FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8017, 647 aa
1>>>pF1KB8017 647 - 647 aa - 647 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8771+/-0.00126; mu= -7.5218+/- 0.073
mean_var=420.5987+/-96.176, 0's: 0 Z-trim(112.4): 473 B-trim: 769 in 1/49
Lambda= 0.062537
statistics sampled from 12646 (13208) to 12646 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.406), width: 16
Scan time: 3.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5563.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 ( 647) 4556 426.2 6.9e-119
CCDS56491.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 ( 613) 4177 392.0 1.3e-108
CCDS13892.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22 ( 617) 1503 150.7 5.5e-36
CCDS13891.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22 ( 638) 1503 150.7 5.7e-36
CCDS33637.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22 ( 686) 1426 143.8 7.3e-34
CCDS6580.1 TESK1 gene_id:7016|Hs108|chr9 ( 626) 661 74.8 4.1e-13
>>CCDS5563.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 (647 aa)
initn: 4556 init1: 4556 opt: 4556 Z-score: 2247.9 bits: 426.2 E(32554): 6.9e-119
Smith-Waterman score: 4556; 100.0% identity (100.0% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQYLQALNADWHADCFRCCDCSASLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQYLQALNADWHADCFRCCDCSASLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEID
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LLIQETSRLLQLTLEHDPHDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLIQETSRLLQLTLEHDPHDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCRPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCRPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 EIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB8 EHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
610 620 630 640
>>CCDS56491.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 (613 aa)
initn: 4177 init1: 4177 opt: 4177 Z-score: 2063.4 bits: 392.0 E(32554): 1.3e-108
Smith-Waterman score: 4177; 99.8% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (51-647:17-613)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 ELPVCASCGQRIYDGQYLQALNADWHADCFRCCDCSASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARY
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MLLASAPRRRRFLQRAKCCDCSASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARY
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 GESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQ
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 TVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVR
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 VQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLLQLTLEHDPHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLLQLTLEHDPHD
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 TLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGR
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 SESLRVVCRPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SESLRVVCRPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRT
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 FLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSF
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 AKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKK
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 PDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFG
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 LNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQ
530 540 550 560 570 580
630 640
pF1KB8 LEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
590 600 610
>>CCDS13892.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22 (617 aa)
initn: 2174 init1: 578 opt: 1503 Z-score: 759.5 bits: 150.7 E(32554): 5.5e-36
Smith-Waterman score: 2238; 55.7% identity (78.2% similar) in 610 aa overlap (35-625:2-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQYLQALNADWHADCFRCCDCSASLSHQYY
:.::.. : ::: .:. ::.. ::
CCDS13 MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTY
::::.:.: ::::...:: ::::: .: : :::::.::::::: :..: ..: :::.:
CCDS13 EKDGKLYCPKDYWGKFGEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDP
.::.:. ::::.:. ..:..:..:.. .: .::..:::.:.::...:.::.:::..
CCDS13 ALVQHATLYCGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVES
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQ
.: .... ::.:. :. .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.. :.
CCDS13 -----AC-SNYATTVQVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAIS
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KB8 ETSRLLQLTLEHDP------HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSARQKPVL
.::. ::: .:::: . : :.:. . . : . .. .. :.. .
CCDS13 QTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLR
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 RSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQA
:: ::..::: .: : .:..:::::: ..:::: ::::::::::: ::::
CCDS13 RSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQA
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 IKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFIT
:::::. ::.::::::::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.::..:
CCDS13 IKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 EYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKN
:::.::::. ...::: .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.. .:.
CCDS13 EYIEGGTLKDFLRSMDP-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKT
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520
pF1KB8 VVVADFGLARLMVDE-KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYD
::::::::.::.:.: : : :.:.: :::::::::::::::::::.::.:::
CCDS13 VVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYD
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 EKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCC
: ::.::::::::::::.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::... ::
CCDS13 ETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICC
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 DLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEV
:.::.::.: ::: .:.: ..: :.: :: .::.::
CCDS13 RLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
570 580 590 600 610
pF1KB8 PD
>>CCDS13891.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22 (638 aa)
initn: 2186 init1: 578 opt: 1503 Z-score: 759.3 bits: 150.7 E(32554): 5.7e-36
Smith-Waterman score: 2308; 55.2% identity (78.5% similar) in 627 aa overlap (19-625:6-623)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQ-YLQALNADWHADCFRCCDCSASL
: .. : .::..: .: . ...: ::..:::: .:. ::
CCDS13 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SHQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIG
.. ::::::.:.: ::::...:: ::::: .: : :::::.::::::: :..: ..:
CCDS13 TNWYYEKDGKLYCPKDYWGKFGEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLS
:::.:.::.:. ::::.:. ..:..:..:.. .: .::..:::.:.::...:.::.:
CCDS13 DGDAYALVQHATLYCGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VSIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEI
::.. .: .... ::.:. :. .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.
CCDS13 VSVE-----SAC-SNYATTVQVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB8 DLLIQETSRLLQLTLEHDP------HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSAR
. :..::. ::: .:::: . : :.:. . . : . .. .. :
CCDS13 EDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKG
.. . :: ::..::: .: : .:..:::::: ..:::: :::::::::::
CCDS13 RRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 CFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKR
:::::::::. ::.::::::::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.
CCDS13 FFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKK
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 LNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLV
::..::::.::::. ...::: .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.
CCDS13 LNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDP-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLI
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 RENKNVVVADFGLARLMVDE-KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMIN
. .:.::::::::.::.:.: : : :.:.: :::::::::::::::::::.:
CCDS13 KLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLN
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 GRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPI
:.:::: ::.::::::::::::.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::.
CCDS13 GKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPL
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 TVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLP
.. :: :.::.::.: ::: .:.: ..: :.: :: .::.::
CCDS13 AAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 AHPEVPD
>>CCDS33637.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22 (686 aa)
initn: 2091 init1: 523 opt: 1426 Z-score: 721.4 bits: 143.8 E(32554): 7.3e-34
Smith-Waterman score: 2161; 56.2% identity (78.5% similar) in 577 aa overlap (35-594:2-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQYLQALNADWHADCFRCCDCSASLSHQYY
:.::.. : ::: .:. ::.. ::
CCDS33 MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTY
::::.:.: ::::...:: ::::: .: : :::::.::::::: :..: ..: :::.:
CCDS33 EKDGKLYCPKDYWGKFGEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDP
.::.:. ::::.:. ..:..:..:.. .: .::..:::.:.::...:.::.:::..
CCDS33 ALVQHATLYCGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVES
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQ
.: .... ::.:. :. .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.. :.
CCDS33 -----AC-SNYATTVQVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAIS
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KB8 ETSRLLQLTLEHDP------HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSARQKPVL
.::. ::: .:::: . : :.:. . . : . .. .. :.. .
CCDS33 QTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLR
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 RSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQA
:: ::..::: .: : .:..:::::: ..:::: ::::::::::: ::::
CCDS33 RSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQA
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 IKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFIT
:::::. ::.::::::::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.::..:
CCDS33 IKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 EYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKN
:::.::::. ...::: .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.. .:.
CCDS33 EYIEGGTLKDFLRSMDP-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKT
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520
pF1KB8 VVVADFGLARLMVDE-KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYD
::::::::.::.:.: : : :.:.: :::::::::::::::::::.::.:::
CCDS33 VVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYD
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 EKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCC
: ::.::::::::::::.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::... ::
CCDS33 ETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICC
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 DLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
:.::.:
CCDS33 RLEPESRAPPGAAGEGPGCADDEGPVRRQGKVTIKYDPKELRKHLNLEEWILEQLTRLYD
570 580 590 600 610 620
>>CCDS6580.1 TESK1 gene_id:7016|Hs108|chr9 (626 aa)
initn: 731 init1: 319 opt: 661 Z-score: 348.9 bits: 74.8 E(32554): 4.1e-13
Smith-Waterman score: 778; 40.2% identity (65.9% similar) in 346 aa overlap (303-644:24-349)
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCRP-H
:: :. :. .. :: : :..
CCDS65 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGR----GRPSSYRALRSAVS
10 20 30 40
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCL
. : .:. .: .: : :... :: ::..:.:::.: . .. . : :.::..: :
CCDS65 SLARVDDFHCAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLK-MNKLPSNRGNT-LREVQLMNRL
50 60 70 80 90 100
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 EHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYL
.:::.:.:.:: .. .:. .:::..::::. ...: . : :. .: ::: :. ::
CCDS65 RHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEP-LSWPVRLHLALDIARGLRYL
110 120 130 140 150 160
460 470 480 490 500
pF1KB8 HSMNIIHRDLNSHNCLVR-ENKN--VVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYT
:: ...::::.:.::::: :... .::.::::: : . .. ::. .
CCDS65 HSKGVFHRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLA----------EKIPVYREGARKEPLA
170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 VVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLD
:::.:::::::.. :. ::::.:::.:::::::.:.:: ::::::::: ::::.: .:
CCDS65 VVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-R
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 RYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGF
.:: :. ....::.:.: : :... . :: . .: :: ..:
CCDS65 TLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQG-
280 290 300 310 320 330
630 640
pF1KB8 WETYRRGESGLPAHPEVPD
. : : :. .:.
CCDS65 -SVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIK
340 350 360 370 380 390
647 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:15:22 2016 done: Wed Nov 2 23:15:23 2016
Total Scan time: 3.980 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]