Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7844
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7844, 587 aa
1>>>pF1KB7844 587 - 587 aa - 587 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5719+/-0.00103; mu= 8.2599+/- 0.061
mean_var=127.9502+/-25.518, 0's: 0 Z-trim(107.9): 32 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.113385
statistics sampled from 9873 (9896) to 9873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 ( 587) 4001 666.2 3.2e-191
CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 ( 619) 2178 368.0 2e-101
CCDS31609.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 ( 551) 1327 228.8 1.4e-59
CCDS73322.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 ( 448) 1320 227.6 2.7e-59
CCDS44651.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 ( 548) 1305 225.2 1.7e-58
CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 ( 579) 975 171.2 3.3e-42
CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 899) 523 97.3 8.6e-20
CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 900) 523 97.3 8.6e-20
CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 ( 968) 362 71.0 7.8e-12
CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 ( 969) 360 70.7 9.7e-12
>>CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 (587 aa)
initn: 4001 init1: 4001 opt: 4001 Z-score: 3546.4 bits: 666.2 E(32554): 3.2e-191
Smith-Waterman score: 4001; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AIVFKTPPYCKAITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AIVFKTPPYCKAITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QKLCQDHVNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPTGVSSQAESYYPSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QKLCQDHVNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPTGVSSQAESYYPSPG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTPRSGNTNPLSSFSTRTLPSNSQGIPPFLRIPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTPRSGNTNPLSSFSTRTLPSNSQGIPPFLRIPVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 NDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSADLYGISDPNMLSNCSVNMMTTSSDSMGETDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSADLYGISDPNMLSNCSVNMMTTSSDSMGETDNP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RLLSMNLENPSCNSVLDPRDLRQLHQMSSSSMSAGANSNTTVFVSQSDAFEGSDFSCADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RLLSMNLENPSCNSVLDPRDLRQLHQMSSSSMSAGANSNTTVFVSQSDAFEGSDFSCADN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB7 SMINESGPSNSTNPNSHGFVQDSQYSGIGSMQNEQLSDSFPYEFFQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SMINESGPSNSTNPNSHGFVQDSQYSGIGSMQNEQLSDSFPYEFFQV
550 560 570 580
>>CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 (619 aa)
initn: 2120 init1: 2120 opt: 2178 Z-score: 1934.4 bits: 368.0 E(32554): 2e-101
Smith-Waterman score: 3927; 94.8% identity (94.8% similar) in 619 aa overlap (1-587:1-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AIVFKTPPYCKAITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AIVFKTPPYCKAITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 QKLCQDHV--------------------------------NFPERPRPGLLGSIGEGRYF
:::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS18 QKLCQDHVETGFRHVDQDGLELLTSGDPPTLASQSAGITVNFPERPRPGLLGSIGEGRYF
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 KKEPNLFSHDAVVREMPTGVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KKEPNLFSHDAVVREMPTGVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTP
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 RSGNTNPLSSFSTRTLPSNSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RSGNTNPLSSFSTRTLPSNSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSA
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 DLYGISDPNMLSNCSVNMMTTSSDSMGETDNPRLLSMNLENPSCNSVLDPRDLRQLHQMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DLYGISDPNMLSNCSVNMMTTSSDSMGETDNPRLLSMNLENPSCNSVLDPRDLRQLHQMS
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 SSSMSAGANSNTTVFVSQSDAFEGSDFSCADNSMINESGPSNSTNPNSHGFVQDSQYSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SSSMSAGANSNTTVFVSQSDAFEGSDFSCADNSMINESGPSNSTNPNSHGFVQDSQYSGI
550 560 570 580 590 600
570 580
pF1KB7 GSMQNEQLSDSFPYEFFQV
:::::::::::::::::::
CCDS18 GSMQNEQLSDSFPYEFFQV
610
>>CCDS31609.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 (551 aa)
initn: 1095 init1: 613 opt: 1327 Z-score: 1182.9 bits: 228.8 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 1327; 46.9% identity (70.7% similar) in 461 aa overlap (5-461:16-465)
10 20 30 40
pF1KB7 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPS
: .::.::::::.:::::::::::::::::::::.:::...:.:.
CCDS31 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRC
:.: .: : : :::.::::. :..::::.:::::::::.::::. .: ::::::.:
CCDS31 IKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VKKKEVKEAIITRIKAGINPFNVP-EKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALP
:::.....:: ::... :::.:: :.: .: :::.::::::: . : : ::
CCDS31 VKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDY---DLNAVRLCFQVTVRDPSGR-PLRLP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 PVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAK
::.:.::.::::::::::.:::::.: :: ::::::::::::::.:::: :. :::.
CCDS31 PVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEAR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCK-AITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTY
: ::::::::::::::.:::: .. :: :.::::::::.:.:: :.:.:::: : .
CCDS31 GSFSQADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 GNKAKKQKTTLLFQKLCQDH-VNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPT
. :...: :... . . : ::: .: . :. . . .
CCDS31 RIEEKRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQP---YPFTS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTPRSGNTNPLSSFSTRTLPS
..:. . .:. :. .:. ...:: : . .. :.: . .. :.. . .:
CCDS31 SLSTINYDEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAPAPAPAMVSALAQ-APAPVPV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 NSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSADLYGIS-DPNMLSNCSVN
. : : . :. . .:... . .. .. .. .. . : : : :: ....
CCDS31 LAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTL---SEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASV
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 MMTTSSDSMGETDNPRLLSMNLENPSCNSVLDPRDLRQLHQMSSSSMSAGANSNTTVFVS
CCDS31 DNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLS
470 480 490 500 510 520
>>CCDS73322.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 (448 aa)
initn: 1095 init1: 613 opt: 1320 Z-score: 1178.1 bits: 227.6 E(32554): 2.7e-59
Smith-Waterman score: 1320; 50.6% identity (72.4% similar) in 413 aa overlap (5-412:16-421)
10 20 30 40
pF1KB7 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPS
: .::.::::::.:::::::::::::::::::::.:::...:.:.
CCDS73 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRC
:.: .: : : :::.::::. :..::::.:::::::::.::::. .: ::::::.:
CCDS73 IKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VKKKEVKEAIITRIKAGINPFNVP-EKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALP
:::.....:: ::... :::.:: :.: .: :::.::::::: . : : ::
CCDS73 VKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDY---DLNAVRLCFQVTVRDPSGR-PLRLP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 PVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAK
::.:.::.::::::::::.:::::.: :: ::::::::::::::.:::: :. :::.
CCDS73 PVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEAR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCK-AITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTY
: ::::::::::::::.:::: .. :: :.::::::::.:.:: :.:.:::: : .
CCDS73 GSFSQADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 GNKAKKQKTTLLFQKLCQDH-VNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPT
. :...: :... . . : ::: .: . :. . . .
CCDS73 RIEEKRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQP---YPFTS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTPRSGNTNPLSSFSTRTLPS
..:. . .:. :. .:. ...:: : . .. :.: . .. :.. :.
CCDS73 SLSTINYDEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAPAPAPAMVSALAQRPPDPAPA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 --NSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSADLYGISDPNMLSNCSV
.. :.:
CCDS73 PLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSQISS
420 430 440
>>CCDS44651.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 (548 aa)
initn: 1083 init1: 601 opt: 1305 Z-score: 1163.5 bits: 225.2 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1310; 46.5% identity (70.4% similar) in 460 aa overlap (5-461:16-462)
10 20 30 40
pF1KB7 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPS
: .::.::::::.:::::::::::::::::::::.:::...:.:.
CCDS44 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRC
:.: .: : : :::.::::. :..::::.:::::::::.::::. .: ::::::.:
CCDS44 IKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VKKKEVKEAIITRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPP
:::.....:: ::... :::. :.: .: :::.::::::: . : : :::
CCDS44 VKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQ--EEQRGDY---DLNAVRLCFQVTVRDPSGR-PLRLPP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 VVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKG
:.:.::.::::::::::.:::::.: :: ::::::::::::::.:::: :. :::.:
CCDS44 VLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 IFSQADVHRQVAIVFKTPPYCK-AITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYG
::::::::::::::.:::: .. :: :.::::::::.:.:: :.:.:::: : .
CCDS44 SFSQADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 NKAKKQKTTLLFQKLCQDH-VNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPTG
. :...: :... . . : ::: .: . :. . . ..
CCDS44 IEEKRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQP---YPFTSS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 VSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTPRSGNTNPLSSFSTRTLPSN
.:. . .:. :. .:. ...:: : . .. :.: . .. :.. . .:
CCDS44 LSTINYDEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAPAPAPAMVSALAQ-APAPVPVL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSADLYGIS-DPNMLSNCSVNM
. : : . :. . .:... . .. .. .. .. . : : : :: ....
CCDS44 APGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTL---SEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVD
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 MTTSSDSMGETDNPRLLSMNLENPSCNSVLDPRDLRQLHQMSSSSMSAGANSNTTVFVSQ
CCDS44 NSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSG
470 480 490 500 510 520
>>CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 (579 aa)
initn: 557 init1: 457 opt: 975 Z-score: 871.4 bits: 171.2 E(32554): 3.3e-42
Smith-Waterman score: 975; 50.3% identity (76.4% similar) in 292 aa overlap (8-295:125-413)
10 20 30
pF1KB7 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPG
:.. : :::.::::::::.::::::::: :
CCDS46 LGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEGRSAGSILG
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
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: ::. ..: :.:.. . : .:..: :: :. :.. :::.:::::: :: ....
CCDS46 ESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTDGICRVRLRP
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100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ERRPLF-FQNLGIRCVKKKEVKEAIITRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQV
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CCDS46 HVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQLGIDPYNAG--SLKNHQEVDMNVVRICFQA
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160 170 180 190 200 210
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:..:.. . ::.:.:.::... ::.::::::.::. : ::.:..::::::::.
CCDS46 SYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKE
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220 230 240 250 260 270
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:: : : .::... :::::::::.::::::::: :.:::::.. :.: .: ::
CCDS46 DISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSE
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. : ::: ..:.:: :...
CCDS46 PLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGS
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.:. .. .: :. . .:
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CCDS41 GPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKV
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CCDS41 MDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGD
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CCDS41 EVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVT
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CCDS41 VFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAA
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320 330 340 350 360 370
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CCDS41 GGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYS------PYQSGAGPMGCYPGGG----GGAQMAATVPSR
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CCDS41 DSGEEAAEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALL
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CCDS54 VTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQAEGGG
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CCDS54 DRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSKA
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:::: ::::::: : ::.:..: .:::: :: :.:: : : :. :: . :.:
CCDS54 VHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQ
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:
CCDS54 KLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITFHPGTT
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CCDS36 RPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTADGPYLQILEQPKQRGFRFRYVCEGPSHGG
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CCDS36 LPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGICTVTAG
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CCDS36 PKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQAEGGGDRQL
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CCDS36 NLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDVHRQ
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pF1KB7 VAIVFKTPPYCKA-ITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]