Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8220
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8220, 432 aa
1>>>pF1KB8220 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9089+/-0.00131; mu= -3.3364+/- 0.077
mean_var=312.4235+/-65.287, 0's: 0 Z-trim(109.7): 159 B-trim: 76 in 1/52
Lambda= 0.072561
statistics sampled from 10928 (11077) to 10928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 2701 296.7 2.9e-80
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 2450 270.4 2.4e-72
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 2447 270.1 3e-72
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 1608 182.3 8.6e-46
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 1580 179.4 6.6e-45
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 1438 164.5 2e-40
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 1097 128.8 1.1e-29
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 1045 123.4 5.3e-28
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 1024 121.5 3.5e-27
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 881 106.5 1.2e-22
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 754 92.9 7.2e-19
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 754 93.0 7.5e-19
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 751 92.6 8.8e-19
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 725 89.9 6.5e-18
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 708 88.2 2.3e-17
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 703 87.6 2.9e-17
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 704 87.8 3e-17
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 701 87.4 3.4e-17
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 700 87.3 4.1e-17
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 700 87.4 4.4e-17
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 696 86.9 5.7e-17
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 692 86.5 6.7e-17
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 689 86.1 7.4e-17
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 691 86.4 8.5e-17
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 688 86.1 9.7e-17
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 686 85.8 9.8e-17
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 685 85.7 1.1e-16
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 687 86.0 1.1e-16
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 681 85.3 1.5e-16
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 676 84.8 2.2e-16
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 677 85.0 2.4e-16
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 669 84.1 3.7e-16
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 667 83.8 3.8e-16
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 667 83.9 4.2e-16
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 664 83.5 4.7e-16
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 657 82.7 7.4e-16
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 657 82.8 8.1e-16
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 658 82.9 8.2e-16
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 654 82.5 1.1e-15
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 651 82.2 1.4e-15
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 642 81.2 2.5e-15
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 628 79.7 5.9e-15
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 625 79.4 8.7e-15
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 620 78.9 1.1e-14
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 612 78.1 2.1e-14
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 611 77.9 2.1e-14
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 611 78.0 2.4e-14
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 608 77.6 2.7e-14
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 603 77.1 3.9e-14
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 600 76.9 5.9e-14
>>CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 2701 init1: 2701 opt: 2701 Z-score: 1554.4 bits: 296.7 E(32554): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 2701; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSLDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSLDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDGEV
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB8 IKESKQEHKDVM
::::::::::::
CCDS11 IKESKQEHKDVM
430
>>CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (431 aa)
initn: 2442 init1: 2442 opt: 2450 Z-score: 1412.4 bits: 270.4 E(32554): 2.4e-72
Smith-Waterman score: 2450; 92.4% identity (97.2% similar) in 423 aa overlap (1-421:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 IEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIR--ETSLDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDG
:::::::::::::::::::::::::::::: ... : .. . . ........ ..
CCDS45 IEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGGKSTKDGENHKVTRYLKSLTIRVIPIQAH
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB8 EVIKESKQEHKDVM
...
CCDS45 QIVNGTPPARG
430
>>CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (438 aa)
initn: 2442 init1: 2442 opt: 2447 Z-score: 1410.6 bits: 270.1 E(32554): 3e-72
Smith-Waterman score: 2447; 97.5% identity (98.5% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-401)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSLDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDGEV
:::::::::::::::::::::::::::::: . ... :::
CCDS59 IEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIR--GQYSRASWEGHWSPAPSSRACRLLQTGT
370 380 390 400 410
430
pF1KB8 IKESKQEHKDVM
CCDS59 EDQGKGIQLSLGAFVTLQRS
420 430
>>CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 (466 aa)
initn: 1693 init1: 1598 opt: 1608 Z-score: 935.6 bits: 182.3 E(32554): 8.6e-46
Smith-Waterman score: 1608; 58.1% identity (85.9% similar) in 427 aa overlap (8-431:47-465)
10 20 30
pF1KB8 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLG---PG
:..: :.:: . . . . :: ::
CCDS71 GPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVYATRSSAVRLRSSVPG
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQN
.:: : :::::: :.:. ::.::..:..:..:::::::.::.:::::::::
CCDS71 VRL--------LQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQN
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQK
: : :::.::... ..:.:.:. :.:::: ..:::: ..::.::::::::.:. .:.:
CCDS71 KILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQ
::.: : ::::.: ..::..:.:.:::::::::.:::.::: ::.:.::::..::: :
CCDS71 LQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHEEEIQELQAQ
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAEL
. .:.:....::.::::::::...: :::..:..:..::::::.::::::..:: :: .
CCDS71 IQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEE
:::::.:...::::.:::::....:.::::::::::::.:: . :::.::....::..:
CCDS71 LRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSL
:..:.::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.::..:. .::.:..:::.:
CCDS71 IQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB8 DTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDGEVIKESKQEHKDVM
:. . . : ::....:::: :::.::.:..:.: :.
CCDS71 DSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE
430 440 450 460
>>CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 (470 aa)
initn: 1559 init1: 1455 opt: 1580 Z-score: 919.7 bits: 179.4 E(32554): 6.6e-45
Smith-Waterman score: 1580; 58.0% identity (84.1% similar) in 429 aa overlap (7-432:47-470)
10 20 30
pF1KB8 MERRRITSAARRSY-VSSGEMMVGGLAPGRRLGPGT
.:.. : : :: .:::. : ..
CCDS33 TFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVSRTSGGAGGLGSLR----AS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 RLSLARMPPPLPTR--VDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQ
::. .: : . .::::: :.: : ::..:..:..:::::::.:::::::::::
CCDS33 RLGTTRTPSSYGAGELLDFSLADAVNQEFLTTRTNEKVELQELNDRFANYIEKVRFLEQQ
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 NKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQ
: :::::.:.:...:::..:..:. :::::: ... :: . ::..:::::: .:: ..
CCDS33 NAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLTNQRARVDVERDNLLDDLQRLKA
140 150 160 170 180 190
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CCDS33 KLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIESLNEEIAFLKKVHEEEIRELQA
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220 230 240 250 260 270
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280 290 300 310 320 330
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340 350 360 370 380 390
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400 410 420 430
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CCDS33 PEQRG-SEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQHEVL
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10 20 30 40 50
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60 70 80 90 100 110
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CCDS87 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE
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CCDS87 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD
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240 250 260 270 280 290
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CCDS87 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD
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CCDS87 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM
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CCDS87 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRN
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CCDS87 GEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY
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CCDS75 AQLEEASSARSQALLERDGLAEEVQRLRARCEEESRGREGAERALKAQQRDVDGATLARL
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CCDS75 DLEKKVESLLDELAFVRQVHDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALREIRAQ
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CCDS75 YESLAAKNLQSAEEWYKSKFANLNEQAARSTEAIRASREEIHEYRRQLQARTIEIEGLRG
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CCDS75 EIAAYRKLLEGEETRFSTSGLSISGLNPLPNPSYLLPPRILSATTSKVSSTGLSLKKEEE
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CCDS75 EAELLVLRQKHSEPSRFRALYEQEIRDLRLAAEDATNEKQALQGEREGLEETLRNLQARY
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CCDS75 EEEVLSREDAEGRLMEARKGADEAALARAELEKRIDSLMDEISFLKKVHEEEIAELQAQI
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CCDS75 RAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADISAMQDTINKLENEL
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CCDS75 FGRSAYGGLQTSSYLMSTRSFPSYYTSHVQEEQIEVEETIEAAKAEEAKDEPPSEGEAEE
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CCDS60 LGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDSDHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRA
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CCDS60 LRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLRSNHEEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTD
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CCDS60 ISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCRYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQ
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CCDS60 SKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHDLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQ
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CCDS60 DLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTFAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKPKVEAPK
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pF1KB8 LKRNIVVKTVEMRDGEVIKESKQEHKDVM
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CCDS60 LK--VQHKFVE----EIIEETKVEDEKSEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEP
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CCDS13 SRFRGAGAASSTDSLDTLSNGPEGCMVAVATSRSEKEQLQALNDRFAGYIDKVRQLEAHN
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CCDS13 RSLEGEAAALRQQQAGRSAMGELYEREVREMRGAVLRLGAARGQLRLEQEHLLEDIAHVR
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CCDS13 QRLDDEARQREEAEAAARALARFAQEAEAARVDLQKKAQALQEECGYLRRHHQEEVGELL
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CCDS13 KEEEGKEEEGGEEEEAEGGEEETKSPPAEEAASPEKEAKSPVKEEAKSPAEAKSPEKEEA
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432 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]