Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8189
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8189, 446 aa
1>>>pF1KB8189 446 - 446 aa - 446 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6968+/-0.00202; mu= 12.1083+/- 0.121
mean_var=280.9703+/-50.552, 0's: 0 Z-trim(104.5): 957 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.076515
statistics sampled from 6864 (7927) to 6864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 3058 352.2 6.2e-97
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1296 157.7 2.3e-38
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1288 156.8 4.1e-38
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1287 156.9 5.2e-38
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1287 157.0 5.3e-38
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1287 157.0 5.4e-38
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1287 157.0 5.4e-38
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1277 155.8 1.1e-37
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1277 155.8 1.1e-37
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CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1277 155.8 1.1e-37
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1277 155.9 1.2e-37
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1277 155.9 1.2e-37
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1277 155.9 1.2e-37
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 1273 155.1 1.3e-37
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CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 387) 1267 154.4 1.9e-37
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1271 155.3 1.9e-37
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1264 154.0 2.3e-37
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1264 154.2 2.6e-37
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CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1265 154.6 2.9e-37
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 1259 153.7 4.1e-37
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1260 154.0 4.3e-37
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1256 153.4 5e-37
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1256 153.4 5.2e-37
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1256 153.5 5.4e-37
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1257 153.8 5.7e-37
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1254 153.4 6.8e-37
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1251 152.9 7.9e-37
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1252 153.2 8.1e-37
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1250 152.7 8.2e-37
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1251 153.0 8.3e-37
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1250 152.8 8.3e-37
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1247 152.6 1.2e-36
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1243 151.9 1.3e-36
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 1243 151.9 1.4e-36
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 1243 151.9 1.4e-36
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 1244 152.2 1.4e-36
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 1242 151.9 1.6e-36
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 1241 151.7 1.6e-36
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1243 152.4 2e-36
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1243 152.5 2e-36
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 1238 151.4 2.1e-36
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 1238 151.4 2.1e-36
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1234 151.1 3e-36
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1232 150.7 3e-36
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 1231 150.6 3.5e-36
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 1231 150.7 3.6e-36
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 1230 150.5 3.8e-36
>>CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 (446 aa)
initn: 3058 init1: 3058 opt: 3058 Z-score: 1853.8 bits: 352.2 E(32554): 6.2e-97
Smith-Waterman score: 3058; 100.0% identity (100.0% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 METQADLVSQEPQALLDSALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 METQADLVSQEPQALLDSALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRETRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRETRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRKMPDFGQVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRKMPDFGQVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 HHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTG
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB8 EKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
430 440
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 2427 init1: 1295 opt: 1296 Z-score: 802.4 bits: 157.7 E(32554): 2.3e-38
Smith-Waterman score: 1507; 56.0% identity (76.7% similar) in 391 aa overlap (38-423:1-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 VSQEPQALLDSALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKR
.::.:: : :: :::::.:.:. :.::.
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRETRTEND----QEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQG
:. :::::::::: :::::: ::: : :.::. ::::::.. :. : .. ..
CCDS23 LDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISEDVQ-FGTTSERPAENAEEN
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGER-LNRKMPDFGQVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFT
. .:..: .: :. .:. .. . .. :. : . : : . . :..:.
CCDS23 PESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVH-KEVHTGIRYHICSHCGKAFS
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSH
:.: ::. .::::.:: ::.:.:.:.: :::::: ::::.::.::::::.:..:::
CCDS23 QISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSH
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHH
::::: :::::::..:..:::.: : :: :.: :.:::::::.::::.:: :: :..:
CCDS23 LIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQH
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310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIH
:: ::::::: :::::..::. : ::.: :.::::.::.:.:::: :::.: : .:.: :
CCDS23 QRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAH
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pF1KB8 TGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEK
::::::.: ::: .:. : :.:::: ::::.::::. :::.: :: :. ::.::::::
CCDS23 TGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEK
330 340 350 360 370 380
430 440
pF1KB8 PLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
:
CCDS23 PYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYEC
390 400 410 420 430 440
>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 (461 aa)
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Smith-Waterman score: 1288; 50.0% identity (75.5% similar) in 380 aa overlap (77-446:57-431)
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pF1KB8 SQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDR----ETRTENDQEI
.: .:.. .. . : ... :. .
CCDS44 SHLSQVGVTHKETFTEMRVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQN
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pF1KB8 SEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGER------LNRKMPDFG
:: ... ...: : : . . .... . :: . ::. .... . .
CCDS44 SELIKTQRMFVG---KKIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERS
90 100 110 120 130 140
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pF1KB8 QVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLI
..::.... ::. : :. :..:. . :: ::: .:..:..: ::.:.:...:.::
CCDS44 SLTVHQRIHT-GEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLI
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 QHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRR
::.:::::::::.::::::::.:: .: ::: :::::::::..:::.:: : ::.:.:
CCDS44 QHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQR
210 220 230 240 250 260
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pF1KB8 IHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTG
:::::::::..:::.:: ::::: ::: ::::::: ::.:::.::.:. ::.:::.:.:
CCDS44 SHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSG
270 280 290 300 310 320
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pF1KB8 EKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPY
::.::::::::::..: : ::.:::::::::::: :: .:: :.: :: :::::.::
CCDS44 VKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPY
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB8 ECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
::.:::::: :. :..:::::::::: . .:. .. .. :.... :
CCDS44 ECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIK-NSSLTVHQRTHTGEKPYQCN
390 400 410 420 430 440
CCDS44 ECGKAFSRSTNLTRHQRTHT
450 460
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 1274 init1: 1274 opt: 1287 Z-score: 795.9 bits: 156.9 E(32554): 5.2e-38
Smith-Waterman score: 1287; 60.1% identity (83.3% similar) in 288 aa overlap (155-436:237-524)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRKMPDFGQVT--VEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFT
:.:.. .... : ::. . .. :.::.
CCDS74 KGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFS
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSH
:.. .:.: .:..:..:.::.:.: .. : :: :::::::::.:.:::::::.::
CCDS74 FRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSS
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHH
: .::::::::::::: .:::.:. . :: :.: :::::::::.::::.:: :. ::.:
CCDS74 LTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEH
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIH
.:::::::::.::::::.::.::.: .:.: :::::::::..::::: ::.:: ::::::
CCDS74 RRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIH
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEK
:::::::: .:: :..::.: .::::::::.::::..::.:: . :..:::::::::
CCDS74 TGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEK
450 460 470 480 490 500
430 440
pF1KB8 PLN----GIGMSKSSLRVTTELNIREST
: . : ..:.::: .
CCDS74 PYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
510 520 530 540 550 560
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 1274 init1: 1274 opt: 1287 Z-score: 795.7 bits: 157.0 E(32554): 5.3e-38
Smith-Waterman score: 1287; 60.1% identity (83.3% similar) in 288 aa overlap (155-436:279-566)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRKMPDFGQVT--VEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFT
:.:.. .... : ::. . .. :.::.
CCDS74 KGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFS
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230 240
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:.. .:.: .:..:..:.::.:.: .. : :: :::::::::.:.:::::::.::
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310 320 330 340 350 360
250 260 270 280 290 300
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: .::::::::::::: .:::.:. . :: :.: :::::::::.::::.:: :. ::.:
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310 320 330 340 350 360
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.:::::::::.::::::.::.::.: .:.: :::::::::..::::: ::.:: ::::::
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370 380 390 400 410 420
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:::::::: .:: :..::.: .::::::::.::::..::.:: . :..:::::::::
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: . : ..:.::: .
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: . : ..:.::: .
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: . : ..:.::: .
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.::::::::.::::: :::.:: :: ::.::::::::.::.:..: ..:: .:. :.:
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. . .. ::.:
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CCDS65 RSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
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446 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]