Result of FASTA (omim) for
pF1KB7360
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7360, 307 aa
1>>>pF1KB7360 307 - 307 aa - 307 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1941+/-0.000482; mu= 16.0542+/- 0.030
mean_var=107.4773+/-28.828, 0's: 0 Z-trim(108.8): 304 B-trim: 2154 in 2/50
Lambda= 0.123713
statistics sampled from 16420 (16917) to 16420 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 6.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1057 200.2 4.5e-51
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NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 827 159.1 1e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 826 159.0 1.2e-38
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 821 158.1 2.2e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 797 153.8 4.2e-37
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NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 780 150.7 3.4e-36
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 780 150.7 3.4e-36
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 780 150.7 3.4e-36
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 780 150.8 3.5e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 773 149.5 8.2e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 772 149.3 9.1e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 772 149.3 9.3e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 765 148.1 2.2e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 146.6 5.8e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 751 145.6 1.2e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 751 145.6 1.2e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 553 110.2 5.5e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 488 98.6 1.7e-20
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 203 47.8 3.7e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 194 46.2 0.00011
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 195 46.5 0.00012
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 195 46.6 0.00013
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 186 44.8 0.0003
NP_005192 (OMIM: 601834) C-C chemokine receptor ty ( 355) 184 44.4 0.00039
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 182 44.1 0.0005
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 179 43.5 0.0007
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 177 43.2 0.00095
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 176 43.1 0.0012
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 174 42.7 0.0015
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 173 42.5 0.0016
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 174 42.8 0.0016
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 174 42.8 0.0016
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 172 42.3 0.0018
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 171 42.1 0.0019
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 171 42.1 0.0019
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 171 42.1 0.002
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 171 42.2 0.0021
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 171 42.2 0.0021
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 171 42.3 0.0025
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 171 42.3 0.0026
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 168 41.5 0.0027
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 168 41.5 0.0027
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 170 42.1 0.0027
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 170 42.1 0.0029
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 168 41.6 0.003
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 168 41.6 0.003
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
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pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
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pF1KB7 VFNKHIA
. ..
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTA
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pF1KB7 FCDVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASY-AVILCRIRGSSSEAKNKA
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pF1KB7 MSTCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPAD--KVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEV
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300
pF1KB7 KASMKKVFNKHIA
....:..
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQ-SQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPL
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pF1KB7 DVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLL-CFLGLLASYAVILCRI-RGSSSEAKNKAM
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLL-ILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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pF1KB7 STCITHIIVI--FFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVK
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NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
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pF1KB7 ASMKKVFNKHIA
.....:.: .:
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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pF1KB7 YFFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKK----IISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLL
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NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
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:::: ..
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAP
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pF1KB7 LYFFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVM
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pF1KB7 CDVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRI-RGSSSEAKNKAM
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KB7 STCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAF-P-ADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVK
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pF1KB7 ASMKKVFNKHIA
. .::. ...
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 786 init1: 635 opt: 797 Z-score: 787.1 bits: 153.8 E(85289): 4.2e-37
Smith-Waterman score: 797; 37.5% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307)
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pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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300
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.......
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310
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pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRI-RGSSSEAKNKAMST
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pF1KB7 SMKKVFNKHIA
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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NP_001 IRKVFAFLKH
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307 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]