FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7910, 330 aa
1>>>pF1KB7910 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1352+/-0.000907; mu= 9.4197+/- 0.054
mean_var=197.8019+/-39.367, 0's: 0 Z-trim(113.0): 929 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.091192
statistics sampled from 12713 (13727) to 12713 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19 ( 575) 592 90.3 4.1e-18
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CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 587 89.5 5.2e-18
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CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 584 89.2 8.1e-18
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CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 583 89.2 1e-17
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 584 89.4 1e-17
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 581 88.8 1.1e-17
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CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 582 89.1 1.1e-17
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 582 89.1 1.1e-17
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 580 88.7 1.1e-17
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 582 89.1 1.2e-17
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 577 88.1 1.2e-17
CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs108|chr12 ( 261) 574 87.5 1.3e-17
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 582 89.1 1.3e-17
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 582 89.1 1.3e-17
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 582 89.2 1.3e-17
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 580 88.8 1.4e-17
CCDS12211.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 ( 538) 578 88.4 1.4e-17
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 574 87.6 1.4e-17
CCDS62531.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 ( 602) 578 88.5 1.5e-17
>>CCDS6957.1 GFI1B gene_id:8328|Hs108|chr9 (330 aa)
initn: 2348 init1: 2348 opt: 2348 Z-score: 1690.1 bits: 321.0 E(32554): 8.1e-88
Smith-Waterman score: 2348; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB7 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
310 320 330
>>CCDS48049.1 GFI1B gene_id:8328|Hs108|chr9 (284 aa)
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Smith-Waterman score: 1918; 86.1% identity (86.1% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNK----------
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 HVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ------------------------------------ERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
200 210 220 230 240 250
310 320 330
pF1KB7 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
260 270 280
>>CCDS30773.1 GFI1 gene_id:2672|Hs108|chr1 (422 aa)
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Smith-Waterman score: 1127; 52.5% identity (71.6% similar) in 341 aa overlap (19-330:82-422)
10 20 30 40
pF1KB7 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLW-PPALTPVP---RDQAPSNSP
: .: : .: ::. . : ... :: .
CCDS30 RDRLSPESQLTEAPDRASASPDSCEGSVCERSSEFEDFWRPPSPSASPASEKSMCPSLDE
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50 60 70 80
pF1KB7 VLSTLFPNQCLDWTNL----------KREP--ELEQDQNLARM---APAPEGPIVLSRPQ
. .: . .:..: . .: ::. .:. . :: : : .: :.
CCDS30 AQPFPLPFKPYSWSGLAGSDLRHLVQSYRPCGALERGAGLGLFCEPAPEPGHPAALYGPK
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130
pF1KB7 DGDSPLSDSPP---------FYKPSFS-WDTLATTYGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYG
. . . . : :... . .... . :.. .. . :.. .:..
CCDS30 RAAGGAGAGAPGSCSAGAGATAGPGLGLYGDFGSAAAGLYERPTAAAGLLYPERGHGLHA
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pF1KB7 SPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGK
. . . . : : .:.:.::.:::::::::::::::::::::::::..:::
CCDS30 DKGAGVKVESELLCTRLLLGGGSYKCIKCSKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACEMCGK
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 TFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQ
::::::::::: ::::::::.:..:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS30 TFGHAVSLEQHKAVHSQERSFDCKICGKSFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQYCGKRFHQ
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pF1KB7 KSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDL
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::
CCDS30 KSDMKKHTFIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFGCDLCGKGFQRKVDL
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pF1KB7 RRHRESQHNLK
:::::.::.::
CCDS30 RRHRETQHGLK
420
>>CCDS55157.1 FEZF1 gene_id:389549|Hs108|chr7 (425 aa)
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Smith-Waterman score: 619; 40.9% identity (69.8% similar) in 215 aa overlap (116-328:165-374)
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pF1KB7 SRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPS
: .... ... . ....:..: . .. .
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pF1KB7 TEPALDFSLRYSPGMD--AYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGH
: ::: : ::. .. : :.:::.. ..: :. :.:.:::.: .::: : .
CCDS55 TS---DFS-RGSPNAKPKVFTCEVCGKVFNAHYNLTRHMP-VHTGARPFVCKVCGKGFRQ
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 AVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDM
: .: .: .:.::. .: .:::::.:::::.:: ::. .:. :.:::: ::::...
CCDS55 ASTLCRHKIIHTQEKPHKCNQCGKAFNRSSTLNTHTRIHAGYKPFVCEFCGKGFHQKGNY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 KKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHR
:.: :.::: ::..:.::: : :: : . :. :::.: : ::: :. ::..:
CCDS55 KNHKLTHSGEKQFKCNICNKAFHQVYNLTFHMHTHNDKKPFTCPTCGKGFCRNFDLKKHV
310 320 330 340 350 360
330
pF1KB7 ESQHNLK
.. :.
CCDS55 RKLHDSSLGLARTPAGEPGTEPPPPLPQQPPMTLPPLQPPLPTPGPLQPGLHQGHQ
370 380 390 400 410 420
>>CCDS34741.2 FEZF1 gene_id:389549|Hs108|chr7 (475 aa)
initn: 1576 init1: 557 opt: 619 Z-score: 458.9 bits: 93.7 E(32554): 3.1e-19
Smith-Waterman score: 619; 40.9% identity (69.8% similar) in 215 aa overlap (116-328:215-424)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPS
: .... ... . ....:..: . .. .
CCDS34 FLSSPLHPQPKTYLAERNKLVVPAVEKYPSGVAFKDLSQAQLQHYMKESAQLLSEKIAFK
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 TEPALDFSLRYSPGMD--AYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGH
: ::: : ::. .. : :.:::.. ..: :. :.:.:::.: .::: : .
CCDS34 TS---DFS-RGSPNAKPKVFTCEVCGKVFNAHYNLTRHMP-VHTGARPFVCKVCGKGFRQ
250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 AVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDM
: .: .: .:.::. .: .:::::.:::::.:: ::. .:. :.:::: ::::...
CCDS34 ASTLCRHKIIHTQEKPHKCNQCGKAFNRSSTLNTHTRIHAGYKPFVCEFCGKGFHQKGNY
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 KKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHR
:.: :.::: ::..:.::: : :: : . :. :::.: : ::: :. ::..:
CCDS34 KNHKLTHSGEKQFKCNICNKAFHQVYNLTFHMHTHNDKKPFTCPTCGKGFCRNFDLKKHV
360 370 380 390 400 410
330
pF1KB7 ESQHNLK
.. :.
CCDS34 RKLHDSSLGLARTPAGEPGTEPPPPLPQQPPMTLPPLQPPLPTPGPLQPGLHQGHQ
420 430 440 450 460 470
>>CCDS2897.1 FEZF2 gene_id:55079|Hs108|chr3 (459 aa)
initn: 1545 init1: 542 opt: 606 Z-score: 449.8 bits: 92.0 E(32554): 9.8e-19
Smith-Waterman score: 606; 47.0% identity (72.9% similar) in 166 aa overlap (163-328:277-441)
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 HSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPF
. : :.:::.. ..: :. :.:.:::
CCDS28 KENSALTAERGGVKGHSKLPGGSADGKPKNFTCEVCGKVFNAHYNLTRHMP-VHTGARPF
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 ACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQF
.: .::: : .: .: .: .:.::. .: .:::::.:::::.::. ::. .:. :.:
CCDS28 VCKVCGKGFRQASTLCRHKIIHTQEKPHKCNQCGKAFNRSSTLNTHIRIHAGYKPFVCEF
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 CGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKG
::: ::::...:.: :.::: .:: .:.::: : :: : . :. :::.: : ::
CCDS28 CGKGFHQKGNYKNHKLTHSGEKQYKCTICNKAFHQVYNLTFHMHTHNDKKPFTCATCGKG
370 380 390 400 410 420
320 330
pF1KB7 FQRKVDLRRHRESQHNLK
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430 440 450
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130 140 150 160 170 180
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:: : :.:..:.:.:: : : .
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: ::: :.:: .:::.: :. :: .: ..:. :.::.: :::::...:.:: : ::.
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310 320 330
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:.: : ..:.:. .: .:.
CCDS33 FACAQCGRSFSRSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKGFAKGAVLLSHRRIHTGEKPFVCT
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:.: :.:.: : : ::::.: .:.
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:. :::.:... .: : ..:. :. ..: :::.::..: :.:: .::. .:: :..
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::: :.:.:.. .: :::::::.::..:::.::::::: ::. :.: ::..:. : :
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:.:. .: :.
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.:. :. :::.: : .: .: .:. :. . : :::::. : : .: .:. .::
CCDS46 KPYKCNECGKVFRHQSTLARHRSIHTGEKPYVCNECGKAFRVRSILVNHQKMHTGDKPYK
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:. ::: : ..: . : ::::::.:: :::::.. : : :. :.: ::..:. :
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pF1KB7 TKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
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CCDS46 GKSFISRSGLTKH-QTKHTAESLKTKFNVEKPLDVLLTSGFK
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: : : :.:::: : : .:::.:
CCDS46 HSGNKPYKCDECGKTFKRSSSLTTHQIIHTGEKPYTCDVCDKVFSQRSQLARH-QRSHTG
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pF1KB7 TRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPY
.:. :. :::.:... : : ..:. :. ..: ::::::..: :. : .::. . :
CCDS46 EKPYKCNECGKVFSQTSHLVGHRRIHTGEKPYKCDKCGKAFKQGSLLTRHKIIHTREKRY
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pF1KB7 PCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCEL
: ::: : ..: . .: :::::.:.::.::::.:. :.:: :.: ::: :::.:.
CCDS46 QCGECGKVFSENSCLVRHLRIHTGEQPYKCNVCGKVFNYSGNLSIHKRIHTGEKPFQCNE
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: :. : ::
CCDS46 CGTVFRNYSCLARHLRIHTGQKPYKCNVCGKVFNDSGNLSNHKRIHTGEKPFQCNECGKV
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pF1KB7 YGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFST
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CCDS44 AFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQ
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: : .: :::..:: :. :::.:.. :: :: ..:. :. .:: .::: : :.
CCDS44 STYLIEH-QRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSS
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:..: .::. .:: :. ::: : :.. . .: :::::::..:. ::::: ..:.: .:
CCDS44 LTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVH
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pF1KB7 SRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
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CCDS44 QRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT
430 440 450 460
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CCDS44 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFT--EMRVCGGNEFER
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170
pF1KB7 APS------TMQSAFL---EHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVF
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CCDS44 CSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSE--LIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTF
60 70 80 90 100 110
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CCDS44 SQSSSLLKH-QRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQS
120 130 140 150 160 170
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CCDS44 MNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLT
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CCDS44 VHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQR
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CCDS12 LGEALHAGEKSFECRACSKVFVKSSDLLKHLRTHTGERPYECAQCGKAFSQTSHLTQH-Q
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pF1KB7 RSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHS
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CCDS12 RIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVRHQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHRKIHA
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pF1KB7 DTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKP
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CCDS12 GGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFKHQRVHTGEKP
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pF1KB7 FSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
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CCDS12 FACPQCGRAFSHSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKAFAKGAVLLSHRRIHTGEKPFVCT
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