FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7875, 570 aa
1>>>pF1KB7875 570 - 570 aa - 570 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5194+/-0.000936; mu= 15.0179+/- 0.058
mean_var=307.9235+/-61.329, 0's: 0 Z-trim(109.2): 2138 B-trim: 123 in 2/49
Lambda= 0.073089
statistics sampled from 14966 (17316) to 14966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 9.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 3120 344.4 5.4e-94
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2844 315.4 3.2e-85
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2757 306.2 1.9e-82
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2738 304.2 7.5e-82
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2663 296.3 1.7e-79
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2663 296.3 1.7e-79
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2662 296.2 1.9e-79
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2660 295.9 2.1e-79
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2660 296.0 2.2e-79
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2660 296.0 2.2e-79
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2659 296.0 2.5e-79
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2655 295.4 3.1e-79
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2649 295.1 6e-79
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2621 291.9 3.8e-78
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2621 291.9 3.8e-78
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2612 291.0 7.7e-78
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2608 291.1 1.4e-77
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2525 282.1 5.2e-75
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2523 282.1 6.9e-75
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2523 282.1 7.2e-75
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2513 280.8 1.2e-74
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2507 280.1 1.9e-74
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2482 277.2 9.5e-74
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2477 276.6 1.3e-73
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2426 271.8 8.2e-72
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2426 271.8 8.2e-72
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2416 270.2 1.2e-71
>>NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [Homo (542 aa)
initn: 4628 init1: 3106 opt: 3120 Z-score: 1808.5 bits: 344.4 E(85289): 5.4e-94
Smith-Waterman score: 3148; 78.4% identity (88.1% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
:.. . :. ::: :::::::.:.::: :..:::::::::::::::::::::::.::: ::
NP_775 MDDPRYGMCPLKGASGCPGAERSLLVQSYFEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDSAQQGLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
::::::::::::::::::..::::::::::::::::.::: :: .::: ::: :::: :
NP_775 RKVMLENYRNLVFLAGIALTKPDLITCLEQGKEPWNIKRHEMVAKPPVICSHFPQDLWAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
: :::::::.::..::: ::..:::. ::::::::..::: ..::::: ::::.::: :
NP_775 QDIKDSFQEAILKKYGKYGHDNLQLQKGCKSVDECKVHKEHDNKLNQCLITTQSNIFQCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
..::. ::: : .::::: :::::::::.::::::::::::::.:: ::::::..:::
NP_775 PSAKVFHTFSNSNRHKIRHTRKKPFKCKKCEKSFCMLLHLTQHKRFHITENSYQCKDCGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
.:::::::: ::::::::::::::.:::::..:: :::::::::::::::::::::.:::
NP_775 AFNWFSTLTTHRRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
::::::::::::: :::.: :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_775 SSHLTTHKRIHTGVKPYKCTECGKAFNRSSHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::::
NP_775 TTHKITHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKTSHTGEKFYKCEECGKGFNWSSALTKHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
::::::::::::.::::::::::::.::.::::::::::.::::::::: .:::::.::.
NP_775 RIHTGEKPYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECGKAFNRSSQLTAHKMIHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
:::::::::::::::. :.:::::::: :. :::. ::
NP_775 GEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKITHTGEKSYKWEEC----------------------
490 500 510
550 560 570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
:: :::: .::.:.::::::::::
NP_775 ------GKDFNQSLSLIKQNNSYWRETLQM
520 530 540
>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa)
initn: 4340 init1: 2601 opt: 2844 Z-score: 1651.0 bits: 315.4 E(85289): 3.2e-85
Smith-Waterman score: 2844; 76.2% identity (90.3% similar) in 526 aa overlap (31-556:9-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
: : :::::::.:::::::::::::::.::
NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
:.:::::::::::. :::.:::::::::::::::::.::: :: .:::.::.:::::::.
NP_001 RNVMLENYRNLVFV-GIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPK
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pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
:: :. ::.:::: : :::.:.:::: :::.:::..:::::. :::::::::..:::::
NP_001 QGKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYD
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
:::.::.:::: : .:: ::::: ::::.:.:::::: ::.:::::: :. :.:.::::
NP_001 KYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
..: :.:. :.:::::.::::::.:::::.. : ::::::::::.:::.::::::.::.
NP_001 AYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
:..::::::::::::::.::::::::..:: ::.:::::.::::::::::::::.:::::
NP_001 SANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTL
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
:::::::.::: :::::::::: :.:.:: :: ::.::: ::::::::.:. ::::: ::
NP_001 TTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHK
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
:::.::: :::: :.:::.. :.::.:: :::::::::::::::::: : .::.::.::.
NP_001 RIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHT
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
:::::::::::::::: :.:.:::. : :. :: :: :::.::: :: ::.:::::::
NP_001 GEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKP
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
:.::: :::::.:: :
NP_001 YKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
520 530 540 550 560 570
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 6296 init1: 2594 opt: 2757 Z-score: 1601.3 bits: 306.2 E(85289): 1.9e-82
Smith-Waterman score: 2757; 74.4% identity (87.5% similar) in 528 aa overlap (33-559:2-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
::::::::::::::.:::::::::..:::.
NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHA-MVDQPPVTYSHFAQDLWPEQ
:::::::::::: ::.::::::::::::::: :.:::: :: .: : :::::::::::
NP_003 VMLENYRNLVFL-GITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDK
.::::::.: :.::::: ::.: :: ::.:.:::..:: . ::::::.:::.::: ::
NP_003 NIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKV
::.: .:::: : ..:::: :::::: :: ::: :. ::.:.::: : : :.::::::.
NP_003 YVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKA
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 FNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRS
::: ::::.:.::::::::::::.:::::.:::.: :: ::::::::.::::::::::
NP_003 FNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLT
: ::::: ::::::::.:.:::.:::::: ::::. :::::::::::::::::.:::.::
NP_003 STLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLT
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 THKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKR
::::::.:::::::..::::: . ..:: :..:::::: ::::.:::.:: : :: ::
NP_003 THKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 IHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSG
::::::::::..:::::..::.:: :::::::::::::.:: ::::.: ::: :: ::.:
NP_003 IHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTG
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 EKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPY
::::.::.::::::: ::::.:: .: . :: :: :.:. :::: ::.::::::::
NP_003 EKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPY
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KB7 NCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
.::: ::::::::.: ..
NP_003 KCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEE
520 530 540 550 560 570
>--
initn: 704 init1: 362 opt: 362 Z-score: 236.4 bits: 53.7 E(85289): 2e-06
Smith-Waterman score: 362; 79.7% identity (90.6% similar) in 64 aa overlap (308-371:529-592)
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 THKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKI
:.:::::::: :::::.:::.::.:: ::
NP_003 IHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKR
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340 350 360 370 380 390
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::::::::::::: :::. ::.:: :::::.:::
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400 410 420 430 440 450
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:::::::: :::::::::::::::..:::
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:::::::::::: ::::::::::: :::::::::.::: :::. :: ::::::.:::..
NP_689 VMLENYRNLVFL-GIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHS
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::::::.:::: ::: :::.:::: :::: :...: :. ::::::::.:.::: :::
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:: :::::: ::::.:::::.:::. : :. :: :: .:::::::::::: : :
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:::::.:::::::::::::: .:: :::::::::::: :::.::::.:: ::::::::::
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::::::::::::. ::.:::::: : . :: :: :::.::: .::::.::: : :.
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::. :.:::::::: .. :
NP_689 CEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECG
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
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pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
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XP_011 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
::::::.: :::: . ::..::.. ::.:::::..::. :. ::: ::::::.::: :::
XP_011 IKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
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XP_011 VKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAF
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
.::::: ::::::::.:::::.::.::: ::.:::::.::::::::::::::.. :.:::
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
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pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
::: ::.:. :.: .. :
XP_011 CEECGKGFKCPSTLTTHKRSGCPTRKLLLSSVSTLNNSEWK
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NP_258 VMLENYRNLVFL-GIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHEMVAKPPVMCSHIAEDLCPERD
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
:: ::.:::::: :: ::.:::: ::::::::.. : :. ::::: ::::...: :::
NP_258 IKYFFQKVILRRYDKCEHENLQLRKGCKSVDECKVCKGGYNGLNQCLITTQSKMYQCDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
:.::::::: . .::::: :: :::.: :::::: .::.::::::::::..::::::.:
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NP_001 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
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NP_001 VKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAF
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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
:: : :: :.::::::: ::::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::.:.:::
NP_001 NWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSS
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
.::::: ::::::::.:::::.::.::: ::.:::::.::::::::::::::.. :.:::
NP_001 NLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTT
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:: ::.:::::::::::.:: :: :: :::::.::: ::::::::.::::: :: ::::
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NP_001 HTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGE
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
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>>XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (550 aa)
initn: 5499 init1: 2419 opt: 2660 Z-score: 1546.3 bits: 296.0 E(85289): 2.2e-79
Smith-Waterman score: 2660; 72.3% identity (87.4% similar) in 524 aa overlap (33-556:2-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
::: :::::::::::::.::::::..:::.
XP_006 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRN
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
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XP_006 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
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XP_006 IKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKY
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570 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 09:59:47 2016 done: Sat Nov 5 09:59:49 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]