
CCDS47 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
. :::::::::::::: .: .::::::::::::.::: :. :::::::: :..:.: : :
CCDS47 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTR-RALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPS
::..:.:: ::::::... : ::::.. ::: :::: :::: : ::..:..:::::
CCDS47 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKP-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FPKW-ARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
.: . : .. .::: :. ::.::...:. .: .::::. :: ::.:.: :
CCDS47 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
240 250 260 270 280 290
>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (496 aa)
initn: 902 init1: 590 opt: 1062 Z-score: 712.8 bits: 140.6 E(32554): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 1062; 53.9% identity (80.5% similar) in 297 aa overlap (1-296:162-456)
10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
.:.. :..:.:::::..:::...::: ..:
CCDS14 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
:::.:::. : ::.: :::::.::::.:.: ::: : :.::::..: ::::.: .:::..
CCDS14 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
.: . . : . .: .:::::.:::.:: ..:::::::::::::: .: .:::::::::
CCDS14 LDDCG-NIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
: ..:..::..:::::::: :.:::: ::: .:.:..:::: ::.: : ::::.. .
CCDS14 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
:: ::: :::: : .:::. : ..: ..::. . . . .: :: :: .::...:..
CCDS14 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQF
370 380 390 400 410 420
270 280 290
pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
. .::::. :. :::: .. . . .:
CCDS14 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
430 440 450 460 470 480
>>CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (502 aa)
initn: 902 init1: 590 opt: 1062 Z-score: 712.7 bits: 140.7 E(32554): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 1062; 53.9% identity (80.5% similar) in 297 aa overlap (1-296:168-462)
10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
.:.. :..:.:::::..:::...::: ..:
CCDS48 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
:::.:::. : ::.: :::::.::::.:.: ::: : :.::::..: ::::.: .:::..
CCDS48 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
.: . . : . .: .:::::.:::.:: ..:::::::::::::: .: .:::::::::
CCDS48 LDDCG-NIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
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CCDS48 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
320 330 340 350 360 370
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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CCDS48 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQF
380 390 400 410 420 430
270 280 290
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CCDS48 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
440 450 460 470 480 490
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10 20 30
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CCDS55 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
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CCDS55 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
390 400 410 420 430 440
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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CCDS55 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQF
450 460 470 480 490 500
270 280 290
pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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CCDS55 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
510 520 530 540 550 560
>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
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10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
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pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
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CCDS53 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
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CCDS53 MDDCG-NIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLAR
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pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
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CCDS53 AKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVED
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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CCDS53 ELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQY
400 410 420 430 440 450
270 280 290
pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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CCDS53 ESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVI
460 470 480 490 500 510
>>CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
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10 20 30
pF1KB8 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVV
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CCDS90 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
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pF1KB8 ALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKF
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CCDS90 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
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pF1KB8 MDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAR
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CCDS90 MDDCG-NIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLAR
280 290 300 310 320 330
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pF1KB8 AFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEID
: .::..::..:::::::: :..::: . ::: .:.:..:::: ::.. : ::::.. :
CCDS90 AKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVED
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 QLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKP-SFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHY
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CCDS90 ELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQY
400 410 420 430 440 450
270 280 290
pF1KB8 DPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
. .::.::. :. : .:...
CCDS90 ESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKN
460 470 480 490 500 510
>>CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (264 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
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pF1KB8 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
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CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEV-----------------
130 140 150 160
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pF1KB8 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 -----------------TRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
170 180 190 200
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
210 220 230 240 250 260
298 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 11:34:15 2016 done: Fri Nov 4 11:34:16 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]