Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7876
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7876, 638 aa
1>>>pF1KB7876 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4423+/-0.0018; mu= 10.6195+/- 0.106
mean_var=280.8752+/-57.362, 0's: 0 Z-trim(102.5): 961 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.076528
statistics sampled from 5976 (6999) to 5976 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 4631 526.5 4.3e-149
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 4631 526.5 4.4e-149
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 2845 329.4 1.1e-89
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 2845 329.4 1.1e-89
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 2761 320.0 6.1e-87
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 2527 294.2 3.7e-79
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 2334 272.9 9.2e-73
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 2334 272.9 9.4e-73
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 2333 272.8 1e-72
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 2275 266.4 8.4e-71
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 2275 266.4 8.8e-71
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2198 257.9 3.2e-68
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 2180 255.9 1.2e-67
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 2172 254.9 2.1e-67
CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 ( 532) 2161 253.7 4.8e-67
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2144 252.2 2.6e-66
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2144 252.2 2.6e-66
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2126 250.2 1e-65
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2106 248.1 5e-65
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2106 248.1 5.1e-65
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2104 247.9 6.2e-65
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2097 246.9 7.9e-65
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2097 246.9 8.2e-65
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2093 246.5 1.1e-64
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2081 245.2 3e-64
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 2072 244.1 5.5e-64
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2068 243.7 7.4e-64
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2068 243.7 7.5e-64
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2068 243.7 7.5e-64
CCDS12271.1 ZNF442 gene_id:79973|Hs108|chr19 ( 627) 2054 242.0 1.9e-63
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2056 242.5 2.1e-63
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2048 241.5 3.4e-63
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2048 241.5 3.5e-63
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2048 241.5 3.7e-63
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 2038 240.1 5.8e-63
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 2038 240.3 6.8e-63
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 2036 239.9 6.9e-63
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2034 239.9 9.6e-63
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2037 240.5 1e-62
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 2032 239.6 1.1e-62
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 2032 239.6 1.1e-62
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2030 239.4 1.2e-62
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2027 239.1 1.7e-62
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2024 238.8 2.2e-62
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2024 238.8 2.2e-62
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2017 238.1 3.8e-62
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2006 236.8 8.1e-62
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 1999 236.1 1.5e-61
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 1999 236.1 1.6e-61
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1988 234.7 2.9e-61
>>CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 (638 aa)
initn: 4631 init1: 4631 opt: 4631 Z-score: 2790.2 bits: 526.5 E(32554): 4.3e-149
Smith-Waterman score: 4631; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRNLRIVGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRNLRIVGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDMLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KTTTGVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHIRDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KTTTGVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHIRDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHSNLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHSNLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 HKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRIHERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRIHERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 CNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKEC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 GKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 NCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB7 HGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHGRAHCIDTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHGRAHCIDTP
610 620 630
>>CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 (673 aa)
initn: 4631 init1: 4631 opt: 4631 Z-score: 2790.0 bits: 526.5 E(32554): 4.4e-149
Smith-Waterman score: 4631; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:36-673)
10 20 30
pF1KB7 MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SVAFEDVAVTFTQEEWALLDPSQKNLCRDVMQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LRIVGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDMLKKTTTGVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRIVGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDMLKKTTTGVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHIRD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 DTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHSNL
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160 170 180 190 200 210
pF1KB7 QRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRIHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRIHE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 RTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEIS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 HKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 QCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGK
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 TFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 ASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 QMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHG
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 RAHCIDTP
::::::::
CCDS45 RAHCIDTP
670
>>CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (742 aa)
initn: 2668 init1: 1517 opt: 2845 Z-score: 1723.9 bits: 329.4 E(32554): 1.1e-89
Smith-Waterman score: 2845; 61.9% identity (79.9% similar) in 646 aa overlap (1-633:53-698)
10 20 30
pF1KB7 MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRN
: ::::::.::::::. ::: ::.: ::.
CCDS32 PVAFEDVAVNFTQEEWTLLDISQKNLFREVMLETFRNLTSIGKKWSDQNIEYEYQNPRRS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KB7 LR-IVGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDML----KKTTTGVKSCESSVYGEVGSAHSSLN
.: .. :.. : :: . :: .:::::: : ::.. ::::.: : .::: ..::.:
CCDS32 FRSLIEEKVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEVKSCDSFVCAEVGIGNSSFN
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 RHIRDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKY--CKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKT
:: ::::::::::::: :::::. :: : :..:.:: :.:.: :.:. ::::
CCDS32 MSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKNKKAFRYRPSIRTQERDHTGEKPYACKVCGKT
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 FISHSNLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHS
:: ::...:: .:: ::: :::::::::. .::::::.:::::::::.::::::.:..:
CCDS32 FIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAFHSFSLYLIHERTHTGEKPYECKQCGKSFTYS
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 SSLRIHERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQ
..:.::::::::::::.:..: ::::::. : :.:.: :::::.::.:::::. . :..
CCDS32 ATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSSSYHRHERSHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLR
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 IHERTHTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLG
:::::.:.::::::. :.... : . : : .: ..::.:: ::: . :::.:
CCDS32 RHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSGERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEK
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 MHTGEISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTG
:::: .::: ::::: ::.. ::. :::::::.:.:::::: :.:..: : ::::
CCDS32 THTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTG
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
pF1KB7 EKPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHRE----
:::::::.:::::::.: :..::::::::::: :::::: : . .::::: ...
CCDS32 EKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMP
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 --EKPYECKGYGKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGEK
:.::.:. : : . :. ::.:::: : :::.:::..: : .:.::: :::::::
CCDS32 SGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEK
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 PYECKQCGKAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYEC
:::::::::::::::.:..: ::::::::::::::::::. ::.:. :::::::::::::
CCDS32 PYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYEC
570 580 590 600 610 620
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CCDS32 NLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLR
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CCDS32 GKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGKAF---SRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCR
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CCDS82 TKNTLPGVGPYESRMSGEVIMGHSSLNCYIRVGAGHKPYEYHECGEKPDTHKQRGKAFSY
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CCDS82 HNSLQTHERLHTGKKPYNCKECGKSFSSLGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLL
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CCDS82 HMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKLYECKQCSKAFPDYSSCLR-H
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CCDS82 LYECKQCGKALSHSSSFRRHMTMHTGDGPHKCKICGKAFVYPSVFQRHEKTHTAEKPYKC
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CCDS82 KQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCKC-GKAFIDFYSFQNHKTTHAGEKPYECKECG
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pF1KB7 RSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFG
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CCDS82 KAFSCFQYLSQHRRTHTGEKPYECNTCKKAFSHFGNLKVHERIHSGEKPYECKECGKAFS
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CCDS82 WLTCFLRHERIHMREKPYECQQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAFASLSS
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pF1KB7 LRRHGRTH-----TGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHGRAHCIDTP
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CCDS82 LHRHKKTHWKKTHTGENPYGCKECGKAFASLSSLHRHKKTH
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CCDS45 SVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVGMKWKDQNIEDQYRYPRKN
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CCDS45 LRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPYESRMSGEVIMGHSSLNCYI
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CCDS45 RVGAGHKPYEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSLQTHERLHTGKKPYNCKECGKSFSSLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]