Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7395
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7395, 221 aa
1>>>pF1KB7395 221 - 221 aa - 221 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4985+/-0.0011; mu= 0.4869+/- 0.066
mean_var=195.9279+/-39.305, 0's: 0 Z-trim(110.4): 43 B-trim: 169 in 1/51
Lambda= 0.091628
statistics sampled from 11527 (11566) to 11527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5519.2 SEPT14 gene_id:346288|Hs108|chr7 ( 432) 1459 204.9 6.7e-53
CCDS82496.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 450) 994 143.4 2.2e-34
CCDS82497.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 544) 994 143.5 2.6e-34
CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 431) 988 142.6 3.7e-34
CCDS46383.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 454) 988 142.6 3.8e-34
CCDS34018.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 429) 907 131.9 6.2e-31
CCDS77931.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 439) 907 131.9 6.3e-31
CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 440) 876 127.8 1.1e-29
CCDS43359.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 442) 876 127.8 1.1e-29
CCDS47262.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 369) 870 126.9 1.6e-29
CCDS43360.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 429) 870 127.0 1.8e-29
CCDS14585.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 427) 869 126.9 2e-29
CCDS14583.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 429) 869 126.9 2e-29
CCDS43358.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 483) 870 127.0 2e-29
CCDS14584.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 434) 869 126.9 2e-29
CCDS75582.1 SEPT7 gene_id:989|Hs108|chr7 ( 401) 472 74.4 1.2e-13
>>CCDS5519.2 SEPT14 gene_id:346288|Hs108|chr7 (432 aa)
initn: 1459 init1: 1459 opt: 1459 Z-score: 1063.2 bits: 204.9 E(32554): 6.7e-53
Smith-Waterman score: 1459; 100.0% identity (100.0% similar) in 221 aa overlap (1-221:212-432)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
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CCDS55 NLDSKVNIIPLIAKADTISKNDLQTFKNKIMSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQLS
370 380 390 400 410 420
220
pF1KB7 TDTKKDKHRKK
:::::::::::
CCDS55 TDTKKDKHRKK
430
>>CCDS82496.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 (450 aa)
initn: 1018 init1: 969 opt: 994 Z-score: 730.8 bits: 143.4 E(32554): 2.2e-34
Smith-Waterman score: 994; 66.2% identity (87.6% similar) in 225 aa overlap (1-221:226-450)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
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CCDS82 NLDSKVNIIPVIAKADTVSKTELQKFKIKLMSELVSNGVQIYQFPTDDDTIAKVNAAMNG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
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CCDS82 QLPFAVVGSMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLICTNMEDLREQTH
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
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CCDS82 TRHYELYRRCKLEEMGFTDVGPENKPVSVQETYEAKRHEFHGERQRKEEEMKQMFVQRVK
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQ--
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CCDS82 EKEAILKEAERELQAKFEHLKRLHQEERMKLEEKRRLLEEEIIAFSKKKATSEIFHSQSF
380 390 400 410 420 430
210 220
pF1KB7 LSTDT--KKDKHRKK
:.: . .::: :::
CCDS82 LATGSNLRKDKDRKK
440 450
>>CCDS82497.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 (544 aa)
initn: 999 init1: 969 opt: 994 Z-score: 729.6 bits: 143.5 E(32554): 2.6e-34
Smith-Waterman score: 994; 66.2% identity (87.6% similar) in 225 aa overlap (1-221:226-450)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
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CCDS82 NLDSKVNIIPVIAKADTVSKTELQKFKIKLMSELVSNGVQIYQFPTDDDTIAKVNAAMNG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
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CCDS82 QLPFAVVGSMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLICTNMEDLREQTH
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
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CCDS82 TRHYELYRRCKLEEMGFTDVGPENKPVSVQETYEAKRHEFHGERQRKEEEMKQMFVQRVK
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQ--
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CCDS82 EKEAILKEAERELQAKFEHLKRLHQEERMKLEEKRRLLEEEIIAFSKKKATSEIFHSQSF
380 390 400 410 420 430
210 220
pF1KB7 LSTDT--KKDKHRKK
:.: . .::: :::
CCDS82 LATGSNLRKDKDRKKEPGCRFELLCIDVRACETNGGRKDAEKAPIFCKTEVPEHRRSSSQ
440 450 460 470 480 490
>>CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 (431 aa)
initn: 1012 init1: 969 opt: 988 Z-score: 726.7 bits: 142.6 E(32554): 3.7e-34
Smith-Waterman score: 988; 66.1% identity (87.5% similar) in 224 aa overlap (1-220:203-426)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
::::.:::.::::.:::..: :..:....:
CCDS42 NLDSKVNIIPVIAKADTVSKTELQKFKIKLMSELVSNGVQIYQFPTDDDTIAKVNAAMNG
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
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CCDS42 QLPFAVVGSMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLICTNMEDLREQTH
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
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CCDS42 TRHYELYRRCKLEEMGFTDVGPENKPVSVQETYEAKRHEFHGERQRKEEEMKQMFVQRVK
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQ--
:::: .::::.::: :::::: ..::: ::::... :: ::: : : ::.:: ...:
CCDS42 EKEAILKEAERELQAKFEHLKRLHQEERMKLEEKRRLLEEEIIAFSKKKATSEIFHSQSF
360 370 380 390 400 410
210 220
pF1KB7 LSTDT--KKDKHRKK
:.: . .::: ::
CCDS42 LATGSNLRKDKDRKNSNFL
420 430
>>CCDS46383.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 (454 aa)
initn: 1012 init1: 969 opt: 988 Z-score: 726.4 bits: 142.6 E(32554): 3.8e-34
Smith-Waterman score: 988; 66.1% identity (87.5% similar) in 224 aa overlap (1-220:226-449)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
::::.:::.::::.:::..: :..:....:
CCDS46 NLDSKVNIIPVIAKADTVSKTELQKFKIKLMSELVSNGVQIYQFPTDDDTIAKVNAAMNG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
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CCDS46 QLPFAVVGSMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLICTNMEDLREQTH
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
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CCDS46 TRHYELYRRCKLEEMGFTDVGPENKPVSVQETYEAKRHEFHGERQRKEEEMKQMFVQRVK
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQ--
:::: .::::.::: :::::: ..::: ::::... :: ::: : : ::.:: ...:
CCDS46 EKEAILKEAERELQAKFEHLKRLHQEERMKLEEKRRLLEEEIIAFSKKKATSEIFHSQSF
380 390 400 410 420 430
210 220
pF1KB7 LSTDT--KKDKHRKK
:.: . .::: ::
CCDS46 LATGSNLRKDKDRKNSNFL
440 450
>>CCDS34018.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 (429 aa)
initn: 980 init1: 888 opt: 907 Z-score: 668.9 bits: 131.9 E(32554): 6.2e-31
Smith-Waterman score: 907; 59.8% identity (85.7% similar) in 224 aa overlap (1-220:201-424)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
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CCDS34 KLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSV
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
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CCDS34 HLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTH
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
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CCDS34 TRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVK
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQL-
:::: .:::::::..::. :: .::: .:.:..::.:: :. .: : :::.. ::.:
CCDS34 EKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQ
360 370 380 390 400 410
210 220
pF1KB7 ---STDTKKDKHRKK
. .::::: .:
CCDS34 QSGAQQTKKDKDKKNASFT
420
>>CCDS77931.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 (439 aa)
initn: 980 init1: 888 opt: 907 Z-score: 668.8 bits: 131.9 E(32554): 6.3e-31
Smith-Waterman score: 907; 59.8% identity (85.7% similar) in 224 aa overlap (1-220:211-434)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
::::.:::.::::.::::::.:. :...:
CCDS77 KLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSV
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
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CCDS77 HLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTH
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
:.::: :: ::..::: :. :...: :.:: .::::.:: . :..:::..: :..:::
CCDS77 TRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVK
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQL-
:::: .:::::::..::. :: .::: .:.:..::.:: :. .: : :::.. ::.:
CCDS77 EKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQ
370 380 390 400 410 420
210 220
pF1KB7 ---STDTKKDKHRKK
. .::::: .:
CCDS77 QSGAQQTKKDKDKKNASFT
430
>>CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 (440 aa)
initn: 870 init1: 870 opt: 876 Z-score: 646.6 bits: 127.8 E(32554): 1.1e-29
Smith-Waterman score: 876; 57.5% identity (82.7% similar) in 226 aa overlap (1-221:202-427)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
:.::.:::.::::.:::.:..:. :. ...
CCDS75 KLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNA
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
:::::::::.:::::...::.:.:::::.::::::::::::::.::. .:::.:.:.::
CCDS75 HLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTH
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
..::: :: ::..::: : ..:: :.:: .::::.:: .. ::.:::..: :...::
CCDS75 SRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVK
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQLS
: : .:: :.::..:::::: ..::: ::.::....:: : : . ::: ::::.:
CCDS75 ETELELKEKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQAL
360 370 380 390 400 410
220
pF1KB7 TDT-----KKDKHRKK
: .::: .::
CCDS75 HATSQQPLRKDKDKKKASGWSSIYSVTIP
420 430 440
>>CCDS43359.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 (442 aa)
initn: 870 init1: 870 opt: 876 Z-score: 646.6 bits: 127.8 E(32554): 1.1e-29
Smith-Waterman score: 876; 57.5% identity (82.7% similar) in 226 aa overlap (1-221:204-429)
10 20 30
pF1KB7 MSELISNGIQIYQLPTDEETAAQANSSVSG
:.::.:::.::::.:::.:..:. :. ...
CCDS43 KLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNA
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLPFAVVGSTDEVKVGKRMVRGRHYPWGVLQVENENHCDFVKLRDMLLCTNMENLKEKTH
:::::::::.:::::...::.:.:::::.::::::::::::::.::. .:::.:.:.::
CCDS43 HLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTH
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TQHYECYRYQKLQKMGFTDVGPNNQPVSFQEIFEAKRQEFYDQCQREEEELKQRFMQRVK
..::: :: ::..::: : ..:: :.:: .::::.:: .. ::.:::..: :...::
CCDS43 SRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVK
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 EKEATFKEAEKELQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQLS
: : .:: :.::..:::::: ..::: ::.::....:: : : . ::: ::::.:
CCDS43 ETELELKEKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQAL
360 370 380 390 400 410
220
pF1KB7 TDT-----KKDKHRKK
: .::: .::
CCDS43 HATSQQPLRKDKDKKKASGWSSIYSVTIP
420 430 440
>>CCDS47262.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 (369 aa)
initn: 870 init1: 870 opt: 870 Z-score: 643.4 bits: 126.9 E(32554): 1.6e-29
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10 20 30
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..::: :: ::..::: : ..:: :.:: .::::.:: .. ::.:::..: :...::
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:... ::
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360
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]