FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7350, 1079 aa
1>>>pF1KB7350 1079 - 1079 aa - 1079 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9163+/-0.000878; mu= 20.0210+/- 0.053
mean_var=99.6824+/-19.944, 0's: 0 Z-trim(109.5): 88 B-trim: 208 in 1/51
Lambda= 0.128459
statistics sampled from 10863 (10952) to 10863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 5.210
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 456 96.1 1.3e-18
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CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 444 93.3 2.1e-18
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 444 93.4 2.4e-18
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 439 92.7 6.9e-18
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 432 91.0 7.5e-18
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 432 91.0 8.2e-18
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 432 91.1 8.8e-18
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CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 432 91.2 1.2e-17
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 433 91.5 1.2e-17
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 433 91.5 1.2e-17
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 433 91.5 1.3e-17
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 434 91.8 1.3e-17
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 401 85.4 5.2e-16
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 401 85.4 5.4e-16
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 401 85.4 5.7e-16
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 391 83.8 3.2e-15
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 391 83.8 3.2e-15
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 383 81.8 3.5e-15
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 383 81.9 4.2e-15
CCDS59361.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 765) 375 80.6 1.5e-14
CCDS58644.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 821) 355 76.9 2.1e-13
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 333 72.7 3.1e-12
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 322 71.0 2.4e-11
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 316 70.1 8.9e-11
>>CCDS46239.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (1079 aa)
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Smith-Waterman score: 7351; 100.0% identity (100.0% similar) in 1079 aa overlap (1-1079:1-1079)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVCSAAPLLLLATTLPLLGSPVAQASQPVSETGVRPREGLQRRQWGPLIGRDKAWNERID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVCSAAPLLLLATTLPLLGSPVAQASQPVSETGVRPREGLQRRQWGPLIGRDKAWNERID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RPFPACPIPLSSSFGRWPKGQTMWAQTSTLTLTEEELGQSQAGGESGSGQLLDQENGAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPFPACPIPLSSSFGRWPKGQTMWAQTSTLTLTEEELGQSQAGGESGSGQLLDQENGAGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLSGYQWNTSICLHYPPCQSLHNHQPCGCLVFSHPEPGYCQLLPPGSPVTCLPAVPGILN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNSQLQMPGDTLSLTLHLSQEATNLSWFLRHPGSPSPILLQPGTQVSVTSSHGQAALSVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NMSHHWAGEYMSCFEAQGFKWNLYEVVRVPLKATDVARLPYQLSISCATSPGFQLSCCIP
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STNLAYTAAWSPGEGSKASSFNESGSQCFVLAVQRCPMADTTYACDLQSLGLAPLRVPIS
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ITIIQDGDITCPEDASVLTWNVTKAGHVAQAPCPESKRGIVRRLCGADGVWGPVHSSCTD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLVSCCLQILSCASKSMSEGIPWPSSEDMGTARS
1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS46238.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (997 aa)
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Smith-Waterman score: 6489; 92.8% identity (93.1% similar) in 1056 aa overlap (1-1053:1-987)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVCSAAPLLLLATTLPLLGSPVAQASQPVSETGVRPREGLQRRQWGPLIGRDKAWNERID
::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLFQGRGGWSKEGCQAQVASASPTAQCLCQHLTAFSVLMSPHTVPEEPALALLTQVGLGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLAAAFLCHFLYLATFFWMLAQALVLAHQLLFVFHQLAKHRVLPLMVLLGYLCPLGLAGV
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910 920 930 940 950 960
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLGLYLPQGQYLREGECWLDGKGGALYTFVGPVLAIIGVNGLVLAMAMLKLLRPSLSEGP
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 PAEKRQALLGVIKALLILTPIFGLTWGLGLATLLEEVSTVPHYIFTILNTLQGVFILLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PAEKRQALLGVIKALLILTPIFGLTWGLGLATLLEEVSTVPHYIFTILNTLQGVFILLFG
900 910 920 930 940 950
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 CLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLVS---CCLQILSCASKSMSEGIPWPSSEDMGTA
:::::::::::::::::::::::::::.. : :.
CCDS46 CLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLATNEGCILEHSKGGSDTAR
960 970 980 990
pF1KB7 RS
>>CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (873 aa)
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CCDS33 DASE
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:: :.. .: :::: :: .:..:: . : :. . ... :. :. ..:... :
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.: .. . ::: ::: .. .:... :.. : :. :::. ..:. : .:: :.:::
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pF1KB7 VSTVPHYIFTILNTLQGVFILLFGCLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLVSCCLQILS
. . : ::..::..:: ::: :: :.: :... : : . .: ::
CCDS34 QNLAWHVIFALLNAFQGFFILCFGILLDSKLRQLL---FNKLSALSSWKQTEKQNSSDLS
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pF1KB7 CASKSMSEGIPWPSSEDMGTARS
CCDS34 AKPKFSKPFNPLQNKGHYAFSHTGDSSDNIMLTQFVSNE
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CCDS49 SVEKLFKDSTGASRLSVAAPSIPLHILDFRAPETIESV-AQGIRKNCPFDYACITDMVKS
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CCDS49 SETTSGNIAFIVELLKNISTDLSDNVTREKMKSYSEVANHILDTAAISNWAFIPNKN--A
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CCDS49 SSDLLQSVNLFARQL--HIHNNSENIVNELFIQTKGFHINHNTSEKSLNFSMSMNNTTED
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pF1KB7 PL-QAQIPRHSLAPLVRNGTEISITSLVLRKLDHLLPSNYGQGLGDSL-YATPGLVLVIS
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CCDS49 ILGMVQIPRQELRKLWPNASQ--AISIAFPTLGAILREAHLQNV--SLPRQVNGLVL--S
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pF1KB7 IMAGDRAFSQGEVIMDFGNTDGS----PHCVFWDHSLFQGRGGWSKEGCQAQVASASPTA
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CCDS49 VVLPERL---QEIILTFEKINKTRNARAQCVGW-HS---KKRRWDEKACQMML-DIRNEV
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CCDS49 KCRCNYTSVVMSFSILMSSKSMTDK-VLDYITCIGLSVSILSLVLCLIIEATVWSRVVVT
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CCDS49 EISYMRHVCIVNIAVSLLTANVWFIIGSHFNIKAQDYNMCVAVTFFSHFFYLSLFFWMLF
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CCDS49 KALLIIYGILVIFRRMMKSRMMVIGFAIGYGCPLIIAVTTVAITEPEKGYMRPEACWLNW
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. :: .:. :...:..:: .:. .. .. :::.. . .. .. . : . ::::
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CCDS49 LLGLTWGFGIATLIEGTSLTFHIIFALLNAFQGFFILLFGTIMDHKIRDALRMRMSSLKG
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:
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