Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7349
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7349, 1016 aa
1>>>pF1KB7349 1016 - 1016 aa - 1016 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1235+/-0.00109; mu= 4.1722+/- 0.065
mean_var=223.1123+/-46.024, 0's: 0 Z-trim(110.8): 69 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.085864
statistics sampled from 11838 (11882) to 11838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 5.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46598.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20 (1016) 6641 836.6 0
CCDS54459.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20 (1661) 6514 821.0 0
CCDS11841.1 MTCL1 gene_id:23255|Hs108|chr18 (1586) 1395 186.9 2.9e-46
CCDS43505.1 SOGA3 gene_id:387104|Hs108|chr6 ( 947) 1342 180.1 1.9e-44
>>CCDS46598.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20 (1016 aa)
initn: 6641 init1: 6641 opt: 6641 Z-score: 4458.8 bits: 836.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6641; 100.0% identity (100.0% similar) in 1016 aa overlap (1-1016:1-1016)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTCRILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTCRILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLEEENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLEEENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQLHFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQLHFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKVHLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKVHLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DDMKDHGGGCGGPEARLAFSALGGGECGESLAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DDMKDHGGGCGGPEARLAFSALGGGECGESLAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQNK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LLLNELAKFRSEHELDVALSEDSCSVLSEPSQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYENRVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLLNELAKFRSEHELDVALSEDSCSVLSEPSQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYENRVLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SNLQRCDLASCQSTRPMLETDAEAGDSAQCVPAPLGETHESHAVRLCRAREAEVLPGLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SNLQRCDLASCQSTRPMLETDAEAGDSAQCVPAPLGETHESHAVRLCRAREAEVLPGLRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QAALVSKAIDVLVADANGFTAGLRLCLDNECADFRLHEAPDNSEGPRDTKLIHAILVRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QAALVSKAIDVLVADANGFTAGLRLCLDNECADFRLHEAPDNSEGPRDTKLIHAILVRLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VLQQELNAFTRKADAVLGCSVKEQQESFSSLPPLGSQGLSKEILLAKDLGSDFQPPDFRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLQQELNAFTRKADAVLGCSVKEQQESFSSLPPLGSQGLSKEILLAKDLGSDFQPPDFRD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LPEWEPRIREAFRTGDLDSKPDPSRSFRPYRAEDNDSYASEIKELQLVLAEAHDSLRGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPEWEPRIREAFRTGDLDSKPDPSRSFRPYRAEDNDSYASEIKELQLVLAEAHDSLRGLQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 EQLSQERQLRKEEADNFNQKMVQLKEDQQRALLRREFELQSLSLQRRLEQKFWSQEKNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EQLSQERQLRKEEADNFNQKMVQLKEDQQRALLRREFELQSLSLQRRLEQKFWSQEKNML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VQESQQFKHNFLLLFMKLRWFLKRWRQGKVLPSEGDDFLEVNSMKELYLLMEEEEINAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VQESQQFKHNFLLLFMKLRWFLKRWRQGKVLPSEGDDFLEVNSMKELYLLMEEEEINAQH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SDNKACTGDSWTQNTPNEYIKTLADMKVTLKELCWLLRDERRGLTELQQQFAKAKATWET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SDNKACTGDSWTQNTPNEYIKTLADMKVTLKELCWLLRDERRGLTELQQQFAKAKATWET
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 ERAELKGHTSQMELKTGKGAGERAGPDWKAALQREREEQQHLLAESYSAVMELTRQLQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ERAELKGHTSQMELKTGKGAGERAGPDWKAALQREREEQQHLLAESYSAVMELTRQLQIS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 ERNWSQEKLQLVERLQGEKQQVEQQVKELQNRLSQLQKAADPWVLKHSELEKQDNSWKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ERNWSQEKLQLVERLQGEKQQVEQQVKELQNRLSQLQKAADPWVLKHSELEKQDNSWKET
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 RSEKIHDKEAVSEVELGGNGLKRTKSVSSMSEFESLLDCSPYLAGGDARGKKLPNNPAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSEKIHDKEAVSEVELGGNGLKRTKSVSSMSEFESLLDCSPYLAGGDARGKKLPNNPAFG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KB7 FVSSEPGDPEKDTKEKPGLSSRDCNHLGALACQDPPGSQKLPFLLILAPPQPPPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FVSSEPGDPEKDTKEKPGLSSRDCNHLGALACQDPPGSQKLPFLLILAPPQPPPIL
970 980 990 1000 1010
>>CCDS54459.1 SOGA1 gene_id:140710|Hs108|chr20 (1661 aa)
initn: 6717 init1: 6514 opt: 6514 Z-score: 4370.8 bits: 821.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6514; 99.9% identity (99.9% similar) in 999 aa overlap (1-999:239-1237)
10 20 30
pF1KB7 MLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTC
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CGPSGLVRELEELRSENDYLKDEIEELRAEMLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTC
210 220 230 240 250 260
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 RILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRGLEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRGLEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLE
270 280 290 300 310 320
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREHSLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREHSLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQL
330 340 350 360 370 380
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 HFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLKYRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLKYRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKV
390 400 410 420 430 440
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEMDDMKDHGGGCGGPEARLAFSALGGGECGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEMDDMKDHGGGCGGPEARLAFSALGGGECGES
450 460 470 480 490 500
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQNKLLLNELAKFRSEHELDVALSEDSCSVLSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQNKLLLNELAKFRSEHELDVALSEDSCSVLSEP
510 520 530 540 550 560
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 SQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYENRVLLSNLQRCDLASCQSTRPMLETDAEAGDSAQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYENRVLLSNLQRCDLASCQSTRPMLETDAEAGDSAQC
570 580 590 600 610 620
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 VPAPLGETHESHAVRLCRAREAEVLPGLREQAALVSKAIDVLVADANGFTAGLRLCLDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPAPLGETHESHAVRLCRAREAEVLPGLREQAALVSKAIDVLVADANGFTAGLRLCLDNE
630 640 650 660 670 680
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 CADFRLHEAPDNSEGPRDTKLIHAILVRLSVLQQELNAFTRKADAVLGCSVKEQQESFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CADFRLHEAPDNSEGPRDTKLIHAILVRLSVLQQELNAFTRKADAVLGCSVKEQQESFSS
690 700 710 720 730 740
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 LPPLGSQGLSKEILLAKDLGSDFQPPDFRDLPEWEPRIREAFRTGDLDSKPDPSRSFRPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPLGSQGLSKEILLAKDLGSDFQPPDFRDLPEWEPRIREAFRTGDLDSKPDPSRSFRPY
750 760 770 780 790 800
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 RAEDNDSYASEIKELQLVLAEAHDSLRGLQEQLSQERQLRKEEADNFNQKMVQLKEDQQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAEDNDSYASEIKELQLVLAEAHDSLRGLQEQLSQERQLRKEEADNFNQKMVQLKEDQQR
810 820 830 840 850 860
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 ALLRREFELQSLSLQRRLEQKFWSQEKNMLVQESQQFKHNFLLLFMKLRWFLKRWRQGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALLRREFELQSLSLQRRLEQKFWSQEKNMLVQESQQFKHNFLLLFMKLRWFLKRWRQGKV
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 LPSEGDDFLEVNSMKELYLLMEEEEINAQHSDNKACTGDSWTQNTPNEYIKTLADMKVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPSEGDDFLEVNSMKELYLLMEEEEINAQHSDNKACTGDSWTQNTPNEYIKTLADMKVTL
930 940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 KELCWLLRDERRGLTELQQQFAKAKATWETERAELKGHTSQMELKTGKGAGERAGPDWKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KELCWLLRDERRGLTELQQQFAKAKATWETERAELKGHTSQMELKTGKGAGERAGPDWKA
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 ALQREREEQQHLLAESYSAVMELTRQLQISERNWSQEKLQLVERLQGEKQQVEQQVKELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALQREREEQQHLLAESYSAVMELTRQLQISERNWSQEKLQLVERLQGEKQQVEQQVKELQ
1050 1060 1070 1080 1090 1100
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 NRLSQLQKAADPWVLKHSELEKQDNSWKETRSEKIHDKEAVSEVELGGNGLKRTKSVSSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NRLSQLQKAADPWVLKHSELEKQDNSWKETRSEKIHDKEAVSEVELGGNGLKRTKSVSSM
1110 1120 1130 1140 1150 1160
940 950 960 970 980 990
pF1KB7 SEFESLLDCSPYLAGGDARGKKLPNNPAFGFVSSEPGDPEKDTKEKPGLSSRDCNHLGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SEFESLLDCSPYLAGGDARGKKLPNNPAFGFVSSEPGDPEKDTKEKPGLSSRDCNHLGAL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1000 1010
pF1KB7 ACQDPPGSQKLPFLLILAPPQPPPIL
::::::: :
CCDS54 ACQDPPGRQMQRSYTAPDKTGIRVYYSPPVARRLGVPVVHDKEGKIIIEPGFLFTTAKPK
1230 1240 1250 1260 1270 1280
>>CCDS11841.1 MTCL1 gene_id:23255|Hs108|chr18 (1586 aa)
initn: 1565 init1: 662 opt: 1395 Z-score: 944.0 bits: 186.9 E(32554): 2.9e-46
Smith-Waterman score: 2046; 41.9% identity (69.8% similar) in 969 aa overlap (1-882:1-960)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTCRILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRG
: :::: :.:::::::::::..::.:.:.::::::::::::..::..:.::::::::::.
CCDS11 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLEEENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREH
::::.::.::.:.:::.::..::.:::. :.::: :::..::.:..::.::.:::: .:
CCDS11 LEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SLKKRGTRSLGKADKKTLVQEDSADLKCQLHFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLK
:::.:.:: . : .:::. :.:::::.:::.:::::. :: ::..::..:.: ...:: :
CCDS11 SLKRRSTREMYK-EKKTFNQDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQK
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETELKVHLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEM
:.:::::.:: : . : . : .::.:::..:::::::::.:.:.:::::::::::.:::
CCDS11 YKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB7 DDMKDHGGGCG-GPEARLAFSALGGGECGESLAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQN
.::. . : : . .. . :. :: .::::::::::::::::::: .:.::.:
CCDS11 EDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFGDSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KLLLNELAKFRSEHELDVA-LSEDSCSVLS--EPSQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYEN
. : .::.::. : . . :.: . . : :::: .:.:::.:::::: :::.::
CCDS11 RQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHEN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 RVLLSNLQRCDLASCQSTR-PM-LETDAE--AG----DSAQC-VPAP-------------
..::::.::::::. . : : ..::: :: :. . .: :
CCDS11 HALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB7 --------LGETHESHAVRLC-----RARE-AEVLPGLREQAALVSKAIDVLVADANGFT
.: . :.: . : .::: .: : :...: . .... :..:...:
CCDS11 EMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB7 --AGLRLCLDNECADFRLHEAPDNSEGPR-DTKLIHAILVRLSVLQQELNAFTRKADAVL
:::: .. .: ...:: . . .:. .: ........::.:: .... .
CCDS11 HDAGLRGGAPLPGPGLQGEE--EQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIG
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 -GCS-VKEQQESFSSLPPLGSQGLSKEIL-LAKDLGSDFQPPDFRDLPEWEPRIREAFRT
: : . . :: : : . : . .. : :.:.:: :.: ... ::. . :
CCDS11 DGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQS-RLKEQLEWQ--LGPA--R
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KB7 GDLDSKPDPSRSFRP-YRAEDNDSYASEIK-----ELQL----VLAEAHDSLRGLQEQLS
:: . . :. : .: :.:. . . :.: :: : :.. :: ::
CCDS11 GD-ERESLRLRAARELHRRADGDTGSHGLGGQTCFSLELRGPPVLPEQSVSIEELQGQLV
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 QERQLRKEEADNFNQKMVQLKEDQQRALLRREFELQSLSLQRRLEQKFWSQEKNMLVQES
: .:..::...:..:. ...:.. :: .:.:..::.:: :... ::.:::.. ::
CCDS11 QAARLHQEETETFTNKIHKMEEEHLYALRWKELEMHSLALQNTLHERTWSDEKNLMQQEL
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KB7 QQFKHNFLLLFMKLRWFLKRWRQGKVLPSEGDDFLE------VNSMKELYLLMEEEEINA
...:.:..:...::::.::.::::: . ::..: : .. . :: . .. .
CCDS11 RSLKQNIFLFYVKLRWLLKHWRQGKQMEEEGEEFTEGEHPETLSRLGELGVQGGHQADGP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750
pF1KB7 QHSDNKAC--------------TGD------SWTQNTPNEYI----KTLADMKVTLKELC
.:.....: :: . .. :.. . . .. .:. :...
CCDS11 DHDSDRGCGFPVGEHSPHSRVQIGDHSLRLQTADRGQPHKQVVENQQLFSAFKALLEDFR
780 790 800 810 820 830
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 WLLRDERRGLTELQQQFAKAKATWETERAELKGHTSQMELKTGKGAGER-AGPDWKAALQ
::...:. .::::.:. ::.:..: : :: . :.: :: . :: .. . :.::.
CCDS11 AELREDERARLRLQQQYASDKAAWDVEWAVLKCRLEQLEEKTENKLGELGSSAESKGALK
840 850 860 870 880 890
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 REREEQQHLLAESYSAVMELTRQLQISERNWSQEKLQLVERLQGEKQQVEQQVKELQNRL
.::: .:.:::.:.: ::.: :.. ::.::..::..:..::. ..:. :.: ::. :.
CCDS11 KEREVHQKLLADSHSLVMDLRWQIHHSEKNWNREKVELLDRLDRDRQEWERQKKEFLWRI
900 910 920 930 940 950
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 SQLQKAADPWVLKHSELEKQDNSWKETRSEKIHDKEAVSEVELGGNGLKRTKSVSSMSEF
:::: .:
CCDS11 EQLQKENSPRRGGSFLCDQKDGNVRPFPHQGSLRMPRPVAMWPCADADSIPFEDRPLSKL
960 970 980 990 1000 1010
>>CCDS43505.1 SOGA3 gene_id:387104|Hs108|chr6 (947 aa)
initn: 923 init1: 587 opt: 1342 Z-score: 911.6 bits: 180.1 E(32554): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 1392; 49.2% identity (74.0% similar) in 526 aa overlap (1-489:377-888)
10 20 30
pF1KB7 MLEMRDVYMEEDVYQLQELRQQLDQASKTC
: ::::...:::. ::::.:..:..:.:.:
CCDS43 QEQEEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRDTFFEEDACQLQEMRHELERANKNC
350 360 370 380 390 400
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 RILQYRLRKAERRSLRAAQTGQVDGELIRGLEQDVKVSKDISMRLHKELEVVEKKRARLE
::::::::::::. :: ::::..::::.:.::::.::.::.:.:::.::: ::.::. :
CCDS43 RILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTE
410 420 430 440 450 460
100 110 120 130 140
pF1KB7 EENEELRQRLIETELAKQVLQTELERPREHSLKKRGTRSLGKADKK---TLVQEDSADLK
.:::.:::.:::.:.:::.::.:::. .: :::.::...: :..:: : ..::. :::
CCDS43 DENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRGSKDLPKSEKKAQQTPTEEDNEDLK
470 480 490 500 510 520
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 CQLHFAKEESALMCKKLTKLAKENDSMKEELLKYRSLYGDLDSALSAEELADAPHSRETE
:::.:.:::.::: ::..:. ::.: ...:: ::::.:::::: : : . : .::.:
CCDS43 CQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRFEHELQKYRSFYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAE
530 540 550 560 570 580
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LKVHLKLVEEEANLLSRRIVELEVENRGLRAEMDDMK-DHGGGCGGPEARLAFSALGGGE
::..:.:::::::.:.:.:::::::::::.::.::.. : .: ..: : :
CCDS43 LKLRLRLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAELDDLRGDDFNGSANPLMR---------E
590 600 610 620 630
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 CGESLAELRRHLQFVEEEAELLRRSSAELEDQNKLLLNELAKFRSEHE-LDVALSEDSCS
.:::.:::.:::.::.:.:::::. :.::.::: . :: :.. . : : .:. .
CCDS43 QSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNVADLEEQNKRITAELNKYKYKSGGHDSARHHDNAK
640 650 660 670 680 690
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 VLSEPSQEELAAAKLQIGELSGKVKKLQYENRVLLSNLQRCDLASCQSTR--PMLETDAE
.: :::: ::.:::.:::::: .::::::::.::.:: :::: . : : ..:::
CCDS43 --TEALQEELKAARLQINELSGKVMQLQYENRVLMSNMQRYDLASHLGIRGSPR-DSDAE
700 710 720 730 740 750
390 400 410
pF1KB7 --AG----DSAQCVP-----APLGETHESHAVRLCR----AREAEVLPG-----------
:: :. . : .:.: .:. :: : .: ::
CCDS43 SDAGKKESDDDSRPPHRKREGPIGGESDSEEVRNIRCLTPTRSFYPAPGPWPKSFSDRQQ
760 770 780 790 800 810
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 ---LREQAALVSKAIDVLVADANGFTAGLRLCLDNECAD-FRLHEAPDNSEGPRDTKLIH
.: .: ..:.:: :.::.. . . :. . : .: : : . :.. :. .:..
CCDS43 MKDIRSEAERLGKTIDRLIADTSTIITEARIYVAN--GDLFGLMDEEDDGSRIREHELLY
820 830 840 850 860 870
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 AILVRLSVLQQELNAFTRKADAVLGCSVKEQQESFSSLPPLGSQGLSKEILLAKDLGSDF
: ........::..:
CCDS43 RINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSADDRGAEEPISVSQMFQPIILLILILVLFSSLSYT
880 890 900 910 920 930
1016 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:53:53 2016 done: Sat Nov 5 08:53:54 2016
Total Scan time: 5.450 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]