Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7879
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7879, 575 aa
1>>>pF1KB7879 575 - 575 aa - 575 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8115+/-0.00179; mu= 19.0619+/- 0.108
mean_var=291.7515+/-53.385, 0's: 0 Z-trim(106.9): 952 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.075088
statistics sampled from 8184 (9243) to 8184 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 575) 4114 460.6 2.4e-129
CCDS56110.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 574) 4095 458.5 1e-128
CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 575) 4030 451.5 1.3e-126
CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 574) 4011 449.4 5.5e-126
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 2585 295.1 1.9e-79
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 2585 295.1 1.9e-79
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2451 280.8 4.9e-75
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 2246 258.3 2.1e-68
CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 2154 248.2 1.9e-65
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 2120 244.6 2.6e-64
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 2090 241.3 2.4e-63
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 2088 241.1 2.8e-63
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 2046 236.6 6.7e-62
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1940 225.0 1.8e-58
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1892 219.8 6.9e-57
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1892 219.9 7.2e-57
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1892 219.9 7.2e-57
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1649 193.7 6.3e-49
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1630 191.6 2.5e-48
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1630 191.6 2.6e-48
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1629 191.4 2.6e-48
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1630 191.7 2.7e-48
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1631 192.1 2.9e-48
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1631 192.1 3e-48
CCDS56109.1 ZNF587B gene_id:100293516|Hs108|chr19 ( 402) 1617 189.8 5.5e-48
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1615 190.0 8e-48
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1615 190.0 8e-48
CCDS12440.2 ZNF792 gene_id:126375|Hs108|chr19 ( 632) 1613 189.7 9.1e-48
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1605 188.9 1.7e-47
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1579 186.1 1.2e-46
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1579 186.2 1.3e-46
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1578 186.0 1.3e-46
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 1573 185.4 1.8e-46
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1571 185.2 2.2e-46
CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 627) 1567 184.7 2.9e-46
CCDS33127.1 ZNF264 gene_id:9422|Hs108|chr19 ( 627) 1563 184.3 3.9e-46
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1566 185.1 3.9e-46
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1561 184.2 4.9e-46
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1560 184.3 5.8e-46
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1558 183.9 6e-46
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1558 183.9 6.2e-46
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1555 183.5 7.1e-46
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1555 183.5 7.3e-46
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1554 183.5 8.1e-46
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1554 183.5 8.2e-46
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1554 183.5 8.2e-46
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1551 183.0 9.5e-46
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1551 183.0 9.5e-46
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1548 182.7 1.2e-45
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1548 182.7 1.2e-45
>>CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 (575 aa)
initn: 4114 init1: 4114 opt: 4114 Z-score: 2435.6 bits: 460.6 E(32554): 2.4e-129
Smith-Waterman score: 4114; 100.0% identity (100.0% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PSSGLCQEEAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSSGLCQEEAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CGKSFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKSFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 IHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHRR
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB7 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
550 560 570
>>CCDS56110.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 (574 aa)
initn: 4047 init1: 4047 opt: 4095 Z-score: 2424.5 bits: 458.5 E(32554): 1e-128
Smith-Waterman score: 4095; 99.8% identity (99.8% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MAAAVPRRPTQ-GTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PSSGLCQEEAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PSSGLCQEEAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCEE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CGKSFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CGKSFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSVT
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pF1KB7 IHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHRR
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550 560 570
pF1KB7 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
540 550 560 570
>>CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 (575 aa)
initn: 4030 init1: 4030 opt: 4030 Z-score: 2386.4 bits: 451.5 E(32554): 1.3e-126
Smith-Waterman score: 4030; 98.1% identity (99.1% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAAAPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PSSGLCQEEAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSSGLCQEAAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS12 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGKTAYPCEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CGKSFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
::::::::::::::: ::::: :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKSFSQKGSLISHQRVHTGERPYECREYGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS12 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVQHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS12 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKNCVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 IHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHRR
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS12 IHQRIHTGERPYECNECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFAECSSLIKHRR
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB7 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
550 560 570
>>CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 (574 aa)
initn: 3970 init1: 3970 opt: 4011 Z-score: 2375.3 bits: 449.4 E(32554): 5.5e-126
Smith-Waterman score: 4011; 97.9% identity (99.0% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
::::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MAAAAPRRPTQ-GTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
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:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PSSGLCQEAAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS74 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGKTAYPCEE
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::::::::::::::: ::::: :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CGKSFSQKGSLISHQRVHTGERPYECREYGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS74 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVQHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS74 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKNCVT
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CCDS74 IHQRIHTGERPYECNECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFAECSSLIKHRR
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CCDS74 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
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.::::: :. ::.:: :: :: ::::::::: ::::: :: :..:.:::: :::::::.
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: : :..: :.. . ::.:..::: ::.::.:: :::. :..::.: .: . ::: :
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::::: .::. ::..:. ::: : :.::::. : :::: . .:.: .:.
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:: : .::::::.: : ::::: ::.: ::.:::::::.:.:.::.::::::::. : :
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: : :: .:.::: ::.::::.: :::: :.:::.:..:.: :: :::::: ::::::
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..:: .::: :::::::.: :::: :.:: .:. :.: ::::::: :. : ::: .:
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. :::.:::::::::.:::::: .::...::.:::.:.::..:::::::: . ::..:
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::.::::::::: .:::.:..::.::.::..:
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:::::::::::.::::: :. ::.:: :: :: ::::::::: ::::: :: :..:.::
CCDS82 LISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLAD
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:: :::::::.: : :..: :.. . ::.:..::: ::.::.:: :::. :..::.:
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.: . ::: :::::: .::. ::..:. ::: : :.::::. : ::::
CCDS82 SIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVF
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. .:.: .:. :: : .::::::.: : ::::: ::.: ::.:::::::.:.:.::.:::
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:::::. : : :::::::.::::..:: ::::: :::: ::::::.:.:.::.::. ::
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::: :.: :::: : :: .:.::: ::.::::.: :::: :.:::.:..:.: :: :::
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::: :::::: ..:: .::: :::::::.: :::: :.:: .:. :.: ::::::: :.
CCDS82 YECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECR
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pF1KB7 VCGKLFGNKHSVTIHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGK
: ::: .: . :::.:::::::::.:::::: .::...::.:::.:.::..::::::
CCDS82 ECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGK
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:: . ::..:::.::::::::: .:::.:..::.::.::..:
CCDS82 SFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSS
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CCDS82 ECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
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pF1KB7 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
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CCDS46 MAAAATLRLSAQGTVTFEDVAVNFTWEEWNLLSEAQRCLYRDVTLENLALISSLGCWCGV
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pF1KB7 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
.:: :: :: : .:::.: ::: ::::::::::::::: :: :..: :::: :::::::.
CCDS46 EDEAAPSKQSIYIQRETQVRTPMAGVSPKKAHPCEMCGPILGDILHVADHQGTHHKQKLH
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pF1KB7 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
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CCDS46 RCEAWGNKLYDSGNFHQHQNEHIGEKPYRGSVEEALFAKRCKLHVSGESSVFSESGKDFL
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pF1KB7 PSSGLCQEEAAV--EKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDG
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CCDS46 PRSGLLQQEASHTGEKSNSKTECVSPIQCGGAHYSCGESMKHFSTKHILSQHQRLLTREE
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pF1KB7 CYVCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPC
:::: .::::::.:.:.::::: :: : ..:::::::.:. :. .:::::: . . :
CCDS46 CYVCCECGKSFSKYASLSNHQRVHTEK-KHECGECGKSFSKYVSFSNHQRVHT-EKKHEC
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::: . : ::::::::.:::.::::::::.. ... .::: :: .. ::: ::::::
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.: : .:::.::::.::.:.:::: :. . :: :.:::.::::. : : : :..:.:
CCDS46 QKSSLIQHQRFHTGEKPYGCEECGKSFSSEGHLRSHQRVHAGERPFKCGECVKSFSHKRS
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pF1KB7 VTIHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKH
.. :::.:.:::::.:.:::::: ... : .:.:::.: .::.:.::::::: . : .:
CCDS46 LVHHQRVHSGERPYQCGECGKSFSQKGNLVLHQRVHTGARPYECGECGKSFSSKGHLRNH
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pF1KB7 RRIHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
..::::.: ::: .:::.:....::. :: : :.
CCDS46 QQIHTGDRLYECGECGKSFSHKGTLILHQRVHPRERSYGCGECGKSFSSIGHLRSHQRVH
540 550 560 570 580 590
CCDS46 TGERPYECGECGKSFSHKRSLVHHQRMHTGERPYKCGDCGKSFNEKGHLRNHQRVHTTER
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CCDS46 DRLYECGECGKSFSHKGTLILHQRVHPRERSYGCGECGKSFSSIGHLRSHQRVHTGERPY
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pF1KB7 ECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKSFRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGE
:: ::::::..: .:..::. ::::: :.::.::::: .: . ::::::: :::.::::
CCDS46 ECGECGKSFSHKRSLVHHQRMHTGERPYKCGDCGKSFNEKGHLRNHQRVHTTERPFKCGE
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pF1KB7 CGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRYRSHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKL
::: :..::::. ::.:::::::: :.:::: :. .::: :::.:.::.:: :. : :.
CCDS46 CGKCFSHKGNLILHQHGHTGERPYVCRECGKLFKKKSHLLVHQRIHNGEKPYACEACQKF
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pF1KB7 FNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSVTIHQRIHTGERPYECSECGKSFLSS
: ::.:..:.::::::::: :. ::: : .. . .:.::::::.::::::::::: :
CCDS46 FRNKYQLIAHQRVHTGERPYECNDCGKSFTHSSTFCVHKRIHTGEKPYECSECGKSFAES
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pF1KB7 SALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHRRIHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLL
:.. :::::.:.:::.::::::::.: ::: ::.:.::::.::.: :::: :...: ::
CCDS46 SSFTKHKRVHTGEKPYECSECGKSFAESSSLTKHKRVHTGEKPYKCEKCGKLFNKKSHLL
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570
pF1KB7 HHQSSHRRKAL
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CCDS46 VHQSSHWRKAI
850
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pF1KB7 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
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10 20 30 40 50
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CCDS12 GDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLY
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pF1KB7 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
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CCDS12 TDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
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CCDS12 VRSRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERS
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 YVCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCE
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CCDS12 ECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGK
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CCDS12 SFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTY
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CCDS12 RSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYL
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pF1KB7 TIHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHR
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CCDS12 ISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHR
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CCDS12 RSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHS
540 550 560 570 580 590
CCDS12 GERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
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10 20 30 40 50 60
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CCDS12 KDE-TPSKQTLSIQQESPLRTHWTGVCTKKVHLWGMCGPLLGDIL----HQGTQHNQKLN
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CCDS12 GFGAYEKKLDDDANHHQDQKQHIGEKSYRSNAKGTSFVKNCKFHMSHEPFIFHEVGKDFL
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CCDS12 PYVCSDSGKFTSKSNSFNNHQGVRTGKRPYQCGQCDESFWYKAHLTEHQRVHTGERPYEC
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CCDS12 GECDKSFSHKHSLVDHQRVHTGERPYECDECGKSFSHKRSLVHHQRVHTGERPYQCGECG
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CCDS12 KSFNHKCNLIQHQRVHTGERPFECTACGKLFRSNSHLKEHQRVHTGERPYECKECRKSFR
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CCDS12 YKSHLTEHQRVHTGERPYECRECGKCFHQKGSLIQHQQIHSGERPHECGECGKCFHQKGS
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CCDS12 LIRHQQIHSGERPHECGECGKCFRQKGNLIKHQRVHTGERHHEC
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CCDS82 GNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGL
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pF1KB7 CQEEAAV--EKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCYVCS
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CCDS82 LLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECY-CW
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CCDS82 ECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGK
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pF1KB7 SFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKSFRQ
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CCDS82 SFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]