Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7387, 430 aa
1>>>pF1KB7387 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8562+/-0.00166; mu= 10.7403+/- 0.099
mean_var=250.2178+/-48.202, 0's: 0 Z-trim(105.1): 985 B-trim: 2 in 1/50
Lambda= 0.081080
statistics sampled from 7148 (8228) to 7148 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34639.2 ZNF713 gene_id:349075|Hs108|chr7 ( 443) 2996 364.7 1e-100
CCDS30686.1 ZFP69 gene_id:339559|Hs108|chr1 ( 526) 1348 172.0 1.2e-42
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1176 152.0 1.5e-36
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1159 149.9 5.6e-36
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1150 148.9 1.2e-35
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 1130 146.4 5.1e-35
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 1118 145.0 1.4e-34
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1108 143.9 3.3e-34
CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19 ( 575) 1093 142.2 1.2e-33
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1082 141.1 3.5e-33
CCDS33931.1 ZNF141 gene_id:7700|Hs108|chr4 ( 474) 1069 139.3 7.7e-33
CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1057 138.0 2.2e-32
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1056 137.9 2.5e-32
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 1028 134.6 2.4e-31
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1025 134.1 2.7e-31
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1012 132.7 8.5e-31
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1012 132.8 9.1e-31
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1012 132.8 9.4e-31
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1012 132.9 9.5e-31
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1012 132.9 9.6e-31
CCDS59371.1 ZNF730 gene_id:100129543|Hs108|chr19 ( 503) 1003 131.6 1.7e-30
CCDS46027.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 412) 990 130.0 4.3e-30
CCDS12845.1 ZNF350 gene_id:59348|Hs108|chr19 ( 532) 981 129.1 1e-29
CCDS33480.1 ZNF334 gene_id:55713|Hs108|chr20 ( 680) 975 128.5 1.9e-29
CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19 ( 422) 968 127.4 2.6e-29
CCDS12843.1 ZNF649 gene_id:65251|Hs108|chr19 ( 505) 969 127.6 2.7e-29
CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 570) 969 127.7 2.8e-29
CCDS74736.1 ZNF334 gene_id:55713|Hs108|chr20 ( 679) 967 127.6 3.7e-29
CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 627) 964 127.2 4.5e-29
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 963 127.1 5.1e-29
CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 571) 957 126.3 7.5e-29
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 953 125.9 1e-28
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 949 125.3 1.4e-28
CCDS56093.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 571) 949 125.4 1.4e-28
CCDS74351.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 635) 949 125.5 1.5e-28
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 943 124.4 1.8e-28
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 944 124.8 2.1e-28
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 944 124.9 2.4e-28
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 940 124.2 2.6e-28
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 940 124.2 2.8e-28
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 940 124.3 2.8e-28
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 940 124.3 2.9e-28
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 942 124.8 3e-28
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 942 124.8 3.1e-28
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 941 124.8 3.6e-28
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 937 124.0 3.9e-28
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 937 124.0 4e-28
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 935 124.0 5.5e-28
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 935 124.0 5.6e-28
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 932 123.4 5.8e-28
>>CCDS34639.2 ZNF713 gene_id:349075|Hs108|chr7 (443 aa)
initn: 2996 init1: 2996 opt: 2996 Z-score: 1921.5 bits: 364.7 E(32554): 1e-100
Smith-Waterman score: 2996; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:14-443)
10 20 30 40
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPSQNAVFSQEGNMEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 MLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLELEEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNIS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 DENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQERSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKKITQERSL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ECNKFAENCNLNSNLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ECNKFAENCNLNSNLMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSEC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GKIFNQHILLTDHIHTAEKPSECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKIFNQHILLTDHIHTAEKPSECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 HRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIH
370 380 390 400 410 420
410 420 430
pF1KB7 TREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
:::::::::::::::::::::::
CCDS34 TREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
430 440
>>CCDS30686.1 ZFP69 gene_id:339559|Hs108|chr1 (526 aa)
initn: 1658 init1: 747 opt: 1348 Z-score: 879.0 bits: 172.0 E(32554): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 1348; 49.2% identity (71.8% similar) in 433 aa overlap (3-427:60-482)
10 20 30
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREE
:.:.. : ..::: :::.:...:::.::
CCDS30 PLWEDVTKMFEGEALLSQDAEDVKTQRESLEDEVTPGLPTAESQELLTFKDISIDFTQEE
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 WDQLYPAQKNLYRDVMLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPDG
: :: ::..::::.:::::: :::..:::: :: ::.::: :: :. :... : :
CCDS30 WGQLAPAHQNLYREVMLENYSNLVSVGYQLSKPSVISQLEKGEEPWMAEKEGPGDPSSDL
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYL
... : .::....::.: : ..:: . :.. :: : . .: : .::. : .
CCDS30 KSKIETIESTAKSTISQERLYHGIMMESFMRDDIIYSTLRKVSTYDDVLERHQETCMRDV
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 GQVTLTHKKITQERSLECNKFAENCNLNSN-LMQQRIPSIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLI
:. ::::: .: : :::.:: ..:: ...:: . : :. :. : :::
CCDS30 RQAILTHKKRVQ----ETNKFGENIIVHSNVIIEQRHHKYDTP----TKRNTYKL--DLI
210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KB7 YYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEKP---SECGKAFSHTSSLSQPQM
. .:.: :: . : :::.: : ::.: :::.::: .:::.:::...::: :
CCDS30 NHPTSYIRTKTYECNICEKIFKQPIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGRAFSQSASLSTHQR
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTG
. :::::..:.:::: : .: : ::.: ::::::..:. : ::: :. :..:::: :.:
CCDS30 IHTGEKPFECEECGKAFRHRSSLNQHHRTHTGEKPYVCDKCQKAFSQNISLVQHLRTHSG
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 EKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPY
:::. ::.:::.: .: :.:: :.::::::: : : :.::.:..:..:.: ::::.::
CCDS30 EKPFTCNECGKTFRQIRHLSEHIRIHTGEKPYACTACCKTFSHRAYLTHHQRIHTGERPY
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KB7 KCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKLCE-YKCEQTVRHSPSFSST
::.:::::: : ::..:. .:: : : .: .. ::. ::
CCDS30 KCKECGKAFRQRIHLSNHKTVHTGVKAYECNRCGKAYRHDSSFKKHQRHHTGEKPYECNE
440 450 460 470 480 490
CCDS30 CGKAFSYNSSLSRHHEIHRRNAFRNKV
500 510 520
>>CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 2231 init1: 789 opt: 1176 Z-score: 769.7 bits: 152.0 E(32554): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 1176; 45.8% identity (69.2% similar) in 426 aa overlap (2-419:53-474)
10 20 30
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTRE
:::.: : . :: .::.::::::..:
CCDS74 VSGSSSQAICVTPVRVESSEATAISQEKSQEEERMAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQE
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 EWDQLYPAQKNLYRDVMLENYRNLVALGYQLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPD
::: : .:..:: .::::::: ::.:: . :: :: :: . :...:.
CCDS74 EWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKPSVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSG
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 GENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIMERLAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRY
: : .. : .:.. .:.:....: : :.. .. :: : : . . : . :.:
CCDS74 WEPICETEELTPKQDFYEEHQSQKII-ETLTSYNLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKAC
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KB7 LGQVTLTHKK-ITQERSLECNKFAENCNLNSNLMQQRI-PSIKIPLNSDTQGNSIKHNSD
. . .::.. . .:: : .... . . : : :.: :. . . ::: :.:.:
CCDS74 FKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWG-SFHQNPLLCTQKIIPKEEKVHKHDTQKRSFKKNLM
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDH--IHTAEKPS---ECGKAFSHTSSLSQP
: .. ... . ..: :.:.: :: : :::.::: :::::::. :.: :
CCDS74 AIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQH
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 QMLLTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIH
: . ::::::.: :: : ::: ::.:: :.::::::. :. : ::: : . ..:: :.:
CCDS74 QRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVH
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 TGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEK
::::::.: .:::::: .:...:.:.:::::::::. :::::: :..:. :.: ::::.
CCDS74 TGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGER
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
pF1KB7 PYKCNECGKAFSQSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
::.:.::::::::..:: ::..::: :: :::..
CCDS74 PYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEK--PYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPY
450 460 470 480 490
CCDS74 ECIECGKAFSNDSSLTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKE
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 957 init1: 489 opt: 489 Z-score: 335.4 bits: 71.6 E(32554): 2.3e-12
Smith-Waterman score: 492; 61.7% identity (79.4% similar) in 107 aa overlap (306-412:475-581)
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 DECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGCGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCG
: ::: : . ..:: :.:::::::.: .::
CCDS74 KECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECG
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFS
:::: .:::.:.:.::::::::: :::::: : ::.: ::::.::.:.:: :.:
CCDS74 KAFSNDSSLTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFR
510 520 530 540 550 560
400 410 420 430
pF1KB7 QSAHLNQHRKIHTREKLCEYKCEQTVRHSPSFSST
: ::: .:..:: :.:
CCDS74 QHAHLAHHQRIHIGESLSPPNPVNHQVL
570 580 590
>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
initn: 2231 init1: 789 opt: 1159 Z-score: 759.4 bits: 149.9 E(32554): 5.6e-36
Smith-Waterman score: 1159; 46.1% identity (69.9% similar) in 412 aa overlap (16-419:11-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEEEEMNDGSQMVRSQESLTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKNLYRDVMLENYRNLVALGY
:: .::.::::::..:::: : .:..:: .::::::: ::.::
CCDS12 MAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 QLCKPEVIAQLEL-EEEWVIERDSLLDTHPDGENRPEIKKSTTSQNISDENQTHEMIMER
. :: :: :: . :...:. : : .. : .:.. .:.:....: :
CCDS12 CFSKPSVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDFYEEHQSQKII-ET
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAGDSFWYSILGGLWDFDYHPEFNQENHKRYLGQVTLTHKK-ITQERSLECNKFAENCNL
:.. .. :: : : . . : . :.: . . .::.. . .:: : .... . .
CCDS12 LTSYNLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWG-SFHQ
120 130 140 150 160 170
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CCDS12 K--PYECKVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSSLAQHQRSHTGEKP
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CCDS12 RPVGFIS
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CCDS46 PYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
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CCDS12 VTGREGFPTDAPYPTTLGK--DRECQSQSLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRL
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pF1KB7 AENCNLNSNLMQQRIPSI---KIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGK
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CCDS12 RENCVLSSS--PNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENSDCHR
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CCDS12 NSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQNSSL
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CCDS12 GRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQ
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CCDS12 RKHAGEK--PFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQCGK
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