Result of FASTA (omim) for
pF1KB7387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7387, 430 aa
1>>>pF1KB7387 430 - 430 aa - 430 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9261+/-0.000749; mu= 10.7560+/- 0.046
mean_var=280.3380+/-54.783, 0's: 0 Z-trim(111.9): 2113 B-trim: 112 in 2/49
Lambda= 0.076601
statistics sampled from 18279 (20658) to 18279 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 8.540
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_872439 (OMIM: 616181) zinc finger protein 713 [ ( 443) 2996 345.7 1.4e-94
NP_066575 (OMIM: 194532) zinc finger protein 8 [Ho ( 575) 1093 135.5 3.4e-31
NP_003432 (OMIM: 194648,615226) zinc finger protei ( 474) 1069 132.7 1.9e-30
XP_016864080 (OMIM: 194648,615226) PREDICTED: zinc ( 534) 1069 132.8 2e-30
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1056 131.5 5.8e-30
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1041 129.8 1.9e-29
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1012 126.5 1.6e-28
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1012 126.6 1.7e-28
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1012 126.6 1.7e-28
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1012 126.6 1.7e-28
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1012 126.7 1.8e-28
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1012 126.7 1.8e-28
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1012 126.7 1.8e-28
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1012 126.7 1.8e-28
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1012 126.7 1.8e-28
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1012 126.7 1.8e-28
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1012 126.7 1.8e-28
NP_067645 (OMIM: 605422) zinc finger protein 350 [ ( 532) 981 123.1 1.7e-27
XP_016882587 (OMIM: 605422) PREDICTED: zinc finger ( 532) 981 123.1 1.7e-27
XP_016882589 (OMIM: 605422) PREDICTED: zinc finger ( 532) 981 123.1 1.7e-27
XP_016882588 (OMIM: 605422) PREDICTED: zinc finger ( 532) 981 123.1 1.7e-27
NP_075562 (OMIM: 611903) zinc finger protein 649 [ ( 505) 969 121.7 4.2e-27
XP_005258907 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 969 121.8 4.4e-27
NP_001139137 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 570) 969 121.8 4.4e-27
XP_016882228 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 969 121.8 4.4e-27
XP_006723246 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 571) 957 120.5 1.1e-26
XP_005258906 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 571) 957 120.5 1.1e-26
NP_001025168 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 571) 957 120.5 1.1e-26
NP_001265050 (OMIM: 602240) zinc finger protein wi ( 391) 953 119.8 1.2e-26
XP_011513176 (OMIM: 602240) PREDICTED: zinc finger ( 391) 953 119.8 1.2e-26
NP_001265051 (OMIM: 602240) zinc finger protein wi ( 391) 953 119.8 1.2e-26
XP_011513175 (OMIM: 602240) PREDICTED: zinc finger ( 391) 953 119.8 1.2e-26
XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 566) 953 120.0 1.5e-26
XP_011513172 (OMIM: 602240) PREDICTED: zinc finger ( 578) 953 120.1 1.5e-26
NP_001265048 (OMIM: 602240) zinc finger protein wi ( 578) 953 120.1 1.5e-26
NP_006289 (OMIM: 602240) zinc finger protein with ( 578) 953 120.1 1.5e-26
XP_016866755 (OMIM: 602240) PREDICTED: zinc finger ( 578) 953 120.1 1.5e-26
XP_016882229 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 585) 953 120.1 1.5e-26
NP_001264878 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001099020 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001264880 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001264875 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001264876 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001264881 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001099021 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001099022 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
XP_016882440 (OMIM: 194558) PREDICTED: zinc finger ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001264877 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_001099019 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 949 119.5 2e-26
NP_060770 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 [H ( 516) 949 119.5 2e-26
>>NP_872439 (OMIM: 616181) zinc finger protein 713 [Homo (443 aa)
initn: 2996 init1: 2996 opt: 2996 Z-score: 1818.8 bits: 345.7 E(85289): 1.4e-94
Smith-Waterman score: 2996; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:14-443)
10 20 30 40
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MPSQNAVFSQEGNMEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 MLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNIS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 DENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQERSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 DENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQERSL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ECNKFAENCNLNSNLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 ECNKFAENCNLNSNLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSEC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GKIFNQHILLTDHIHTAEKPSECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GKIFNQHILLTDHIHTAEKPSECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 HRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 HRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIH
370 380 390 400 410 420
410 420 430
pF1KB7 TREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
:::::::::::::::::::::::
NP_872 TREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
430 440
>>NP_066575 (OMIM: 194532) zinc finger protein 8 [Homo s (575 aa)
initn: 1380 init1: 691 opt: 1093 Z-score: 681.1 bits: 135.5 E(85289): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 1093; 40.9% identity (67.1% similar) in 435 aa overlap (6-428:12-440)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDVMLENYRN
:. : .: :: .::.:::::::.::: :: :.:. ::::::::.. .
NP_066 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LVALGYQLCKPEVIAQLELEEE-WVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNISDENQTH
:...: .: :::::.::: : :: :: . :: : : : . : ... .:. .:
NP_066 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPSH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKI-TQERSLECNKF
: . :. . . :: : . . . ... : :. . :. .:... . ..
NP_066 VTGREGFPTDAPYPTTLGK--DRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 AENCNLNSNLMQQRIPSI---KIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGK
::: :.:. . .: : . . :.: .. .:::.:. : . . : : :.: .
NP_066 RENCVLSSS--PNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENSDCHR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 IFNQHILLTDHIHTA--EKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQ
.: : .:. .. .:: ..:::.:.:.. :. . . :::.:: : :::: :::
NP_066 DSSQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGKAFSQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSL
:.::.:::::.::. : :::.: . . .: : :::::::::.:..::.::.. .::
NP_066 NSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQNSSL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHR
.:.: ::::::: :. :::.::. : : : :::: :.::.::.:::.: .:. : ::.
NP_066 GRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KB7 KIHTREKLCEYKCEQTV--RHSPSFSST
. :. :: ..:.: . ...:...
NP_066 RKHAGEK--PFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQCGK
420 430 440 450 460 470
>>NP_003432 (OMIM: 194648,615226) zinc finger protein 14 (474 aa)
initn: 2067 init1: 748 opt: 1069 Z-score: 667.6 bits: 132.7 E(85289): 1.9e-30
Smith-Waterman score: 1069; 42.6% identity (70.0% similar) in 413 aa overlap (17-419:2-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDVMLENYRNLVALGY
: :::.:::..:. ::: : : :.:::::::::::::::.::
NP_003 MELLTFRDVAIEFSPEEWKCLDPDQQNLYRDVMLENYRNLVSLGV
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 QLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIM---
. .:.... :: ..: . . ..: . . :.: :.. :..:.
NP_003 AISNPDLVTCLEQRKEPYNVKIHKIVARPPAMCSHFTQDHWPVQGI--EDSFHKLILRRY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQER-SLEC-NKFAEN
:. . :.. .. : ... . .... ..... .. :..:: : . :.. .::.
NP_003 EKCGHDNL--QLRKGCKSLN-ECKLQKGGYNEFNECLSTTQSKILQCKASVKVVSKFS--
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CNLNSNLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHI
::: . : . : . :.:... : : .. .. : :: :::: :. .
NP_003 ---NSNKRKTRHTGEK---HFKECGKSFQKFSHLTQHKVIHAGEKPYTCEECGKAFKWSL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LLTDH--IHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQ
....: :::.::: :::. :. .: ... ... ::::::::.:::: :.. : .
NP_003 IFNEHKRIHTGEKPFTCEECGSIFTTSSHFAKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRFTTLTK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 HQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRL
:.:::.::::. :. : : : . :.:..: :::::::::::..:::::.: :.::.:.:.
NP_003 HKRIHAGEKPITCEECRKIFTSSSNFAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTTLTKHKRI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTRE
::::::: : ::::: : ..::.:...::::.::::.::::::..: ::.:.:::: :
NP_003 HTGEKPYTCEECGKAFRQSSKLNEHKKVHTGERPYKCDECGKAFGRSRVLNEHKKIHTGE
340 350 360 370 380 390
420 430
pF1KB7 KLCEYKCEQTVRHSPSFSST
: ::::.
NP_003 K--PYKCEECGKAFRRSTDRSQHKKIHSADKPYKCKECDKAFKQFSLLSQHKKIHTVDKP
400 410 420 430 440 450
>--
initn: 322 init1: 322 opt: 322 Z-score: 221.5 bits: 50.2 E(85289): 1.3e-05
Smith-Waterman score: 322; 53.3% identity (84.0% similar) in 75 aa overlap (334-408:400-474)
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCG
::::: : :. ..:...:...:::.: :
NP_003 DECGKAFGRSRVLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFRRSTDRSQHKKIHSADKPYKCKECD
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRH
:::.: . :.::.. :: .:::::..: :::.. .:::.:.::::
NP_003 KAFKQFSLLSQHKKIHTVDKPYKCKDCDKAFKRFSHLNKHKKIHT
430 440 450 460 470
430
pF1KB7 SPSFSST
>>XP_016864080 (OMIM: 194648,615226) PREDICTED: zinc fin (534 aa)
initn: 2067 init1: 748 opt: 1069 Z-score: 667.1 bits: 132.8 E(85289): 2e-30
Smith-Waterman score: 1069; 42.6% identity (70.0% similar) in 413 aa overlap (17-419:62-459)
10 20 30 40
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRD
: :::.:::..:. ::: : : :.:::::
XP_016 LIGSAENAMFEDDDWWSWDEKYLCCDNGVGELLTFRDVAIEFSPEEWKCLDPDQQNLYRD
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VMLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNI
::::::::::.:: . .:.... :: ..: . . ..: . . :.:
XP_016 VMLENYRNLVSLGVAISNPDLVTCLEQRKEPYNVKIHKIVARPPAMCSHFTQDHWPVQGI
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SDENQTHEMIM---ERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQ
:.. :..:. :. . :.. .. : ... . .... ..... .. :..:: :
XP_016 --EDSFHKLILRRYEKCGHDNL--QLRKGCKSLN-ECKLQKGGYNEFNECLSTTQSKILQ
160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ER-SLEC-NKFAENCNLNSNLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETP
. :.. .::. ::: . : . : . :.:... : : .. .. : :
XP_016 CKASVKVVSKFS-----NSNKRKTRHTGEK---HFKECGKSFQKFSHLTQHKVIHAGEKP
210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KB7 YEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCD
: :::: :. .....: :::.::: :::. :. .: ... ... ::::::::.
XP_016 YTCEECGKAFKWSLIFNEHKRIHTGEKPFTCEECGSIFTTSSHFAKHKIIHTGEKPYKCE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 ECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGK
:::: :.. : .:.:::.::::. :. : : : . :.:..: :::::::::::..:::
XP_016 ECGKAFNRFTTLTKHKRIHAGEKPITCEECRKIFTSSSNFAKHKRIHTGEKPYKCEECGK
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 AFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQ
::.: :.::.:.:.::::::: : ::::: : ..::.:...::::.::::.::::::..
XP_016 AFNRSTTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFRQSSKLNEHKKVHTGERPYKCDECGKAFGR
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430
pF1KB7 SAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
: ::.:.:::: :: ::::.
XP_016 SRVLNEHKKIHTGEK--PYKCEECGKAFRRSTDRSQHKKIHSADKPYKCKECDKAFKQFS
440 450 460 470 480 490
>--
initn: 322 init1: 322 opt: 322 Z-score: 221.0 bits: 50.3 E(85289): 1.4e-05
Smith-Waterman score: 322; 53.3% identity (84.0% similar) in 75 aa overlap (334-408:460-534)
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCG
::::: : :. ..:...:...:::.: :
XP_016 DECGKAFGRSRVLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFRRSTDRSQHKKIHSADKPYKCKECD
430 440 450 460 470 480
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRH
:::.: . :.::.. :: .:::::..: :::.. .:::.:.::::
XP_016 KAFKQFSLLSQHKKIHTVDKPYKCKDCDKAFKRFSHLNKHKKIHT
490 500 510 520 530
430
pF1KB7 SPSFSST
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 794 init1: 794 opt: 1056 Z-score: 658.9 bits: 131.5 E(85289): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 1056; 42.8% identity (66.4% similar) in 423 aa overlap (19-428:4-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDVMLENYRNLVALGY
:::.:::..:. .::. : ::.::::.:::::::::: ::
NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 QLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIMER
. ::..:. :: .: : ..: .. ..: . :::.: : .. ..:
NP_003 TVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQ--KVTLKR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAGDSFWYSIL-GGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKIT--QERSLECNKFAENC
. : : ..: . . :: : . .. .: : . ..:.:...
NP_003 YGKCRHENLPLRKGCESMD-----ECKMHK---GGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVA
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NLNSNLMQQRI-PSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHI
. :: ...: . : :.. :.:. : : .. ..: . :. :::: ::
NP_003 HKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LLTDH--IHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQ
:: : :::.::: ::::::...:.: . . . ::::::::.:::: :.. :
NP_003 TLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 HQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRL
:. :::::::. :. ::::: . :..: : .::::::::::..:::::.. ..:: :. .
NP_003 HKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKII
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTRE
:::::::.: :::::.: .::. :: :::::::::..:::::.. .::. :. ::: :
NP_003 HTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGE
340 350 360 370 380 390
420 430
pF1KB7 KLCEYKCEQ---TVRHSPSFSST
: :::.. . .:: ...
NP_003 K--PYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKP
400 410 420 430 440 450
>--
initn: 700 init1: 700 opt: 724 Z-score: 460.6 bits: 94.8 E(85289): 6.4e-19
Smith-Waterman score: 724; 56.0% identity (82.3% similar) in 175 aa overlap (241-412:419-593)
220 230 240 250 260
pF1KB7 YYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDHIHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLL
:::.::: .:: :::...:.:.. . .
NP_003 KIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIH
390 400 410 420 430 440
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEK
::::::.:..::: :.: .: .:.. :: :::. :. :::.:. :..: : ::::::
NP_003 TGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEK
450 460 470 480 490 500
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 PYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKC
::::..:::::.. ..::.:...::::::: : :::::.: ..:..:.: :::::::::
NP_003 PYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKC
510 520 530 540 550 560
390 400 410 420 430
pF1KB7 NECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
.:: :::. :. :..:. ::: :::
NP_003 EECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
570 580 590
>>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa)
initn: 757 init1: 757 opt: 1041 Z-score: 649.7 bits: 129.8 E(85289): 1.9e-29
Smith-Waterman score: 1050; 42.3% identity (67.1% similar) in 426 aa overlap (19-428:4-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDVMLENYRNLVALGY
:::.:::..:. .::. : ::.::::.:::::::::: ::
NP_001 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 QLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIMER
. ::..:. :: .: : ..: .. ..: : :. .: : . .:.
NP_001 TVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTG---------CLSKRMSYELLRKVYILML
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAGDSFWYS---ILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQERSLECNKFAEN-
: : :. :. . . : :: .: : . .::: . ....: : :.
NP_001 LR--SVLYASVRIMCSHFAQDLWPE---QNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESM
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KB7 --CNLNS---NLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHN-SDLIYYQGNYVRETPYEYSECGK
:.... : ..: . . . . . . .. :. :. .. .... :.. ..:::
NP_001 DECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGK
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 IFNQHILLTDH--IHTA---EKPSECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQ
:.. ::.: ::: : ::::::. .:.:.. . . ::::::::.:::: :.:
NP_001 SFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQ
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSL
.::.:..:::::::. :. :::.: . :..: : ::::::::::..:::::.: ..:
NP_001 SSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHR
: :...:::::::.: :::::.: ..:. :. :::::::::..:::::.:::::. :.
NP_001 TTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHE
340 350 360 370 380 390
410 420 430
pF1KB7 KIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
::: :: ::::. . ::
NP_001 VIHTGEK--PYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKII
400 410 420 430 440
>--
initn: 735 init1: 735 opt: 784 Z-score: 496.2 bits: 101.4 E(85289): 6.7e-21
Smith-Waterman score: 786; 54.8% identity (79.9% similar) in 199 aa overlap (219-412:425-623)
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEK
: ::. .:::: :.. :: : :::.::
NP_001 TGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEK
400 410 420 430 440 450
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 P---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFIC
: .:: :::...:.:.. . . ::::::.:..::: :.: .: .:.. :: :::. :
NP_001 PYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKC
460 470 480 490 500 510
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCG
. :::.:. :..: : ::::::::::..:::::.. ..::.:...::::::: : ::
NP_001 EECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECG
520 530 540 550 560 570
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRH
:::.: ..:..:.: :::::::::.:: :::. :. :..:. ::: :::
NP_001 KAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
580 590 600 610 620
430
pF1KB7 SPSFSST
>>NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [Homo (542 aa)
initn: 1960 init1: 700 opt: 1012 Z-score: 633.0 bits: 126.5 E(85289): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 1012; 42.9% identity (66.6% similar) in 413 aa overlap (19-419:35-433)
10 20 30 40
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDVM
:::.:::..:. :::. : ::..::: ::
NP_775 RYGMCPLKGASGCPGAERSLLVQSYFEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDSAQQGLYRKVM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 LENYRNLVAL-GYQLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPDGENR-PEIKKSTTSQN
:::::::: : : : ::..:. :: .: : :.: .. : .. :. . :.
NP_775 LENYRNLVFLAGIALTKPDLITCLEQGKEPWNIKRHEMVAKPPVICSHFPQ--DLWAEQD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ISDENQTHEMIMERLAG---DSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKIT
:.: : : :... . :.. .. : . : . . ..: : :.: .: :
NP_775 IKDSFQ--EAILKKYGKYGHDNL--QLQKGCKSVD-ECKVHKE-HDNKLNQCLIT----T
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 QERSLECNKFAENCNLNSNLMQQRI-PSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETP
: ..:. :. . :: ...: . : :.. .:. : .. .. :.
NP_775 QSNIFQCDPSAKVFHTFSNSNRHKIRHTRKKPFKCKKCEKSFCMLLHLTQHKRFHITENS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB7 YEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCD
:. ..::: :: :: : :::.::: ::::::...: :. ... ::::::.:.
NP_775 YQCKDCGKAFNWFSTLTTHRRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYRCE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 ECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGK
:::: :.. :: :.::::: ::. :. ::::: . : .: : ::::::::::..:::
NP_775 ECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGVKPYKCTECGKAFNRSSHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 AFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQ
::.. ..:: :. :.:::::.: ::::: . ..:..:. .::::: :::.::::.:.
NP_775 AFNQSSTLTTHKITHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKTSHTGEKFYKCEECGKGFNW
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KB7 SAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
:. :..:..::: :: ::::.
NP_775 SSALTKHKRIHTGEK--PYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECGKAFNRSS
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 1177 init1: 433 opt: 433 Z-score: 287.2 bits: 62.6 E(85289): 2.9e-09
Smith-Waterman score: 433; 57.0% identity (78.5% similar) in 107 aa overlap (306-412:434-540)
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 DECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCG
::::: . :..: : ::::::::::..::
NP_775 EECGKGFNWSSALTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECG
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFS
:::.: ..:: :. .:::::::.: :::::.. . :..:. :::::: :: .:::: :.
NP_775 KAFNRSSQLTAHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKITHTGEKSYKWEECGKDFN
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430
pF1KB7 QSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
:: : .. . . :: :
NP_775 QSLSLIKQNNSYWRETLQM
530 540
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 824 init1: 824 opt: 1012 Z-score: 632.5 bits: 126.6 E(85289): 1.7e-28
Smith-Waterman score: 1018; 45.6% identity (67.7% similar) in 375 aa overlap (88-428:42-412)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LGYQLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIM
.:: :.::..: :. .:.::.: .. ...
NP_001 GHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
20 30 40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQERSLECNKFAENCN
::. :..:: : : . : :.. :. . :..: : .. . : :.:: .
NP_001 ERFLWDGLWYC-RGE--DTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENIS
80 90 100 110 120
180 190 200 210
pF1KB7 LNSNLMQQRI------------------PSIKI---------PLNSDTQGNSIKHNSDLI
:: .: .: . :.... : . . :....:.: ::
NP_001 LNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALI
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260
pF1KB7 YYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQM
.. ... : ::: :: : : . :: : :::.::: ..::..:.. . : : :
NP_001 EHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTG
::::::.:.:::: :: : . ::.: ::::::. :. ::::::: .:::::::::
NP_001 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTG
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 EKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPY
::::.:..::::::. .:::.:.:.::::::::: :::::.: : : ::.:::::::::
NP_001 EKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430
pF1KB7 KCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKL--CEYKCEQTVRHSPSFSST
.:.:::::::::. :..::.::: :: :. .: .: :: :.:
NP_001 ECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCN-ECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
370 380 390 400 410 420
NP_001 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 797 init1: 797 opt: 835 Z-score: 526.8 bits: 107.1 E(85289): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 885; 62.6% identity (79.5% similar) in 195 aa overlap (219-408:421-615)
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEK
: ::: :.::: : : ::.: :::.::
NP_001 TGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEK
400 410 420 430 440 450
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PSEC---GKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFIC
: :: ::::::.:::.. : . ::::::.:..::. ::: :::::::::::::. :
NP_001 PYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYEC
460 470 480 490 500 510
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NP_001 KSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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XP_016 CGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKA
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pF1KB7 FSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRI
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XP_016 QSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTH
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XP_016 LTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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430 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:07:06 2016 done: Fri Nov 4 07:07:07 2016
Total Scan time: 8.540 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]