FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7837, 540 aa
1>>>pF1KB7837 540 - 540 aa - 540 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9057+/-0.00236; mu= 12.8257+/- 0.141
mean_var=340.6511+/-63.537, 0's: 0 Z-trim(104.0): 943 B-trim: 60 in 1/49
Lambda= 0.069490
statistics sampled from 6630 (7674) to 6630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1664 182.4 1.4e-45
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CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1605 176.4 8e-44
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CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1588 175.2 3.6e-43
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 ( 372) 1575 173.0 5.3e-43
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1577 173.7 6.1e-43
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CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 1567 172.9 1.4e-42
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CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1557 171.6 2.3e-42
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1557 171.6 2.4e-42
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1557 171.7 2.4e-42
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1557 171.7 2.4e-42
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1557 171.7 2.4e-42
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1556 171.5 2.4e-42
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1557 171.7 2.5e-42
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1556 171.6 2.6e-42
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1552 171.0 3.1e-42
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1549 170.7 3.9e-42
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1549 170.9 4.3e-42
>>CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 (540 aa)
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Smith-Waterman score: 3911; 100.0% identity (100.0% similar) in 540 aa overlap (1-540:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSVAFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMWETMRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDSVAFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMWETMRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 RNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKKIPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKKIPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNRH
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSVR
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHER
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKPFVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHTG
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370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGPYKCKVCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKPY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECKR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGKAYSCRASFQRHMLTHAEDGPPYKCMWESL
490 500 510 520 530 540
>>CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 (553 aa)
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Smith-Waterman score: 2436; 63.4% identity (78.9% similar) in 535 aa overlap (1-534:1-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSVAFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMWETMRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRG
::::: ::: :::: :::::::::::.:::::: ::.:::: .::::.::.:.: ::..:
CCDS42 MDSVASEDVAVNFTLEEWALLDPSQKKLYRDVMRETFRNLACVGKKWEDQSIEDWYKNQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 RNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKKIPG-VKLCESIVYGEVSMGQSSLNR
: ::.:: : : ..:. .: : :::. : ::.:::: :. :: . :.: : .:::.:
CCDS42 RILRNHMEEGLSESKEYDQCGEAFSQILNLNLNKKIPTIVRPCECSLCGKVFMHHSSLSR
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFS
::..: ::.: .:::::::: .:: : ::: .::: :: ::::: : : ::::.:.:
CCDS42 HIRSHLGHKPYDYQEYGEKPYKCKQCGKAFSSCQSFRRHERTHTGEKPYACPECGKAFIS
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pF1KB7 LKRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSV
: .:::.: :.: ::::. :::::: :: :. :::.::::::::::::.::: . :
CCDS42 LPSVRRHMIKHTGDGPYKCQECGKAFDRPSLFQIHERTHTGEKPYECQECAKAFISLPSF
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHE
.::::.:::::::::. ::: : : :..::: :::::: .:::::::: ... :
CCDS42 QRHMIRHTGDGPYKCQECGKAFDRPSLFRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFISFTNFQSHM
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pF1KB7 RTHTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKPFVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHT
:::. ::.:: ::.:: . .: ::: ::::::. :..:::.: :.:. . ::::::
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:::::::::::.:: .::.:::::::::.:::::.:::. : : :.:::::::::::
CCDS42 GEKPYECKECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGPYKCQVCGRAFDCPSSFQIHERTHTGEKP
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pF1KB7 YVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECK
: :. :::::.: :: : :::. ::.:. :::::. .: :::: ::::::.:::
CCDS42 YECQVCGKAFISLKRIRKHMILHTGDGPYKCQVCGKAFDCPSSVRTHERTHTGEKPYECK
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.::::: .::.:.:::::::.:::.::.:::..: .::::: .: : : :
CCDS42 ECGKAFNYASSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKTFSYSSSFQRHERAHNGDKPYVKNVGKL
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540
pF1KB7 L
CCDS42 SFITQPSNTCENE
550
>>CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 (641 aa)
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Smith-Waterman score: 2348; 61.8% identity (78.5% similar) in 536 aa overlap (1-535:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSVAFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMWETMRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRG
::::.:::: ::::::::::: ::::.:::::: ::. ::::::..:...::.:: :..:
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10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 RNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKK-IPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNR
:.:::::.::: . :.::: : .:: : . .:: . :: : : :. : .:::::
CCDS42 RKLRSHMVERLCERKEGSQFGETISQTPNPKPNKKTFTRVKPYECSVCGKDYMCHSSLNR
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFS
:...:. :. ::..:::: ..: : :: . ::: :: ::::: : ::.:::.:
CCDS42 HMRSHTEHRSYEYHKYGEKSYECKECGKRFSFRSSFRIHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LKRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSV
. .. : ::.: ::.:: ::::: : . :: : : :::::::.:.::::.:. .:
CCDS42 PSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFIYHTTFRGHMRMHTGEKPYKCKECGKTFSHPSSF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHE
: : :.:. ::.:: ::: :. ..::.::: ::::::..:::::::.:: ..: ::
CCDS42 RNHERTHSGEKPYECKQCGKAFRYYQTFQIHERTHTGEKPYQCKQCGKALSCPTSFRSHE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RTHTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKPFVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHT
: :::::::.::.::::::. :.: ::::::::::. ::.::::: : ... : ::
CCDS42 RIHTGEKPYKCKKCGKAFSFPSSFRKHERIHTGEKPYDCKECGKAFISLPSYRRHMIMHT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 GEKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGPYKCKVCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKP
:. ::.:::::.::.: :.. : :::: ::.:: ::: : : ::.::::::::::
CCDS42 GNGPYKCKECGKAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKP
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 YVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECK
. ::.::::: :.:.::::::::::::::::::::::: .::: :: :::::::.:::
CCDS42 HECKQCGKAFSCSSSVRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERIHTGEKPYECK
420 430 440 450 460 470
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pF1KB7 RCGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGKAYSCRASFQRHMLTHAEDGPPYKCMWES
.::::: :::::.:::::::.:::.::.::::.:: .::. : ::. . ::.:
CCDS42 QCGKAFSFSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGE-KPYECKQCG
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB7 L
CCDS42 KAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSVRMHERTHTGVKPYECKQCDKAFS
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 565 init1: 565 opt: 565 Z-score: 336.3 bits: 72.2 E(32554): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 565; 68.2% identity (86.0% similar) in 107 aa overlap (255-361:535-641)
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 ECQECGKAFTCITSVRRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQ
: ::: : ::...::: ::::::..:::
CCDS42 ECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQ
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pF1KB7 CGKAFSCSPTLRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKPFVCKQCGKA
:::::::: ..:.::::::: :::::::: :::: :.:.::: ::::::..:.:::::
CCDS42 CGKAFSCSSSVRMHERTHTGVKPYECKQCDKAFSCSRSFRIHERTHTGEKPYACQQCGKA
570 580 590 600 610 620
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CCDS42 FKCSRSFRIHERVHSGE
630 640
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10 20 30 40 50
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::: ::.::::: :.. .. : ::::::::: ::.::: :: .. :. :: .: :::.:
CCDS45 KPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYE
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CCDS45 CKGYGKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGE-KPYECKQ
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540
pF1KB7 ESL
CCDS45 CGKAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKS
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CCDS45 CGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKA
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CCDS45 YIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSS
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CCDS45 PGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSY
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240 250 260 270 280 290
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CCDS45 LRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHE
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CCDS45 RIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHT
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CCDS45 YECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECK
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CCDS45 ECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAE-KPYECKQCR
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540
pF1KB7 L
CCDS45 KAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFS
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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CCDS54 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
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CCDS54 VNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLS
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CCDS54 YRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSL
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pF1KB7 FRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSVRRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVH
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CCDS54 LRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRH
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:: ::::::.:::::::::: : .::.::: ::::::: :::::::: .: :.. : .:
CCDS54 ERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMH
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340 350 360 370 380 390
pF1KB7 TGEKPFVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHTGEKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEG
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pF1KB7 PYKCKVCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKPYVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYEC
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CCDS54 PHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKC
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pF1KB7 KQCGKAFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECKRCGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECG
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::.: . .. : ::. . ::.:
CCDS54 KAFSRFSYLKTHERTHTAE-KPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAF
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CCDS32 KNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNC
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pF1KB7 HIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFS
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CCDS32 YIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSS
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CCDS32 LGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSY
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CCDS32 LRHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHE
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CCDS32 RTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHT
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pF1KB7 ---------------------IHERTHTGEKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGP
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CCDS32 GNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGP
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pF1KB7 YKCKVCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKPYVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECK
.::::::: : : :. ::::::.:::: ::.::::. :.:.: :: ::::::::.::
CCDS32 HKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK
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pF1KB7 QCGKAFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECKRCGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGK
::: . ::..:. ::::::.:::.::::: . :.:::::.:::.:: : :
CCDS32 L-GKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRK
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pF1KB7 AYSCRASFQRHMLTHAEDGPPYKCMWESL
:.. ... : :. . ::.:
CCDS32 AFGHYDNLKVHERIHSGE-KPYECKECGKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFT
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>>CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 (643 aa)
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pF1KB7 MDSVAFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMWETMRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRG
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CCDS45 MASVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVGMKWKDQNIEDQYRYPR
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pF1KB7 RNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKK-IPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNR
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CCDS45 KNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPYESRMSGEVIMGHSSLNC
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pF1KB7 HIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFS
.:. .::.: ::.: ::::::..: : :: :.:..::: .:::.: :.::::::.: :
CCDS45 YIRVGAGHKPYEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSLQTHERLHTGKKPYNCKECGKSFSS
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pF1KB7 LKRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSV
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CCDS45 LGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSY
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 RRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHE
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CCDS45 LRHERTHTGEKLYECKQCSKAFPDYSSCLRHERTHTGKKPYTCKQCGKAFSASTSLRRHE
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CCDS45 TTHTDEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMVMHTRDGPHKCKICGKGFDCPSSLKSHERTHT
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