Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8294, 691 aa
1>>>pF1KB8294 691 - 691 aa - 691 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6472+/-0.00127; mu= -8.3939+/- 0.075
mean_var=426.5056+/-88.539, 0's: 0 Z-trim(112.1): 87 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.062103
statistics sampled from 12819 (12890) to 12819 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16
Scan time: 3.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8864.1 CALCOCO1 gene_id:57658|Hs108|chr12 ( 691) 4472 415.6 1.2e-115
CCDS44908.1 CALCOCO1 gene_id:57658|Hs108|chr12 ( 606) 2343 224.8 2.8e-58
CCDS43561.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 ( 747) 736 80.9 7.3e-15
CCDS5415.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 ( 789) 736 81.0 7.6e-15
>>CCDS8864.1 CALCOCO1 gene_id:57658|Hs108|chr12 (691 aa)
initn: 4472 init1: 4472 opt: 4472 Z-score: 2189.8 bits: 415.6 E(32554): 1.2e-115
Smith-Waterman score: 4472; 100.0% identity (100.0% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 YHTFVWSSVPESTTDGSPIHTSVQFQASYLPKPGAQLYQFRYVNRQGQVCGQSPPFQFRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTELRSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDIQTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDIQTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAELQVAQQENHHLNLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAELQVAQQENHHLNLDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KEAKSWQEEQSAQAQRLKDKVAQMKDTLGQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQWSKERAGLLQSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQWSKERAGLLQSVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVFKTELAREKDSSLVQLSESKRELTELRSALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVFKTELAREKDSSLVQLSESKRELTELRSALR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 VLQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VLQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASPLVVISQPAPISPHLSGPAEDSSSDSEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASPLVVISQPAPISPHLSGPAEDSSSDSEAE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 DEKSVLMAAVQSGGEEANLLLPELGSAFYDMASGFTVGTLSETSTGGPATPTWKECPICK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DEKSVLMAAVQSGGEEANLLLPELGSAFYDMASGFTVGTLSETSTGGPATPTWKECPICK
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB8 ERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
670 680 690
>>CCDS44908.1 CALCOCO1 gene_id:57658|Hs108|chr12 (606 aa)
initn: 2889 init1: 2308 opt: 2343 Z-score: 1159.7 bits: 224.8 E(32554): 2.8e-58
Smith-Waterman score: 3707; 87.7% identity (87.7% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YHTFVWSSVPESTTDGSPIHTSVQFQASYLPKPGAQLYQFRYVNRQGQVCGQSPPFQFRE
:::::::::::::::::::::::::: :
CCDS44 YHTFVWSSVPESTTDGSPIHTSVQFQ---------------------------------E
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTELRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTELRSR
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDIQTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDIQTI
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAELQVAQQENHHLNLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAEL--------------
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KEAKSWQEEQSAQAQRLKDKVAQMKDTLGQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAT
::::::::::::::::::::::
CCDS44 --------------------------------------EPLKEQLRGAQELAASSQQKAT
260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQWSKERAGLLQSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQWSKERAGLLQSVE
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVFKTELAREKDSSLVQLSESKRELTELRSALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVFKTELAREKDSSLVQLSESKRELTELRSALR
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 VLQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSE
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASPLVVISQPAPISPHLSGPAEDSSSDSEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASPLVVISQPAPISPHLSGPAEDSSSDSEAE
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 DEKSVLMAAVQSGGEEANLLLPELGSAFYDMASGFTVGTLSETSTGGPATPTWKECPICK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DEKSVLMAAVQSGGEEANLLLPELGSAFYDMASGFTVGTLSETSTGGPATPTWKECPICK
520 530 540 550 560 570
670 680 690
pF1KB8 ERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
580 590 600
>>CCDS43561.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 (747 aa)
initn: 993 init1: 428 opt: 736 Z-score: 380.4 bits: 80.9 E(32554): 7.3e-15
Smith-Waterman score: 954; 29.1% identity (60.5% similar) in 731 aa overlap (2-680:5-712)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAAC
.: :: .. . . : : :::..:.::...:::::: : : .::.::::: .
CCDS43 MTSFQEVPL-QTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHTSVQFQASYLPKPGAQLYQFRYVNRQGQVCGQSPPFQ
.:::.::.:: .:: ..:: .. . ::. :::. ...::: ::...:.. : : :::
CCDS43 ARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 FREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTEL
:: :..::.:.:. .:.::.:.:. :: .:. .......:...:..: :: ....:
CCDS43 FRASSPVEELLTMED-EGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RSRVQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDI
: .: ..:: : ... .:. . ::... . : . .... .: ... .::.::
CCDS43 REQVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QTISEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAELQVAQQENHHLN
....:.. ::.::: :.: .: .:.:.: ::: . .:: ...:. .. :: .:
CCDS43 VSVTHKAIEKETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB8 LDLKEAKSWQEEQSAQAQRLKDKVAQMKDTLGQAQ--QRVAELEP--------LKEQLRG
... :. . .. . ..:....... :.. . ::. : ::::::
CCDS43 SEVQTLKNLDGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 AQELAASSQQKATLLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQ
:.: . ...:....:..::..:. .::::.:.:: .::: .:. .::. .:: . .
CCDS43 AEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB8 WSKERAGLLQSV---EAEKDKI-LKLSA--------EILRLEKAVQEERTQ----NQVFK
..... :. :.: :. :...: : ::.: ... : :.::
CCDS43 KDQDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB8 TELAREK---DSSL------------VQLSESKRELT-ELRSALRV--LQKEKEQLQEEK
. . .. :.:. :. : : : .. . .: . :: . :.
CCDS43 KKTGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKY
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KB8 QELLEYMRKLEARLEKVADE------KWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSEDESPEDM
.. . .. .:. .: ::: ::.:.. :.. . : : . :. : ...
CCDS43 NKCKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIA-ENVKLEL---AEVQDNYKELKRSL
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASPLVVISQPAPISPHLSGPAEDSSSDSEAED-EKSVL
. : : : :. . :. : : . : ::.. : . :: : :
CCDS43 ENPAERKMEDGADGAFYPDEIQRPPVRVPSWGLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKE
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 MAAVQSGGEEANLLLPELGSAF-YDMASGFTVGTLSETSTGGPATPTWKECPICKERFPA
: .. . . : :..: .: :.: : :.::.:. ::
CCDS43 DENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCFD--SSFDVH---------------KKCPLCELMFPP
660 670 680 690
670 680 690
pF1KB8 ESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
. :.. .:.:...:.
CCDS43 NYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTHFDQNVLNFD
700 710 720 730 740
>>CCDS5415.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 (789 aa)
initn: 993 init1: 428 opt: 736 Z-score: 380.0 bits: 81.0 E(32554): 7.6e-15
Smith-Waterman score: 906; 28.7% identity (61.9% similar) in 708 aa overlap (2-651:5-704)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAAC
.: :: .. . . : : :::..:.::...:::::: : : .::.::::: .
CCDS54 MTSFQEVPL-QTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHTSVQFQASYLPKPGAQLYQFRYVNRQGQVCGQSPPFQ
.:::.::.:: .:: ..:: .. . ::. :::. ...::: ::...:.. : : :::
CCDS54 ARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 FREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTEL
:: :..::.:.:. .:.::.:.:. :: .:. .......:...:..: :: ....:
CCDS54 FRASSPVEELLTMED-EGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RSRVQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDI
: .: ..:: : ... .:. . ::... . : . .... .: ... .::.::
CCDS54 REQVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QTISEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAELQVAQQENHHLN
....:.. ::.::: :.: .: .:.:.: ::: . .:: ...:. .. :: .:
CCDS54 VSVTHKAIEKETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB8 LDLKEAKSWQEEQSAQAQRLKDKVAQMKDTLGQAQ--QRVAELEP--------LKEQLRG
... :. . .. . ..:....... :.. . ::. : ::::::
CCDS54 SEVQTLKNLDGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 AQELAASSQQKATLLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQ
:.: . ...:....:..::..:. .::::.:.:: .::: .:. .::. .:: . .
CCDS54 AEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB8 WSKERAGLLQSV---EAEKDKI-LKLSA--------EILRLEKAVQEERTQ----NQVFK
..... :. :.: :. :...: : ::.: ... : :.::
CCDS54 KDQDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB8 TELAREK---DSSL------------VQLSESKRELT-ELRSALRV--LQKEKEQLQEEK
. . .. :.:. :. : : : .. . .: . :: . :.
CCDS54 KKTGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKY
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KB8 QELLEYMRKLEARLEKVADE------KWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSEDESPEDM
.. . .. .:. .: ::: ::.:.. :.. . : : . :. : ...
CCDS54 NKCKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIA-ENVKLEL---AEVQDNYKELKRSL
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590
pF1KB8 RLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASP----LVVISQPAPI----SPHLSGPAEDSSSDSEA
. : : :. ..:: . : ....:. :. .:. : ..:... .
CCDS54 ENPAERKME-GQNSQSPQCFKTCSEQNGYVLTLSNAQPVLQYGNPYASQETRDGADGAFY
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 EDEKSVLMAAVQSGGEEANLLLPELGSAFYDMASGFTVGTLSETSTGGPATPTWKECPIC
:: . . : : : : :.. . . : . .:. . :. . . :..:
CCDS54 PDEIQRPPVRVPSWGLEDNVVCSQPARNF-SRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLR
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690
pF1KB8 KERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
CCDS54 GHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQV
720 730 740 750 760 770
691 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 11:28:16 2016 done: Fri Nov 4 11:28:17 2016
Total Scan time: 3.820 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]