FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7849, 545 aa
1>>>pF1KB7849 545 - 545 aa - 545 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3226+/-0.000801; mu= 10.9342+/- 0.050
mean_var=347.6892+/-66.421, 0's: 0 Z-trim(112.4): 2062 B-trim: 79 in 1/53
Lambda= 0.068783
statistics sampled from 19041 (21366) to 19041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 9.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 3960 408.3 3.1e-113
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 2682 281.2 3.8e-75
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 2682 281.2 3.8e-75
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1618 176.0 3.1e-43
XP_011525946 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
XP_006722684 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
XP_016881644 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
XP_006722685 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
XP_006722683 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
XP_006722686 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
XP_016881643 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1608 175.0 6.1e-43
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1554 169.5 2.3e-41
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1554 169.5 2.3e-41
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1524 166.7 1.9e-40
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1524 166.7 1.9e-40
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1524 166.7 2e-40
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1524 166.7 2e-40
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1524 166.7 2e-40
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1524 166.7 2e-40
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1524 166.7 2e-40
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1524 166.7 2e-40
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1524 166.7 2e-40
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1524 166.7 2e-40
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1519 166.1 2.5e-40
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1519 166.1 2.5e-40
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1519 166.1 2.5e-40
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1519 166.1 2.5e-40
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1519 166.2 2.8e-40
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1519 166.2 2.9e-40
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1519 166.2 2.9e-40
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1519 166.2 2.9e-40
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1519 166.2 2.9e-40
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40
NP_003399 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ho ( 630) 1482 162.5 3.5e-39
NP_001269447 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 631) 1482 162.5 3.5e-39
NP_001269444 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 645) 1482 162.5 3.6e-39
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1476 161.9 5.1e-39
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1476 161.9 5.1e-39
XP_016881649 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
NP_006622 (OMIM: 604751) zinc finger protein 266 [ ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
NP_001258243 (OMIM: 604751) zinc finger protein 26 ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
XP_011525950 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
XP_016881650 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
XP_016881654 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
XP_011525949 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
XP_006722690 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39
>>NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [Homo (545 aa)
initn: 3960 init1: 3960 opt: 3960 Z-score: 2153.9 bits: 408.3 E(85289): 3.1e-113
Smith-Waterman score: 3960; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDCVIFEEVAVNFTPEEWALLDHAQRSLYRDVMLETCRNLASLDCYIYVRTSGSSSQRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MDCVIFEEVAVNFTPEEWALLDHAQRSLYRDVMLETCRNLASLDCYIYVRTSGSSSQRDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FGNGISNDEEIVKFTGSDSWSIFGENWRFDNTGDQHQIPQRHLRSQLGRLCESNEGHQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FGNGISNDEEIVKFTGSDSWSIFGENWRFDNTGDQHQIPQRHLRSQLGRLCESNEGHQCG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ETLSQTANLLVHKSYPTEAKPSECTKCGKAFENRQRSHTGQRPCKECGQACSCLSCQSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ETLSQTANLLVHKSYPTEAKPSECTKCGKAFENRQRSHTGQRPCKECGQACSCLSCQSPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKKSYECQKCGKAFICPSSFRGHVNSHHGQKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKKSYECQKCGKAFICPSSFRGHVNSHHGQKTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYECKECGKAFSCPSYFREHVRTHTGEKPYECKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYECKECGKAFSCPSYFREHVRTHTGEKPYECKH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCGKAFTCYSSLREHGRTHSGEKPYECKECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 CGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCGKAFTCYSSLREHGRTHSGEKPYECKECGKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFGCPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKECGKAYSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFGCPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKECGKAYSFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSSLREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 SSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSSLREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 KHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVHVRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 KHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVHVRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVR
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 THAGA
:::::
NP_067 THAGA
>>XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger pro (365 aa)
initn: 2682 init1: 2682 opt: 2682 Z-score: 1470.1 bits: 281.2 E(85289): 3.8e-75
Smith-Waterman score: 2682; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (181-545:1-365)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FENRQRSHTGQRPCKECGQACSCLSCQSPPMKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKK
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 SYECQKCGKAFICPSSFRGHVNSHHGQKTHACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SYECQKCGKAFICPSSFRGHVNSHHGQKTHACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYEC
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KECGKAFSCPSYFREHVRTHTGEKPYECKHCGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KECGKAFSCPSYFREHVRTHTGEKPYECKHCGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCG
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KAFTCYSSLREHGRTHSGEKPYECKECGKAFRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAFTCYSSLREHGRTHSGEKPYECKECGKAFRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFG
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 CPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKECGKAYSFSSSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKECGKAYSFSSSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSS
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 LREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQKHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQKHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVH
280 290 300 310 320 330
520 530 540
pF1KB7 VRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVRTHAGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVRTHAGA
340 350 360
>>XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger pro (365 aa)
initn: 2682 init1: 2682 opt: 2682 Z-score: 1470.1 bits: 281.2 E(85289): 3.8e-75
Smith-Waterman score: 2682; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (181-545:1-365)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FENRQRSHTGQRPCKECGQACSCLSCQSPPMKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKK
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 SYECQKCGKAFICPSSFRGHVNSHHGQKTHACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SYECQKCGKAFICPSSFRGHVNSHHGQKTHACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYEC
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KECGKAFSCPSYFREHVRTHTGEKPYECKHCGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KECGKAFSCPSYFREHVRTHTGEKPYECKHCGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCG
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KAFTCYSSLREHGRTHSGEKPYECKECGKAFRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAFTCYSSLREHGRTHSGEKPYECKECGKAFRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFG
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 CPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKECGKAYSFSSSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKECGKAYSFSSSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSS
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 LREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQKHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQKHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVH
280 290 300 310 320 330
520 530 540
pF1KB7 VRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVRTHAGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVRTHAGA
340 350 360
>>NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [Homo (642 aa)
initn: 10058 init1: 1535 opt: 1618 Z-score: 897.3 bits: 176.0 E(85289): 3.1e-43
Smith-Waterman score: 1900; 51.3% identity (69.2% similar) in 558 aa overlap (1-544:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDCVIFEEVAVNFTPEEWALLDHAQRSLYRDVMLETCRNLASLDCYIYVRTSGSSSQRDV
:: : ::.:::::: ::::::: .:..::.::: :: .::. :
NP_066 MDSVSFEDVAVNFTLEEWALLDSSQKKLYEDVMQETFKNLVCL-----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 FGNGISNDEEIVKFTGSDSWSIFGENWRFDNTGDQHQIPQRHLRSQL-GRLCESNEGHQC
:..:. .. :.:. .. : .. ::::: .: .:
NP_066 -----------------------GKKWEDQDIEDDHRNQGKNRRCHMVERLCESRRGSKC
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GETLSQTANLLVHKSYPTEAKPSECTKCGKAF-----ENRQ-RSHTGQRPCKECGQACSC
::: :: :. ..: : ::: ::. ::. : ::. ::::::.: .
NP_066 GETTSQMPNVNINKETFTGAKPHECSFCGRDFIHHSSLNRHMRSHTGQKPNEY-------
90 100 110 120 130
180 190 200 210 220
pF1KB7 LSCQSPPMKTQTVEK-PCNCQD-SRTASVTYV-----KSLSSKKSYECQKCGKAFICPSS
: :: ::.:. ..: : . .. .. : :::..:::::: .
NP_066 ----------QEYEKQPCKCKAVGKTFSYHHCFRKHERTHTGVKPYECKQCGKAFIYYQP
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FRGHVNSHHGQKTHACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYECKECGKAFSCPSYFREH
:. : .: ::: . :: :::::.::. . .:. :::.::::::.::::: : . :..:
NP_066 FQRHERTHAGQKPYECKQCGKTFIYYQSFQKHA--HTGKKPYECKQCGKAFICYQSFQRH
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 VRTHTGEKPYECKHCGKSFSCYSSFRDHVRTHTGEKPCQCKHCGKAFTCYSSLREHGRTH
::::::::::::.:::.::: . :: : :::::::: .::.:::::. ::.:.: :::
NP_066 KRTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYFRTHERTHTGEKPYKCKECGKAFSFLSSFRRHKRTH
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SGEKPYECKECGKAFRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFGCPTYFRRHVKTHSGVK
::::::::::::::: : .:.:::. .::: .:: ::.:::::. . : : .:: : :
NP_066 SGEKPYECKECGKAFFYSASFRAHVIIHTGARPYKCKECGKAFNSSNSCRVHERTHIGEK
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 PYQCKECGKAYSFSSSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSSLREHVRTHSGEKPYEC
::.::.:::..:.: :::.: ::::::::.:::.: :.:: :::::: ::.:::::::
NP_066 PYECKRCGKSFSWSISLRLHERTHTGEKPYECKQCHKTFSFSSSLREHETTHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 NQCGKAFSHAQYFQKHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVHVRTHTGERPYECKQCG
.::::.:: .. .:.: :.:.. ::::: .::::. ::: .:.: :.::::.::::::::
NP_066 KQCGKTFSFSSSLQRHERTHNAEKPYECKQCGKAFRCSSYFRIHERSHTGEKPYECKQCG
430 440 450 460 470 480
530 540
pF1KB7 KTFRYLASLQAHVRTHAGA
:.: .:.. : :::.:
NP_066 KVFIRSSSFRLHERTHTGEKPYECKLCGKTFSFSSSLREHEKIHTGNKPFECKQCGKAFL
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>--
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