Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8185
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8185, 461 aa
1>>>pF1KB8185 461 - 461 aa - 461 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9772+/-0.000912; mu= 10.9473+/- 0.055
mean_var=123.8665+/-24.841, 0's: 0 Z-trim(109.2): 19 B-trim: 221 in 1/51
Lambda= 0.115238
statistics sampled from 10725 (10741) to 10725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 2.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8109.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 ( 461) 3130 531.6 6.6e-151
CCDS55771.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 ( 494) 3107 527.8 9.9e-150
CCDS31610.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 ( 513) 2493 425.7 5.5e-119
CCDS8110.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 ( 546) 2493 425.7 5.8e-119
CCDS10706.1 KAT8 gene_id:84148|Hs108|chr16 ( 458) 1077 190.2 3.7e-48
CCDS56038.1 KAT7 gene_id:11143|Hs108|chr17 ( 442) 1060 187.4 2.5e-47
CCDS56037.1 KAT7 gene_id:11143|Hs108|chr17 ( 472) 1060 187.4 2.7e-47
CCDS56036.1 KAT7 gene_id:11143|Hs108|chr17 ( 501) 1060 187.4 2.8e-47
CCDS56035.1 KAT7 gene_id:11143|Hs108|chr17 ( 581) 1060 187.5 3.2e-47
CCDS11554.1 KAT7 gene_id:11143|Hs108|chr17 ( 611) 1060 187.5 3.3e-47
CCDS45468.1 KAT8 gene_id:84148|Hs108|chr16 ( 467) 1049 185.6 9.4e-47
CCDS83290.1 KAT6A gene_id:7994|Hs108|chr8 ( 815) 1005 178.4 2.4e-44
CCDS6124.1 KAT6A gene_id:7994|Hs108|chr8 (2004) 1005 178.7 4.8e-44
CCDS58084.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1781) 957 170.7 1.1e-41
CCDS58085.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1890) 947 169.0 3.7e-41
CCDS7345.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (2073) 947 169.1 4e-41
>>CCDS8109.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 (461 aa)
initn: 3130 init1: 3130 opt: 3130 Z-score: 2822.7 bits: 531.6 E(32554): 6.6e-151
Smith-Waterman score: 3130; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREVKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREVKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB8 ILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW
430 440 450 460
>>CCDS55771.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 (494 aa)
initn: 3107 init1: 3107 opt: 3107 Z-score: 2801.6 bits: 527.8 E(32554): 9.9e-150
Smith-Waterman score: 3107; 100.0% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (5-461:38-494)
10 20 30
pF1KB8 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VPGAGRREPGEVGRARGPPVADPGVALSPQGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 KDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPERE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 KTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 EFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 ITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKD
430 440 450 460 470 480
460
pF1KB8 WSKRGKW
:::::::
CCDS55 WSKRGKW
490
>>CCDS31610.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 (513 aa)
initn: 2487 init1: 2487 opt: 2493 Z-score: 2249.7 bits: 425.7 E(32554): 5.5e-119
Smith-Waterman score: 2882; 89.5% identity (89.5% similar) in 493 aa overlap (21-461:21-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KB8 ERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREV-------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREVPASAQASGKTLPIPVQITLRFNLPK
70 80 90 100 110 120
100 110 120
pF1KB8 ---------------------------KRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGAARRAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EREAIPGGEPDQPLSSSSCLQPNHRSTKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGAARRAV
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRH
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTIS
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKE
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 STEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQ
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDI
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460
pF1KB8 VDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW
490 500 510
>>CCDS8110.1 KAT5 gene_id:10524|Hs108|chr11 (546 aa)
initn: 2487 init1: 2487 opt: 2493 Z-score: 2249.3 bits: 425.7 E(32554): 5.8e-119
Smith-Waterman score: 2882; 89.5% identity (89.5% similar) in 493 aa overlap (21-461:54-546)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPPVADPGVALSPQGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDF
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90
pF1KB8 NKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREV---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREVPASAQASGKTLPIPV
90 100 110 120 130 140
100 110
pF1KB8 -------------------------------------KRKVEVVSPATPVPSETAPASVF
:::::::::::::::::::::::
CCDS81 QITLRFNLPKEREAIPGGEPDQPLSSSSCLQPNHRSTKRKVEVVSPATPVPSETAPASVF
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 PQNGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PQNGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMK
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPG
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFH
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLG
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 LLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKG
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460
pF1KB8 QYILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QYILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW
510 520 530 540
>>CCDS10706.1 KAT8 gene_id:84148|Hs108|chr16 (458 aa)
initn: 1136 init1: 873 opt: 1077 Z-score: 978.1 bits: 190.2 E(32554): 3.7e-48
Smith-Waterman score: 1161; 43.4% identity (66.5% similar) in 454 aa overlap (3-452:56-447)
10 20 30
pF1KB8 MAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEIL
:.:: :: : .. : ::..
CCDS10 GENAAAEGTAPSPGRVSPPTPARGEPEVTVEIGETYL-CRRP--------DSTWHSAEVI
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 S--VKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGS
. :.: ::. :::::. ::.:::::: ..:: : : :.: ... . .
CCDS10 QSRVNDQEGREEFYVHYVGFNRRLDEWVDKNRLALTKT---VKDAVQKNSEKYLSELAEQ
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 PEREVKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDS
:::.. :. .::: . .. . .
CCDS10 PERKITRN-----------------------------------QKRKHDEINHVQKTYAE
140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYL
: :. :..: .. :. .:..: .. :..: ... :::::.:.. : :.:
CCDS10 MD--PT----TAAL--EKEHE-AITKVKYVDKIHIGNYEIDAWYFSPFPEDYGKQPKLWL
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 CEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKC
::.:::: . : . :: .:. :.:::.:::::..:: .:.::. .: : ::::::::
CCDS10 CEYCLKYMKYEKSYRFHLGQCQWRQPPGKEIYRKSNISVYEVDGKDHKIYCQNLCLLAKL
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 FLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYG
::::::::.:..::.::..:: : .: :::::::::::: . :::::::::::::::::
CCDS10 FLDHKTLYFDVEPFVFYILTEVDRQGAHIVGYFSKEKESPDGNNVACILTLPPYQRRGYG
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 KLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITIN
:.:: :::::::.:. .:.::::::::: :::::::: ..:::: . : ..:.
CCDS10 KFLIAFSYELSKLESTVGSPEKPLSDLGKLSYRSYWSWVLLEILRDF------RGTLSIK
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB8 EISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDIVDGHER-AMLKRL-LRIDSKCL
..:..::: ..:.::::: ::...:.:::... .. .:. : . :. :. . .:: ::
CCDS10 DLSQMTSITQNDIISTLQSLNMVKYWKGQHVICVTPKLVEEHLKSAQYKKPPITVDSVCL
390 400 410 420 430 440
450 460
pF1KB8 HFTPKDWSKRGKW
...:
CCDS10 KWAPPKHKQVKLSKK
450
>>CCDS56038.1 KAT7 gene_id:11143|Hs108|chr17 (442 aa)
initn: 1065 init1: 920 opt: 1060 Z-score: 963.0 bits: 187.4 E(32554): 2.5e-47
Smith-Waterman score: 1060; 52.9% identity (77.8% similar) in 297 aa overlap (159-452:147-438)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRH
: . .: . : . .:. . :. : .::.
CCDS56 HRQTYGNTREPLLENLTSEYDLDLFRRAQARASEDLEKLRLQGQITEGSNMIKTIAFGRY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTIS
.: :: ::::.: . : ::.::::::: .: :.::..:: .::::.::::::.::
CCDS56 ELDTWYHSPYPEEYARLGRLYMCEFCLKYMKSQTILRRHMAKCVWKHPPGDEIYRKGSIS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKE
::.::.::: : :::::::: ::::::::::..::::::::: : : :..:::::::.
CCDS56 VFEVDGKKNKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVMTEADNTGCHLIGYFSKEKN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 STEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]