FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7371, 316 aa
1>>>pF1KB7371 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2291+/-0.000787; mu= 15.8641+/- 0.047
mean_var=64.2997+/-12.940, 0's: 0 Z-trim(107.1): 59 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.159945
statistics sampled from 9298 (9360) to 9298 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 2152 505.2 2.7e-143
CCDS74295.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 240) 679 165.2 4.4e-41
CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 679 165.3 5.9e-41
CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 672 163.7 1.8e-40
CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 637 155.6 5e-38
CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 637 155.7 5.9e-38
CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 637 155.7 6.4e-38
CCDS3277.1 DNAJB11 gene_id:51726|Hs108|chr3 ( 358) 465 116.0 4.6e-26
CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 368 93.5 1.8e-19
CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 368 93.6 2.3e-19
CCDS10726.1 DNAJA2 gene_id:10294|Hs108|chr16 ( 412) 342 87.6 1.8e-17
CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 339 86.8 2.1e-17
CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 339 86.9 2.4e-17
CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 323 83.1 2.3e-16
CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 315 81.3 1.1e-15
CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9 ( 397) 306 79.3 5.5e-15
CCDS7316.2 DNAJB12 gene_id:54788|Hs108|chr10 ( 409) 293 76.3 4.5e-14
CCDS45317.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 370) 290 75.6 6.7e-14
CCDS45316.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 397) 290 75.6 7.1e-14
CCDS10299.2 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 426) 290 75.6 7.5e-14
CCDS45400.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 453) 282 73.8 2.9e-13
CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 480) 282 73.8 3e-13
CCDS4214.1 DNAJC18 gene_id:202052|Hs108|chr5 ( 358) 269 70.7 1.9e-12
CCDS34035.1 DNAJB14 gene_id:79982|Hs108|chr4 ( 379) 254 67.3 2.2e-11
>>CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 2152 init1: 2152 opt: 2152 Z-score: 2686.1 bits: 505.2 E(32554): 2.7e-143
Smith-Waterman score: 2152; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFFDAEGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFFDAEGSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VDLNFGGLQGRGVKKQDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKKIKISRRVLNEDGYSSTIKDKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VDLNFGGLQGRGVKKQDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKKIKISRRVLNEDGYSSTIKDKIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEKLHPRFRRENDNLFFVNPIPLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEKLHPRFRRENDNLFFVNPIPLGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGMPLPEDPTKKGDLFIFFDIQFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGMPLPEDPTKKGDLFIFFDIQFPT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 RLTPQKKQMLRQALLT
::::::::::::::::
CCDS82 RLTPQKKQMLRQALLT
310
>>CCDS74295.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (240 aa)
initn: 724 init1: 634 opt: 679 Z-score: 851.0 bits: 165.2 E(32554): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 690; 46.6% identity (69.3% similar) in 238 aa overlap (99-314:1-238)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFFDA----EGSEVDLN
.: ::::: :::. :: :: ..:
CCDS74 MFAEFFGGRNPFDTFFGQRNGEEGMDIDDP
10 20 30
130 140 150 160
pF1KB7 FGGL-QGRG-----------------VKKQDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKKIKISRRVL
:.:. .: : ::::: : .:: .:::... :::::.:::.. :
CCDS74 FSGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRL
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 NEDGYSSTIKDKILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEKLHPRFRRE
: :: : .::::::.:: ::..::.::: ::::: : :::::.:..:.: : :.:.
CCDS74 NPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLKDKPHNIFKRD
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 NDNLFFVNPIPLGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGMPLPEDPTK
...... : : .:: :::.: ::: : . . ..:.:.: . .::::::.:::. : :
CCDS74 GSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTIPVVFKDVIRPGMRRKVPGEGLPLPKTPEK
160 170 180 190 200 210
290 300 310
pF1KB7 KGDLFIFFDIQFPTRLTPQKKQMLRQALLT
.:::.: :.. :: :. .. .:.:.:
CCDS74 RGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI
220 230 240
>>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (340 aa)
initn: 1085 init1: 634 opt: 679 Z-score: 848.7 bits: 165.3 E(32554): 5.9e-41
Smith-Waterman score: 1046; 48.5% identity (72.5% similar) in 338 aa overlap (1-314:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMK
::.:::..::..:.. : .::.:::: ::..:: :..::.. : :..::::::::::: :
CCDS12 MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKEPGAEEKFKEIAEAYDVLSDPRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 RGIYDKFGEEGLKGGIPL--EFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFFDA--
: :.:..:::::::. : :. . . .:.::: :. .: ::::: :::. ::
CCDS12 REIFDRYGEEGLKGSGPSGGSGGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDTFFGQRN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KB7 --EGSEVDLNFGGL-QGRG-----------------VKKQDPQVERDLYLSLEDLFFGCT
:: ..: :.:. .: : ::::: : .:: .:::... :::
CCDS12 GEEGMDIDDPFSGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 KKIKISRRVLNEDGYSSTIKDKILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVK
::.:::.. :: :: : .::::::.:: ::..::.::: ::::: : :::::.:..:
CCDS12 KKMKISHKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 EKLHPRFRRENDNLFFVNPIPLGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGE
.: : :.:....... : : .:: :::.: ::: : . . ..:.:.: . .:::::
CCDS12 DKPHNIFKRDGSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTIPVVFKDVIRPGMRRKVPGE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KB7 GMPLPEDPTKKGDLFIFFDIQFPTRLTPQKKQMLRQALLT
:.:::. : :.:::.: :.. :: :. .. .:.:.:
CCDS12 GLPLPKTPEKRGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI
310 320 330 340
>>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 (337 aa)
initn: 1095 init1: 641 opt: 672 Z-score: 840.0 bits: 163.7 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 1022; 46.4% identity (72.6% similar) in 336 aa overlap (1-314:1-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMK
::.::: .::: ... : .::.:::. ::: :: :.. :.. : :...::::.::::: :
CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 RGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFF------
: :::.::::::::: :. : :.::: :. .: ::::.::: ::
CCDS68 REIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGG--TFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMGG
70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KB7 --DAEGSEVDLN----FG-GLQGR-------GVK--KQDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKK
:.: :.: . :: ...: : . :::: : ..: .:::... ::::.
CCDS68 GRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKR
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 IKISRRVLNEDGYSSTIKDKILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEK
.::::. :: :: : .::::::..: ::..::.::: .:::. :: :::::.::.:.:
CCDS68 MKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LHPRFRRENDNLFFVNPIPLGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGM
::.:.:...:.... : : .:: :...: ::: : . . .:::..: . ... : :.
CCDS68 DHPKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRRRIIGYGL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KB7 PLPEDPTKKGDLFIFFDIQFPTRLTPQKKQMLRQALLT
:.:..: ..:::.: :...:: .. ..:..::. :
CCDS68 PFPKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
300 310 320 330
>>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa)
initn: 1105 init1: 634 opt: 637 Z-score: 796.2 bits: 155.6 E(32554): 5e-38
Smith-Waterman score: 1024; 46.1% identity (70.3% similar) in 347 aa overlap (1-314:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMK
::.:::..::: .... .::.:::..:::.:: :..::.. : :..::::::::::: :
CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 RGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGYVFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFF------
::.::..:::::: : ::. . :.::: :. .: ::::.:::. ::
CCDS35 RGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFH--YTFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRST
70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KB7 ------DAEGSEVDLN---FG-----GLQG--RGVKK-----------QDPQVERDLYLS
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CCDS35 RPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 LEDLFFGCTKKIKISRRVLNEDGYSSTIKDKILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNII
::... : ::..::.:: :: :: . .:::: : .: ::..::.::: :::: :. :
CCDS35 LEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKILHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNI
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 PADIIFIVKEKLHPRFRRENDNLFFVNPIPLGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHP
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CCDS35 PADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLKEALCGCTVNIPTIDGRVIPLPCNDVIKP
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB7 KYFKKVPGEGMPLPEDPTKKGDLFIFFDIQFPTRLTPQKKQMLRQALLT
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CCDS35 GTVKRLRGEGLPFPKVPTQRGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQILKQHLPCS
300 310 320 330 340
>>CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (420 aa)
initn: 1085 init1: 634 opt: 637 Z-score: 794.9 bits: 155.7 E(32554): 5.9e-38
Smith-Waterman score: 1024; 46.1% identity (70.3% similar) in 347 aa overlap (1-314:73-417)
10 20 30
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALK
::.:::..::: .... .::.:::..:::
CCDS47 QLEPLKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 HHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMKRGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGY
.:: :..::.. : :..::::::::::: :::.::..:::::: : ::. . :
CCDS47 YHPDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFH--Y
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130
pF1KB7 VFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFF------------DAEGSEVDLN---FG-----GLQG
.::: :. .: ::::.:::. :: : . .:: . :: :..:
CCDS47 TFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNG
170 180 190 200 210 220
140 150 160 170
pF1KB7 --RGVKK-----------QDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKKIKISRRVLNEDGYSSTIKD
:: .. ::: : ..: .:::... : ::..::.:: :: :: . .:
CCDS47 LSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTED
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEKLHPRFRRENDNLFFVNPIP
::: : .: ::..::.::: :::: :. :::::.:..:.: : .:::.. :... :
CCDS47 KILHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALIS
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGMPLPEDPTKKGDLFIFFDIQ
: .:: :::.. :.: :.. .: ::.:.: :.. :::.:.:. ::..:::.. : ..
CCDS47 LKEALCGCTVNIPTIDGRVIPLPCNDVIKPGTVKRLRGEGLPFPKVPTQRGDLIVEFKVR
350 360 370 380 390 400
300 310
pF1KB7 FPTRLTPQKKQMLRQALLT
:: ::::: .:.:.: :
CCDS47 FPDRLTPQTRQILKQHLPCS
410 420
>>CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (462 aa)
initn: 1085 init1: 634 opt: 637 Z-score: 794.3 bits: 155.7 E(32554): 6.4e-38
Smith-Waterman score: 1024; 46.1% identity (70.3% similar) in 347 aa overlap (1-314:115-459)
10 20 30
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALK
::.:::..::: .... .::.:::..:::
CCDS47 QLEPLKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALK
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 HHPLKSNEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDPMKRGIYDKFGEEGLKGGIPLEFGSQTPWTTGY
.:: :..::.. : :..::::::::::: :::.::..:::::: : ::. . :
CCDS47 YHPDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFH--Y
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130
pF1KB7 VFHGKPEKVFHEFFGGNNPFSEFF------------DAEGSEVDLN---FG-----GLQG
.::: :. .: ::::.:::. :: : . .:: . :: :..:
CCDS47 TFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNG
210 220 230 240 250 260
140 150 160 170
pF1KB7 --RGVKK-----------QDPQVERDLYLSLEDLFFGCTKKIKISRRVLNEDGYSSTIKD
:: .. ::: : ..: .:::... : ::..::.:: :: :: . .:
CCDS47 LSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTED
270 280 290 300 310 320
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQGPNIIPADIIFIVKEKLHPRFRRENDNLFFVNPIP
::: : .: ::..::.::: :::: :. :::::.:..:.: : .:::.. :... :
CCDS47 KILHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALIS
330 340 350 360 370 380
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LGKALTCCTVEVRTLDDRLLNIPINDIIHPKYFKKVPGEGMPLPEDPTKKGDLFIFFDIQ
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CCDS32 LQGY
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CCDS47 DPFEDF-FGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSF
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MGQDYYSVLGITRNSEDAQIKQAYRRLALKHHPLKS--NEPSSAEIFRQIAEAYDVLSDP
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CCDS59 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDA
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CCDS59 KKRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRN-PDDVFREFFGGRDPFSFDFF--E
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CCDS59 DPFEDF-FGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSF
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]