Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7368
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7368, 316 aa
1>>>pF1KB7368 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2379+/-0.00137; mu= 10.6168+/- 0.079
mean_var=181.0038+/-67.061, 0's: 0 Z-trim(101.2): 382 B-trim: 393 in 1/47
Lambda= 0.095330
statistics sampled from 5948 (6403) to 5948 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 2104 302.8 2.4e-82
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1599 233.3 1.9e-61
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1129 168.7 5.5e-42
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1119 167.3 1.4e-41
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1092 163.6 1.9e-40
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1084 162.5 4e-40
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1081 162.1 5.3e-40
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1072 160.8 1.2e-39
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1065 159.9 2.5e-39
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1061 159.3 3.6e-39
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1048 157.5 1.2e-38
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1047 157.4 1.4e-38
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1039 156.3 3e-38
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1031 155.2 6.3e-38
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1030 155.0 6.9e-38
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1030 155.1 7e-38
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1025 154.4 1.1e-37
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1016 153.1 2.6e-37
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1007 151.9 6.2e-37
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1001 151.1 1.1e-36
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 996 150.4 1.8e-36
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 982 148.4 6.6e-36
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 949 143.9 1.5e-34
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 945 143.4 2.3e-34
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 937 142.3 4.9e-34
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 916 139.4 3.6e-33
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 914 139.1 4.5e-33
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 899 137.0 1.9e-32
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 898 136.9 2e-32
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 893 136.2 3.2e-32
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 874 133.6 2e-31
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 864 132.2 5.2e-31
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 859 131.5 8.2e-31
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 856 131.1 1.1e-30
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 845 129.6 3.1e-30
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 839 128.8 5.9e-30
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 833 128.0 1.1e-29
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 817 125.8 4.6e-29
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 797 123.0 3.1e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 736 114.6 1e-25
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 735 114.6 1.2e-25
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 728 113.5 2.2e-25
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 721 112.5 4.3e-25
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 717 112.0 6.2e-25
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 695 109.0 5.1e-24
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 677 106.5 2.8e-23
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 675 106.2 3.5e-23
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 610 97.3 1.7e-20
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 557 90.0 2.6e-18
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 545 88.3 8.2e-18
>>CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 2104 init1: 2104 opt: 2104 Z-score: 1592.0 bits: 302.8 E(32554): 2.4e-82
Smith-Waterman score: 2104; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 QIRDHIVKVFFFKKVT
::::::::::::::::
CCDS31 QIRDHIVKVFFFKKVT
310
>>CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1627 init1: 1583 opt: 1599 Z-score: 1216.7 bits: 233.3 E(32554): 1.9e-61
Smith-Waterman score: 1599; 74.8% identity (91.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
: : .:.:::.. :.:::::::::::::::: :.:::..:::::.: ::: : ::: :
CCDS31 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
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CCDS31 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
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CCDS31 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
:::::::::::. ...:::::::::::.. :::. ::::::.:::::::.::::::::::
CCDS31 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:..::::::::::.:::.::
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHISPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 QIRDHIVKVFFFKKVT
::: :.::.:
CCDS31 QIRIHVVKMFCS
310
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
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Smith-Waterman score: 1129; 51.8% identity (80.4% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
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CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
:: :::::. ::... . .:: : :::::: .:.:: :: ::.. :.: ..:::.:. :
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
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pF1KB7 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
::::::::: :::..::... ....: .. ::...:::: : : : . : ... :.
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKL-LPYCRGNILPHT
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
::.::...::. ...:: ::::.::. : ::::. :: ::..:. .: .: . .:: ::
CCDS44 YCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKA
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250 260 270 280 290
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHI-PPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKT
:::: ::::... : ::::::.:::: :: :: ::...:.:::.:: .:::::::::
CCDS44 FNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKT
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300 310
pF1KB7 KQIRDHIVKVFFFKKVT
::::: .....
CCDS44 KQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
300 310 320
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 1114 init1: 618 opt: 1119 Z-score: 859.7 bits: 167.3 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 1119; 53.5% identity (81.0% similar) in 310 aa overlap (5-311:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
: . : ::.:.:.::::::... :::.:: :.:.:..::: ::..:: ..::: :
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
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pF1KB7 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
:. ::::::.::..:.: .::::::::..: : :.::: ::..::.: .::..:.::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLI---KCCLKHYRTTVI
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CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNH----VI
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SHSYCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEAR
:.:::::....:. .:..: :::: :. : ::: :.::::.:. .::.:: .:::
CCDS31 PHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGL-CAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEAR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FKAFNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGV
.:...:: .:.::.: :: :.:::.::::: ..: ::::::.:::..:::.:::..:::
CCDS31 LKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 KTKQIRDHIVKVFFFKKVT
.:::: . :...
CCDS31 RTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
300 310 320
>>CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1089 init1: 1089 opt: 1092 Z-score: 839.8 bits: 163.6 E(32554): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 1092; 52.1% identity (78.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
: ::.. .::.: : :::::::.. :..:::..:::..:.:: ::...: : ::: :
CCDS31 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
::.:: :::: :..:.: .::.:::::: .:..:::: ::.::: : ..::::.:::
CCDS31 MYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
:.::::::: ::::. ... . ..:: ::... : : .:. : :.: :::::
CCDS31 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
::::::.: :. : :::..::: ..: .: .: . :. :::.:: .:. : :::.:.
CCDS31 YCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
..:: .:.:..: ::. : . ::::. .:: .: ::.:.:::.::.::::::.:.::
CCDS31 LGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRTK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 QIRDHIVKVFFFKKVT
:::. ....
CCDS31 QIRESLLQIPRIEMKIR
310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1050 init1: 560 opt: 1084 Z-score: 833.9 bits: 162.5 E(32554): 4e-40
Smith-Waterman score: 1084; 50.6% identity (79.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
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CCDS31 QIREQIVKIFVQKE
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CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
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CCDS31 ARLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIY
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CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
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CCDS31 QLKALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYG
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CCDS31 VRTKQIRERVLYVFTKK
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CCDS31 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
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CCDS31 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
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CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
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CCDS31 YCDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]