Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7650
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7650, 392 aa
1>>>pF1KB7650 392 - 392 aa - 392 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0410+/-0.00086; mu= 18.7996+/- 0.052
mean_var=80.6443+/-17.778, 0's: 0 Z-trim(106.6): 38 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.142819
statistics sampled from 9053 (9071) to 9053 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 392) 2746 575.6 2.6e-164
CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 334) 2276 478.7 3.3e-135
CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 384) 1802 381.1 9.2e-106
CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 392) 1776 375.8 3.8e-104
CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 ( 394) 1111 238.7 6.8e-63
CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 ( 380) 1094 235.2 7.5e-62
CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 ( 383) 1051 226.4 3.5e-59
>>CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (392 aa)
initn: 2746 init1: 2746 opt: 2746 Z-score: 3063.3 bits: 575.6 E(32554): 2.6e-164
Smith-Waterman score: 2746; 99.7% identity (99.7% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
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CCDS88 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
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CCDS88 RLLFERFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
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CCDS88 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEED
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB7 VTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
370 380 390
>>CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (334 aa)
initn: 2276 init1: 2276 opt: 2276 Z-score: 2540.9 bits: 478.7 E(32554): 3.3e-135
Smith-Waterman score: 2276; 99.4% identity (99.7% similar) in 328 aa overlap (65-392:7-334)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFVRLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEK
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CCDS61 MMKPRPKRFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCI
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDF
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 IFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARI
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CCDS61 IFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARI
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ALKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
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CCDS61 ALKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
280 290 300 310 320 330
>>CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (384 aa)
initn: 1783 init1: 1673 opt: 1802 Z-score: 2012.3 bits: 381.1 E(32554): 9.2e-106
Smith-Waterman score: 1802; 65.1% identity (88.6% similar) in 370 aa overlap (15-384:7-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
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CCDS22 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEAT-FPQAEDLYLAFPLAFCIFMV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
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CCDS22 RLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
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CCDS22 SIQRWFRQRRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
:::.. :..:::.::.:::::::::::::::::: :::.::::.: ::.:::.:::.:::
CCDS22 QPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
::..:::: .: ::::::.:::::.:..:: :::.:..::..:::::.:.:.::::::::
CCDS22 TLVLCLHDSADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFES
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEED
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CCDS22 WEIVGPYPSWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKVSKDDRSDIESSSDEED
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB7 VTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
:.: ....::.. .::..
CCDS22 SEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
360 370 380
>>CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (392 aa)
initn: 1775 init1: 1537 opt: 1776 Z-score: 1983.2 bits: 375.8 E(32554): 3.8e-104
Smith-Waterman score: 1776; 63.8% identity (86.8% similar) in 378 aa overlap (15-384:7-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
:.:.::::::.::.::::.. .. .:... . .:::: ::.:
CCDS58 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEAT-FPQAEDLYLAFPLAFCIFMV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
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CCDS58 RLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
.:: :::.::::.:: :::.::::::::.::: .: ::.::: ..::.:. :.::.:::.
CCDS58 SIQRWFRQRRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
:::.. :..:::.::.:::::::::::::::::: :::.::::.: ::.:::.:::.:::
CCDS58 QPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
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CCDS58 TLVLCLHDSADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFES
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGK--------VSKDDRSDV
:::.::: :::..: ::: .: :. .:::::..:: ::. ::: ::::::::.
CCDS58 WEIVGPYPSWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 ESSSEEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
::::.::: :.: ....::.. .::..
CCDS58 ESSSDEEDSEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
360 370 380 390
>>CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 (394 aa)
initn: 1168 init1: 1005 opt: 1111 Z-score: 1242.6 bits: 238.7 E(32554): 6.8e-63
Smith-Waterman score: 1111; 43.9% identity (70.9% similar) in 371 aa overlap (9-379:2-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
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CCDS12 MLSSFNEWFWQDRFWLPPNVTWTELED-RDGRVYPHPQDLLAALPLALVLLAM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
:: :::::. : . .:..:. :..::: ::: :.. . : . .: :. : ...
CCDS12 RLAFERFIGLPLSRWLGVRDQTRRQVKPNATLEKHFLTEGHRPKEPQLSLLAAQCGLTLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
. : :::.:::::.: ::::. ::: ::: : :. :. :.: .:: ::
CCDS12 QTQRWFRRRRNQDRPQLTKKFCEASWRFLFYLSSFVGGLSVLYHESWLWAPVMCWDRYPN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
: :. .:: .:..::.:: ::.. :.::::: . .::.:.. :..::: :..:.:
CCDS12 QTLKPSLYWWYLLELGFYLSLLIRLPFDVKRKDFKEQVIHHFVAVILMTFSYSANLLRIG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
.:.. ::: ::.:::: :..:: .::..::.::.::: ::. ::: ..: :: :: .::
CCDS12 SLVLLLHDSSDYLLEACKMVNYMQYQQVCDALFLIFSFVFFYTRLVLFPTQILYTTYYES
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEED
::. .....::::. ::::::.:: :: :. . . .:.. :: ::::: :. :.
CCDS12 ISNRGPFFGYYFFNGLLMLLQLLHVFWSCLILRMLYSFMKKGQMEKDIRSDVEESDSSEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB7 VTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
... . .... :. :
CCDS12 AAAAQEPLQLKNGAAGGPRPAPTDGPRSRVAGRLTNRHTTAT
360 370 380 390
>>CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 (380 aa)
initn: 1053 init1: 953 opt: 1094 Z-score: 1223.9 bits: 235.2 E(32554): 7.5e-62
Smith-Waterman score: 1094; 45.2% identity (73.7% similar) in 354 aa overlap (9-360:2-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
:. :. ..: ::.::: :..::::: :: : .. . ..::: ...:
CCDS97 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLED-RDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
: .:: ..: : : ..:... .: ::: ::. ... : : . ..: ::.: . :
CCDS97 RYFFELYVATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
... :::.:::::.: : :: :. ::::::: : :. . ..:::.:... :..::.
CCDS97 QVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
: . : ::..::.:::::.:: .:.::::: ...::..:: :::::.. :..:.:
CCDS97 QSTIPSQYWYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
:::: ::: ::.:::.::. ::: .. :...:..:. ::..::: : :::::. ::
CCDS97 TLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVES--SSEE
:. . .....:... .:::::..:.::: :.: : .: ::. .:.::: : :::
CCDS97 LELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHK-FITGKLVEDERSDREETESSEG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 EDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
:.
CCDS97 EEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHRKND
360 370 380
>>CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 (383 aa)
initn: 990 init1: 841 opt: 1051 Z-score: 1176.0 bits: 226.4 E(32554): 3.5e-59
Smith-Waterman score: 1051; 43.1% identity (71.1% similar) in 353 aa overlap (11-360:1-350)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MATAAQGPLSLLWG---WLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGI
..: :.: :::::: ...:.::: :: . . :. ..: : .
CCDS10 MFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDH-DGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFVRLLFERFIAKPCALRIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDW
...: .::.:.:.: : .::... .. ::..::. : :. : . . ::.:. .
CCDS10 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKET-VRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHN
. :... ::: ::::..: : :: :. :::.::: : :: ::...::..:. . :..
CCDS10 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMV
:: ::: . : :::.:..:::::.: :.:::::: ..:::..:.:.:::. :..
CCDS10 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTL
: :::.: .:::.:. ::.::. .:: . . :.::: :::..:...:: ..::::: ::
CCDS10 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 FESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSSE
. . :. :. .:: :. ::.::. :.: : .. :. : : .: ::: :. :
CCDS10 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKM-LNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
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::.
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