Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7952
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7952, 394 aa
1>>>pF1KB7952 394 - 394 aa - 394 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7286+/-0.0012; mu= 6.3248+/- 0.070
mean_var=231.9734+/-47.727, 0's: 0 Z-trim(109.8): 897 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.084208
statistics sampled from 10146 (11162) to 10146 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 394) 2761 348.7 5.6e-96
CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 445) 1481 193.2 3.9e-49
CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 ( 389) 1412 184.8 1.2e-46
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 1228 162.4 6.6e-40
CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 ( 348) 1139 151.6 1.1e-36
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 1061 142.1 7.9e-34
CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 335) 904 123.0 4.1e-28
CCDS11913.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 333) 809 111.4 1.2e-24
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 800 110.6 3.7e-24
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 786 109.0 1.3e-23
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 750 104.5 2.4e-22
CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 390) 744 103.6 3.2e-22
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 744 103.8 4e-22
CCDS59001.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 247) 685 96.2 3.4e-20
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 684 96.6 7.1e-20
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 670 94.8 1.9e-19
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 670 94.8 2e-19
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 669 94.7 2.3e-19
CCDS56108.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 ( 359) 665 94.0 2.4e-19
CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 ( 402) 665 94.0 2.5e-19
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 669 94.8 2.5e-19
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 669 94.8 2.6e-19
CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7 ( 561) 665 94.2 3.1e-19
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 664 94.1 3.3e-19
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 663 93.9 3.3e-19
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 661 93.6 3.8e-19
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 662 93.9 4.2e-19
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 662 93.9 4.3e-19
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 662 93.9 4.3e-19
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 662 94.0 4.9e-19
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 653 92.7 7.7e-19
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 654 92.9 7.7e-19
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 654 92.9 7.9e-19
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 656 93.3 8.1e-19
CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 350) 650 92.1 8.2e-19
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 653 92.8 9.2e-19
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 653 92.8 9.5e-19
CCDS74924.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 373) 648 91.9 1e-18
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 650 92.3 1.1e-18
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 650 92.4 1.1e-18
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 650 92.4 1.1e-18
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 650 92.4 1.1e-18
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 648 92.0 1.1e-18
CCDS74207.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 307) 643 91.2 1.4e-18
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 648 92.2 1.4e-18
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 648 92.2 1.5e-18
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 648 92.2 1.5e-18
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 648 92.2 1.5e-18
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 644 91.6 1.7e-18
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 644 91.6 1.8e-18
>>CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 (394 aa)
initn: 2761 init1: 2761 opt: 2761 Z-score: 1836.7 bits: 348.7 E(32554): 5.6e-96
Smith-Waterman score: 2761; 100.0% identity (100.0% similar) in 394 aa overlap (1-394:1-394)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQTPLTLQSQPKEPQLTCDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQTPLTLQSQPKEPQLTCDSA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKCHSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QKCHSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRSH
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB7 TGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
370 380 390
>>CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 (445 aa)
initn: 1723 init1: 1476 opt: 1481 Z-score: 995.6 bits: 193.2 E(32554): 3.9e-49
Smith-Waterman score: 2525; 88.0% identity (88.0% similar) in 426 aa overlap (20-394:20-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQTPLTLQSQPKEPQLTCDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQTPLTLQSQPKEPQLTCDSA
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB7 QKCHSIGETD--------------------------------------------------
::::::::::
CCDS56 QKCHSIGETDLIRSLRRRAVLIPLGAHLFSTDTFLFSKPVVIPQLKGGGETWPNNRGVLR
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KB7 -EVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKDRIERQWGNLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKDRIERQWGNLL
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFNHRGIHNIQKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFNHRGIHNIQKR
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 YHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRSHTGERPHQCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRSHTGERPHQCI
370 380 390 400 410 420
370 380 390
pF1KB7 ECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
430 440
>>CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 (389 aa)
initn: 1302 init1: 731 opt: 1412 Z-score: 951.0 bits: 184.8 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 1412; 54.8% identity (78.0% similar) in 387 aa overlap (9-392:3-387)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKV--EAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQL
..: .:. : : ::..:: : . : :: :.:.:: .::::::.:::.
CCDS47 MAITLTLQTAEMQEGLLAVKVKEEEEEHSCGPESGLSRNNPHTREIFRRRFRQF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CYQETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPE
::::.::::::: ::::::.:::::.. ::::::.::::::::.:::.:::.:::.: :
CCDS47 CYQESPGPREALQRLQELCHQWLRPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVRQHRPV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SGEEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKE-MVPLAEQTPLTLQSQPKEPQLTC
:::::: .:::::::::.: .....: :.:: . :: .: : : . : : : ::
CCDS47 SGEEAVTVLEDLERELDDPGEQVLSHAHEQEEFVKEKATPGAAQESSNDQFQTLEEQLGY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DSAQKCHSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEH
. . : . : : . : . ::. ... . :. .....:. ...: : .:.. ..
CCDS47 NLREVC-PVQEIDGKAGTWNVELAPKREISQEVKSLIQVLGKQNGNITQI-PEYGDTCDR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KDRIERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGL
. :.:.: . : . :.::::::::.: ::.::: ::::.::::.:::.:::. :::
CCDS47 EGRLEKQRVSSSVERPYICSECGKSFTQNSILIEHQRTHTGEKPYECDECGRAFSQRSGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 FNHRGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQ
:.:. .:. .:::.:. :::.:::.:::..: ::: :::::::.::.::.:::: ::.::
CCDS47 FQHQRLHTGEKRYQCSVCGKAFSQNAGLFHHLRIHTGEKPYQCNQCNKSFSRRSVLIKHQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 RSHTGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
: ::::::..: ::::.: :::::.:.:.: :::
CCDS47 RIHTGERPYECEECGKNFIYHCNLIQHRKVHPVAESS
360 370 380
>>CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 (406 aa)
initn: 1147 init1: 662 opt: 1228 Z-score: 830.0 bits: 162.4 E(32554): 6.6e-40
Smith-Waterman score: 1228; 51.2% identity (75.7% similar) in 375 aa overlap (20-389:5-374)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMK-VEAKSHLQW-QESRLKRSNPLAREIFRRHFRQL
:: .: :... : ::..:. .: ..: :. :::.
CCDS46 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CYQETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPE
::::::::::::.::.:::.:::::.. ::::::.::::::::.:::.:::.::::: ::
CCDS46 CYQETPGPREALSRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SGEEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRH-RQEVLCKEMVPL-AEQTPLTLQSQPKEPQLT
:::::: ..::::.::.:: .. :.: ..::: ... : ..: : .: :: ::
CCDS46 SGEEAVAVVEDLEQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CDSAQKC-HSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVG
.: : :.. : : . :..::. ... : .: : .. .:: : .. :.
CCDS46 YESF--CLHQFQEQDGESIPENQELASKQEILKEMEHLGD--SKLQRDVSL-DSKYRETC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EHKDRIERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSS
.. .. :.: .. :: .:.:.:::::::.:: ::.::::::::.::::.:::::::: :
CCDS46 KRDSKAEKQQAHSTGERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GLFNHRGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIE
.: .:: :. .: :.::::::.:: : :: .:.::: :::::.:. :.:.. : :..
CCDS46 SLNEHRRSHTGEKPYQCKECGKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB7 HQRSHTGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
::: ::::. .:: ::::.: .. .:..: ..::
CCDS46 HQRIHTGEKRYQCRECGKAFIQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKI
350 360 370 380 390 400
CCDS46 HTGERP
>>CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 1467 init1: 534 opt: 1139 Z-score: 772.3 bits: 151.6 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 1139; 50.3% identity (74.9% similar) in 350 aa overlap (16-364:7-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
:: . :: .:.: .: :.: .. .: ::..:.:::.:::
CCDS46 MTTALEPEDQKGLLIIKAE--DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
:..::::::::.: ::: :::::. ::::::::::::::::::::.::.::: : ::.:
CCDS46 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQ-TPLTLQSQPKEPQLTCDS
:::: .::::::::::: ... .. .:...: ...::.. ::.: .::. :: .
CCDS46 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQE-
110 120 130 140 150 160
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CCDS46 HHRVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRI
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CCDS46 HTANKLY
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CCDS11 RHNAEKLLNVVKV
360
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CCDS46 AMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWLLDPSQKDLCRD
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CCDS46 NRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDVIRGLEHEEARDLL
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CCDS10 SAQHSDGESDFERDAGIQRLQGHSPGEDHGEVVSQDREV------GQLIGLQGTYLGEKP
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CCDS10 YEC----PQCGKTFSRKSHLITHERTHTGEKYYKCDECGKSFSDGSNFSRHQTTHTGEKP
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CCDS10 KPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYE
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CCDS10 CLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSECGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMC
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