FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7794, 519 aa
1>>>pF1KB7794 519 - 519 aa - 519 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9424+/-0.00036; mu= -1.7034+/- 0.023
mean_var=256.2748+/-52.744, 0's: 0 Z-trim(122.6): 108 B-trim: 1653 in 1/57
Lambda= 0.080116
statistics sampled from 40862 (40979) to 40862 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16
Scan time: 12.360
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_443086 (OMIM: 616215) cyclic AMP-responsive ele ( 519) 3488 416.1 1.3e-115
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NP_919047 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive ele ( 520) 984 126.7 1.7e-28
XP_016868029 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP- ( 457) 952 122.9 2e-27
XP_016868030 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP- ( 457) 952 122.9 2e-27
NP_001305175 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive ( 457) 952 122.9 2e-27
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NP_001258925 (OMIM: 611998) cyclic AMP-responsive ( 459) 427 62.3 3.7e-09
NP_001258924 (OMIM: 611998) cyclic AMP-responsive ( 460) 426 62.1 4e-09
NP_115996 (OMIM: 611998) cyclic AMP-responsive ele ( 461) 426 62.1 4e-09
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NP_001242907 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 395) 413 60.6 1e-08
NP_570968 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ele ( 395) 413 60.6 1e-08
XP_006711235 (OMIM: 607138) PREDICTED: cyclic AMP- ( 375) 406 59.8 1.7e-08
XP_016855861 (OMIM: 607138) PREDICTED: cyclic AMP- ( 375) 406 59.8 1.7e-08
NP_001242910 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 375) 406 59.8 1.7e-08
NP_001242909 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 375) 406 59.8 1.7e-08
NP_006359 (OMIM: 606443) cyclic AMP-responsive ele ( 371) 387 57.6 7.7e-08
NP_001240704 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive ( 248) 287 45.9 0.00017
>>NP_443086 (OMIM: 616215) cyclic AMP-responsive element (519 aa)
initn: 3488 init1: 3488 opt: 3488 Z-score: 2196.8 bits: 416.1 E(85289): 1.3e-115
Smith-Waterman score: 3488; 100.0% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (1-519:1-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDAVLEPFPADRLFPGSSFLDLGDLNESDFLNNAHFPEHLDHFTENMEDFSNDLFSSFFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 MDAVLEPFPADRLFPGSSFLDLGDLNESDFLNNAHFPEHLDHFTENMEDFSNDLFSSFFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKMEDTTQDAEHGAWALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 DPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKMEDTTQDAEHGAWALG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 HKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PVIKAEPLEVNQFLKVTPEDLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQSPRSLPPSSPVRPMARSSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 PVIKAEPLEVNQFLKVTPEDLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQSPRSLPPSSPVRPMARSSTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 ISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 KISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPCLPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 ISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPCLPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PSRSLLFYDDGAGLWEDGRSTLLPMEPPDGWEINPGGPAEQRPRDHLQHDHLDSTHETTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 PSRSLLFYDDGAGLWEDGRSTLLPMEPPDGWEINPGGPAEQRPRDHLQHDHLDSTHETTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB7 YLSEAWPKDGGNGTSPDFSHSKEWFHDRDLGPNTTIKLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 YLSEAWPKDGGNGTSPDFSHSKEWFHDRDLGPNTTIKLS
490 500 510
>>XP_006718443 (OMIM: 616215) PREDICTED: cyclic AMP-resp (363 aa)
initn: 2271 init1: 2271 opt: 2271 Z-score: 1438.8 bits: 275.3 E(85289): 2.1e-73
Smith-Waterman score: 2271; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDAVLEPFPADRLFPGSSFLDLGDLNESDFLNNAHFPEHLDHFTENMEDFSNDLFSSFFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MDAVLEPFPADRLFPGSSFLDLGDLNESDFLNNAHFPEHLDHFTENMEDFSNDLFSSFFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKMEDTTQDAEHGAWALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKMEDTTQDAEHGAWALG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PVIKAEPLEVNQFLKVTPEDLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQSPRSLPPSSPVRPMARSSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PVIKAEPLEVNQFLKVTPEDLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQSPRSLPPSSPVRPMARSSTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANSFSSGIQPLLCSLIGLE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPCLPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQM
XP_006 NPT
>>NP_919047 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive element (520 aa)
initn: 940 init1: 710 opt: 984 Z-score: 632.6 bits: 126.7 E(85289): 1.7e-28
Smith-Waterman score: 1186; 51.7% identity (74.0% similar) in 404 aa overlap (42-430:35-434)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 RLFPGSSFLDLGDLNESDFLNNAHFPEHLDHFTENMEDFSNDLFSSFFDDPVLDEKSPLL
::.: ...::.........:: :.::: .
NP_919 ESGEQGVLQWDRKLSELSEPGDGEALMYHTHFSELLDEFSQNVLGQLLNDPFLSEKSVSM
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KB7 DMELD--SPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKMEDTTQD--AEHGAWALGHKLCSIM
..: . ::.: ::::::::: . :::.. : :. .: .: : :. . :
NP_919 EVEPSPTSPAPLIQAEHSYSLCEEPRAQSPFTHITTSDSFNDDEVESEKWYLSTDFPSTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQLPVIKAEP
.: : . : : .::. . .:. .::: : .. .. . : .: :: ::
NP_919 IKTEPVTDEP-PPGLVPSVTLTITAI-STPLEKEEPPLEMNTGVDSSCQ-TIIPKIKLEP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 LEVNQFLKVTPE----DLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQSPR------SLPPS-SPVRPMAR
::.:::. .:. : ...::::::::::::.:: :: ::: . :: : :
NP_919 HEVDQFLNFSPKEAPVDHLHLPPTPPSSHGSDSEGSLSPNPRLHPFSLPQTHSPSRAAPR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SSTAISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRR
. .:.:.:::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::.:.::::::..::
NP_919 APSALSSSPLLTAPHKLQG-SGPLVLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KIKNKISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTL
::::::::::::::::::.. ::::::. ..:: :: ::::.:::.::::::::::::::
NP_919 KIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVESCSTENLELRKKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 VTNKISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPCLPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYT
: .:.:: :.:.:::::::::..:::....::. . :... . . . . ::
NP_919 VMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFAVAFGSFFQGYGPYPSATKMALPSQHSLQEPYT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 ASQMPSRSLLFYDDGAGLWEDGRSTLLPMEPPDGWEINPGGPAEQRPRDHLQHDHLDSTH
:: . ::.::.:..
NP_919 ASVVRSRNLLIYEEHSPPEESSSPGSAGELGGWDRGSSLLRVSGLESRPDVDLPHFIISN
430 440 450 460 470 480
>>XP_016868029 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP-resp (457 aa)
initn: 865 init1: 710 opt: 952 Z-score: 613.4 bits: 122.9 E(85289): 2e-27
Smith-Waterman score: 1109; 53.7% identity (73.3% similar) in 367 aa overlap (77-430:9-371)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 MEDFSNDLFSSFFDDPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKME
::.: ::::::::: . :::.. :
XP_016 MEVEPSPTSPAPLIQAEHSYSLCEEPRAQSPFTHITTS
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pF1KB7 DTTQD--AEHGAWALGHKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPL
:. .: .: : :. . : .: : . : : .::. . .:. .::: :
XP_016 DSFNDDEVESEKWYLSTDFPSTSIKTEPVTDEP-PPGLVPSVTLTITAI-STPLEKEEPP
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pF1KB7 SRLPIPHQAPGEMTQLPVIKAEPLEVNQFLKVTPE----DLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQ
.. .. . : .: :: :: ::.:::. .:. : ...::::::::::::.::
XP_016 LEMNTGVDSSCQ-TIIPKIKLEPHEVDQFLNFSPKEAPVDHLHLPPTPPSSHGSDSEGSL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB7 SPR------SLPPS-SPVRPMARSSTAISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAE
:: ::: . :: : :. .:.:.:::::::::::: ::::.::::::::::::
XP_016 SPNPRLHPFSLPQTHSPSRAAPRAPSALSSSPLLTAPHKLQG-SGPLVLTEEEKRTLIAE
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELW
::::::::::.:.::::::..::::::::::::::::::::.. ::::::. ..:: ::
XP_016 GYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVESCSTENLELR
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPC
::::.:::.::::::::::::::: .:.:: :.:.:::::::::..:::....::.
XP_016 KKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFAVAFGSFFQG
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 LPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQMPSRSLLFYDDGAGLWEDGRSTLLPMEPPDGWEI
. :... . . . . :::: . ::.::.:..
XP_016 YGPYPSATKMALPSQHSLQEPYTASVVRSRNLLIYEEHSPPEESSSPGSAGELGGWDRGS
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 NPGGPAEQRPRDHLQHDHLDSTHETTKYLSEAWPKDGGNGTSPDFSHSKEWFHDRDLGPN
XP_016 SLLRVSGLESRPDVDLPHFIISNETSLEKSVLLELQQHLVSAKLEGNETLKVVELDRRVN
400 410 420 430 440 450
>>XP_016868030 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP-resp (457 aa)
initn: 865 init1: 710 opt: 952 Z-score: 613.4 bits: 122.9 E(85289): 2e-27
Smith-Waterman score: 1109; 53.7% identity (73.3% similar) in 367 aa overlap (77-430:9-371)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 MEDFSNDLFSSFFDDPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKME
::.: ::::::::: . :::.. :
XP_016 MEVEPSPTSPAPLIQAEHSYSLCEEPRAQSPFTHITTS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 DTTQD--AEHGAWALGHKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPL
:. .: .: : :. . : .: : . : : .::. . .:. .::: :
XP_016 DSFNDDEVESEKWYLSTDFPSTSIKTEPVTDEP-PPGLVPSVTLTITAI-STPLEKEEPP
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 SRLPIPHQAPGEMTQLPVIKAEPLEVNQFLKVTPE----DLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQ
.. .. . : .: :: :: ::.:::. .:. : ...::::::::::::.::
XP_016 LEMNTGVDSSCQ-TIIPKIKLEPHEVDQFLNFSPKEAPVDHLHLPPTPPSSHGSDSEGSL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB7 SPR------SLPPS-SPVRPMARSSTAISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAE
:: ::: . :: : :. .:.:.:::::::::::: ::::.::::::::::::
XP_016 SPNPRLHPFSLPQTHSPSRAAPRAPSALSSSPLLTAPHKLQG-SGPLVLTEEEKRTLIAE
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELW
::::::::::.:.::::::..::::::::::::::::::::.. ::::::. ..:: ::
XP_016 GYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVESCSTENLELR
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPC
::::.:::.::::::::::::::: .:.:: :.:.:::::::::..:::....::.
XP_016 KKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFAVAFGSFFQG
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 LPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQMPSRSLLFYDDGAGLWEDGRSTLLPMEPPDGWEI
. :... . . . . :::: . ::.::.:..
XP_016 YGPYPSATKMALPSQHSLQEPYTASVVRSRNLLIYEEHSPPEESSSPGSAGELGGWDRGS
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 NPGGPAEQRPRDHLQHDHLDSTHETTKYLSEAWPKDGGNGTSPDFSHSKEWFHDRDLGPN
XP_016 SLLRVSGLESRPDVDLPHFIISNETSLEKSVLLELQQHLVSAKLEGNETLKVVELDRRVN
400 410 420 430 440 450
>>NP_001305175 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive elem (457 aa)
initn: 865 init1: 710 opt: 952 Z-score: 613.4 bits: 122.9 E(85289): 2e-27
Smith-Waterman score: 1109; 53.7% identity (73.3% similar) in 367 aa overlap (77-430:9-371)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 MEDFSNDLFSSFFDDPVLDEKSPLLDMELDSPTPGIQAEHSYSLSGDSAPQSPLVPIKME
::.: ::::::::: . :::.. :
NP_001 MEVEPSPTSPAPLIQAEHSYSLCEEPRAQSPFTHITTS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 DTTQD--AEHGAWALGHKLCSIMVKQEQSPELPVDPLAAPSAMAAAAAMATTPLLGLSPL
:. .: .: : :. . : .: : . : : .::. . .:. .::: :
NP_001 DSFNDDEVESEKWYLSTDFPSTSIKTEPVTDEP-PPGLVPSVTLTITAI-STPLEKEEPP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SRLPIPHQAPGEMTQLPVIKAEPLEVNQFLKVTPE----DLVQMPPTPPSSHGSDSDGSQ
.. .. . : .: :: :: ::.:::. .:. : ...::::::::::::.::
NP_001 LEMNTGVDSSCQ-TIIPKIKLEPHEVDQFLNFSPKEAPVDHLHLPPTPPSSHGSDSEGSL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB7 SPR------SLPPS-SPVRPMARSSTAISTSPLLTAPHKLQGTSGPLLLTEEEKRTLIAE
:: ::: . :: : :. .:.:.:::::::::::: ::::.::::::::::::
NP_001 SPNPRLHPFSLPQTHSPSRAAPRAPSALSSSPLLTAPHKLQG-SGPLVLTEEEKRTLIAE
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 GYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTSENNELW
::::::::::.:.::::::..::::::::::::::::::::.. ::::::. ..:: ::
NP_001 GYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVESCSTENLELR
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVLGSLVPC
::::.:::.::::::::::::::: .:.:: :.:.:::::::::..:::....::.
NP_001 KKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFAVAFGSFFQG
280 290 300 310 320 330
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. :... . . . . :::: . ::.::.:..
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.. .. . : .: :: :: ::.:::. .:. : ...::::::::::::.::
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::::::::::.:.::::::..::::::::::::::::::::.. ::::::. ..:: ::
XP_005 GYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVESCSTENLELR
220 230 240 250 260 270
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::::.:::.::::::::::::::: .:.:: :.:.:::::::::..:::....::.
XP_005 KKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFAVAFGSFFQG
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. :... . . . . :::: . ::.::.:..
XP_005 YGPYPSATKMALPSQHSLQEPYTASVVRSRNLLIYEEHSPPEESSSPGSAGELGGWDRGS
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NP_001 QELQRKVLHLEKQNLSLLEQLKKLQAIVVQSTSK-----SAQTGTCVAVLLLSFALII--
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NP_001 PEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNATLVLRNATEGLGQVALLDWVAPGP
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NP_001 VKDLLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGA-------------------GHCQELVLTEDEK
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pF1KB7 RTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTS
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NP_001 KLLAKEGITLPTQLPLTKYEERVLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTA
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pF1KB7 ENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVL
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NP_001 QNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQLKKLQAIVVQSTSK-----SAQTGTCVAVLLLSFALII
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pF1KB7 GSLVPCLPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQMPSRSLLFYDDGAG-LWEDGR-STLLPM
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NP_115 SDDFLSSILGSGDSLPSSPLWSPEGSDSGISEDLPSDPQDTPPRSGPATSPAGCHPAQPG
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NP_115 KGPCLSYHPGNSCSTTTPGPVIQVPEASVTIDLEMWSPGGRICAEKPADPVDLSPRCNLT
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pF1KB7 RTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKEYVECLEKKVETFTS
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NP_115 KLLAKEGITLPTQLPLTKYEERVLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTA
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 ENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTGTCLMVAALCFVLVL
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NP_115 QNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQLKKLQAIVVQSTSK-----SAQTGTCVAVLLLSFALII
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pF1KB7 GSLVPCLPEFSSGSQTVKEDPLAADGVYTASQMPSRSLLFYDDGAG-LWEDGR-STLLPM
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NP_115 ------LPSISPFGPNKTESP----GDFAPVRVFSRTL--HNDAASRVAADAVPGSEAPG
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NP_115 PRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNATLVLRNATEGLGQVALLDWVAP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]