FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7377, 449 aa
1>>>pF1KB7377 449 - 449 aa - 449 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6216+/-0.000658; mu= 17.2753+/- 0.040
mean_var=87.4222+/-17.478, 0's: 0 Z-trim(113.2): 87 B-trim: 4 in 1/52
Lambda= 0.137171
statistics sampled from 13804 (13892) to 13804 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 ( 449) 3209 644.5 6.3e-185
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CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 370 82.9 1.5e-15
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 331 75.2 3.3e-13
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 313 71.7 3.9e-12
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 312 71.9 1.2e-11
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 298 68.6 2.4e-11
CCDS44491.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (1785) 303 69.9 2.4e-11
CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 ( 449) 294 67.7 2.8e-11
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 298 68.7 3e-11
CCDS44492.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2403) 303 70.0 3e-11
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CCDS7631.1 CUZD1 gene_id:50624|Hs108|chr10 ( 607) 295 67.9 3.1e-11
>>CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 (449 aa)
initn: 3209 init1: 3209 opt: 3209 Z-score: 3433.5 bits: 644.5 E(32554): 6.3e-185
Smith-Waterman score: 3209; 100.0% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (1-449:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWLI
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CCDS58 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWHV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 DLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQLLLHWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQLLLHWL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB7 HPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF
430 440
>>CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623 aa)
initn: 338 init1: 338 opt: 747 Z-score: 787.8 bits: 158.0 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 747; 33.4% identity (62.3% similar) in 374 aa overlap (30-397:1165-1529)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWL
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CCDS71 HSNKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECYWW
1140 1150 1160 1170 1180 1190
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWH
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CCDS71 LKSSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNS-HLLTQLCGDEKPPLIRSSGD
1200 1210 1220 1230 1240 1250
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLS-GVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAA
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CCDS71 SMFIKLRTDEGQQGRGFKAEYRQTCENVVIVNQTYGILESIGYPNPYSENQHCNWTIRAT
1260 1270 1280 1290 1300 1310
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFK
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CCDS71 TGNTVNYTFLAFDLEHHINCSTDYLELYDG--PRQMGRYCGVDLPPPGSTTSSKLQVLLL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SDFNIGGR--GFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVK
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CCDS71 TD-GVGRREKGFQMQWFVYGCGGELSGATGSFSSPGFPNRYPPNKECIWYIRTDPGSSIQ
1380 1390 1400 1410 1420 1430
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPP-P--VTSSHNQLLL
. . :.:.: . :.:: : . : . ..: ... : .. : : :.:. :.: .
CCDS71 LTIHDFDVE----YHSRCNFDVLEIYGGPDFHSPRIAQLCTQRSPENPMQVSSTGNELAI
1440 1450 1460 1470 1480
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLL
..:: : . :::.... . :::. :: .: . ::
CCDS71 RFKTDLSINGRGFNASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSP-NYPSPYRSNTDCSWVIRVDRN
1490 1500 1510 1520 1530 1540
420 430 440
pF1KB7 QLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF
CCDS71 HRVLLNFTDFDLEPQDSCIMAYDGLSSTMSRLARTCGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGP
1550 1560 1570 1580 1590 1600
>--
initn: 700 init1: 266 opt: 695 Z-score: 732.2 bits: 147.7 E(32554): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 695; 34.0% identity (61.3% similar) in 362 aa overlap (23-376:810-1164)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPY
.:. : :: :.. : . :: :: .::
CCDS71 GNGTISHIKSITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGE-GVIRSPFFPNVYPG
780 790 800 810 820 830
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGR-FCGKVPP
. : : : ... .::.: .:.. : :..:: :.: :. .. .:: :
CCDS71 ERTCRWTIHQPQSQVILLNFTVFEIGSSAHCETDYVEI--GSSSILGSPENKKYCGTDIP
840 850 860 870 880 890
120 130 140 150 160
pF1KB7 PPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKD--VCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSM
.:: .. . : : ... . .::: : .. . .:: .:: .:.. :: .:: ::...
CCDS71 SFITSVYNFLYVTFVKSSSTENHGFMAKFSAEDLACGEILTESTGTIQSPGHPNVYPHGI
900 910 920 930 940 950
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ECHWVIRAAGPAH-VKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVS
.: : : . : : ..:.: :..: . .:: ::. : . : .:::.. ::.:.:
CCDS71 NCTWHI-LVQPNHLIHLMFETFHLEFHYNCTNDYLEVYDTDSETSLGRYCGKSIPPSLTS
960 970 980 990 1000 1010
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LGHELQVVFKSDFNIGGRGF----KAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCH
:. :..:: .: ... .:: .: . : . : :.:.::..:..:::: .:
CCDS71 SGNSLMLVFVTDSDLAYEGFLINYEAISAATACLQDYTDDLGTFTSPNFPNNYPNNWECI
1020 1030 1040 1050 1060 1070
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 WTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPV
. : . : . : : ...::: . : : : ::. :..:::: . : .::: .
CCDS71 YRITVRTGQLIAVHFTNFSLEEAIGNYYT---DFLEIRDGGYEKSPLLGIFYGSNLPPTI
1080 1090 1100 1110 1120 1130
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVC
: :.: : ...:. :: :::. . :.. :
CCDS71 ISHSNKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECY
1140 1150 1160 1170 1180 1190
410 420 430 440
pF1KB7 PAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF
CCDS71 WWLKSSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNSHLLTQLCGDEKPPLIRSSG
1200 1210 1220 1230 1240 1250
>--
initn: 572 init1: 214 opt: 615 Z-score: 646.6 bits: 131.9 E(32554): 1.1e-29
Smith-Waterman score: 632; 32.4% identity (62.5% similar) in 355 aa overlap (14-358:2788-3135)
10 20 30 40
pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQ-AMEGVKCGGVLSAPSGNFS
.: : :. : . . :::.. . .:..
CCDS71 PIIGQYCGNSNPRTIQSGSNQLVVTFNSDHSLQGGGFYATWNTQTLGCGGIFHSDNGTIR
2760 2770 2780 2790 2800 2810
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 SPNFPRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTF-HAFDLEYHD-TCSFDFLEIYNGASPDKGN
::..:. .: :..::: .. ... . ..: . : . : :. .:.... :.
CCDS71 SPHWPQNFPENSRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKVWAGTEEVDKA
2820 2830 2840 2850 2860 2870
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 LLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPE
::. ::.: : : . ......:.: ... ..::::.. . ::. .:: :: . ::.
CCDS71 LLATGCGNVAPGPVITPSNTFTAVFQS-QEAPAQGFSASFVSR-CGSNFTGPSGYIISPN
2880 2890 2900 2910 2920 2930
170 180 190 200 210
pF1KB7 YPNNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEE----CTYDYVAVLGGPG--PTRG
::..: :.:.: .::.: . : :.::.:..:. :. : : .. : . :
CCDS71 YPKQYDNNMNCTYVIEANPLSVVLLTFVSFHLEARSAVTGSCVNDGVHIIRGYSVMSTPF
2940 2950 2960 2970 2980 2990
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYP
::. : :. : : . : :. .: ::: : : :. : ..:: :
CCDS71 ATVCGDEMPAPLTIAGPVL-LNFYSNEQITDFGFKFSYRIISCGGVFNFSSGIITSPAYS
3000 3010 3020 3030 3040 3050
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pF1KB7 -SSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLG
..:::...: .:: . ... : :.:. :.. .:. :.:: .:::. ::::
CCDS71 YADYPNDMHCLYTITVSDDKVIELKFSDFDVV-PST---SCSHDYLAIYDGANTSDPLLG
3060 3070 3080 3090 3100 3110
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 NWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQS
..:: . :: : ::.:..::...::
CCDS71 KFCGSKRPPNVKSSNNSMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNNTFAS
3120 3130 3140 3150 3160 3170
>--
initn: 421 init1: 220 opt: 402 Z-score: 418.8 bits: 89.7 E(32554): 5.2e-17
Smith-Waterman score: 430; 26.6% identity (59.3% similar) in 290 aa overlap (86-366:530-809)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFT
.::..:.: : ... ::::::. : .
CCDS71 CFWVIKTEMGKVLRITFTFFRLESMDNCPHEFLQVYDGDS-SSAFQLGRFCGSSLPHELL
500 510 520 530 540 550
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGY--QKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHW
:: ... ..:.. ..::.. . :. :::.::: : . :: ::.::: . .: :
CCDS71 SSDNALYFHLYSEHLRNGRGFTVRWETQQPECGGILTGPYGSIKSPGYPGNYPPGRDCVW
560 570 580 590 600 610
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP---GPTRGHHYCGSTRPPTLVSLG
.. .. : ..: ...: ...:. ::. . :: : :. .: . : : . :
CCDS71 IVVTSPDLLVTFTFGTLSLEHHDDCNKDYLEIRDGPLYQDPLLGK-FCTTFSVPPLQTTG
620 630 640 650 660 670
240 250 260 270 280
pF1KB7 HELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSG----ECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWT
.. :.:: .:. .::. :... .: : .:.. :. . . .. .: .
CCDS71 PFARIHFHSDSQISDQGFHITYLTSPSDLRCGGNYTDPEGELFLPELSGPFTHTRQCVYM
680 690 700 710 720 730
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 IRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTS
.. : : :... : ..:. .. .. ... . :: . :::. ::. . :
CCDS71 MKQPQGEQIQINFTHVELQCQSDSSQ----NYIEVRDGET----LLGKVCGNGTISHIKS
740 750 760 770 780
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPA
:.. . .. : :. . .:
CCDS71 ITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGEGVIRSPFFPNVYPGERTCRWTIHQP
790 800 810 820 830 840
>>CCDS3127.1 PCOLCE2 gene_id:26577|Hs108|chr3 (415 aa)
initn: 535 init1: 258 opt: 494 Z-score: 530.3 bits: 107.2 E(32554): 3.2e-23
Smith-Waterman score: 568; 37.2% identity (62.8% similar) in 261 aa overlap (5-252:7-265)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLAEWGA-CLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECS
:. :::::.: :. :::.:.. :: ..: .:: .:: :..:.
CCDS31 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 WLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSS
: :.: ::. :.:.:. .::: . : .::...::: . .:. .::::: : ..::
CCDS31 WKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHA--NGQRIGRFCGTFRPGALVSS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB7 WHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQK--------DVCGGVLTGLSGVLTSPEYPN-NYPNS
. : : . :: ..:..:: : .. . :::.: :: . .:..:. .:: .
CCDS31 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 MECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP---GPTRGHHYCGSTRPPT
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CCDS84 ELAVLFRTDHGISSGGFSATYLAFNATENPCGPSELSCQAGGCKGVQWMCDMWRDCTDGS
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CCDS84 IQVATDHAIQLKIEALSIESVASCLFDRLEL----SPEPEGPLLRVCGRVPPPTLNTNAS
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CCDS84 HLLVVFVSDSSVEGFGFHAWYQAMAPGRGSCAHDEFRCDQLICLLPDSVCDGFANCADGS
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CCDS46 PCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVYAPEPNQKIVLNFNPHFEIE-KHDCKY
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pF1KB7 DYVAVLGGPGPTR---GHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYY--F--
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CCDS46 DFIEIRDGDSESADLLGKH-CGNIAPPTIISSGSMLYIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKT
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CCDS46 EGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRSSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARY
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pF1KB7 IGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLR
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>>CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 (901 aa)
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CCDS46 MDMFPLTWVFLALYF--SRHQVR-----GQPDP
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CCDS46 PCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVYAPEPNQKIVLNFNPHFEIE-KHDCKY
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pF1KB7 DYVAVLGGPGPTR---GHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYY--F--
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CCDS46 DFIEIRDGDSESADLLGKH-CGNIAPPTIISSGSMLYIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKT
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CCDS46 GSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTILAKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVG
150 160 170 180 190 200
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pF1KB7 K-TCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAY
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CCDS46 EGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRSSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARY
210 220 230 240 250 260
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pF1KB7 IGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLR
CCDS46 YLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYSDGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDS
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449 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:01:08 2016 done: Fri Nov 4 07:01:09 2016
Total Scan time: 3.020 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]