Result of FASTA (omim) for
pF1KB7830
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7830, 605 aa
1>>>pF1KB7830 605 - 605 aa - 605 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9412+/-0.000798; mu= 14.2426+/- 0.050
mean_var=344.6829+/-69.409, 0's: 0 Z-trim(112.9): 2039 B-trim: 98 in 1/52
Lambda= 0.069082
statistics sampled from 19718 (22019) to 19718 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 10.910
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016865280 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger ( 605) 4168 430.8 6.4e-120
NP_005640 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A ( 605) 4168 430.8 6.4e-120
NP_001311268 (OMIM: 602444) zinc finger protein 35 ( 563) 3891 403.2 1.3e-111
XP_011532947 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger ( 563) 3891 403.2 1.3e-111
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1958 210.6 1.3e-53
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1958 210.6 1.3e-53
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1951 209.9 2.2e-53
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1819 196.7 1.9e-49
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1796 194.4 9.5e-49
NP_115799 (OMIM: 615580) zinc finger protein 528 [ ( 628) 1780 192.8 2.9e-48
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1783 193.6 3e-48
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1783 193.6 3e-48
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 1783 193.6 3.1e-48
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1783 193.6 3.1e-48
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1783 193.6 3.1e-48
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1783 193.6 3.1e-48
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1783 193.6 3.2e-48
XP_016882851 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1767 191.5 7e-48
XP_016882852 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1767 191.5 7e-48
XP_016882853 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1767 191.5 7e-48
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1745 189.4 3.2e-47
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1739 188.8 4.9e-47
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1739 188.8 5e-47
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1739 188.8 5e-47
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1739 188.8 5e-47
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1739 188.8 5.1e-47
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1726 187.6 1.3e-46
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1726 187.6 1.3e-46
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1726 187.7 1.3e-46
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 1726 187.7 1.4e-46
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 1726 187.7 1.4e-46
NP_009069 (OMIM: 603973) zinc finger protein 90 [H ( 601) 1715 186.3 2.5e-46
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1700 185.0 8e-46
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1700 185.0 8e-46
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1700 185.0 8e-46
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1700 185.1 8.2e-46
>>XP_016865280 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger pro (605 aa)
initn: 4168 init1: 4168 opt: 4168 Z-score: 2273.9 bits: 430.8 E(85289): 6.4e-120
Smith-Waterman score: 4168; 100.0% identity (100.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIH
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 IEEDP
:::::
XP_016 IEEDP
>>NP_005640 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A isof (605 aa)
initn: 4168 init1: 4168 opt: 4168 Z-score: 2273.9 bits: 430.8 E(85289): 6.4e-120
Smith-Waterman score: 4168; 100.0% identity (100.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIH
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 IEEDP
:::::
NP_005 IEEDP
>>NP_001311268 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A i (563 aa)
initn: 3891 init1: 3891 opt: 3891 Z-score: 2125.0 bits: 403.2 E(85289): 1.3e-111
Smith-Waterman score: 3891; 100.0% identity (100.0% similar) in 563 aa overlap (43-605:1-563)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 WEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 EKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPPKCEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPPKCEIQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 GNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKECSKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKECSKAFS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 QSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSFSRRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSFSRRSG
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 LFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRYH
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 QRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIH
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGER
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 PYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFKC
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KB7 NTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIHIEEDP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIHIEEDP
520 530 540 550 560
>>XP_011532947 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger pro (563 aa)
initn: 3891 init1: 3891 opt: 3891 Z-score: 2125.0 bits: 403.2 E(85289): 1.3e-111
Smith-Waterman score: 3891; 100.0% identity (100.0% similar) in 563 aa overlap (43-605:1-563)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 WEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 EKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPPKCEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 ALIQHRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTN
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pF1KB7 HYKIHIEEDP
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pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLEN
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pF1KB7 SFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQI-VSATHKKIPTIERSHKN
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pF1KB7 TELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEK
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pF1KB7 TFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTL
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pF1KB7 STSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSL
. : .: :::: :: :.:.::::::: ::.. :.. :. :.: . . :: : :
XP_005 IAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHL
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pF1KB7 SGCQRIHSRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHE
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XP_005 TQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQ
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pF1KB7 RIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHT
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XP_005 RTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHT
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pF1KB7 GEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKP
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XP_005 GEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
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pF1KB7 YRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECN
:.:..:: .:.: . ::::.::::::::..:: ::..: ::: : :::::: :::: ::
XP_005 YECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCN
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pF1KB7 TCGKLFNHRSSLTNHYKIHIEEDP
::: :.: :::..: . : : :
XP_005 ECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGK
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pF1KB7 SLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
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pF1KB7 WEVE-KDGSGV-SSLGSKSSHKTT--KSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIY
: :: . .:: .: .. . : . :. ... : . ....: . : . :
NP_001 WAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDT---
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pF1KB7 EGRLEKKQDKKGSFQI-VSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPP
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NP_001 EGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNG-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPH
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pF1KB7 KCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKEC
.:. : . ..: : . .: :::. : :.: ..:.: .:...:.::. ..:.::
NP_001 TWGTRGKREKPDLNVL-QKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHEC
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pF1KB7 SKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSF
:.: .:::: .:: ::::::: : .::..:. . : .: :::: :: :.:.::::::
NP_001 LKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSF
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pF1KB7 SRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECGNTFKSSS
: ::.. :.. :. :.: . . :: : :. :::. .: : :.:::..:. ::
NP_001 SFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSS
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pF1KB7 SLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNR
:: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.: :::::::.:.::::.:.. . :..
NP_001 SLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTE
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pF1KB7 HRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRM
:: :::::: :.::::::..: :.: ::: :::::: .:. ::::::::. : ::::.
NP_001 HRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRI
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pF1KB7 HTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGE
::::.::.::.:::.: .:::..:::::::::::.:..:: .:.: . ::::.::::::
NP_001 HTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGE
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pF1KB7 KPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIHIEEDP
::..:: ::..: ::: : :::::: :::: :: ::: :.: :::..: . : : :
NP_001 KPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYE
510 520 530 540 550 560
NP_001 CHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]