FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7714, 473 aa 1>>>pF1KB7714 473 - 473 aa - 473 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7603+/-0.000854; mu= 16.1104+/- 0.052 mean_var=84.5985+/-16.758, 0's: 0 Z-trim(108.1): 123 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.139442 statistics sampled from 9899 (10025) to 9899 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16 Scan time: 3.250 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2995.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 473) 3217 657.1 1.1e-188 CCDS43136.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 434) 2955 604.4 7.8e-173 CCDS54627.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 397) 1506 312.8 4.1e-85 CCDS55820.1 VDR gene_id:7421|Hs108|chr12 ( 477) 972 205.5 1e-52 CCDS8757.1 VDR gene_id:7421|Hs108|chr12 ( 427) 965 204.0 2.5e-52 CCDS53409.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 319) 603 131.1 1.7e-30 CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 348) 603 131.1 1.8e-30 CCDS41430.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 352) 595 129.5 5.5e-30 CCDS41427.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 324) 583 127.1 2.7e-29 CCDS53408.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 306) 505 111.4 1.4e-24 CCDS44260.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 339) 497 109.8 4.6e-24 CCDS53410.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 311) 485 107.4 2.3e-23 CCDS44261.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 340) 485 107.4 2.4e-23 CCDS44584.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 387) 399 90.1 4.4e-18 CCDS44585.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 402) 399 90.1 4.5e-18 CCDS7929.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 447) 399 90.2 4.9e-18 CCDS73285.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 453) 399 90.2 5e-18 CCDS42593.1 NR1H2 gene_id:7376|Hs108|chr19 ( 460) 397 89.8 6.7e-18 CCDS53411.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 315) 371 84.4 1.8e-16 CCDS41429.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 357) 371 84.5 2e-16 CCDS2641.1 THRB gene_id:7068|Hs108|chr3 ( 461) 357 81.7 1.8e-15 CCDS9078.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 472) 350 80.3 4.8e-15 CCDS55875.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 482) 350 80.3 4.8e-15 CCDS55873.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 476) 339 78.1 2.2e-14 CCDS55876.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 486) 339 78.1 2.3e-14 CCDS2642.1 RARB gene_id:5915|Hs108|chr3 ( 448) 336 77.5 3.2e-14 CCDS6744.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9 ( 443) 335 77.3 3.7e-14 CCDS33718.1 NR1D2 gene_id:9975|Hs108|chr3 ( 579) 335 77.4 4.5e-14 CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 457) 333 76.9 5e-14 CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 443) 332 76.7 5.6e-14 CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 454) 332 76.7 5.7e-14 CCDS42316.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 410) 331 76.5 6e-14 CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs108|chr2 ( 598) 333 77.0 6.2e-14 CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9 ( 626) 333 77.0 6.4e-14 CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9 ( 637) 333 77.0 6.5e-14 CCDS58546.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 451) 331 76.5 6.5e-14 CCDS11360.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 490) 331 76.5 6.9e-14 CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 462) 330 76.3 7.6e-14 CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 382) 328 75.8 8.6e-14 CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 598) 330 76.4 9.4e-14 CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 611) 330 76.4 9.5e-14 CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 652) 330 76.4 1e-13 CCDS10179.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15 ( 556) 329 76.2 1e-13 CCDS68131.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 395) 327 75.7 1e-13 CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19 ( 404) 327 75.7 1e-13 CCDS13331.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 417) 327 75.7 1.1e-13 CCDS46604.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 442) 327 75.7 1.1e-13 CCDS74728.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 449) 327 75.7 1.1e-13 CCDS42876.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 452) 327 75.7 1.1e-13 CCDS46605.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 464) 327 75.7 1.2e-13 >>CCDS2995.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 (473 aa) initn: 3217 init1: 3217 opt: 3217 Z-score: 3500.7 bits: 657.1 E(32554): 1.1e-188 Smith-Waterman score: 3217; 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CCDS55 DCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILKRKEEEALKDSLRPK- 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KB7 LTEEQRMMIRELMDAQMKTFDTTFSHFKNFRLPGVLSSGC----ELPESLQAPSREEAAK :.:::. .: :.::. ::.: :.: : .:: : ...: :.: ..:: .. CCDS55 LSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSF--SGD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 WSQVRKDLC----SLKVSLQLRGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSLLPHMADMSTYMFKGI :. .: : .. : .. . : : . :. . .:.:::.::. .: .. . CCDS55 SSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 ISFAKVISYFRDLPIEDQISLLKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTWECGRLSYC--LED-T :.:::.: :::: :::: :::..:.:. .:: : :. . .: :: .: . : : CCDS55 IGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSDVT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 AGGFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQLHEEEYVLMQAISLFSPDRPGVLQHRVVDQLQEQFAI .: . :.::..::. ::::.:::::.::..:: . ::::::: . ... .:.... CCDS55 KAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQDAALIEAIQDRLSN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 TLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQDIHPFA----TPLMQE ::..::.: .: :. ..:. :.. :..:::.: .:... : ...: :::. : CCDS55 TLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQY-RCLSFQPECSMKLTPLVLE 420 430 440 450 460 470 470 pF1KB7 LFGITGS .:: CCDS55 VFGNEIS >>CCDS8757.1 VDR gene_id:7421|Hs108|chr12 (427 aa) initn: 969 init1: 297 opt: 965 Z-score: 1052.9 bits: 204.0 E(32554): 2.5e-52 Smith-Waterman score: 1050; 42.2% identity (70.8% similar) in 408 aa overlap (77-469:21-423) 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 SWNHADFVHCEDTESVPGKPSVNADEEVGGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRR :.:: ::::.:::.:::.:::::::::::: CCDS87 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRR 10 20 30 40 50 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 AMKRNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKR .:::.: . ::: .: :.::. .::.::::::..:.. :: ::.:..:: :...: .: . CCDS87 SMKRKALFTCPF-NGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILK 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 KKSERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELMDAQMKTFDTTFSHFKNFRLPGVLSSGC----E .: :.. . : . :.:::. .: :.::. ::.: :.: : .:: : ...: CCDS87 RKEEEALKDSLRPK-LSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPS 110 120 130 140 150 160 230 240 250 260 270 pF1KB7 LPESLQAPSREEAAKWSQVRKDLC----SLKVSLQLRGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSL :.: ..:: .. :. .: : .. : .. . : : . :. . .:. CCDS87 RPNSRHTPSF--SGDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSM 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 LPHMADMSTYMFKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISLLKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTW :::.::. .: .. .:.:::.: :::: :::: :::..:.:. .:: : :. . .: CCDS87 LPHLADLVSYSIQKVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSW 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 ECGRLSYC--LED-TAGGFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQLHEEEYVLMQAISLFSPDRPGV :: .: . : : .: . :.::..::. ::::.:::::.::..:: . ::::::: CCDS87 TCGNQDYKYRVSDVTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGV 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 LQHRVVDQLQEQFAITLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQD . ... .:.... ::..::.: .: :. ..:. :.. :..:::.: .:... : . CCDS87 QDAALIEAIQDRLSNTLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQY-RCLS 350 360 370 380 390 400 460 470 pF1KB7 IHPFA----TPLMQELFGITGS ..: :::. :.:: CCDS87 FQPECSMKLTPLVLEVFGNEIS 410 420 >>CCDS53409.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (319 aa) initn: 811 init1: 348 opt: 603 Z-score: 661.2 bits: 131.1 E(32554): 1.7e-30 Smith-Waterman score: 797; 39.3% identity (64.0% similar) in 364 aa overlap (105-467:7-317) 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 GGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRRAMKRNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQ ::..... ::: :.::... ::.: CCDS53 MLPKRSRRTVSKSIGPTCPF-AGSCEVSKTQRRHCP 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 ACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKRKKSERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELM ::::.:::..::.:.::.: ::. ::: ......: .: :..::. .:: :. 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CCDS53 LQEPEYVLLAAMALFSPDRPGVTQRDEIDQLQEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRFLYAKLL 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 pF1KB7 AMLTELRSINAQHTQRLLRIQDIHPFATPLMQELFGITGS ..:.:::::: . .. .:: . . ::.::. CCDS53 GLLAELRSINEAYGYQIQHIQGLSAMM-PLLQEICS 290 300 310 >>CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (348 aa) initn: 965 init1: 348 opt: 603 Z-score: 660.6 bits: 131.1 E(32554): 1.8e-30 Smith-Waterman score: 972; 42.2% identity (66.1% similar) in 389 aa overlap (80-467:11-346) 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 HADFVHCEDTESVPGKPSVNADEEVGGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRRAMK : ::::.:::::::..:::::::::::... CCDS12 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVS 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 RNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKRKKS .. ::: :.::... ::.: ::::.:::..::.:.::.: ::. ::: .... CCDS12 KSIGPTCPF-AGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRA 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 ERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELMDAQMKTFDTTFSHFKNFRLPGVLSSGCELPESLQA ..: .: :..::. .:: :. :. . . : : .: .:: :. : . : : CCDS12 QQTPVQ------LSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLFIHHQ-PLPTLA 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 PSREEAAKWSQVRKDLCSLKVSLQLRGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSLLPHMADMSTYM : .. :. :.::..:.: CCDS12 P--------------------------------------------VLPLVTHFADINTFM 160 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 FKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISLLKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTWECGRLSYCLED .:.:.: . ::.:::::::::::::: :.:.. .::.: .: .. :: : : .:: CCDS12 VLQVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCGPLRYTIED 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 TAG-GFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQLHEEEYVLMQAISLFSPDRPGVLQHRVVDQLQEQF : ::: .:: ...:: :.::::.: ::::. :..::::::::: :. .:::::.. CCDS12 GARVGFQVEFLELLFHFHGTLRKLQLQEPEYVLLAAMALFSPDRPGVTQRDEIDQLQEEM 230 240 250 260 270 280 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 AITLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQDIHPFATPLMQELF :.::.:::. .. .: :::. :....:.:::::: . .. .:: . . ::.::. CCDS12 ALTLQSYIKGQQRRPRDRFLYAKLLGLLAELRSINEAYGYQIQHIQGLSAMM-PLLQEIC 290 300 310 320 330 340 470 pF1KB7 GITGS CCDS12 S >>CCDS41430.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (352 aa) initn: 974 init1: 348 opt: 595 Z-score: 651.8 bits: 129.5 E(32554): 5.5e-30 Smith-Waterman score: 964; 41.7% identity (65.4% similar) in 393 aa overlap (80-467:11-350) 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 HADFVHCEDTESVPGKPSVNADEEVGGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRRAMK : ::::.:::::::..:::::::::::... CCDS41 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVS 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 RNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKRKKS .. ::: :.::... ::.: ::::.:::..::.:.::.: ::. ::: .... CCDS41 KSIGPTCPF-AGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRA 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 ERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELMDAQMKTFDTTFSHFKNFRLPGVLSSGCELPESLQA ..: .: :..::. .:: :. :. . . : : .: .:: :. : . : : CCDS41 QQTPVQ------LSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLFIHHQ-PLPTLA 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 PSREEAAKWSQVRKDLCSLKVSLQLRGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSLLPHMADMSTYM : .. :. :.::..:.: CCDS41 P--------------------------------------------VLPLVTHFADINTFM 160 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 FKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISLLKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTWECGRLSYCLED .:.:.: . ::.:::::::::::::: :.:.. .::.: .: .. :: : : .:: CCDS41 VLQVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCGPLRYTIED 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 TAG-----GFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQLHEEEYVLMQAISLFSPDRPGVLQHRVVDQL : ::: .:: ...:: :.::::.: ::::. :..::::::::: :. .::: CCDS41 GARVSPTVGFQVEFLELLFHFHGTLRKLQLQEPEYVLLAAMALFSPDRPGVTQRDEIDQL 230 240 250 260 270 280 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 QEQFAITLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQDIHPFATPLM ::..:.::.:::. .. .: :::. :....:.:::::: . .. .:: . . ::. CCDS41 QEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRFLYAKLLGLLAELRSINEAYGYQIQHIQGLSAMM-PLL 290 300 310 320 330 340 470 pF1KB7 QELFGITGS ::. CCDS41 QEICS 350 >>CCDS41427.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (324 aa) initn: 785 init1: 233 opt: 583 Z-score: 639.3 bits: 127.1 E(32554): 2.7e-29 Smith-Waterman score: 777; 38.8% identity (63.1% similar) in 369 aa overlap (105-467:7-322) 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 GGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRRAMKRNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQ ::..... ::: :.::... ::.: CCDS41 MLPKRSRRTVSKSIGPTCPF-AGSCEVSKTQRRHCP 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 ACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKRKKSERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELM ::::.:::..::.:.::.: ::. ::: ......: .: :..::. .:: :. CCDS41 ACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQTPVQ------LSKEQEELIRTLL 40 50 60 70 80 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 DAQMKTFDTTFSHFKNFRLPGVLSSGCELPESLQAPSREEAAKWSQVRKDLCSLKVSLQL :. . . : : .: .:: :. : . : :: CCDS41 GAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLFIHHQ-PLPTLAP------------------------ 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 RGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSLLPHMADMSTYMFKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISL .. :. :.::..:.: .:.:.: . ::.::::::::: CCDS41 --------------------VLPLVTHFADINTFMVLQVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISL 130 140 150 160 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 LKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTWECGRLSYCLEDTAG-GFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQ ::::: :.:.. .::.: .: .. :: : : .:: : ::: .:: ...:: :.::: CCDS41 LKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCGPLRYTIEDGARVGFQVEFLELLFHFHGTLRKLQ 170 180 190 200 210 220 380 390 400 410 420 pF1KB7 LHEEEYVLMQAISLFSP-----DRPGVLQHRVVDQLQEQFAITLKSYIECNRPQPAHRFL :.: ::::. :..:::: ::::: :. .:::::..:.::.:::. .. .: ::: CCDS41 LQEPEYVLLAAMALFSPAPYLTDRPGVTQRDEIDQLQEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRFL 230 240 250 260 270 280 430 440 450 460 470 pF1KB7 FLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQDIHPFATPLMQELFGITGS . :....:.:::::: . .. .:: . . ::.::. CCDS41 YAKLLGLLAELRSINEAYGYQIQHIQGLSAMM-PLLQEICS 290 300 310 320 >>CCDS53408.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (306 aa) initn: 709 init1: 258 opt: 505 Z-score: 554.9 bits: 111.4 E(32554): 1.4e-24 Smith-Waterman score: 699; 39.3% identity (62.8% similar) in 323 aa overlap (105-426:7-277) 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 GGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRRAMKRNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQ ::..... ::: :.::... ::.: CCDS53 MLPKRSRRTVSKSIGPTCPF-AGSCEVSKTQRRHCP 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 ACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKRKKSERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELM ::::.:::..::.:.::.: ::. ::: ......: .: :..::. .:: :. CCDS53 ACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQTPVQ------LSKEQEELIRTLL 40 50 60 70 80 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 DAQMKTFDTTFSHFKNFRLPGVLSSGCELPESLQAPSREEAAKWSQVRKDLCSLKVSLQL :. . . : : .: .:: :. : . : :: CCDS53 GAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLFIHHQ-PLPTLAP------------------------ 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 RGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSLLPHMADMSTYMFKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISL .. :. :.::..:.: .:.:.: . ::.::::::::: CCDS53 --------------------VLPLVTHFADINTFMVLQVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISL 130 140 150 160 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 LKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTWECGRLSYCLEDTAG-GFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQ ::::: :.:.. .::.: .: .. :: : : .:: : ::: .:: ...:: :.::: CCDS53 LKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCGPLRYTIEDGARVGFQVEFLELLFHFHGTLRKLQ 170 180 190 200 210 220 380 390 400 410 420 430 pF1KB7 LHEEEYVLMQAISLFSPDRPGVLQHRVVDQLQEQFAITLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIM :.: ::::. :..::::::::: :. .:::::..:.::.:::. .. .: : CCDS53 LQEPEYVLLAAMALFSPDRPGVTQRDEIDQLQEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRSPGTPWI 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 pF1KB7 AMLTELRSINAQHTQRLLRIQDIHPFATPLMQELFGITGS CCDS53 HWSGKMLGPKIGPGSKGAQWLQ 290 300 473 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 18:29:33 2016 done: Sat Nov 5 18:29:34 2016 Total Scan time: 3.250 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]