FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7830, 605 aa
1>>>pF1KB7830 605 - 605 aa - 605 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8326+/-0.0017; mu= 8.4214+/- 0.102
mean_var=284.8630+/-57.757, 0's: 0 Z-trim(106.0): 978 B-trim: 45 in 1/52
Lambda= 0.075990
statistics sampled from 7668 (8745) to 7668 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 ( 605) 4168 471.7 1.2e-132
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CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1860 218.7 1.8e-56
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1852 217.8 3.2e-56
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1819 214.2 4e-55
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CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1780 210.0 7.8e-54
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1783 210.6 8.9e-54
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1783 210.7 9.1e-54
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1775 209.4 1.2e-53
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1739 205.5 1.8e-52
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1739 205.5 1.8e-52
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1729 204.4 3.9e-52
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1726 204.2 5.5e-52
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1726 204.2 5.5e-52
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1726 204.2 5.5e-52
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1720 203.3 7e-52
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1723 203.9 7e-52
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1723 203.9 7e-52
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1720 203.3 7.1e-52
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 1715 202.8 1.1e-51
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 1711 202.3 1.4e-51
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1705 202.0 3.2e-51
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CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1700 201.3 3.9e-51
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CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1695 200.9 6.3e-51
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CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1684 199.4 1.1e-50
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1682 199.1 1.2e-50
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1682 199.3 1.4e-50
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 1681 199.1 1.5e-50
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 1680 199.0 1.5e-50
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1680 199.0 1.6e-50
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1682 199.5 1.7e-50
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1678 198.7 1.8e-50
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1670 197.9 3.5e-50
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 1670 198.0 3.6e-50
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1667 197.6 4.3e-50
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1643 194.8 2.2e-49
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1645 195.1 2.2e-49
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1646 195.4 2.3e-49
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1629 193.5 8.1e-49
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1628 193.3 8.2e-49
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1624 192.8 1e-48
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1627 193.4 1e-48
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1624 192.8 1.1e-48
>>CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 (605 aa)
initn: 4168 init1: 4168 opt: 4168 Z-score: 2495.0 bits: 471.7 E(32554): 1.2e-132
Smith-Waterman score: 4168; 100.0% identity (100.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 LIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQH
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 RRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIH
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 IEEDP
:::::
CCDS44 IEEDP
>>CCDS4439.1 ZNF354B gene_id:117608|Hs108|chr5 (612 aa)
initn: 3104 init1: 3104 opt: 3548 Z-score: 2127.6 bits: 403.8 E(32554): 3.4e-112
Smith-Waterman score: 3548; 86.1% identity (93.4% similar) in 605 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS44 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
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pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
::::::::::::::::::.::::::: ::. : ::::::::: :: : :: .:. ::..
CCDS44 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS-FQEQIRKRLKRDEPWNF
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
:. ::: .:.:.:::. ..::.:..: :: :..:::::.:..::: :::.:.:: .
CCDS44 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRF
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pF1KB7 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKI-TADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGE
.:::: ::::: ::.::::.:::: :: ::.:::::: :::.::..::::::.:::.::
CCDS44 AKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGE
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pF1KB7 KLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYR
:::::::: ::::::::::::: :::::::::::::::::. :.:: :::::::::: ::
CCDS44 KLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYR
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pF1KB7 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNEC
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pF1KB7 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
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pF1KB7 TSISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
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pF1KB7 ALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQ
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: :::.:::::.::::
CCDS44 ALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQ
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pF1KB7 HRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKI
:.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::..::::::::::
CCDS44 HQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKI
540 550 560 570 580 590
600
pF1KB7 HIEEDP
:::::
CCDS44 HIEEDSLKADLHV
600 610
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
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Smith-Waterman score: 1958; 48.7% identity (73.4% similar) in 610 aa overlap (1-605:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
:. : : . ..:::::.: :...:: .: :.::.:::::::...: :::.: . ::
CCDS74 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVE-KDGSGV-SSLGSKSSHKTT--KSTQTQDSSFQGLILKRSNRNV
.:::::.: . : :: . .:: .: .. . : . :. ... : . ....: .
CCDS74 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 PWDLKLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQI-VSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLI
: . : ::. : . .. :. . :. : : :..:. ..: ...:.: . :
CCDS74 LWYCRGEDT---EGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNG-FGENISLNPDLP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RQQILPREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKITADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKN
.: . :....: .:. : . ..: : . .: :::. : :.: ..:.: .:...
CCDS74 HQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVL-QKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HSGEKLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVE
:.::. ..:.:: :.: .:::: .:: ::::::: : .::..:. . : .: :::: :
CCDS74 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KSYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYL
: :.:.::::::: ::.. :.. :. :.: . . :: : :. :::. .: :
CCDS74 KPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 CNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNEC
:.:::..:. :::: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.: :::::::.:.::
CCDS74 CGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGEC
360 370 380 390 400 410
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::.:.. . :..:: :::::: :.::::::..: :.: ::: :::::: .:. :::::
CCDS74 GKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAF
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pF1KB7 RQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSS
:::. : ::::.::::.::.::.:::.: .:::..:::::::::::.:..:: .:.: .
CCDS74 RQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 ALIQHRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTN
::::.::::::::..:: ::..: ::: : :::::: :::: :: ::: :.: :::..
CCDS74 PLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQ
540 550 560 570 580 590
600
pF1KB7 HYKIHIEEDP
: . : : :
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CCDS33 MALTQGPLKFMDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLGICLPDL
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CCDS33 SVTSMLEQKRDPWTLQSEEKIANDPDGRECIKGVNTERSSKLGSNAGNKPCKNQLGFTFQ
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pF1KB7 SSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKN
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CCDS33 LHLSDLQLFQAERKISGCKHFEKPV---------SDNSS----VSPL-EKISSSVKSHLL
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CCDS33 NKYRNNFDHAPLLPQEQKAHIREKAYKCNEHGQVFRASASLTNQVIHNADNPYKCSECGK
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pF1KB7 TFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTL
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CCDS33 VFSCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRS
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CCDS33 SSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSYL
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CCDS33 AEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQLIHTGRKPYKCKECDKVFGRKCFLTSHQ
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CCDS33 GEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEKP
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pF1KB7 YRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECN
:.:..:: :.:.: : .:. :::::.:..:. :::.:: :. :: ::: .: .::.
CCDS33 YKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECK
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CCDS74 HKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKII
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CCDS74 HTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGK
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CCDS74 CEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKEC
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CCDS42 TGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPY-----KCKECDK--TFKRLSTLTKHK
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CCDS42 VKPLLY
1190
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CCDS42 DLITYLEQGKEPWNM-KQHEMVDEPTGICPHFPQDFWPEQSMEDSFQKVLLRKYEKCGHE
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CCDS42 NLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLTTAQSK----VFQCGKYLKVFYKFLNSN---R
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CCDS42 KCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEE
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CCDS42 LTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLS
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CCDS42 THKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKR
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605 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 22:31:34 2016 done: Fri Nov 4 22:31:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]