Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7875, 570 aa
1>>>pF1KB7875 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5220+/-0.00241; mu= 14.7108+/- 0.144
mean_var=272.5143+/-50.811, 0's: 0 Z-trim(102.6): 991 B-trim: 35 in 1/51
Lambda= 0.077693
statistics sampled from 5935 (7005) to 5935 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.519), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 4021 465.8 6.5e-131
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 3165 369.8 5e-102
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 3120 364.7 1.6e-100
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 2844 333.8 3.4e-91
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 2757 324.1 3e-88
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 2738 322.0 1.3e-87
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 2721 320.1 4.9e-87
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 2662 313.4 4.6e-85
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 2660 313.2 5.3e-85
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 2659 313.2 6.3e-85
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 2651 312.2 1.1e-84
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2649 312.3 1.6e-84
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 2640 310.9 2.5e-84
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 2621 308.8 1.1e-83
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 2612 307.9 2.4e-83
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 2606 307.3 3.9e-83
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2608 307.9 4.5e-83
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 2600 306.5 5.7e-83
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 2587 305.0 1.5e-82
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 2569 303.0 6.4e-82
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2525 298.4 2.4e-80
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2523 298.4 3.4e-80
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2513 297.0 6e-80
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2507 296.3 9.4e-80
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 2488 294.0 3.7e-79
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 2483 293.4 5.3e-79
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2473 292.5 1.3e-78
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 2452 289.9 5.5e-78
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 2444 289.0 1e-77
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 2432 287.7 2.7e-77
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 2405 284.7 2.2e-76
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 2345 277.8 2.2e-74
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 2335 276.7 4.8e-74
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 2309 273.9 3.7e-73
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 2303 273.1 5.7e-73
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 2280 270.6 3.7e-72
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2253 267.8 3.5e-71
CCDS42533.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19 ( 498) 2248 266.9 4e-71
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2222 264.4 3.9e-70
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 2218 263.7 4.5e-70
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2209 263.2 1.3e-69
CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 ( 483) 2200 261.5 1.7e-69
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 2162 257.3 3.1e-68
CCDS75078.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 478) 2146 255.5 1.1e-67
CCDS42534.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19 ( 466) 2098 250.1 4.5e-66
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 2062 246.0 7.2e-65
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 1998 238.8 1e-62
CCDS75079.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 446) 1986 237.5 2.6e-62
CCDS78236.1 ZNF735 gene_id:730291|Hs108|chr7 ( 412) 1938 232.1 1.1e-60
CCDS55113.1 ZNF727 gene_id:442319|Hs108|chr7 ( 499) 1902 228.2 1.9e-59
>>CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 (570 aa)
initn: 4021 init1: 4021 opt: 4021 Z-score: 2463.8 bits: 465.8 E(32554): 6.5e-131
Smith-Waterman score: 4021; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
550 560 570
>>CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 2772 init1: 2772 opt: 3165 Z-score: 1945.2 bits: 369.8 E(32554): 5e-102
Smith-Waterman score: 3165; 79.3% identity (89.8% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
:..:: ::::::::::::::.:::::::..:: :::::::::::::::.::. :::.::
CCDS32 MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
.::::::.::::: :.:::: : .::::: ::::::::: :::.::. :.:..:::::
CCDS32 MNVMLENYKNLVFL-GVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
: ::::::.::::::::: ::.:::: : :::: ..::: :.:::::::::::.:: :
CCDS32 QDIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
:::.::.:: : : .: ::::::::::::: :::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS32 KYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGK
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
.:.::::::::.::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 AFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
:::::::: ::::::::.:::::.:::.:: :.:::.::.:::::::::: ::::. : :
CCDS32 SSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
: :::::.::: ::::::::.: : ::::: :::::: :::: :::.:: ::.:: ::
CCDS32 TKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
:::::::::::.::::::.: .:::::::::::::::::::::::..: ::.:: ::.
CCDS32 MIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
:::::::::::::::. :::::::: : :. ::: :: :::.::::::::. ::: .::
CCDS32 GEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKP
480 490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
::::: ..::::::::.:.::::::::::
CCDS32 YNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
540 550 560 570
>>CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 (542 aa)
initn: 4628 init1: 3106 opt: 3120 Z-score: 1918.2 bits: 364.7 E(32554): 1.6e-100
Smith-Waterman score: 3148; 78.4% identity (88.1% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
:.. . :. ::: :::::::.:.::: :..:::::::::::::::::::::::.::: ::
CCDS42 MDDPRYGMCPLKGASGCPGAERSLLVQSYFEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDSAQQGLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
::::::::::::::::::..::::::::::::::::.::: :: .::: ::: :::: :
CCDS42 RKVMLENYRNLVFLAGIALTKPDLITCLEQGKEPWNIKRHEMVAKPPVICSHFPQDLWAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
: :::::::.::..::: ::..:::. ::::::::..::: ..::::: ::::.::: :
CCDS42 QDIKDSFQEAILKKYGKYGHDNLQLQKGCKSVDECKVHKEHDNKLNQCLITTQSNIFQCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
..::. ::: : .::::: :::::::::.::::::::::::::.:: ::::::..:::
CCDS42 PSAKVFHTFSNSNRHKIRHTRKKPFKCKKCEKSFCMLLHLTQHKRFHITENSYQCKDCGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
.:::::::: ::::::::::::::.:::::..:: :::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 AFNWFSTLTTHRRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
::::::::::::: :::.: :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSHLTTHKRIHTGVKPYKCTECGKAFNRSSHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS42 TTHKITHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKTSHTGEKFYKCEECGKGFNWSSALTKHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
::::::::::::.::::::::::::.::.::::::::::.::::::::: .:::::.::.
CCDS42 RIHTGEKPYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECGKAFNRSSQLTAHKMIHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
:::::::::::::::. :.:::::::: :. :::. ::
CCDS42 GEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKITHTGEKSYKWEEC----------------------
490 500 510
550 560 570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
:: :::: .::.:.::::::::::
CCDS42 ------GKDFNQSLSLIKQNNSYWRETLQM
520 530 540
>>CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 (572 aa)
initn: 4340 init1: 2601 opt: 2844 Z-score: 1750.8 bits: 333.8 E(32554): 3.4e-91
Smith-Waterman score: 2844; 76.2% identity (90.3% similar) in 526 aa overlap (31-556:9-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
: : :::::::.:::::::::::::::.::
CCDS46 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
:.:::::::::::. :::.:::::::::::::::::.::: :: .:::.::.:::::::.
CCDS46 RNVMLENYRNLVFV-GIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
:: :. ::.:::: : :::.:.:::: :::.:::..:::::. :::::::::..:::::
CCDS46 QGKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYD
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
:::.::.:::: : .:: ::::: ::::.:.:::::: ::.:::::: :. :.:.::::
CCDS46 KYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
..: :.:. :.:::::.::::::.:::::.. : ::::::::::.:::.::::::.::.
CCDS46 AYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
:..::::::::::::::.::::::::..:: ::.:::::.::::::::::::::.:::::
CCDS46 SANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
:::::::.::: :::::::::: :.:.:: :: ::.::: ::::::::.:. ::::: ::
CCDS46 TTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
:::.::: :::: :.:::.. :.::.:: :::::::::::::::::: : .::.::.::.
CCDS46 RIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHT
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
:::::::::::::::: :.:.:::. : :. :: :: :::.::: :: ::.:::::::
CCDS46 GEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKP
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
:.::: :::::.:: :
CCDS46 YKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
520 530 540 550 560 570
>>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
::::::::::::::.:::::::::..:::.
CCDS32 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHA-MVDQPPVTYSHFAQDLWPEQ
:::::::::::: ::.::::::::::::::: :.:::: :: .: : :::::::::::
CCDS32 VMLENYRNLVFL-GITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQ
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDK
.::::::.: :.::::: ::.: :: ::.:.:::..:: . ::::::.:::.::: ::
CCDS32 NIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDK
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pF1KB7 YVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKV
::.: .:::: : ..:::: :::::: :: ::: :. ::.:.::: : : :.::::::.
CCDS32 YVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKA
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRS
::: ::::.:.::::::::::::.:::::.:::.: :: ::::::::.::::::::::
CCDS32 FNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLT
: ::::: ::::::::.:.:::.:::::: ::::. :::::::::::::::::.:::.::
CCDS32 STLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLT
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pF1KB7 THKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKR
::::::.:::::::..::::: . ..:: :..:::::: ::::.:::.:: : :: ::
CCDS32 THKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 IHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSG
::::::::::..:::::..::.:: :::::::::::::.:: ::::.: ::: :: ::.:
CCDS32 IHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTG
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490 500 510 520 530 540
pF1KB7 EKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPY
::::.::.::::::: ::::.:: .: . :: :: :.:. :::: ::.::::::::
CCDS32 EKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPY
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KB7 NCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
.::: ::::::::.: ..
CCDS32 KCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEE
520 530 540 550 560 570
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Smith-Waterman score: 2738; 74.8% identity (85.9% similar) in 531 aa overlap (33-563:2-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
:::::::: :::::::::::::::..:::
CCDS34 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
:::::::::::: ::::::::::: :::::::::.::: :::. :: ::::::.:::..
CCDS34 VMLENYRNLVFL-GIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHS
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
::::::.:::: ::: :::.:::: :::: :...: :. ::::::::.:.::: :::
CCDS34 IKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
:.::.:: : : .:::::::::::::. :::::: .:::::.:: :: ::.::::::.:
CCDS34 VKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAF
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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
:: ::::.:. :::::::::::.:::::..::.:: :::::::::::.::::::.:::::
CCDS34 NWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
:: :::::: ::::.:::::.:::. : :. :: :: .:::::::::::: : :
CCDS34 TLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKK
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pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
:::::.:::::::::::::: .:: :::::::::::: :::.::::.:: ::::::::::
CCDS34 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRI
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pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
::::::::::.:::::..::.:: ::::::::::::::.:::::. : .: :: : .
CCDS34 HTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMED
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
::::::::::::. ::.:::::: : . :: :: :::.::: .::::.::: : :.
CCDS34 KPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYK
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
::. :.:::::::: .. :
CCDS34 CEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECG
520 530 540 550 560 570
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Smith-Waterman score: 2721; 73.9% identity (85.7% similar) in 524 aa overlap (33-556:2-524)
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pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
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CCDS59 MGLLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQKNLYRN
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pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
:::::::::.:: :::::::::: :::. :::::::: :::.:: :::::.:::::
CCDS59 VMLENYRNLAFL-GIAVSKPDLIICLEKEKEPWNMKRDEMVDEPPGICPHFAQDIWPEQG
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
..::::.:::::. :::::.:::: ::::::::..::: :. ::::.::::.. : ::
CCDS59 VEDSFQKVILRRFEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNGLNQCFTTTQGKASQCGKY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
..::::: : : ::::: :::::::.: :::::. : :::: :. :.::.:.::::.:
CCDS59 LKVFYKFINLNRYKIRHTRKKPFKCKNCVKSFCMFSHKTQHKSIYTTEKSYKCKECGKTF
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
:: :::: :.. :: :::::::. ::::.:::. ::::. :::::::.::::::.:..::
CCDS59 NWSSTLTNHKKTHTEEKPYKCEEYGKAFNQSSNYTTHKVTHTGEKPYKCEECGKAFSQSS
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
:: :::::::::: .:::::.::.. : :: :: .: :::::::::::::: :::::
CCDS59 TLTIHKRIHTGEKPCKCEECGKAFSQPSALTIHKRMHIGEKPYKCEECGKAFVWSSTLTR
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
:: .:.::::::::::.::: .:..:: :.::::::: ::::::::.: : :::::::::
CCDS59 HKRLHSGEKPYKCEECAKAFSQFGHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFIWPSTLTKHKRI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
::::::::::.:::::..::::: :::::::::::::::::::: : .:: :: ::. :
CCDS59 HTGEKPYKCEECGKAFHRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSNLTEHKKIHTRE
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
::::::::.:::.. : :: :: : :. :: :: :::::::::: ::.::::::::.
CCDS59 KPYKCEECSKAFSRSSALTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTAHKIIHTGEKPYK
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
::: :::: ::.:
CCDS59 CEECGKAFILSSTLSKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFNQSSNLSTHKIIHTGEKPYKCEEC
520 530 540 550 560 570
>--
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Smith-Waterman score: 535; 81.5% identity (90.2% similar) in 92 aa overlap (333-424:525-616)
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
. :: :::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS59 TLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFILSSTLSKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFNQSSNLST
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pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
:::::.:::::::::::::: : : :. ::::::::: :::.::::.: ::::: :::::
CCDS59 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLSTHKIIHTGEKPYKCDECGKSFIWSSTLFKHKRI
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pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
::
CCDS59 HT
>>CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 (563 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
::::.:::..:::::::.:::::::.:::
CCDS46 MGPLTIRDVTVEFSLEEWHCLDTAQQNLYRD
10 20 30
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pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
:::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::: :: .::: ::.:.:: ::.
CCDS46 VMLENYRNLVFL-GIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHEMVAKPPVMCSHIAEDLCPERD
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
:: ::.:::::: :: ::.:::: ::::::::.. : :. ::::: ::::...: :::
CCDS46 IKYFFQKVILRRYDKCEHENLQLRKGCKSVDECKVCKGGYNGLNQCLITTQSKMYQCDKY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
:.::::::: . .::::: :: :::.: :::::: .::.::::::::::..::::::.:
CCDS46 VKVFYKFSNSDRHKIRHTEKKTCKCKECGKSFCMLSQLTRHKRIHIRENSHKCEECGKAF
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
: :.::::. ::::::::::.:::::..:: :: ::.::: ::::.::::::.:::::
CCDS46 NQSSALTRHKMTHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTQHKVIHTREKPYKCEECGKAFNRSS
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTT---HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSST
:.: :::::. :::.. .:: .::. :: ::: :: :::::::::::::::::::::.
CCDS46 HITQHKRIHNREKPFKYDECCKAFKWSSALTTLTQHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSA
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 LTTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKH
:: ::.::.::::..:::::::: : :.::.:::::: :: ::::::::.:: :: ::::
CCDS46 LTRHKMIHTGEKPFQCEECGKAFNRSSHLTQHKIIHTKEKPYKCEECGKAFNRSSHLTKH
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 KRIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTA---HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHK
::::: :: :::.. :::: :: ::. ::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS46 KRIHTREKAYKCDEYCKAFNWSSALTTLTQHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSYLIRHK
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 VIHSGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHT
.::.:::::::::::::::: :.::.::: : :. :: :: :::..:: :..::.:::
CCDS46 IIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTQHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLSQHKIIHT
460 470 480 490 500 510
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pF1KB7 GEKPYNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
:::::.::: :: ::. : :
CCDS46 GEKPYKCEECGKPFNRFSYLTVHKRIHAGENPNKYEECGKACNHSSNLTKHNS
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CCDS54 KPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYK
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CCDS54 CEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
520 530
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CCDS32 RNVMLENYRNLAFL-GIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPE
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pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
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CCDS32 QGMEDSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCD
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pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
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CCDS32 KYLKVFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGK
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CCDS32 TFNWSSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNR
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pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
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CCDS32 SSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTL
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CCDS32 TRHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHK
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CCDS32 YKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCE
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CCDS32 EQPYKWEKFGKAFNRSSHLTTDKITHWREILQV
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570 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]