Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8295
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8295, 473 aa
1>>>pF1KB8295 473 - 473 aa - 473 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6395+/-0.000914; mu= 8.1253+/- 0.054
mean_var=216.7209+/-45.759, 0's: 0 Z-trim(112.8): 922 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.087121
statistics sampled from 12478 (13497) to 12478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.415), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5681.1 ZSCAN21 gene_id:7589|Hs108|chr7 ( 473) 3321 430.4 2.1e-120
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 1370 185.2 1.4e-46
CCDS78119.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 ( 478) 1114 153.0 6.6e-37
CCDS4643.1 ZNF165 gene_id:7718|Hs108|chr6 ( 485) 1110 152.5 9.5e-37
CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX ( 518) 957 133.3 6.1e-31
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 958 133.5 6.3e-31
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 958 133.5 6.5e-31
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 958 133.5 6.6e-31
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 958 133.5 6.7e-31
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 932 130.2 5.8e-30
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 925 129.2 9.3e-30
CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 925 129.3 1.1e-29
CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 925 129.3 1.1e-29
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 921 128.6 1.1e-29
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 921 128.7 1.3e-29
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 921 128.7 1.4e-29
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 921 128.9 1.7e-29
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 916 128.2 2.3e-29
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 916 128.2 2.5e-29
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 914 127.9 2.7e-29
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 910 127.3 3.6e-29
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 910 127.4 3.9e-29
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 911 127.6 4e-29
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 907 127.0 5e-29
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 907 127.0 5e-29
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 906 126.9 5.4e-29
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 906 126.9 5.4e-29
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 903 126.5 6.5e-29
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 903 126.5 6.8e-29
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 900 126.0 7.9e-29
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 903 126.6 8.1e-29
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 902 126.4 8.2e-29
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 902 126.5 8.8e-29
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 899 126.1 1.1e-28
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 892 124.9 1.4e-28
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 891 125.0 1.9e-28
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 893 125.4 2.1e-28
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 889 124.6 2.1e-28
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 893 125.4 2.1e-28
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 893 125.4 2.2e-28
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 895 125.8 2.2e-28
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 893 125.5 2.2e-28
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 895 125.8 2.2e-28
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 891 125.1 2.3e-28
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 890 124.9 2.4e-28
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 890 124.9 2.4e-28
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 890 125.0 2.4e-28
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 890 125.0 2.5e-28
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 890 125.0 2.6e-28
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 886 124.3 3e-28
>>CCDS5681.1 ZSCAN21 gene_id:7589|Hs108|chr7 (473 aa)
initn: 3321 init1: 3321 opt: 3321 Z-score: 2275.3 bits: 430.4 E(32554): 2.1e-120
Smith-Waterman score: 3321; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MMTKVLGMAPVLGPRPPQEQVGPLMVKVEEKEEKGKYLPSLEMFRQRFRQFGYHDTPGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MMTKVLGMAPVLGPRPPQEQVGPLMVKVEEKEEKGKYLPSLEMFRQRFRQFGYHDTPGPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EALSQLRVLCCEWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPQELQAWVQEHCPESAEEAVTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EALSQLRVLCCEWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPQELQAWVQEHCPESAEEAVTLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EDLERELDEPGHQVSTPPNEQKPVWEKISSSGTAKESPSSMQPQPLETSHKYESWGPLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EDLERELDEPGHQVSTPPNEQKPVWEKISSSGTAKESPSSMQPQPLETSHKYESWGPLYI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QESGEEQEFAQDPRKVRDCRLSTQHEESADEQKGSEAEGLKGDIISVIIANKPEASLERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QESGEEQEFAQDPRKVRDCRLSTQHEESADEQKGSEAEGLKGDIISVIIANKPEASLERQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 CVNLENEKGTKPPLQEAGSKKGRESVPTKPTPGERRYICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CVNLENEKGTKPPLQEAGSKKGRESVPTKPTPGERRYICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GEKPYVCTKCGKAFSHSSNLTLHYRTHLVDRPYDCKCGKAFGQSSDLLKHQRMHTEEAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GEKPYVCTKCGKAFSHSSNLTLHYRTHLVDRPYDCKCGKAFGQSSDLLKHQRMHTEEAPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QCKDCGKAFSGKGSLIRHYRIHTGEKPYQCNECGKSFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QCKDCGKAFSGKGSLIRHYRIHTGEKPYQCNECGKSFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKCKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB8 CGKAFNHSSNFNKHHRIHTGEKPYWCHHCGKTFCSKSNLSKHQRVHTGEGEAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CGKAFNHSSNFNKHHRIHTGEKPYWCHHCGKTFCSKSNLSKHQRVHTGEGEAP
430 440 450 460 470
>>CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 (494 aa)
initn: 1218 init1: 643 opt: 1370 Z-score: 949.8 bits: 185.2 E(32554): 1.4e-46
Smith-Waterman score: 1409; 46.2% identity (71.6% similar) in 493 aa overlap (7-467:3-492)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MMTKVLGMAPVLGPRPPQEQVGPLMVKVEEK-----EEKG-KYLP-SLEMFRQRFRQFGY
: : ::. . :.:: : :.:::::. .. : . : : :.:::.::::.:
CCDS42 MSGEATVLAYHAPEEQEGLLVVKVEEENYVLDQDFGLQENPWSQEVFRQKFRQFSY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 HDTPGPREALSQLRVLCCEWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPQELQAWVQEHCPESA
:. :::::::.:: :::.:::::.:.::::::::.:::::.:::.:::::..:: ::..
CCDS42 SDSTGPREALSRLRELCCQWLRPEVHSKEQILELLMLEQFLAILPEELQAWLREHRPENG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EEAVTLLEDLERELDEPGHQVSTPPNEQKPVWEKISSSGTAKESPSSMQP-QPLETSHKY
:::::.::.::.::.:: .: .: . :. :....:.:. : : : .: ::::.. :
CCDS42 EEAVTMLEELEKELEEPRQQDTT--HGQEMFWQEMTSTGALK-SLSLNSPVQPLENQCKT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB8 ESWGPLYIQESGEEQ---EFAQDPRKVRDCRLS------------TQHEESADEQKGS--
:. .:: .. . . ... .: : :. .. :.: :.
CCDS42 ETQESQAFQERDGRMVAGKVLMAKQEIVECVASAAMISPGKLPGETHSQRIAEEALGGLD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 EAEGLKGDIISVIIANKPEASLERQCVNLENEKGTKPPLQEAGSKKGRESVPTKPTPG--
... ::. . :.. : . . . .... . :. . :. ..: :. ..
CCDS42 NSKKQKGNAAGNKISQLPSQDRHFSLATFNRRIPTEHSVLESHESEGSFSMNSNDITQQS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB8 ----ERRYICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHTGEKPYVCTKCGKAFSHSSNLTLHYRTHLV
:. : : .::::: .::.: .:.: ::::.::.: .:::::: ::.:. : : :
CCDS42 VDTREKLYECFDCGKAFCQSSKLIRHQRIHTGERPYACKECGKAFSLSSDLVRHQRIHSG
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 DRPYDC-KCGKAFGQSSDLLKHQRMHTEEAPYQCKDCGKAFSGKGSLIRHYRIHTGEKPY
..::.: .::::: ::.:..:.:.:: : ::.: .:::::: ...::.: .::::.: :
CCDS42 EKPYECCECGKAFRGSSELIRHRRIHTGEKPYECGECGKAFSRSSALIQHKKIHTGDKSY
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 QCNECGKSFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKCKECGKAFNHSSNFNKHHRIHTGEKPYWCHH
.: :::.:.. . : :::.:::::::.:.::::.::.:: ...:.::::::::: : .
CCDS42 ECIACGKAFGRSSILIEHQRIHTGEKPYECNECGKSFNQSSALTQHQRIHTGEKPYECSE
420 430 440 450 460 470
450 460 470
pF1KB8 CGKTFCSKSNLSKHQRVHTGEGEAP
: ::: .:.: .:::.::
CCDS42 CRKTFRHRSGLMQHQRTHTRV
480 490
>>CCDS78119.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 (478 aa)
initn: 1611 init1: 704 opt: 1114 Z-score: 776.0 bits: 153.0 E(32554): 6.6e-37
Smith-Waterman score: 1137; 43.4% identity (67.6% similar) in 438 aa overlap (46-466:52-472)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 PPQEQVGPLMVKVEEKEEKGKYLPSLEMFRQRFRQFGYHDTPGPREALSQLRVLCCEWLR
..:::. :..: :::::::.:: :: .::.
CCDS78 RVVREDHYSTWEQGFKLQGNSKGLGQEPLCKQFRQLRYEETTGPREALSRLRELCQQWLQ
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 PEIHTKEQILELLVLEQFLTILPQELQAWVQEHCPESAEEAVTLLEDLERELDEPGHQVS
:: :::::::::::::::: :::.:::: :::: ::: :..:..::::. .: : :.:
CCDS78 PETHTKEQILELLVLEQFLIILPKELQARVQEHHPESREDVVVVLEDLQLDLGETGQQDP
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 TPPNEQKPVWEKISSSGTAKESPSSMQPQPLETSHKYESWGPLYIQESGEEQEFAQDPRK
:..:: . :... ...: : .. :. : : .:.::: .. .
CCDS78 DQPKKQKILVEEMAPL-------KGVQEQ--QVRHECEVTKPE--KEKGEETRIENGKLI
150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 V--RDC-RLSTQHEESADEQKGSEAEGLKGDIISVIIANKPEASLERQCVNLENEKGTKP
: .: :. .. . : . .:. .:. ::. ..: .: . :.. .
CCDS78 VVTDSCGRVESSGKISEPMEAHNEGSNLERH------QAKPKEKIEYKCSEREQRFIQHL
200 210 220 230 240
260 270 280 290
pF1KB8 PLQE-AGSKKGR---ES--VPTKPTPGERRYI-------CAECGKAFSNSSNLTKHRRTH
: : :... :. :: .. :... . : ::::::. ::.:..:.. :
CCDS78 DLIEHASTHTGKKLCESDVCQSSSLTGHKKVLSREKGHQCHECGKAFQRSSHLVRHQKIH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TGEKPYVCTKCGKAFSHSSNLTLHYRTHLVDRPYDC-KCGKAFGQSSDLLKHQRMHTEEA
::::: :..:::.::....: : : : ..:: : .::: : .:: : .:::.:..:
CCDS78 LGEKPYQCNECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCIHCGKNFRRSSHLNRHQRIHSQEE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PYQCKDCGKAFSGKGSLIRHYRIHTGEKPYQCNECGKSFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKC
: .::.:::.:: : .: :::. : .:::::::.:: . : :.:.::::::.::
CCDS78 PCECKECGKTFSQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGEKPFKC
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KECGKAFNHSSNFNKHHRIHTGEKPYWCHHCGKTFCSKSNLSKHQRVHTGEGEAP
. : ::: .:.. .: :::. :::: : .::..: ..:.: .::: :
CCDS78 NICQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYQCSECGEAFRQRSGLFQHQRYHHKDKLA
430 440 450 460 470
>>CCDS4643.1 ZNF165 gene_id:7718|Hs108|chr6 (485 aa)
initn: 1812 init1: 587 opt: 1110 Z-score: 773.3 bits: 152.5 E(32554): 9.5e-37
Smith-Waterman score: 1169; 42.1% identity (68.0% similar) in 478 aa overlap (17-469:14-481)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MMTKVLGMAPVLGPRPPQEQVGPLMVKVEEKE---------EKGKYLPSLEMFRQRFRQF
:... : :.::.::.: .... : . :. :: ::::
CCDS46 MATEPKKAAAQNSPEDE-GLLIVKIEEEEFIHGQDTCLQRSELLKQ-ELCRQLFRQF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GYHDTPGPREALSQLRVLCCEWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPQELQAWVQEHCPE
:.:.::::::::.:: :::.::.::::::::::::::::::::::: .:::::.:: ::
CCDS46 CYQDSPGPREALSRLRELCCQWLKPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPGDLQAWVHEHYPE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SAEEAVTLLEDLERELDEPGHQVSTPPNEQKPVWEKISSSGTAKESPSSMQPQPLETSHK
:.:::::.:::::: :: ::.. . :. .:.: : : ... ::.::. .
CCDS46 SGEEAVTILEDLERGTDEAVLQVQAHEHGQEIFQKKVSPPGPAL----NVKLQPVETKAH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 YESWGPLYIQESGEEQEFAQDPRKVRDCRLSTQHEESADEQKG--SEAEGLKGDIISVII
..: : . . .:.: ... :.. . ... . . .: ::: : . :: .
CCDS46 FDSSEPQLLWDCDNESENSRSMPKLEIFEKIESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSAG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 ANK---PEASLERQCVNLENEKGTKPPLQEAGSKKG----------RESVPTKPTPGERR
: . : : : .. ...: : . .. .: : .. .. ..
CCDS46 RVKRQWEKESGESQRLSSAQDEGFGKILTHKNTVRGEIISHDGCERRLNLNSNEFTHQKS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 YICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHTGEKPYVCTKCGKAFSHSSNLTLHYRTHLVDRPYDC-
. : ..:. .:.. .:. ..::: . . ::.:. : .:. : . :. ..:
CCDS46 CKHGTCDQSFKWNSDFINHQIIYAGEKNH---QYGKSFK-SPKLAKHAAVFSGDKTHQCN
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
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460 470
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