Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7970
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7970, 410 aa
1>>>pF1KB7970 410 - 410 aa - 410 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5180+/-0.000842; mu= 9.1377+/- 0.051
mean_var=163.2507+/-32.926, 0's: 0 Z-trim(112.8): 57 B-trim: 81 in 1/50
Lambda= 0.100380
statistics sampled from 13481 (13537) to 13481 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5308.2 PHF10 gene_id:55274|Hs108|chr6 ( 498) 2822 420.3 2e-117
CCDS5309.2 PHF10 gene_id:55274|Hs108|chr6 ( 496) 2795 416.4 2.9e-116
CCDS61497.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 ( 378) 445 76.0 6.7e-14
CCDS8100.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 ( 391) 441 75.4 1e-13
CCDS81583.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 ( 405) 441 75.4 1.1e-13
CCDS46065.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 ( 332) 435 74.5 1.7e-13
CCDS46064.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 ( 414) 435 74.6 2e-13
CCDS83290.1 KAT6A gene_id:7994|Hs108|chr8 ( 815) 428 73.8 6.6e-13
CCDS58084.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1781) 432 74.7 7.9e-13
CCDS58085.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1890) 432 74.7 8.3e-13
CCDS7345.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (2073) 432 74.7 8.9e-13
CCDS6124.1 KAT6A gene_id:7994|Hs108|chr8 (2004) 428 74.1 1.3e-12
>>CCDS5308.2 PHF10 gene_id:55274|Hs108|chr6 (498 aa)
initn: 2822 init1: 2822 opt: 2822 Z-score: 2221.8 bits: 420.3 E(32554): 2e-117
Smith-Waterman score: 2822; 100.0% identity (100.0% similar) in 410 aa overlap (1-410:89-498)
10 20 30
pF1KB7 MLQEQVSEYLGVTSFKRKYPDLERRDLSHK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSSQDLGFSYYPAENLIEYKWPPDETGEYYMLQEQVSEYLGVTSFKRKYPDLERRDLSHK
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 EKLYLRELNVITETQCTLGLTALRSDEVIDLMIKEYPAKHAEYSVILQEKERQRITDHYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKLYLRELNVITETQCTLGLTALRSDEVIDLMIKEYPAKHAEYSVILQEKERQRITDHYK
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EYSQMQQQNTQKVEASKVPEYIKKAAKKAAEFNSNLNRERMEERRAYFDLQTHVIQVPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EYSQMQQQNTQKVEASKVPEYIKKAAKKAAEFNSNLNRERMEERRAYFDLQTHVIQVPQG
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 KYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPLNTALYEPPLDPELPALDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPLNTALYEPPLDPELPALDSD
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQGRQKSKDKAATPRKDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQGRQKSKDKAATPRKDGP
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTME
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVGLGAIPSGRWICDCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVGLGAIPSGRWICDCC
420 430 440 450 460 470
400 410
pF1KB7 QRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
::::::::::::::::::::
CCDS53 QRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
480 490
>>CCDS5309.2 PHF10 gene_id:55274|Hs108|chr6 (496 aa)
initn: 2797 init1: 2680 opt: 2795 Z-score: 2200.7 bits: 416.4 E(32554): 2.9e-116
Smith-Waterman score: 2795; 99.5% identity (99.5% similar) in 410 aa overlap (1-410:89-496)
10 20 30
pF1KB7 MLQEQVSEYLGVTSFKRKYPDLERRDLSHK
:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS53 TSSQDLGFSYYPAENLIEYKWPPDETGEYYMLQEQVSEYLGVTSFKRKYP--ERRDLSHK
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 EKLYLRELNVITETQCTLGLTALRSDEVIDLMIKEYPAKHAEYSVILQEKERQRITDHYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKLYLRELNVITETQCTLGLTALRSDEVIDLMIKEYPAKHAEYSVILQEKERQRITDHYK
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EYSQMQQQNTQKVEASKVPEYIKKAAKKAAEFNSNLNRERMEERRAYFDLQTHVIQVPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EYSQMQQQNTQKVEASKVPEYIKKAAKKAAEFNSNLNRERMEERRAYFDLQTHVIQVPQG
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 KYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPLNTALYEPPLDPELPALDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPLNTALYEPPLDPELPALDSD
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQGRQKSKDKAATPRKDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQGRQKSKDKAATPRKDGP
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTME
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVGLGAIPSGRWICDCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVGLGAIPSGRWICDCC
420 430 440 450 460 470
400 410
pF1KB7 QRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
::::::::::::::::::::
CCDS53 QRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
480 490
>>CCDS61497.1 DPF3 gene_id:8110|Hs108|chr14 (378 aa)
initn: 416 init1: 296 opt: 445 Z-score: 363.1 bits: 76.0 E(32554): 6.7e-14
Smith-Waterman score: 445; 41.2% identity (67.6% similar) in 136 aa overlap (260-390:228-363)
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 TSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQGRQKSKDKAATPRKDGP--KRSVLSKSVPGYKPKVI
:.: . .: .:. . : ::
CCDS61 YVCDICGKRYKNRPGLSYHYAHTHLASEEGDEAQDQETRSPPNHRNENHRPQKGPDGTVI
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 PNAICGICLKGKESNKK-GKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTMELVSMIKTYPWQCMECK
:: : .:: :.. ::: :. : :. :..: ::::.::..:.... .::: :::.:::
CCDS61 PNNYCDFCLGGSNMNKKSGRPEELVSCADCGRSGHPTCLQFTLNMTEAVKTYKWQCIECK
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVG--LGAIPSGRWICDCCQRAPPTPRKVGRRG
.::.:: .......::: :::::: .:.. .. : : : : :
CCDS61 SCILCGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLNPPVAEPPEGSWSCHLCWELLKEKASAFGCQ
320 330 340 350 360 370
410
pF1KB7 KNSKEG
CCDS61 A
>>CCDS8100.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 462 init1: 310 opt: 441 Z-score: 359.7 bits: 75.4 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 459; 33.2% identity (57.6% similar) in 238 aa overlap (180-390:137-374)
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 GKYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPL-NTALYEPPLDPE--LPA
: . : : .:. :. . :.:. :
CCDS81 KKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDD
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250
pF1KB7 LDSDGDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSS---GNVSEGESPP---DSQEDSFQGR-----
::.. .: :: : :.::.... . ... : .. : : ...:
CCDS81 LDDEDYEEDTPKRRGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSY
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KB7 ---------QKSKDKAAT-PRKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKK-
....:: . : .:: .:: : ..:: : .:: .. :::
CCDS81 HYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTMELVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCD
:. : :. ::.: :::::::..: ... .::: :::.::: : ::: .......:::
CCDS81 GQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KB7 MCDRGYHTFCV--GLGAIPSGRWICDCCQRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
:::::: .:. ... : : : : :
CCDS81 DCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
350 360 370 380 390
>>CCDS81583.1 DPF2 gene_id:5977|Hs108|chr11 (405 aa)
initn: 462 init1: 310 opt: 441 Z-score: 359.5 bits: 75.4 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 453; 32.1% identity (54.8% similar) in 252 aa overlap (180-390:137-388)
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 GKYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPL-NTALYEPPLDPE--LPA
: . : : .:. :. . :.:. :
CCDS81 KKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGAPDPRVDDDSLGEFPVTNSRARKRILEPDDFLDD
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250
pF1KB7 LDSDGDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSS---GNVSEGESPPDSQEDSFQGRQKSK----
::.. .: :: : :.::.... . ... : .. : . ..::. .. ::
CCDS81 LDDEDYEEDTPKRRGKGKSKGKGVGSARKKLDASILEDRDKPYACDNSFKQKHTSKAPQR
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290
pF1KB7 ---------------------------DKAAT-PRKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNAI
:: . : .:: .:: : ..::
CCDS81 VCGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CGICLKGKESNKK-GKAESLIHCSQCENSGHPSCLDMTMELVSMIKTYPWQCMECKTCII
: .:: .. ::: :. : :. ::.: :::::::..: ... .::: :::.::: : :
CCDS81 CDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB7 CGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCV--GLGAIPSGRWICDCCQRAPPTPRKVGRRGKNSK
:: .......::: :::::: .:. ... : : : : :
CCDS81 CGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS
350 360 370 380 390 400
410
pF1KB7 EG
>>CCDS46065.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 (332 aa)
initn: 367 init1: 318 opt: 435 Z-score: 356.0 bits: 74.5 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 435; 39.0% identity (65.4% similar) in 159 aa overlap (240-392:168-319)
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 DGDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQ----GRQKSKDKAATP
::: . . :. .: :. : .:
CCDS46 KPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYTHTHLAEEEGEENAERHALPFHRKNNHKQFYKELAWVP
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 RKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCENSGHPSCL
. .:. .:..: ::::. : .:: : :.: : :.:: :..: :::::::
CCDS46 EA---QRKHTAKKAPD--GTVIPNGYCDFCLGG--SKKTGCPEDLISCADCGRSGHPSCL
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 DMTMELVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVG--LGAIPSG
..:..... ..:: :::.:::.: .:: .......::: :::::: .:.. .. : :
CCDS46 QFTVNMTAAVRTYRWQCIECKSCSLCGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLSPPMAEPPEG
260 270 280 290 300 310
390 400 410
pF1KB7 RWICDCCQRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
: : : :
CCDS46 SWSCHLCLRHLKEKASAYITLT
320 330
>>CCDS46064.1 DPF1 gene_id:8193|Hs108|chr19 (414 aa)
initn: 367 init1: 318 opt: 435 Z-score: 354.7 bits: 74.6 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 435; 39.0% identity (65.4% similar) in 159 aa overlap (240-392:250-401)
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 DGDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDSQEDSFQ----GRQKSKDKAATP
::: . . :. .: :. : .:
CCDS46 KPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYTHTHLAEEEGEENAERHALPFHRKNNHKQFYKELAWVP
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 RKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCENSGHPSCL
. .:. .:..: ::::. : .:: : :.: : :.:: :..: :::::::
CCDS46 EA---QRKHTAKKAPD--GTVIPNGYCDFCLGG--SKKTGCPEDLISCADCGRSGHPSCL
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 DMTMELVSMIKTYPWQCMECKTCIICGQPHHEEEMMFCDMCDRGYHTFCVG--LGAIPSG
..:..... ..:: :::.:::.: .:: .......::: :::::: .:.. .. : :
CCDS46 QFTVNMTAAVRTYRWQCIECKSCSLCGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLSPPMAEPPEG
340 350 360 370 380 390
390 400 410
pF1KB7 RWICDCCQRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
: : : :
CCDS46 SWSCHLCLRHLKEKASAYITLT
400 410
>>CCDS83290.1 KAT6A gene_id:7994|Hs108|chr8 (815 aa)
initn: 376 init1: 273 opt: 428 Z-score: 345.2 bits: 73.8 E(32554): 6.6e-13
Smith-Waterman score: 428; 47.6% identity (67.7% similar) in 124 aa overlap (283-403:200-318)
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 QGRQKSKDKAATPRKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKAESLIH
:: . : ::..:: ::.:.. : : ::
CCDS83 NTKATNVDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKPVAEPIPICSFCLGTKEQNREKKPEELIS
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 CSQCENSGHPSCLDMTMELVSMIKTYPWQCMECKTCIIC-GQPHHEEEMMFCDMCDRGYH
:..: :::::::: .. ::. .:. :::.::::: : : .. ..:.::: ::::.:
CCDS83 CADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFH
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410
pF1KB7 TFCVG--LGAIPSGRWICDCCQRAPPTPRKVGRRGKNSKEG
: : .:.: :::. :. ::: ::.
CCDS83 MECCDPPLTRMPKGMWICQICR-----PRKKGRKLLQKKAAQIKRRYTNPIGRPKNRLKK
290 300 310 320 330 340
CCDS83 QNTVSKGPFSKVRTGPGRGRKRKITLSSQSASSSSEEGYLERIDGLDFCRDSNVSLKFNK
350 360 370 380 390 400
>>CCDS58084.1 KAT6B gene_id:23522|Hs108|chr10 (1781 aa)
initn: 345 init1: 273 opt: 432 Z-score: 343.8 bits: 74.7 E(32554): 7.9e-13
Smith-Waterman score: 436; 32.5% identity (57.4% similar) in 249 aa overlap (171-403:85-325)
150 160 170 180 190
pF1KB7 QTHVIQVPQGKYKVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYK--RYSPDELRYLPLNTALY--
:: : . : : : ..:: . : :
CCDS58 VQDGSVLKVTNKGLASYKDPDNPGRFSSVKPGTFPKSAKGSRGSCNDLRNVDWNKLLRRA
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240
pF1KB7 ----EPPLDPELPALD----SDGDSDDGEDGRGDEKRKNKGTSDSSSGNVSEGESPPDS-
: : : .. :..: . .. . ..: :.. . ... ..:
CCDS58 IEGLEEPNGSSLKNIEKYLRSQSDLTSTTNNPAFQQRLRLGAKRAVNNGRLLKDGPQYRV
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QEDSFQGRQKSKDKAATPRKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNAICGICLKGKESNKKGKA
. :..:. . .: : .. : :.: . .:.. : ::..:: ::::.. :
CCDS58 NYGSLDGKGAPQYPSAFP-SSLPPVSLLPHEKD--QPRADPIPICSFCLGTKESNREKKP
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ESLIHCSQCENSGHPSCLDMTMELVSMIKTYPWQCMECKTCIICG-QPHHEEEMMFCDMC
: :. :..: .::::::: . ::.. .:. :::.::::: : : .. ..:.::: :
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