Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7852
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7852, 614 aa
1>>>pF1KB7852 614 - 614 aa - 614 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0049+/-0.000931; mu= 15.6411+/- 0.056
mean_var=78.6062+/-15.418, 0's: 0 Z-trim(106.8): 52 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.144659
statistics sampled from 9169 (9221) to 9169 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS82238.1 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 ( 614) 4300 907.3 0
CCDS11839.2 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 ( 623) 3428 725.3 5.8e-209
CCDS34538.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 ( 755) 2188 466.5 5.4e-131
CCDS34537.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 ( 780) 2188 466.5 5.6e-131
CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 772) 1916 409.8 6.8e-114
CCDS46602.2 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 840) 1916 409.8 7.3e-114
CCDS14011.1 L3MBTL2 gene_id:83746|Hs108|chr22 ( 705) 674 150.6 6.7e-36
CCDS11581.2 MBTD1 gene_id:54799|Hs108|chr17 ( 628) 641 143.6 7.2e-34
CCDS14185.1 SCML2 gene_id:10389|Hs108|chrX ( 700) 636 142.6 1.6e-33
CCDS53304.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 648) 580 130.9 5e-30
CCDS30688.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 660) 580 130.9 5.1e-30
CCDS461.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 591) 519 118.2 3.2e-26
CCDS53301.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 577) 489 111.9 2.4e-24
CCDS53302.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 599) 489 111.9 2.4e-24
CCDS31138.1 SFMBT2 gene_id:57713|Hs108|chr10 ( 894) 439 101.6 4.8e-21
CCDS2867.1 SFMBT1 gene_id:51460|Hs108|chr3 ( 866) 326 78.0 5.9e-14
>>CCDS82238.1 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 (614 aa)
initn: 4300 init1: 4300 opt: 4300 Z-score: 4848.7 bits: 907.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4300; 100.0% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (1-614:1-614)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRLEQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKE
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CCDS82 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRLEQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NRSPNGPMSKEFQVGMKLEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NRSPNGPMSKEFQVGMKLEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 REYSVEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 REYSVEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 EFVQSLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EFVQSLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQE
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB7 LPEEDIASGQEVRG
::::::::::::::
CCDS82 LPEEDIASGQEVRG
610
>>CCDS11839.2 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 (623 aa)
initn: 4286 init1: 3428 opt: 3428 Z-score: 3865.1 bits: 725.3 E(32554): 5.8e-209
Smith-Waterman score: 4272; 98.6% identity (98.6% similar) in 623 aa overlap (1-614:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRLEQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRLEQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NRSPNGPMSKEFQVGMKLEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NRSPNGPMSKEFQVGMKLEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB7 R---------EYSVEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQV
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVLVLHPRGLEYSVEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 ARWTVDEVAEFVQSLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ARWTVDEVAEFVQSLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNS
550 560 570 580 590 600
600 610
pF1KB7 ILMFRHSQELPEEDIASGQEVRG
:::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILMFRHSQELPEEDIASGQEVRG
610 620
>>CCDS34538.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 (755 aa)
initn: 2182 init1: 1101 opt: 2188 Z-score: 2465.2 bits: 466.5 E(32554): 5.4e-131
Smith-Waterman score: 2189; 52.2% identity (76.5% similar) in 626 aa overlap (2-600:148-749)
10 20
pF1KB7 MKQPNRKRKLNM--DSKERLD-----QDGRL
:.:. . : . :..:: : :: :.
CCDS34 CARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADTKEDGEERDDEMENKQDVRI
120 130 140 150 160 170
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 ---EQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHE
: ..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..
CCDS34 LRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNK
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 NGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGW
:::..::.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . :::::::
CCDS34 NGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGW
240 250 260 270 280 290
150 160 170 180 190
pF1KB7 CEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMK
:::: :.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.::::
CCDS34 CEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMK
300 310 320 330 340 350
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 LEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTL
:::::.::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. :::
CCDS34 LEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTL
360 370 380 390 400 410
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 IAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVAT
:.: :::: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::
CCDS34 ITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVAT
420 430 440 450 460 470
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQA
..:.::.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: ..
CCDS34 VADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHG
480 490 500 510 520 530
380 390 400 410 420
pF1KB7 VCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLR-------------EQ
: ::::.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . ::: ..
CCDS34 GCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKR
540 550 560 570 580 590
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFREYS
:.:: :.: . ... ... . . :...:. : ..: .: .. : .
CCDS34 TDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFE-ERTESEMRTSHEA-----RGARE--------EPT
600 610 620 630
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVAEFVQ
:.:::. ...: .: : : ::: ::. :::: :: : ::.:..:..:::.::.:
CCDS34 VQQAQR--RSAVFLSFKSPIPC--LPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQ
640 650 660 670 680 690
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQELPEE
:: :::::.: :: :::::.::::.:::::::.:.:::::::::.::::::. ...
CCDS34 SLPGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHN
700 710 720 730 740 750
610
pF1KB7 DIASGQEVRG
CCDS34 EL
>>CCDS34537.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 (780 aa)
initn: 2182 init1: 1101 opt: 2188 Z-score: 2464.9 bits: 466.5 E(32554): 5.6e-131
Smith-Waterman score: 2189; 52.2% identity (76.5% similar) in 626 aa overlap (2-600:173-774)
10 20
pF1KB7 MKQPNRKRKLNM--DSKERLD-----QDGRL
:.:. . : . :..:: : :: :.
CCDS34 CARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADTKEDGEERDDEMENKQDVRI
150 160 170 180 190 200
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 ---EQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHE
: ..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..
CCDS34 LRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNK
210 220 230 240 250 260
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 NGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGW
:::..::.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . :::::::
CCDS34 NGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGW
270 280 290 300 310 320
150 160 170 180 190
pF1KB7 CEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMK
:::: :.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.::::
CCDS34 CEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMK
330 340 350 360 370
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 LEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTL
:::::.::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. :::
CCDS34 LEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTL
380 390 400 410 420 430
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 IAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVAT
:.: :::: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::
CCDS34 ITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVAT
440 450 460 470 480 490
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQA
..:.::.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: ..
CCDS34 VADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHG
500 510 520 530 540 550
380 390 400 410 420
pF1KB7 VCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLR-------------EQ
: ::::.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . ::: ..
CCDS34 GCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKR
560 570 580 590 600 610
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFREYS
:.:: :.: . ... ... . . :...:. : ..: .: .. : .
CCDS34 TDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFE-ERTESEMRTSHEA-----RGARE--------EPT
620 630 640 650 660
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVAEFVQ
:.:::. ...: .: : : ::: ::. :::: :: : ::.:..:..:::.::.:
CCDS34 VQQAQR--RSAVFLSFKSPIPC--LPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQ
670 680 690 700 710
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQELPEE
:: :::::.: :: :::::.::::.:::::::.:.:::::::::.::::::. ...
CCDS34 SLPGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHN
720 730 740 750 760 770
610
pF1KB7 DIASGQEVRG
CCDS34 EL
780
>>CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 (772 aa)
initn: 1915 init1: 937 opt: 1916 Z-score: 2158.2 bits: 409.8 E(32554): 6.8e-114
Smith-Waterman score: 1935; 49.4% identity (70.9% similar) in 591 aa overlap (1-559:148-708)
10 20 30
pF1KB7 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRLEQAEEE
::. :::. .. .:. .. .:. ::
CCDS13 NDGCPQLFQERSVIVENSSGSTSASELLKPMKK--RKRREYQSPSEEESEPEAMEKQEEG
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80
pF1KB7 KKPKD---STTPLSHVPSAA--AQGA----WSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHE
: :. ..:: :. :.. : : :::: ::.::::..::: ::. .:. ...
CCDS13 KDPEGQPTASTPESEEWSSSQPATGEKKECWSWESYLEEQKAITAPVSLFQDSQAVTHNK
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:::..::.::::::.:::.. .:.:::::::::::::::: :.:::.::.::::::.::
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pF1KB7 CEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRSPNGPMSKEFQVGMKLEAV
::: :.:. ::::....: : .::.. . : :::.:: ..: ..: ::::::::::
CCDS13 FEKTGHKLQPPKGYKEEEFSWSQYLRSTRAQAAPKHLFVSQS-HSPPPLGFQVGMKLEAV
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210 220 230 240 250 260
pF1KB7 DRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQ
:: ::::::::...:.:..:.:::::::::.:::::: .:::..::::::..:. : ::
CCDS13 DRMNPSLVCVASVTDVVDSRFLVHFDNWDDTYDYWCDPSSPYIHPVGWCQKQGKPLTPPQ
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270 280 290 300 310 320
pF1KB7 GYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDV
::.:.:: : .::: : ..:::. .::.: ::.:: :::::.::.::: :::::.. ::
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330 340 350 360
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.:.:.:.:::::.: ::.:..:: ::::: :::. :::::. : .
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370 380 390 400 410
pF1KB7 -LKILPGQAV---------CPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKK-EATLH
. :: . :::::: : ::. : ....:: ::: .. : .. .: :
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pF1KB7 DRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDN
: . :: . : ..: . .: ... : : :: .::
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pF1KB7 LFREYSVEQAQQVLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDE
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540 550 560 570 580 590
pF1KB7 VAEFVQSLLGCEEHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHS
: :::.: :::..:. :: :
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10 20 30
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pF1KB7 KKPKD---STTPLSHVPSAA--AQGA----WSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHE
: :. ..:: :. :.. : : :::: ::.::::..::: ::. .:. ...
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pF1KB7 CEKTKHELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRSPNGPMSKEFQVGMKLEAV
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CCDS46 FEKTGHKLQPPKGYKEEEFSWSQYLRSTRAQAAPKHLFVSQS-HSPPPLGFQVGMKLEAV
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pF1KB7 DRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQ
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CCDS46 DRMNPSLVCVASVTDVVDSRFLVHFDNWDDTYDYWCDPSSPYIHPVGWCQKQGKPLTPPQ
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370 380 390 400 410
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. :: . :::::: : ::. : ....:: ::: .. : .. .: :
CCDS46 SYRSLPHTRTSKYSFHHRKCPTPGCDGSGHVTG-KFTAHHCLSGCPLAERNQSRLKAELS
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CCDS46 VFGFVQTLTGCEDQARLFKDEARIVRVTHVSGKTLVWTVAQLGDLVCSDHLQEGKGILET
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CCDS14 FHIKMVESMKYP-----FRQGMRLEVVDKSQVSRTRMAVVDTVIGGRLRLLYEDGDSDDD
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:: . :: :::::: ... : ... . :.. .. .. . .: ::..
CCDS14 FWCHMWSPLIHPVGWSRRVGHGIKMSE--RRSDMAHHPTFRKIYCDAVPY-LFKKVRAVY
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. :. ::::::.: : . .::::. .. : :.. :. :. :..: ..:
CCDS14 TEGGWFEEGMKLEAIDPLNLGNICVATVCKVLLDGYLMICVDGGPSTDGLDWFCYHASSH
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pF1KB7 YVQPVGWCQENGRTLIAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLP-HGFLPNMK
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CCDS14 AIFPATFCQKNDIELTPPKGY-EAQTFNWENYLEKTKSKAAPSRLFNMDCPNHGFKVGMK
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CCDS14 LEAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDSEYDQWVDCESPDIYPVGWCELTGYQL
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. :
CCDS14 QPPVAAEPATPLKAKEATKKKKKQFGKKRKRIPPTKTRPLRQGSKKPLLEDDPQGARKIS
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CCDS11 AKTLPPD-FSQKVS-ESMQYPFKPCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYEESE
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CCDS11 DRTDDFWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFK-----RSDITKKQD-----GHFDTPPHLFAK
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. .. :. ::::::.: : : .::::: .. : :.. .:. . :. :..:
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CCDS11 HATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLP--FKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHG
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pF1KB7 FLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCD
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CCDS11 FRVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQ
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pF1KB7 VTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEA
.::. :. :
CCDS11 LTGYQLQPPASQSSRENQSASSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGA
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CCDS14 MGQTVNEDSMDVKKENQEKTPQSST-SSVQRDDFHWEEYLKE
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pF1KB7 QKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDG
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CCDS14 TGSISAPSECFRQSQIPP--VNDFKVGMKLEARDPRNATSVCIATVIGITGARLRLRLDG
50 60 70 80 90
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pF1KB7 YLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKHELHIPKGYRKDKFVW-MDYLKACK-LQNAPKKL
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CCDS14 SDNRNDFWRLVDSPDIQPVGTCEKEGDLLQPPLGYQMNTSSWPMFLLKTLNGSEMASATL
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pF1KB7 FRNRSPNGPMSKEFQVGMKLEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCD
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CCDS14 FKKEPPKPPLNN-FKVGMKLEAIDKKNPYLICPATIGDVKGDEVHITFDGWSGAFDYWCK
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pF1KB7 VNSPYVQPVGWCQENGRTLIAP-QGYPNPENFSWTEYL--EATQTNAVPAKVFKMRLPHG
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CCDS14 YDSRDIFPAGWCRLTGDVLQPPGTSVPIVKNIAKTESSPSEASQHSMQSPQKTTLILPTQ
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 FLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCD
CCDS14 QVRRSSRIKPPGPTAVPKRSSSVKNITPRKKGPNSGKKEKPLPVICSTSAASLKSLTRDR
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CCDS53 IDWSDVRKHKYGHLSESASQYQEAADILDLGHFTWDKYLKETCSVPAPVHCFK--QSYTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 HENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPV
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CCDS53 PSNEFKISMKLEAQDPRNTTSTCIATVVGLTGARLRLRLDGSDNKNDFWRLVDSAEIQPI
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pF1KB7 GWCEKTKHELHIPKGYRKDKFVW-MDYLKACK-LQNAPKKLFRNRSPNGPMSKEFQVGMK
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CCDS53 GNCEKNGGMLQPPLGFRLNASSWPMFLLKTLNGAEMAPIRIF-HKEPPSPSHNFFKMGMK
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pF1KB7 LEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWC-------
::::::::: ..: :::... ...:: ::.: ..:::: .: . :::::
CCDS53 LEAVDRKNPHFICPATIGEVRGSEVLVTFDGWRGAFDYWCRFDSRDIFPVGWCSLTGDNL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 QENGRTLIAPQG-YP-------NPENFSWTEYL---EATQTNAVPAKVFKMRLPHGFL--
: : .. :.. :: .: : :. . . : . :.: . : :. ..
CCDS53 QPPGTKVVIPKNPYPASDVNTEKPSIHSSTKTVLEHQPGQRGRKPGKK-RGRTPKTLISH
250 260 270 280 290 300
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pF1KB7 ----PNMKLEVVD---KRNPR---LIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPD
:. : . ::.:. . :... . : . : :.
CCDS53 PISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS
310 320 330 340 350 360
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pF1KB7 --IHPIGWC------DVTGHPLE---VPQRTNDL-----KILPGQAVCPTPGC----RGI
.. : :: :. : : . . ... ::: : . .
CCDS53 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
370 380 390 400 410 420
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pF1KB7 GHIRGPRYSGH--HSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLR--EQTQANLESDSSHSKSK----
. ..:. ..: .:: .. :: :. ::.::. ...
CCDS53 FSFLKQGHGGEVISAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQT
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 --SLCSLNFNGKHEKVNSQPRLV---QQAKCLKIKGKEDIDLDNLFREYSVEQAQQVLHQ
:: ..... .:.. .: . :. :. .. . .: :. : .. : .
CCDS53 HLSLTAIEYSHSHDRYLPGETFVLGNSLARSLEPHSDSMDSASNPTNLVSTSQRHRPLLS
490 500 510 520 530 540
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: .. .: : : : ... . . . . . . . :::..: .::. ::
CCDS53 SCGLPPSTASAVRRLCSRGSDRYLESRDA-SRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQLG--
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pF1KB7 EHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQELPEEDIASGQ
:: :.:..:::::.::: . ..: : .:::
CCDS53 PHADLFRKHEIDGKALLLLRSDMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
600 610 620 630 640
pF1KB7 EVRG
614 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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