Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7824
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7824, 604 aa
1>>>pF1KB7824 604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2518+/-0.00175; mu= 11.6854+/- 0.105
mean_var=278.9313+/-55.502, 0's: 0 Z-trim(107.6): 952 B-trim: 66 in 2/48
Lambda= 0.076794
statistics sampled from 8600 (9665) to 8600 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 3.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 ( 603) 4252 485.7 7.3e-137
CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 1903 225.5 1.7e-58
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CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1838 218.4 2.7e-56
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1797 213.8 6.2e-55
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CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 653) 1691 202.0 2e-51
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CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 657) 1691 202.0 2e-51
CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 667) 1691 202.0 2e-51
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1632 195.5 1.8e-49
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1630 195.3 2.3e-49
CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 509) 1575 189.0 1.3e-47
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CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 599) 1575 189.1 1.4e-47
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1576 189.3 1.4e-47
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CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1576 189.4 1.5e-47
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1569 188.5 2.2e-47
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1569 188.5 2.3e-47
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1556 187.2 6.9e-47
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1551 186.5 9.2e-47
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CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 ( 588) 1546 185.9 1.3e-46
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CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1535 184.7 3e-46
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1535 184.7 3.2e-46
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1535 184.8 3.2e-46
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1535 184.8 3.2e-46
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1525 183.6 6.9e-46
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1512 182.1 1.8e-45
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 1510 181.9 2e-45
CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 1510 182.0 2.1e-45
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 1510 182.0 2.2e-45
CCDS4439.1 ZNF354B gene_id:117608|Hs108|chr5 ( 612) 1503 181.1 3.5e-45
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1497 180.6 6.4e-45
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 1495 180.3 7e-45
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1491 179.9 9.4e-45
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1491 179.9 9.6e-45
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1491 180.0 1e-44
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1491 180.0 1.1e-44
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1491 180.0 1.1e-44
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1484 179.1 1.6e-44
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1484 179.2 1.8e-44
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1484 179.2 1.8e-44
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1484 179.2 1.8e-44
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1484 179.2 1.8e-44
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1483 179.2 2e-44
>>CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 (603 aa)
initn: 3705 init1: 3705 opt: 4252 Z-score: 2570.6 bits: 485.7 E(32554): 7.3e-137
Smith-Waterman score: 4252; 99.8% identity (99.8% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPGLLTTRKEALMAFRDVAVAFTQKEWKLLSSAQRTLYREVMLENYSHLVSLGIAFSKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MSPGLLTTRKEALMAFRDVAVAFTQKEWKLLSSAQRTLYREVMLENYSHLVSLGIAFSKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KLIEQLEQGDEPWREENEHLLDLCPAEPRTEFQPSFPHLVAFSSSQLLRQYALSGHPTQI
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KLIEQLEQGDEPWREENEHLLDLCP-EPRTEFQPSFPHLVAFSSSQLLRQYALSGHPTQI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FPSSSAGGDFQLEAPRCSSEKGESGETEGPDSSLRKRPSRISRTFFSPHQGDPVEWVEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FPSSSAGGDFQLEAPRCSSEKGESGETEGPDSSLRKRPSRISRTFFSPHQGDPVEWVEGN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 REGGTDLRLAQRMSLGGSDTMLKGADTSESGAVIRGNYRLGLSKKSSLFSHQKHHVCPEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 REGGTDLRLAQRMSLGGSDTMLKGADTSESGAVIRGNYRLGLSKKSSLFSHQKHHVCPEC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GRGFCQRSDLIKHQRTHTGEKPYLCPECGRRFSQKASLSIHQRKHSGEKPYVCRECGRHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GRGFCQRSDLIKHQRTHTGEKPYLCPECGRRFSQKASLSIHQRKHSGEKPYVCRECGRHF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RYTSSLTNHKRIHSGERPFVCQECGRGFRQKIALLLHQRTHLEEKPFVCPECGRGFCQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RYTSSLTNHKRIHSGERPFVCQECGRGFRQKIALLLHQRTHLEEKPFVCPECGRGFCQKA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SLLQHQSSHTGERPFLCLECGRSFRQQSLLLSHQVTHSGEKPYVCAECGHSFRQKVTLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SLLQHQSSHTGERPFLCLECGRSFRQQSLLLSHQVTHSGEKPYVCAECGHSFRQKVTLIR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 HQRTHTGEKPYLCPQCGRGFSQKVTLIGHQRTHTGEKPYLCPDCGRGFGQKVTLIRHQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HQRTHTGEKPYLCPQCGRGFSQKVTLIGHQRTHTGEKPYLCPDCGRGFGQKVTLIRHQRT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HTGEKPYLCPKCGRAFGFKSLLTRHQRTHSEEELYVDRVCGQGLGQKSHLISDQRTHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HTGEKPYLCPKCGRAFGFKSLLTRHQRTHSEEELYVDRVCGQGLGQKSHLISDQRTHSGE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KPCICDECGRGFGFKSALIRHQRTHSGEKPYVCRECGRGFSQKSHLHRHRRTKSGHQLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KPCICDECGRGFGFKSALIRHQRTHSGEKPYVCRECGRGFSQKSHLHRHRRTKSGHQLLP
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 QEVF
::::
CCDS67 QEVF
600
>>CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 (641 aa)
initn: 1386 init1: 1386 opt: 1903 Z-score: 1163.8 bits: 225.5 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 2094; 50.9% identity (69.4% similar) in 633 aa overlap (1-582:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPGLLTTRKEALMAFRDVAVAFTQKEWKLLSSAQRTLYREVMLENYSHLVSLGIAFSKP
:. ::: ..:::..::::::: :::.::.::: :::::.::::::.:.::::: : :::
CCDS82 MATGLLRAKKEAFVAFRDVAVYFTQEEWRLLSPAQRTLHREVMLETYNHLVSLEIPSSKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 KLIEQLEQGDEPWREENEHLLDLCPAEPRTEFQ--PSFPHLVAFSSSQLLRQYALSGHPT
::: :::.:. ::::: . ::::::: . :.: :: : . :::.: : :.. .: .
CCDS82 KLIAQLERGEAPWREERKCPLDLCPAESKPEIQLSPSCP--LIFSSQQALSQHVWLSHLS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB7 QIFPSSSAGGDFQL-----------EAPRCSSEKGESGETEGPDSSL---RKRPSRISRT
:.: : ::. ..: . : : : :.: . :: :: : : . :..
CCDS82 QLFSSLWAGNPLHLGKHYPEDQKQQQDPFCFSGKAEWIQ-EGEDSRLLFGRVSKNGTSKA
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170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FFSP-HQGDPVEWVEGNREGGTDLRLAQRMSLGGSDTMLKGADTSESGAVIRGNYRLGLS
. :: .. .:.. : : .: .: .: .:.: ..: : . .. :.
CCDS82 LSSPPEEQQPAQSKEDNTVVDIGSSPERRADLEETDKVLHGLEVSGFGEIKYEEFGPGFI
180 190 200 210 220 230
230 240
pF1KB7 KKSSLFSHQK-----------------------------H-----HVCPECGRGFCQRSD
:.:.:.: :: : .:: :::::: .:.
CCDS82 KESNLLSLQKTQTGETPYMYTEWGDSFGSMSVLIKNPRTHSGGKPYVCRECGRGFTWKSN
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LIKHQRTHTGEKPYLCPECGRRFSQKASLSIHQRKHSGEKPYVCRECGRHFRYTSSLTNH
:: :::::.:::::.: .::: :. :..: ::: ::: :::::.:::. : :.: .:
CCDS82 LITHQRTHSGEKPYVCKDCGRGFTWKSNLFTHQRTHSGLKPYVCKECGQSFSLKSNLITH
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310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KRIHSGERPFVCQECGRGFRQKIALLLHQRTHLEEKPFVCPECGRGFCQKASLLQHQSSH
.: :.::.:.::.::::::::. :. :.::: :::..: :: .:: ::. :..: .:
CCDS82 QRAHTGEKPYVCRECGRGFRQHSHLVRHKRTHSGEKPYICRECEQGFSQKSHLIRHLRTH
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TGERPFLCLECGRSFRQQSLLLSHQVTHSGEKPYVCAECGHSFRQKVTLIRHQRTHTGEK
:::.:..: :::: : .: : .:: :::: ::::: :::. : : .: .:::.:::::
CCDS82 TGEKPYVCTECGRHFSWKSNLKTHQRTHSGVKPYVCLECGQCFSLKSNLNKHQRSHTGEK
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PYLCPQCGRGFSQKVTLIGHQRTHTGEKPYLCPDCGRGFGQKVTLIRHQRTHTGEKPYLC
:..: .:::::..: :: :::::.::::..: .:::::..: ::: :::::.::::..:
CCDS82 PFVCTECGRGFTRKSTLSTHQRTHSGEKPFVCAECGRGFNDKSTLISHQRTHSGEKPFMC
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PKCGRAFGFKSLLTRHQRTHSEEELYVDRVCGQGLGQKSHLISDQRTHSGEKPCICDECG
.::: : : : ::.:.:: .: : ::::. : ::. ::.:.: :: .: :::
CCDS82 RECGRRFRQKPNLFRHKRAHSGA--FVCRECGQGFCAKLTLIKHQRAHAGGKPHVCRECG
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RGFGFKSALIRHQRTHSGEKPYVCRECGRGFSQKSHLHRHRRTKSGHQLLPQEVF
.::. .: ::::::::::::::.::.::::::.
CCDS82 QGFSRQSHLIRHQRTHSGEKPYICRKCGRGFSRKSNLIRHQRTHSG
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>>CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 (894 aa)
initn: 1754 init1: 1754 opt: 1841 Z-score: 1125.3 bits: 218.8 E(32554): 2.3e-56
Smith-Waterman score: 1855; 51.9% identity (70.3% similar) in 528 aa overlap (87-597:382-886)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FSKPKLIEQLEQGDEPWREENEHLLDLCPAEPRTEFQPSFPHLVAFSSSQLLRQYALSGH
::. :..: .::::...: :.. .:
CCDS43 ELLVWYGDEYGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLSQHVERNH
360 370 380 390 400 410
120 130 140 150
pF1KB7 PTQIFPSSSAGGDFQLEAPRCSSEKGESGETEGPDSS---------------LRKRP--S
.: ::. :: .: : : : ..... . : : : ::
CCDS43 SSQNFPGPSARKLLQPENP-CPGDQNQEQQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLLNKRTWQR
420 430 440 450 460 470
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RISRTFFSPHQGDPVEWVEGNREGGTDLRLAQRMSLGGSDTMLKGADTSESGAVIRGNYR
.:::.: :: .:. :.: . : .:... :.. .. :. :. . : :
CCDS43 EISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAKVKYG---
480 490 500 510 520
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LGLSKKSSLFSHQKHHVCPECGRGFCQRSDLIKHQRTHTGEKPYLCPECGRRFSQKASLS
:::.:: .::.: ::::::::: :.: :::: :: :. :
CCDS43 -------------------ECGQGFSVKSDVITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLL
530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 IHQRKHSGEKPYVCRECGRHFRYTSSLTNHKRIHSGERPFVCQECGRGFRQKIALLLHQR
:::: :.:::::::::::: : . : : .:.: :.::.:.::.:::::: .. .:: :::
CCDS43 IHQRIHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQR
570 580 590 600 610 620
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 THLEEKPFVCPECGRGFCQKASLLQHQSSHTGERPFLCLECGRSFRQQSLLLSHQVTHSG
: :::.:: :::::: ... :: :: ::::.:..: ::::.: ::.::.:: ::.:
CCDS43 RHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTG
630 640 650 660 670 680
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 EKPYVCAECGHSFRQKVTLIRHQRTHTGEKPYLCPQCGRGFSQKVTLIGHQRTHTGEKPY
:::::: :::..: . .:. :::::::::::.: .::::::.: :. :::::::::::
CCDS43 EKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPY
690 700 710 720 730 740
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 LCPDCGRGFGQKVTLIRHQRTHTGEKPYLCPKCGRAFGFKSLLTRHQRTHSEEELYVDRV
.: .::::: .: :.::::::::::::.: .:::.: :: : :::::. :. :: :
CCDS43 VCRECGRGFRDKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCRE
750 760 770 780 790 800
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pF1KB7 CGQGLGQKSHLISDQRTHSGEKPCICDECGRGFGFKSALIRHQRTHSGEKPYVCRECGRG
::.:...::::. ::::.:::: .: :::::: :: :.::::::.:::::::::::::
CCDS43 CGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRG
810 820 830 840 850 860
580 590 600
pF1KB7 FSQKSHLHRHRRTKSGHQLLPQEVF
::..: : :.::..:..
CCDS43 FSDRSSLCYHQRTHTGEKPYVCREDE
870 880 890
>>CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 (751 aa)
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10 20 30 40 50
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.::..::::. :: :: .. : . . ..:. :. ..:: :.. :
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: :..: :. : . .. . :. : :.: : . . .. .:.:
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.:..: :. .. :.: . . :. : : . .. . : .. :. .:.:.
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:.::::: :.::::.: :: ..: . ::::.::::.:::::. .: ...:.: : :
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: .: .:: :: ::. :::::.::::..: .::.:: :: ::. :: ::. :::..: ::
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:::: :: :. :::::. :::: : .::: : :: ..: :.: :. . : ::.:.
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: .: ::::::::: .: .: ..:..:. :.::: :::::.:. :..::::: ::
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: :..:.::..
CCDS13 TLLFHQKTHSGEKPFICSECGQGFIWKSNLVKHQLAHSGKQPFVCKECGRGFNWKGNLLT
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>--
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::.: :::.:: :..:..:: .:.:..::
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:
CCDS13 ASS
750
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CCDS31 ECRKRFSKKPSLIKHQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYNCSQCGK
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: :. ::: : :::: : :::..: .:..:. :. .::: .:: : .: ..: ..: :
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340 350 360 370 380 390
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:. :: ::... ::::::: ::::.:::: :.:::..:: ::.: :::::.::::
CCDS31 GEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKP
520 530 540 550 560 570
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: ::.: ..:::::.:. :.: ..:.. : :
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CCDS31 YECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGEKPYECN
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:: ..::..: :..:: :.::::. :.:::..: .: :: ::::::::::: : .: .
CCDS31 ECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRK
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CCDS31 AFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVKKS
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CCDS74 LENYRNLLSLDGVSLLLPRLECNRAISAHHNLCLPGSSNSPATASRVVGITAEPKPEIYT
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100 110 120 130 140
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:.::: .:.: :..:. : ... :..:. : .. .. . : :..:.
CCDS74 CSSCLLAFSCQQFLSQHVLQIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEG
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150 160 170 180 190 200
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: : .. : : . . ::.: :: : . . .:: :. ::: . : :
CCDS74 QERGGGSKPWSARTEERETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGL
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: .: . ::. : : .. : .:..: . :: :.::
CCDS74 KELETLRFGAI---NCR----------EYEPDH---------NLESNFITNPRTLLGKKP
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270 280 290 300 310 320
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:.: .::: :.....: :.: :: :::::: :::: : :.:. :.: :: :.:..:.
CCDS74 YICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCR
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330 340 350 360 370 380
pF1KB7 ECGRGFRQKIALLLHQRTHLEEKPFVCPECGRGFCQKASLLQHQSSHTGERPFLCLECGR
:::..::.: : :: :: ::::.:: :::::: .:.:...:: .:.::.:..::::::
CCDS74 ECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGR
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:: ..: : .:: ::::::::: :::..: :. ::.::::: ::::.: .::::: .
CCDS74 SFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQRTHLDEKPYVCRECGRGFCD
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: ::: :.:::.:::::.: .:::::..: :. :::::.::: :.: .: :.:. :: :
CCDS74 KSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECRRGFSQKSNL
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CCDS74 IRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSGEKPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQ
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CCDS74 RTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH
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CCDS63 MCNGRKTVLADPEPELYLDPFCPP--GFSSQKFPMQHV
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pF1KB7 LSGHPTQIFPSSSAGGDFQLEAP--------------RCSSEKGESGETEGPDSSLRKRP
: .:: :: : :..: : : :...:. : :: . .
CCDS63 LCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEGAMPLFGRTK
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.: .: : : .:: .: : :..:. :: . .: .:: .. :.: :
CCDS63 KRTLGAFSRPPQRQPVSSRNGLR--GVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCG
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pF1KB7 NYRLGLSKKSSLFSHQKHH------VCPECGRGFCQRSDLIKHQRTHTGEKPYLCPECGR
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CCDS63 ECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGR
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CCDS63 GFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQ
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CCDS63 KSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTL
280 290 300 310 320 330
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..:: ::: ::::::. ::::: :. ::: :.:::::::::.:
CCDS63 VNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQ
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 -------P----QCGRGFSQKVTLIGHQRTHTGEKPYLCPDCGRGFGQKVTLIRHQRTHT
: .:::::::. .:: :::::.::::..: .:::::.:: .:. :::::.
CCDS63 NIHSGEKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFSQKSNLVAHQRTHS
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::.::.: .:::.:. .. : ::.: ::.:. :. : :: :.:.:: ::. .:.:: :::
CCDS63 GERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSALITHKRAHSEEKP
460 470 480 490 500 510
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pF1KB7 CICDECGRGFGFKSALIRHQRTHSGEKPYVCRECGRGFSQKSHLHRHRRTKSGHQLLPQE
:.: :::.:: :: : :: ::.:::::::. :::::: :::: :::.: : :. ::
CCDS63 CVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRHRKTTSVHHRLPVQ
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 VF
CCDS63 PDPEPCAGQPSDSLYSL
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630
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: ..:.:::. : :: : .:: ...: .::..:.:::: .: :::: :..:..
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: .:::::::. .:: :::::.::::..: .:::::.:: .:. :::::.::.::.:
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650
>>CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (654 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPGLLTTRKEALMAFRDVAVAFTQKEWKLLSSAQRTLYREVMLENYSHLVSLGIAFSKP
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CCDS63 MAFRDVAVDFTQDEWRLLSPAQRTLYREVMLENYSNLVSLGISFSKP
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CCDS63 ELITQLEQGKETWREEKKCSPATCPADPEPELYLDPFCPP--GFSSQKFPMQHVLCNHPP
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CCDS63 WIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEGAMPLFGRTKKRTLGA
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CCDS63 FSRPPQRQPVSSRNGLR--GVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLSF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]