Result of FASTA (omim) for
pF1KB7369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7369, 318 aa
1>>>pF1KB7369 318 - 318 aa - 318 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8842+/-0.000552; mu= 18.3795+/- 0.034
mean_var=105.4913+/-29.055, 0's: 0 Z-trim(106.9): 327 B-trim: 1025 in 1/46
Lambda= 0.124872
statistics sampled from 14567 (15025) to 14567 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.502), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 6.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1005 192.6 8.8e-49
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1005 192.6 8.8e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 978 187.8 2.5e-47
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 970 186.3 6.9e-47
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 969 186.1 7.8e-47
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 965 185.4 1.3e-46
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 959 184.3 2.7e-46
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 956 183.8 3.9e-46
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 915 176.4 6.7e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 912 175.9 9.8e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 878 169.7 6.7e-42
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 875 169.2 1e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 839 162.7 8.8e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 839 162.7 8.8e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 839 162.7 9e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 822 159.7 7.3e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 779 151.9 1.6e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 772 150.6 3.8e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 684 134.8 2.2e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 588 117.5 3.6e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 542 109.2 1.1e-23
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 214 50.2 7.8e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 214 50.3 8.1e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 209 49.3 1.4e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 209 49.3 1.4e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 209 49.4 1.6e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 203 48.2 2.9e-05
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 200 47.7 4.6e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 200 47.8 4.9e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 200 47.8 5e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 193 46.4 9.6e-05
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 193 46.4 0.0001
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 193 46.4 0.0001
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 193 46.5 0.00011
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 193 46.5 0.00011
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 193 46.5 0.00011
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 193 46.5 0.00011
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 193 46.5 0.00011
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 193 46.5 0.00011
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 190 46.0 0.00017
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 190 46.0 0.00017
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 190 46.1 0.00019
NP_859528 (OMIM: 609042) opsin-5 [Homo sapiens] ( 354) 187 45.3 0.00022
XP_016865905 (OMIM: 609042) PREDICTED: opsin-5 iso ( 408) 187 45.4 0.00024
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 186 45.2 0.00027
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 178 43.8 0.00074
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 178 43.9 0.0008
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 178 43.9 0.00085
XP_016864712 (OMIM: 600933) PREDICTED: proteinase- ( 383) 176 43.4 0.0009
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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pF1KB7 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
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pF1KB7 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
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XP_011 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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pF1KB7 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
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pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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pF1KB7 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
:.:: : ..:
XP_011 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHT
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pF1KB7 SCEILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKA
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pF1KB7 LRNKDVKEAVKHLPNRRFFSK
:::: :. :::.:
NP_001 LRNKVVRGAVKRLMGWE
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
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pF1KB7 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
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pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--------QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRN
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pF1KB7 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
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NP_003 KDVKAALRKVATRNFP
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>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYA------QERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN
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NP_009 KEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 965; 45.5% identity (78.7% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-308)
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KB7 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
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NP_003 KEVKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 955 init1: 810 opt: 959 Z-score: 952.0 bits: 184.3 E(85289): 2.7e-46
Smith-Waterman score: 959; 46.4% identity (78.1% similar) in 306 aa overlap (5-310:7-306)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KB7 AFDRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFS
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pF1KB7 CEILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KB7 STCSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSL
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPN------TDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSL
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300 310
pF1KB7 RNKDVKEAVKHLPNRRFFSK
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NP_006 RNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 956; 46.7% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYA------QERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
:. :
XP_011 KEQKRRGS
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 887 init1: 778 opt: 915 Z-score: 909.2 bits: 176.4 E(85289): 6.7e-44
Smith-Waterman score: 915; 44.5% identity (77.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]