Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7736, 482 aa
1>>>pF1KB7736 482 - 482 aa - 482 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7712+/-0.000974; mu= 6.6450+/- 0.059
mean_var=148.4140+/-29.125, 0's: 0 Z-trim(109.2): 36 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.105278
statistics sampled from 10700 (10730) to 10700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS360.1 HDAC1 gene_id:3065|Hs108|chr1 ( 482) 3277 509.7 2.8e-144
CCDS43493.2 HDAC2 gene_id:3066|Hs108|chr6 ( 488) 2880 449.4 4e-126
CCDS4264.1 HDAC3 gene_id:8841|Hs108|chr5 ( 428) 1833 290.3 2.7e-78
CCDS14420.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX ( 377) 1083 176.4 4.7e-44
CCDS55449.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX ( 286) 813 135.3 8.4e-32
CCDS55451.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX ( 256) 717 120.7 1.9e-27
CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX (1215) 387 71.0 8.2e-12
CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025) 367 67.9 5.8e-11
CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066) 367 67.9 6e-11
CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069) 367 67.9 6.1e-11
>>CCDS360.1 HDAC1 gene_id:3065|Hs108|chr1 (482 aa)
initn: 3277 init1: 3277 opt: 3277 Z-score: 2703.7 bits: 509.7 E(32554): 2.8e-144
Smith-Waterman score: 3277; 100.0% identity (100.0% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKAN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 FKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPEAKGVKEEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPEAKGVKEEVK
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LA
::
CCDS36 LA
>>CCDS43493.2 HDAC2 gene_id:3066|Hs108|chr6 (488 aa)
initn: 2951 init1: 2811 opt: 2880 Z-score: 2377.8 bits: 449.4 E(32554): 4e-126
Smith-Waterman score: 2880; 85.9% identity (95.0% similar) in 483 aa overlap (1-478:1-483)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAQTQGT-RRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKA
:: .:: ..:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAYSQGGGKKKVCYYYDGDIGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVA
.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TAEEMTKYHSDEYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHH
.:::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAVKLNRQQTDMAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS43 GDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNFPMRDGIDDESYGQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLG
::::..::::::.::::::::::.::::::::::::::.:::::::: ::.::::.::::
CCDS43 IFKPIISKVMEMYQPSAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLTVKGHAKCVEVVKTFNLPLLMLG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYL
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.
CCDS43 GGGYTIRNVARCWTYETAVALDCEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTPEYM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEE
:::::::::::::::::::::::::::::. :.::::: .:::::::: .:::::::.::
CCDS43 EKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAVHEDSGDEDGEDPDKRISIRASDKRIACDEE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 FSDSEEEGEGGRKNSSNFKK-AKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKE---EKPEAKGV
:::::.::::::.: .. :: ::... :..:.. ..: .: ::.:.:. :: ..::.
CCDS43 FSDSEDEGEGGRRNVADHKKGAKKARIEEDKKETEDKKTDVKEEDKSKDNSGEKTDTKGT
430 440 450 460 470 480
480
pF1KB7 KEEVKLA
: :
CCDS43 KSEQLSNP
>>CCDS4264.1 HDAC3 gene_id:8841|Hs108|chr5 (428 aa)
initn: 1130 init1: 977 opt: 1833 Z-score: 1519.2 bits: 290.3 E(32554): 2.7e-78
Smith-Waterman score: 1833; 58.8% identity (84.0% similar) in 425 aa overlap (9-428:3-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKAN
. : :.:: ::::..:: ::::::::. .::.:.:.::::.:: ...:..:.
CCDS42 MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQAS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVAS
..: ..::.::: ::. . : ::. ..:... ::::.::::: ::::::. ::.:. .
CCDS42 QHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHG
:..::.. :::.::::::::::: ::::::::::::..:::::::: ::::::::::::
CCDS42 ATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 DGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYF-PGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEA
:::.:::: :::::::::::::.:: :::::. ..:: .:.:: .: ::::::::.::.
CCDS42 DGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLG
.:.::...:....::. .:::::.:::. ::::::::.:.::..:::.:::::.:.:.::
CCDS42 LFQPVINQVVDFYQPTCIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSN-MTNQNTNEY
:::::.:::::::::::.. .. : .::::..:::::.::: :: . :. . :::. .:
CCDS42 GGGYTVRNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQNSRQY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDE---DEDDPDKRISICSSDKRIA
:..:.: .::::.:: :::.::.. .: : . . :: .: :.. : :
CCDS42 LDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPADLLTYDRTDEADAEERGPEENYS------RPE
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 CEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPEAKGV
.:: :......
CCDS42 APNEFYDGDHDNDKESDVEI
410 420
>>CCDS14420.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX (377 aa)
initn: 949 init1: 542 opt: 1083 Z-score: 904.3 bits: 176.4 E(32554): 4.7e-44
Smith-Waterman score: 1083; 43.1% identity (77.1% similar) in 341 aa overlap (32-371:35-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 AQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANA
:.: :.:.:. :.:...:.: .:. :.
CCDS14 EEPADSGQSLVPVYIYSPEYVSMCDSLAKIPKRASMVHSLIEAYALHKQMRIVKPKVASM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASA
:::. .:.: :.. :... .. ... ... ...: :::. .:.:.. :.....:
CCDS14 EEMATFHTDAYLQHLQKVSQEGDDDHPDSIE-YGLGYDCPATEGIFDYAAAIGGATITAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGD
: . .:.::.:: :::::.:::::::.:: ::.::.: . .:.::.:.:.::::
CCDS14 QCLIDGMCKVAINWSGGWHHAKKDEASGFCYLNDAVLGILRLRRKFERILYVDLDLHHGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGE-YFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAI
:::.:: :..:::::.::.. .::::::. :.: :::.::.:: :..:::.::.: :
CCDS14 GVEDAFSFTSKVMTVSLHKFSPGFFPGTGDVSDVGLGKGRYYSVNVPIQDGIQDEKYYQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGG
. :...:.. :.:.::::: :.:...:: . ::.: : .::.... ...: :.:::
CCDS14 CESVLKEVYQAFNPKAVVLQLGADTIAGDPMCSFNMTPVGIGKCLKYILQWQLATLILGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLE
:::.. :.:::::: :.: : . .:.: ...: .:::. :.:.:: ..: . ..
CCDS14 GGYNLANTARCWTYLTGVILGKTLSSEIPDHEFFTAYGPDYVLEITPSCRPDRNEPHRIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEF
.: . . ::.
CCDS14 QILNYIKGNLKHVV
370
>>CCDS55449.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX (286 aa)
initn: 811 init1: 542 opt: 813 Z-score: 684.5 bits: 135.3 E(32554): 8.4e-32
Smith-Waterman score: 813; 45.7% identity (77.6% similar) in 254 aa overlap (120-371:30-283)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 QMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDI-AVNWAGGLHHAKKSEAS
: .:. :. . . .. : .::. ..:::
CCDS55 MEEPEEPADSGQSLVPVYIYSPEYVSMCDSLAKIPKRASMVHSLIEAYALHKQMRDEAS
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 GFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGE-YFPG
::::.:: ::.::.: . .:.::.:.:.:::::::.:: :..:::::.::.. .:::
CCDS55 GFCYLNDAVLGILRLRRKFERILYVDLDLHHGDGVEDAFSFTSKVMTVSLHKFSPGFFPG
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 TGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLS
:::. :.: :::.::.:: :..:::.::.: : . :...:.. :.:.::::: :.:...
CCDS55 TGDVSDVGLGKGRYYSVNVPIQDGIQDEKYYQICESVLKEVYQAFNPKAVVLQLGADTIA
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 GDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNE
:: . ::.: : .::.... ...: :.::::::.. :.:::::: :.: : . .:
CCDS55 GDPMCSFNMTPVGIGKCLKYILQWQLATLILGGGGYNLANTARCWTYLTGVILGKTLSSE
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPED
.: ...: .:::. :.:.:: ..: . ...: . . ::.
CCDS55 IPDHEFFTAYGPDYVLEITPSCRPDRNEPHRIQQILNYIKGNLKHVV
240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 AIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTED
>>CCDS55451.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX (256 aa)
initn: 572 init1: 410 opt: 717 Z-score: 606.4 bits: 120.7 E(32554): 1.9e-27
Smith-Waterman score: 717; 45.7% identity (79.0% similar) in 210 aa overlap (32-240:35-243)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 AQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANA
:.: :.:.:. :.:...:.: .:. :.
CCDS55 EEPADSGQSLVPVYIYSPEYVSMCDSLAKIPKRASMVHSLIEAYALHKQMRIVKPKVASM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASA
:::. .:.: :.. :... .. ... ... ...: :::. .:.:.. :.....:
CCDS55 EEMATFHTDAYLQHLQKVSQEGDDDHPDSIE-YGLGYDCPATEGIFDYAAAIGGATITAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGD
: . .:.::.:: :::::.:::::::.:: ::.::.: . .:.::.:.:.::::
CCDS55 QCLIDGMCKVAINWSGGWHHAKKDEASGFCYLNDAVLGILRLRRKFERILYVDLDLHHGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGE-YFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAI
:::.:: :..:::::.::.. .::::::. :.: :::.::.:: :..:::.::.: :
CCDS55 GVEDAFSFTSKVMTVSLHKFSPGFFPGTGDVSDVGLGKGRYYSVNVPIQDGIQDEKYYQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGG
CCDS55 CERYEPPAPNPGL
250
>>CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX (1215 aa)
initn: 168 init1: 102 opt: 387 Z-score: 325.6 bits: 71.0 E(32554): 8.2e-12
Smith-Waterman score: 387; 25.3% identity (52.4% similar) in 391 aa overlap (15-390:485-861)
10 20 30 40
pF1KB7 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNY--YYGQGHPMKPHRIRMTHNLL
:: .. :. . . :: :.:: :
CCDS14 VEESEEEGPWEPPVLPILTWPVLQSRTGLVYDQNMMNHCNLWDSHHPEVPQRILRIMCRL
460 470 480 490 500 510
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 LNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPV
. :: . :. :. :. :: .:. ::. . . : .. . :. ::
CCDS14 EELGLAGRCLTLTPRPATEAELLTCHSAEYVGHLRATEKMKTRELHRESSNFDSIYICP-
520 530 540 550 560 570
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 FDGLFEFCQLSTGGS--VASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAI
. : ::.::.. .. :: .. . :: : :::... : :::. :....:
CCDS14 --STFACAQLATGAACRLVEAVLSGEVLNGAAVVRPPG-HHAEQDAACGFCFFNSVAVAA
580 590 600 610 620 630
170 180 190 200 210
pF1KB7 --LELLKYHQ-RVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKY--GEYFP--GTGDLRD
. .. : :.: .: :.:::.:... : :. ::.:.: : .:: : .
CCDS14 RHAQTISGHALRILIVDWDVHHGNGTQHMFEDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQ
640 650 660 670 680 690
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 IGAGKGKYYAVNYPLRDG--IDDESYEAIFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRL
:: . : ..:: .: . : .: : .. .. . :.: :... : :. :: :
CCDS14 IGRAAGTGFTVNVAW-NGPRMGDADYLAAWHRLVLPIAYEFNPELVLVSAGFDAARGDPL
700 710 720 730 740
280 290 300 310 320
pF1KB7 GCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLP-MLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPN-ELP
: ... .:.:. .... .. .... :::.. .... . : : : ::
CCDS14 GGCQVSPEGYAHLTHLLMGLASGRIILILEGGYNLTSISESMAACTRSLLGDPPPLLTLP
750 760 770 780 790 800
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 YNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAI
: .. .. . : : .: .... :. : : . . . :. :
CCDS14 R--------PPLSGALASITETIQVHRRYWRSLRVMKVED-REGPSSSKLVTKKAPQPAK
810 820 830 840 850 860
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 PEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEK
:
CCDS14 PRLAERMTTREKKVLEAGMGKVTSASFGEESTPGQTNSETAVVALTQDQPSEAATGGATL
870 880 890 900 910 920
>>CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025 aa)
initn: 225 init1: 101 opt: 367 Z-score: 310.2 bits: 67.9 E(32554): 5.8e-11
Smith-Waterman score: 416; 27.0% identity (56.0% similar) in 411 aa overlap (28-401:613-1006)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPH
:: . ::. . : . :: : : . .
CCDS83 DRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGR
590 600 610 620 630 640
60 70 80 90 100
pF1KB7 KANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQM------QRFNVGEDCPVF--DGLFEF
::. ::. ::. . ..: . : . .. . .. :.: . : . :. .
CCDS83 KASLEEIQLVHSEHH-SLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIW
650 660 670 680 690 700
110 120 130 140 150
pF1KB7 CQLSTGGS----------VASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLA
.: ..:. .:: : .. .. .:: : :::..: : :::. :.....
CCDS83 NELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPG-HHAEESTAMGFCFFNSVAIT
710 720 730 740 750 760
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ILELLKYH---QRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKY--GEYFPGTGDLRDI
. :. . ...: .:.:.:::.:...:::. .. .:.:.: :..:::.: ..
CCDS83 A-KYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEV
770 780 790 800 810
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GAGKGKYYAVNYPLRDGID----DESYEAIFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDR
:.: :. : .: :.: : : :. ... : . :.:. :... : :.: :
CCDS83 GTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHT
820 830 840 850 860 870
280 290 300 310 320
pF1KB7 --LGCFNLTIK--GH-AKCVEFVKSFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIP
:: ...: : :: .: . . . . . . :: : : : . :. : .. .
CCDS83 PPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLT----AICDASEACV--NALLG
880 890 900 910 920 930
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 NELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRML--PHA---PGVQ
::: : .. :. :: :: ::. . . . .:... ....::. :.. :.:
CCDS83 NEL------EPLAEDI-LHQSP-NMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQ
940 950 960 970 980
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 MQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKA
.: : . : : ..:
CCDS83 LQEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
990 1000 1010 1020
>>CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066 aa)
initn: 225 init1: 101 opt: 367 Z-score: 310.0 bits: 67.9 E(32554): 6e-11
Smith-Waterman score: 416; 27.0% identity (56.0% similar) in 411 aa overlap (28-401:654-1047)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPH
:: . ::. . : . :: : : . .
CCDS47 DRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGR
630 640 650 660 670 680
60 70 80 90 100
pF1KB7 KANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQM------QRFNVGEDCPVF--DGLFEF
::. ::. ::. . ..: . : . .. . .. :.: . : . :. .
CCDS47 KASLEEIQLVHSEHH-SLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIW
690 700 710 720 730 740
110 120 130 140 150
pF1KB7 CQLSTGGS----------VASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLA
.: ..:. .:: : .. .. .:: : :::..: : :::. :.....
CCDS47 NELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPG-HHAEESTAMGFCFFNSVAIT
750 760 770 780 790 800
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ILELLKYH---QRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKY--GEYFPGTGDLRDI
. :. . ...: .:.:.:::.:...:::. .. .:.:.: :..:::.: ..
CCDS47 A-KYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEV
810 820 830 840 850 860
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GAGKGKYYAVNYPLRDGID----DESYEAIFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDR
:.: :. : .: :.: : : :. ... : . :.:. :... : :.: :
CCDS47 GTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHT
870 880 890 900 910 920
280 290 300 310 320
pF1KB7 --LGCFNLTIK--GH-AKCVEFVKSFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIP
:: ...: : :: .: . . . . . . :: : : : . :. : .. .
CCDS47 PPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLT----AICDASEACV--NALLG
930 940 950 960 970
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 NELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRML--PHA---PGVQ
::: : .. :. :: :: ::. . . . .:... ....::. :.. :.:
CCDS47 NEL------EPLAEDI-LHQSP-NMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQ
980 990 1000 1010 1020
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 MQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKA
.: : . : : ..:
CCDS47 LQEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
1030 1040 1050 1060
>>CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069 aa)
initn: 225 init1: 101 opt: 367 Z-score: 310.0 bits: 67.9 E(32554): 6.1e-11
Smith-Waterman score: 416; 27.0% identity (56.0% similar) in 411 aa overlap (28-401:657-1050)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPH
:: . ::. . : . :: : : . .
CCDS47 DRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGR
630 640 650 660 670 680
60 70 80 90 100
pF1KB7 KANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQM------QRFNVGEDCPVF--DGLFEF
::. ::. ::. . ..: . : . .. . .. :.: . : . :. .
CCDS47 KASLEEIQLVHSEHH-SLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIW
690 700 710 720 730 740
110 120 130 140 150
pF1KB7 CQLSTGGS----------VASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLA
.: ..:. .:: : .. .. .:: : :::..: : :::. :.....
CCDS47 NELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPG-HHAEESTAMGFCFFNSVAIT
750 760 770 780 790 800
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ILELLKYH---QRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKY--GEYFPGTGDLRDI
. :. . ...: .:.:.:::.:...:::. .. .:.:.: :..:::.: ..
CCDS47 A-KYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEV
810 820 830 840 850 860
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GAGKGKYYAVNYPLRDGID----DESYEAIFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDR
:.: :. : .: :.: : : :. ... : . :.:. :... : :.: :
CCDS47 GTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHT
870 880 890 900 910 920
280 290 300 310 320
pF1KB7 --LGCFNLTIK--GH-AKCVEFVKSFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIP
:: ...: : :: .: . . . . . . :: : : : . :. : .. .
CCDS47 PPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLT----AICDASEACV--NALLG
930 940 950 960 970
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 NELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRML--PHA---PGVQ
::: : .. :. :: :: ::. . . . .:... ....::. :.. :.:
CCDS47 NEL------EPLAEDI-LHQSP-NMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQ
980 990 1000 1010 1020
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 MQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKA
.: : . : : ..:
CCDS47 LQEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
1030 1040 1050 1060
482 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:18:30 2016 done: Fri Nov 4 09:18:31 2016
Total Scan time: 2.250 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]