Result of FASTA (omim) for
pF1KB7332
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7332, 1032 aa
1>>>pF1KB7332 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0019+/-0.000462; mu= 23.4287+/- 0.029
mean_var=66.6582+/-13.240, 0's: 0 Z-trim(108.3): 97 B-trim: 170 in 1/53
Lambda= 0.157090
statistics sampled from 16268 (16366) to 16268 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 12.980
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000876 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform (1032) 6891 1571.8 0
NP_002198 (OMIM: 603963) integrin alpha-9 precurso (1035) 2758 635.1 5.9e-181
NP_001303241 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isofo ( 195) 1330 311.0 4.2e-84
NP_001278423 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha- (1048) 967 229.2 9.2e-59
NP_002195 (OMIM: 605025,614748) integrin alpha-3 p (1051) 962 228.1 2e-58
NP_002201 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform (1048) 949 225.1 1.6e-57
NP_001138471 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1002) 861 205.2 1.5e-51
NP_002196 (OMIM: 135620) integrin alpha-5 precurso (1049) 837 199.8 6.8e-50
NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1012) 817 195.2 1.5e-48
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086) 803 192.1 1.5e-47
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169) 803 192.1 1.5e-47
NP_003629 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 I (1063) 798 190.9 3.1e-47
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 796 190.5 4.6e-47
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 796 190.5 4.6e-47
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074) 794 190.0 5.9e-47
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087) 794 190.0 6e-47
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform (1170) 794 190.0 6.4e-47
XP_005254285 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1086) 760 182.3 1.3e-44
XP_011519665 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1119) 760 182.3 1.3e-44
NP_001004439 (OMIM: 604789) integrin alpha-11 prec (1188) 760 182.3 1.3e-44
XP_011518054 (OMIM: 191830,604063) PREDICTED: inte ( 799) 756 181.3 1.8e-44
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091) 686 165.5 1.4e-39
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153) 686 165.6 1.5e-39
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152) 684 165.1 2e-39
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179) 680 164.2 3.8e-39
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 665 160.7 3e-38
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190) 666 161.0 3.5e-38
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 658 159.2 1.2e-37
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 656 158.8 1.6e-37
NP_000410 (OMIM: 187800,273800,607759) integrin al (1039) 655 158.5 1.8e-37
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160) 655 158.5 1.9e-37
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 652 157.9 3.1e-37
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028) 647 156.7 6.1e-37
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164) 647 156.7 6.8e-37
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 647 156.7 6.9e-37
XP_016858117 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 796) 643 155.7 9.4e-37
XP_016858116 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 835) 643 155.7 9.8e-37
XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180) 644 156.1 1.1e-36
XP_011508385 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1002) 643 155.8 1.1e-36
NP_001289970 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1024) 643 155.8 1.1e-36
NP_001289969 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1036) 643 155.8 1.2e-36
XP_016858115 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1100) 643 155.8 1.2e-36
XP_005277493 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1105) 643 155.8 1.2e-36
XP_016858113 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143) 643 155.8 1.3e-36
XP_016858114 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143) 643 155.8 1.3e-36
NP_003628 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isoform (1167) 643 155.8 1.3e-36
XP_016858111 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1181) 643 155.8 1.3e-36
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173) 642 155.6 1.5e-36
XP_005268907 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte ( 979) 634 153.7 4.6e-36
XP_005268903 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte (1024) 634 153.7 4.7e-36
>>NP_000876 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform 1 pr (1032 aa)
initn: 6891 init1: 6891 opt: 6891 Z-score: 8431.9 bits: 1571.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6891; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 APCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 LSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 FVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 NILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIELNKDENVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIELNKDENVA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 HVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRD
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB7 SWSYINSKSNDD
::::::::::::
NP_000 SWSYINSKSNDD
1030
>>NP_002198 (OMIM: 603963) integrin alpha-9 precursor [H (1035 aa)
initn: 1687 init1: 1156 opt: 2758 Z-score: 3369.7 bits: 635.1 E(85289): 5.9e-181
Smith-Waterman score: 2773; 42.1% identity (70.2% similar) in 1037 aa overlap (11-1025:7-1031)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAA-VRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLH
:: :. .: .. :. :.:.: ::.: . . .::: ...:::.:. :
NP_002 MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGIPAG-AYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQL--GSPNGEPCGKT
: .::.::::: :. . :: .:::...::. :: . : .:.. :. : ::::
NP_002 FHDNTRWVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCGKT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 CLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELS
: :.::..:.::.:.::: .: ...:.::::::.: . .. :: : :: .: .:... .
NP_002 CREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYY-EADHILPHGFCYIIPSNLQAK-G
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKA
. . :::..: ::.::. .::::::..:.:..:.::::::: ::.:.. : :.: : :
NP_002 RTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVLNLTDNTYLK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILH--
. :. . . .::::.: :::: : .::::::: . :::.::: :.. ....
NP_002 LNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAME
. .:::.:::::.:.::::::.::.::::::::: : ::.::.: :::: :.::. . .
NP_002 QASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDEGQVTVYINRGNGALEEQL-
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFS
:.:. : :.:::::..: :.::::: :::::::.:::. ::.:::.: : :: .:
NP_002 -ALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 QRIEGLQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSH
... : .:. : :::::::: :: :.::: ::.:::: :::.::::.:::. ::.:.
NP_002 MKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLRARPVITVDVSIFL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESP-PRFY
: :.: : .: .. : :...: :::..::.::: : : : . :: .: .. :: :
NP_002 PGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFHGKHVPGEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 FSSNG-TSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRST
: : : .: ..:.. : .:: . : ... :.:...:: .:::: :. :: ...
NP_002 FVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE-
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 EEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTIN-FARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVG
.:.::: :.:. :: . : .:. . : : : :.:.::::...:. . . :. :::.:
NP_002 RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSEDCAADLQLQGKLLLSSMDEKTLYLALG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 SMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCS
..:.. ::.:. : :::::.... .. :.::.. . :: :.::. ... : ::
NP_002 AVKNISLNISISNLGDDAYDANVSFNVSRELFFINMWQKEEMGISCELLESD---FLKCS
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 IGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKY
.:. .. :. ..: ..:.: :: :: ::. : : : :. ..:. . ... .:: .
NP_002 VGFPFMRSKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQSGNTERSESLHDNTLVLMVPLMH
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820
pF1KB7 EVKLTVHGFVNPTSFVYG-SNDEN-----EPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEI
:: .. :...::::::: : : . : . .:.:..: ::: : :. :: :
NP_002 EVDTSITGIMSPTSFVYGESVDAANFIQLDDLECHFQPINITLQVYNTGPSTLPGSSVSI
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 MVPNSFSPQTDKLFNILD--VQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTD
:: .: ..:.. . : :.: :.. : . :.. . .. : :..:.
NP_002 SFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVGQEKGNCSFQKNPTPCIIPQEQENI--FHTIFAFFTKSG
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 KRLLYCIKADPHCLNFLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFP
...: : : ::. :::. . . . .. : . ::. : .:...: ::
NP_002 RKVLDCEKPGISCLTAHCNFSALAKEESRTIDIYMLLNTEILKKDSSSVIQFMSRAKVKV
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 EPNPRVIEL--NKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKA
.: ::.:. .. :.:. :..:.::. .:. : . ::. :::.:....::.. ..::
NP_002 DPALRVVEIAHGNPEEVT-VVFEALHNLEPRGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKM
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030
pF1KB7 GFFKRQYKSILQ-EENRR---DSWSYINSKSNDD
:::.:.:: :.. :.::. :::...
NP_002 GFFRRRYKEIIEAEKNRKENEDSWDWVQKNQ
1010 1020 1030
>>NP_001303241 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform 2 (195 aa)
initn: 1360 init1: 1330 opt: 1330 Z-score: 1630.9 bits: 311.0 E(85289): 4.2e-84
Smith-Waterman score: 1330; 97.4% identity (99.0% similar) in 191 aa overlap (1-191:1-191)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 APCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLD
::::: ..:.
NP_001 APCYQGSISKYRART
190
>>NP_001278423 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 Is (1048 aa)
initn: 581 init1: 136 opt: 967 Z-score: 1176.0 bits: 229.2 E(85289): 9.2e-59
Smith-Waterman score: 1174; 26.4% identity (58.8% similar) in 1074 aa overlap (22-1029:27-1045)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYS
: . : :. . .:.:.:. .:.::... :::.
NP_001 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPACQAFNLDVEKLTVYSGPKGSYFGYA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VVLHSHGANRW-LLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPC
: .: : .::::: :: .. .... ::.: : . . :.:. . . :..
NP_001 VDFHIPDARTASVLVGAPKAN-TSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTNNRKI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB7 ---G-KTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGV
: : .: ..:::.:.:.. ...:..:.:. ..:... . .: :.: :: .
NP_001 RVNGTKEPIEFKSNQWFGATVK---AHKGKVVACAPLYHWRTL--KPTPEKDPVGTCYVA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 PPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGIS-SFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLF-
.. . ...:: .. . :... ::::.: .:: . ...:.::: :: :...
NP_001 IQNFSA--YAEFSPCRNSNADPEGQGY--CQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGSFYWQGQVIT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB7 --VYNITTN-KYKAFL-----DKQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQI
: .: .: ..: .: .::..: .:: .. :.:.: :. :
NP_001 ASVADIIANYSFKDILRKLAGEKQTEVAPASY-----------DDSYLELVAGIPRGAQ-
240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GKAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QST
. .:. :. ........ :....:::: .: . :.:.::..:.:::::. .:.
NP_001 NFGYVSIINSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVLVGAPLFMEREFESN
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 IREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAP-
:: :....:.. .: .. :.:.. .. ::: ....:::...::..:.:::.:
NP_001 PREVGQIYLYLQVSS--LLFRDPQILTGTETFG-RFGSAMAHLGDLNQDGYNDIAIGVPF
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 QEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSL-SMFGQSISGQIDADNNGYVDVAV
: .: . :::: ::... :: ..:. :... : :: .. :. : :.: : :. :
NP_001 AGKDQRGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGDSDIDKNDYPDLIV
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KB7 GAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDC-VENGWPSV-CIDLTLCFSYKGK
::: . .... :.:::: :::.: :: .: . : : .. :. :..: .: : :.
NP_001 GAFGTGKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAACFSLRVCASVTGQ
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 EVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKD
. . :::. ...:: .. . : : .: . . . .. .:. ...: .
NP_001 SIANTIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDE
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 V--RDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHE
. :: :.::.: : : .. :.. : ..:::. .: .:... .. :...
NP_001 TEFRDKLSPINISLNYSLDESTF-KEGLE----VKPILNYYRE-NIVSEQAHILVDCGED
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 N-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLY
: : ::..::. : .: . .:. . ::: .. : :. :::. : : .:
NP_001 NLCVPDLKLSAR-----P--DKHQVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEAD
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 FIKILELEE--KQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDL
.. : . .. . ..:: .. . .. :..: .:. . .... . : : ... ..
NP_001 YVGIERNNKGFRPLSCEYKMENVTRMVVCDLGNPMVSG-TNYSLGLRFAVPRLEKTNMSI
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 SITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYG-SNDENEPETCM
.. .. :. :: . :.. : . ... ..: .: ..: : : : :
NP_001 NFDLQIRSSNK---DNPDSNFVSLQINITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHK
750 760 770 780 790
810 820 830 840 850
pF1KB7 VEKMN-LTFHVI---NTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTG-ECHF--
:... :. :. : : : .. .:. : :: . . :. :. .:: .:.
NP_001 EEEVGPLVEHIYELHNIGPSTISDTILEVGWP--FSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNP
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890
pF1KB7 -------------ENYQRVCALEQQKSAMQTLKG----IVRFLSKTDKRLLYCIKADPHC
:. .. :. .... . .. .:.: .. ..: : . . :
NP_001 NINPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNSTIPHLVRKRDVHVVEFHRQSPAKILNCTNIE--C
860 870 880 890 900 910
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 LNFLCNFGKMESGKEASVHIQ--LEGRPSILEMDETSAL----KFEIRATGFPEPNPRVI
:.. : :..:.:. : .... : .. . . .. :: .::.. . . ..
NP_001 LQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQRKNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLP
920 930 940 950 960 970
960 970 980 990 1000
pF1KB7 ELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIV--IISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQY
: . :. .. :. :.: .: ..::::.:: ... ..:: ::: :
NP_001 EGSI------VIKTSVIWATPNVSFSIPLWVIILAILLGLLVLAILTLALWKCGFFDRAR
980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030
pF1KB7 KSILQEENRRDSWSYINSKSNDD
.:. : . :.:.
NP_001 P---PQEDMTDREQLTNDKTPEA
1030 1040
>>NP_002195 (OMIM: 605025,614748) integrin alpha-3 prepr (1051 aa)
initn: 483 init1: 243 opt: 962 Z-score: 1169.8 bits: 228.1 E(85289): 2e-58
Smith-Waterman score: 1047; 27.5% identity (56.2% similar) in 1076 aa overlap (9-1019:3-1033)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLL-LCLGVPTG----RPYNVDTESALLYQ-GPHNTLFGY
::: :: .:: : : : .: .:.::. .. . : ..::::
NP_002 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SVVLH--SHGANRWLLV-GAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNG
::.:: .. .:.::. ::: . .. . ::.: : . . . ::.... :
NP_002 SVALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHK-DDCERMNITVKN-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNEN-KLPTGGCYGVPP
.: :. .:. .:::::.. : : : ...:.::. .... .:. . .: ::
NP_002 DP-GHHIIED---MWLGVTVASQ-GPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGN
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 DLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFAS--CQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFV-
::. . : .... .. . . . :: : :. .:.. . .::::. : :. ..
NP_002 DLELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMI
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 ----YNITTNKYKAFLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHF-RSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAY
.... .:: : ..: .. :.::.. .: : .. .: :::.:...: ..
NP_002 QRKEWDLSEYSYK---DPEDQGNL--YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVF
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB7 IFSIDEK-ELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREE--GRV
..: . .: . ..:...:.:::... .::: ::..:::::::. .:: : .
NP_002 LLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAI
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 FVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGA
.:..:. .:. . : . :. . . .: :: :....:::..:::.:.:.::: : :
NP_002 YVFMNQ-AGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGK
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 IYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQIS-KSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSA
.:::.. . :. .: :.: ... .:. :: :.:::.:.:.: : :. ::.. ::
NP_002 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHI
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 VLLRTRPVV-IVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSY-KGKEVPGY---I
::::.:::. :: .: :. . :. .. :... :::.: .. :.: :
NP_002 VLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATS----CVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNI
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 VLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILT
.: :.. : .:. :::. :... : :. : . : : :. . .. ..:: :
NP_002 TLAYTLEADRDRR---PPRLRFAGS-ESAVFHGFF--SMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLR
520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 PIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ--PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSAD
:: : : : : . : . :. :::.: . . . ..: . :. .: : ..
NP_002 PIIISMNYSL-PLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALE-NHTEVQFQKECGPDNKCESN
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KB7 LQVSAKIGFLKPHENK-TYLAVG-SMKTLMLNVSLFN------AGDDAYETTLHVKLPVG
::. : .:.. ...: . : . ... :.:.... : .:.::.:. : . .: .
NP_002 LQMRA--AFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPA
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730
pF1KB7 LYFIKILELEEKQIN----CEVTD---NSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSL
: . .. : : ::. . . ..: .. : : .: :.. :..:.
NP_002 LLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLIAFEVIGVTLHTR-DLQVQLQLSTS
690 700 710 720 730 740
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 SRAEED----LSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS
:. .. :.. : : .. : : . . . . ::. .: .. .
NP_002 SHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQV
750 760 770 780 790 800
800 810 820 830 840
pF1KB7 NDENEPET---CMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS----PQTDKLFNILD
. .: . .: .. ..: : . :. :: : .. : : : :.: :.
NP_002 GPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPT---EITVHGNGSWPCRPPGD-LINPLN
810 820 830 840 850
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 VQTTT-GECHFENYQRVCALEQ---QKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
. . :. .: :. : :: . . :.: .: : . ::. .
NP_002 LTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET---VLTCATGRAHCVWL
860 870 880 890 900 910
910 920 930 940 950
pF1KB7 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN-PRVIELNKDE--
: . ...:. .. . : .. . . .. . :: : . . : . ::
NP_002 ECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWF
920 930 940 950 960 970
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 --NVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQE
.. :.: : . ... .. ::::::.::: :: ::::: : :
NP_002 SVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLL-----WKCGFFKRARTRALYE
980 990 1000 1010 1020
1020 1030
pF1KB7 ENRRDSWSYINSKSNDD
.:.
NP_002 AKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
1030 1040 1050
>>NP_002201 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 1 pr (1048 aa)
initn: 581 init1: 161 opt: 949 Z-score: 1153.9 bits: 225.1 E(85289): 1.6e-57
Smith-Waterman score: 1163; 27.2% identity (58.5% similar) in 1099 aa overlap (1-1032:1-1047)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSV--VL
::. ::. : . : .:: : .: : .:.:..: :.::... ::..: .
NP_002 MAFPPRRR---LRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC
: .. .:::::: :: .. .... : . .: ... . :. ... . ... .:
NP_002 PSASSRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSST--RRCQPIEFDATGNRDYAKDD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 -LEERDNQWLGVTL-SRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRT
:: ...::.:... :.: .:..:. ..:.. .:.: . :.: :. . .:
NP_002 PLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT--EMKQERE-PVGTCF-LQDGTKT
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 ELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTK-DLIVMGAPGSSYWTGSL--------
. ::: .. . :..: ::.:.: .:: : ...:.::: :: :.:
NP_002 ---VEYAPCRSQDIDADGQGF--CQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEI
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB7 ---FVYNITTNKYKAFL-DKQNQVKFG-SYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IG
. :. . ::. : . :. : :::::::..: : .. . :.:.:. . .:
NP_002 VSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLG
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QSTI
.::. : :... :... :.....::: :: :.:.:.: ..:...:::. .. .
NP_002 MVYIY--DGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKL
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 REEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE
.: :.: : .. .:: . . :.: : . .: ::: .:. :::.:.:::.:.::.::
NP_002 QEVGQVSVSLQRASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYG
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 -DDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS-MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVG
.: .: .::.:::. :.... :: .:: ..:. :: :..: : :.::: :. ::
NP_002 GEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVG
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KB7 AFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKE
:: : :.: :.:::. :.:.: .: .:. . : : :... .:.. ::
NP_002 AFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKG
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 V-PGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMR-
: : . . .. :: .. . : ... : . : . .:. .. .:. :..:
NP_002 VLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGL-MQCEELIAYLRD
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 -KDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAH
.. :: :::: : :.: . :.. . :::::.: .: ... .. :..
NP_002 ESEFRDKLTPITIFMEYRL-----DYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQA-HILLDCGE
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 EN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGL
.: :. :.:: . ..: : .:. . : : :. : :. :::. : :..:.
NP_002 DNVCKPKLEVS-----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQA
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730
pF1KB7 YFIKILELEEK--QINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFL--LDVSSLSRAE
:: ... .: ...: .. . :. :..: . . ..: : : ...:
NP_002 DFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPM-----KAGTQLLAGLRFSVHQQSE
690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 EDLSITVHATCENEEEMDNLK---HSRVTVAIPLKYEVKLTV---HGFVNPTSFVYGSND
: :. .. . .:... .: .:. :.. . : :. .. . :
NP_002 MDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENP
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KB7 ENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTGECH
:.: .. : .. ... :.: : .. .... : ... .: :. :: . : .
NP_002 ETEEDVGPV--VQHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT--LLYILHYDID-GPMN
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890
pF1KB7 FENYQRVCALEQQKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----KRLLYCIKADPH--------CLN
. ... :. . :..:: . : .. : :: : ..: : ::.
NP_002 CTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLK
860 870 880 890 900 910
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 FLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATG------FPEPNPRVIEL
..:. :... :: : .... . :.. .. ..... :: : . ..
NP_002 IVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDI
920 930 940 950 960 970
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 NKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSIL
... :. . :. : . .: ..: ::..: .. .::.. ::::: .
NP_002 TNSTLVTTNVTWGI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQ
980 990 1000 1010 1020
1020 1030
pF1KB7 QEENRRDSWSYINSKSNDD
.:..:.. . :...:..
NP_002 EEQEREQLQPHENGEGNSET
1030 1040
>>NP_001138471 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 2 (1002 aa)
initn: 615 init1: 161 opt: 861 Z-score: 1046.4 bits: 205.2 E(85289): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1075; 26.9% identity (58.4% similar) in 1032 aa overlap (66-1032:19-1001)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 VDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGK
.:::::: :: .. .... : . .: ..
NP_001 MLLGTLLLILYILMLCRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSS
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 NPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC-LEERDNQWLGVTL-SRQPGENGSIVTCG--HRWKNI
. . :. ... . ... .: :: ...::.:... :.: .:..:. ..:..
NP_001 T--RRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT-
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTK-DL
.:.: . :.: :. . .: . ::: .. . :..: ::.:.: .:: :
NP_001 -EMKQE-REPVGTCF-LQDGTKT---VEYAPCRSQDIDADGQGF--CQGGFSIDFTKADR
110 120 130 140 150
220 230 240 250
pF1KB7 IVMGAPGSSYWTGSL-----------FVYNITTNKYKAFL-DKQNQVKFG-SYLGYSVGA
...:.::: :: :.: . :. . ::. : . :. : :::::::..
NP_001 VLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 GHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IGKAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLN
: : .. . :.:.:. . .: .::. : :... :... :.....::: :: :.:.:
NP_001 GDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIY--DGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDIN
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 ADGFSDLLVGAPM------QSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGE
.: ..:...:::. .. ..: :.: : .. .:: . . :.: : . .: :::
NP_001 GDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGS
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420
pF1KB7 SIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE-DDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS-
.:. :::.:.:::.:.::.:: .: .: .::.:::. :.... :: .:: ..:.
NP_001 AIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPP
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCV
:: :..: : :.::: :. :::: : :.: :.:::. :.:.: .: .:. . :
NP_001 SFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCS
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 ENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKEV-PGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDV
: :... .:.. :: : : . . .. :: .. . : ... : . :
NP_001 LPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHS
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 ITGSIQVSSREANCRTHQAFMR--KDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQP
. .:. .. .:. :..: .. :: :::: : :.: . :.. . :::
NP_001 KNMTISRGGL-MQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRL-----DYRTAADTTGLQP
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 ILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLN
::.: .: ... .. :...: :. :.:: . ..: : .:. . : :
NP_001 ILNQFTPANISRQA-HILLDCGEDNVCKPKLEVS-----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLI
570 580 590 600 610
670 680 690 700 710
pF1KB7 VSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEK--QINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYV
:. : :. :::. : :..:. :: ... .: ...: .. . :. :..:
NP_001 VKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLG----
620 630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 DHLSRIDISFL--LDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLK---HSRVTVAIPLKYE
. . ..: : : ...: : :. .. . .:... .: .:. :
NP_001 -NPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVE
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 VKLTV---HGFVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPN
.. . : :. .. . : :.: .. : . ... :.: : .. .... :
NP_001 IRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQH--IYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPY
730 740 750 760 770 780
840 850 860 870 880
pF1KB7 SFSPQTDKLFNILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----
... .: :. :: . : . . ... :. . :..:: . : .. :
NP_001 KYNNNT--LLYILHYDID-GPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLIT
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930
pF1KB7 KRLLYCIKADPH--------CLNFLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKF
:: : ..: : ::...:. :... :: : .... . :.. ..
NP_001 KRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSY
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KB7 EIRATG------FPEPNPRVIELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLI
..... :: : . ..... :. . :. : . .: ..: ::.
NP_001 SLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLL
910 920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030
pF1KB7 VLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYINSKSNDD
.: .. .::.. ::::: . .:..:.. . :...:..
NP_001 LLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
970 980 990 1000
>>NP_002196 (OMIM: 135620) integrin alpha-5 precursor [H (1049 aa)
initn: 663 init1: 147 opt: 837 Z-score: 1016.7 bits: 199.8 E(85289): 6.8e-50
Smith-Waterman score: 1174; 27.4% identity (59.7% similar) in 1054 aa overlap (10-1007:18-1028)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLF
:::: ..::: : .:.:.:. . .:: ...:
NP_002 MGSRTPESPLHAVQLRWGPRRRPPLLPLLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPGSFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 GYSVVLHSHGANRW-LLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNG
:.:: .. :.. .::::: :: .. .:.. ::.: : : .: : : ... : ..
NP_002 GFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKAN-TSQPGVLQGGAVYLCPWGASPTQ-CTPIEFDSKGS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB7 E--------PCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLP
. :. .: .. ::.:.:. : : .::..:. . :.. :. . :
NP_002 RLLESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATV-RAHG--SSILACAPLYSWRTE---KEPLSDP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 TGGCYGVPPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKD-LIVMGAPGSSY
.: :: . : :.. . ::: .:. :... ::.:.:. .:: .:.:.::: .
NP_002 VGTCY-LSTDNFTRILEY-APCRSDFSWAAGQGY--CQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYF
180 190 200 210 220
230 240 250 260
pF1KB7 WTGSLFVYN---ITTNKYKAFLDK--QNQVKF--------GSYLGYSVGAGHFRSQHTTE
: :... . :. . : .: . :.:.. :::::::..:.: .. : .
NP_002 WQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTED
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 VVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGA
:.:.:. . . .:. .. ... :....:....:::: .: :.:.:.::..::::::
NP_002 FVAGVPKGN-LTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGA
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 PM------QSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDND
:. .. .: :::.::.. .: . . .:.: :... ::: :.. :::.:.:
NP_002 PLLMDRTPDGRPQEVGRVYVYLQHPAG-IEPTPTLTLTGHDEFG-RFGSSLTPLGDLDQD
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KB7 GFEDVAIGAP-QEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQI-SKSLSMFGQSISGQID
:..::::::: . ::..... : :..: :: .. : :.. ..::... : :
NP_002 GYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQVLQPLWAASHTPDFFGSALRGGRD
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 ADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDL
:.::: :. ::.: :.::. : ::.: ..:::. : : . .: .: : .::.:
NP_002 LDGNGYPDLIVGSFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGNPVACINL
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 TLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANC
..:.. .::.: : . ...:: ... . : ....: .. . : :: ..:: .:
NP_002 SFCLNASGKHVADSIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGARE-DC
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 RTHQAFMRKD--VRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKT
: . ..:.. :: :.::.: . : :. . . :.: :. .... : :.
NP_002 REMKIYLRNESEFRDKLSPIHIALNFSLDPQ-----APVDSHGLRPALHYQSKSRIEDKA
590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 INFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDD-AYET
. :...: : :::. . .: ..:..:: :. ..: :. :.:. :::.
NP_002 QILLD-CGEDNICVPDLQLEV-FG----EQNHVYL--GDKNALNLTFHAQNVGEGGAYEA
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 TLHVKLPVGLYFIKILEL--EEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLD
:.: : . ... . ....:. . : :..: . : .. .
NP_002 ELRVTAPPEAEYSGLVRHPGNFSSLSCDYFAVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWG-GLRFT
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 VSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS
: : ... ... . .: ..: . . :. . .. ....:..: .: . ..
NP_002 VPHLRDTKKTIQFDFQILSKN---LNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVTLNGVSKPEAVLFPV
760 770 780 790 800
800 810 820 830 840
pF1KB7 ND---ENEP--ETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQ
.: ...: : . .. ....:: : : . .:. :... : ..: :
NP_002 SDWHPRDQPQKEEDLGPAVHHVYELINQGPSSISQGVLELSCPQALEGQ-----QLLYVT
810 820 830 840 850 860
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 TTTG-ECHFENYQRVCALEQQKSA----MQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNFL
.:: .: .. .:: . . .: .. : ... ..: : .:. :. .
NP_002 RVTGLNCTTNHPINPKGLELDPEGSLHHQQKREAPSRSSASSGPQILKCPEAE--CFRLR
870 880 890 900 910 920
910 920 930 940 950
pF1KB7 CNFGKMESGKEASV--HIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN---PRVIELNKD
:..: ... . :. :... .. . . . .:. : .. : :: . .:.
NP_002 CELGPLHQQESQSLQLHFRVWAKTFLQREHQPFSLQCEAVYKALKMPYRILPRQLP-QKE
930 940 950 960 970
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 ENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEE
..:: .. . . . . :: ..:.::..: :. :...: :::::
NP_002 RQVATAV--QWTKAEGSYGVPLWIIILAILFGLLLLGLLIYILYKLGFFKRSLPYGTAME
980 990 1000 1010 1020 1030
1020 1030
pF1KB7 NRRDSWSYINSKSNDD
NP_002 KAQLKPPATSDA
1040
>>NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 3 (1012 aa)
initn: 581 init1: 161 opt: 817 Z-score: 992.5 bits: 195.2 E(85289): 1.5e-48
Smith-Waterman score: 1040; 26.3% identity (57.3% similar) in 1087 aa overlap (1-1032:1-1011)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSV--VL
::. ::. : . : .:: : .: : .:.:..: :.::... ::..: .
NP_001 MAFPPRRR---LRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC
: .. .:::::: :: .. .... : . .: ... . :. ... . ... .:
NP_001 PSASSRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSST--RRCQPIEFDATGNRDYAKDD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 -LEERDNQWLGVTL-SRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRT
:: ...::.:... :.: .:..:. ..:.. .:.: . :.: :.
NP_001 PLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT--EMKQERE-PVGTCF--------
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQA-GISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTN
:: .: ..: :.. . : . ... :. ::.: :
NP_001 ---------LQDGTKTV--EYAPCRSRQLISDQVAEIVSKYDPN---------VYSIKYN
160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KYKAFLDKQNQVKFG-SYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IGKAYIFSIDEKEL
. : . :. : :::::::..: : .. . :.:.:. . .: .::. : :..
NP_001 NQLA--TRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIY--DGKNM
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340
pF1KB7 NILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QSTIREEGRVFVYINS
. :... :.....::: :: :.:.:.: ..:...:::. .. ..: :.: : ..
NP_001 SSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQR
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE-DDLQGAIYIYN
.:: . . :.: : . .: ::: .:. :::.:.:::.:.::.:: .: .: .::.:
NP_001 ASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFN
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS-MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRT
::. :.... :: .:: ..:. :: :..: : :.::: :. :::: : :.: :.
NP_001 GRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRA
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510
pF1KB7 RPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKEV-PGYIVLFYNM
:::. :.:.: .: .:. . : : :... .:.. :: : : . . ..
NP_001 RPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVEL
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 SLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMR--KDVRDILTPIQ
:: .. . : ... : . : . .:. .. .:. :..: .. :: ::::
NP_001 LLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGL-MQCEELIAYLRDESEFRDKLTPIT
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 IEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSA
: :.: . :.. . :::::.: .: ... .. :...: :. :.::
NP_001 IFMEYRL-----DYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQA-HILLDCGEDNVCKPKLEVS-
560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 KIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEK-
. ..: : .:. . : : :. : :. :::. : :..:. :: ... .:
NP_001 ----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEAL
610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 -QINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFL--LDVSSLSRAEEDLSITVHATCE
...: .. . :. :..: . . ..: : : ...: : :. .
NP_001 ARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPM-----KAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQ
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800
pF1KB7 NEEEMDNLK---HSRVTVAIPLKYEVKLTV---HGFVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKM
. . .:... .: .:. :.. . : :. .. . : :.: .. : .
NP_001 SSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPV--V
720 730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KB7 NLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQ
. ... :.: : .. .... : ... .: :. :: . : . . ... :.
NP_001 QHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT--LLYILHYDID-GPMNCTSDMEINPLRI
780 790 800 810 820
870 880 890 900 910
pF1KB7 QKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----KRLLYCIKADPH--------CLNFLCNFGKMESGK
. :..:: . : .. : :: : ..: : ::...:. :... ::
NP_001 KISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGK
830 840 850 860 870 880
920 930 940 950 960
pF1KB7 EASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATG------FPEPNPRVIELNKDENVAHVLLE
: .... . :.. .. ..... :: : . ..... :. .
NP_001 SAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTW
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 GLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYI
:. : . .: ..: ::..: .. .::.. ::::: . .:..:.. .
NP_001 GI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQEEQEREQLQPHE
950 960 970 980 990 1000
1030
pF1KB7 NSKSNDD
:...:..
NP_001 NGEGNSET
1010
>>NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform b (1086 aa)
initn: 572 init1: 196 opt: 803 Z-score: 974.9 bits: 192.1 E(85289): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 826; 26.9% identity (58.0% similar) in 872 aa overlap (171-1014:239-1042)
150 160 170 180 190
pF1KB7 IVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI----APCYQDYVKKFGENFA
:: :::.:.: . :: . .:. ...
NP_001 TKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVIEGTSKQD-LTSFNMELS
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 SCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLDKQN---QVKFGSYLGY
: .:::. .. :.:: :.. :.:. :. . . .:. .. .:. : ::::
NP_001 S--SGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGG-FLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVRAG-YLGY
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEK--ELNILHEMKGKKLGSYFGASVC
.: : :.:. ...:::.....:.. .:. . . . .. ..: ..:::::. .:
NP_001 TVTWLPSR-QKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELC
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360
pF1KB7 AVDLNADGFSDLL-VGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYA-ARFG
.::.. :: ..:: .:::. .. ::::.: : ..: :. : .:::
NP_001 GVDVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFIYQRRQLGF---EEVSELQGDPGYPLGRFG
390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLSM
:.:. : ::..::. :::.::: :. :::.::.::: :.: :::::: :. ....
NP_001 EAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEE--QGAVYIFNGRHGGLSPQPSQRIEGTQVLSGIQW
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSH-PESVNRTKFDCVE
::.:: : : ...: .:::::: .. ..: .:::: . . .: : . . .:
NP_001 FGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGA--ESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSY
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 NGWPSVC--IDLTLCFSYKG--KEVPGYIV--LFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSD
. .. ...:.::. :. . : .: : :...:: .: . : : :
NP_001 STSNKMKEGVNITICFQIKSLIPQFQGRLVANLTYTLQLDGHRTRR---RGLFP--GGRH
560 570 580 590 600 610
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 VITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPI
. .: :.. .: . . :.:...::.. . : . . :. . . ::
NP_001 ELRRNIAVTTS-MSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQRAGKDIPPI
620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNV
:. . ... . : : . :.... : :.:.:: ..: .... : . .. .: ...
NP_001 LRPSLHSETWE--IPFEKNCGEDKKCEANLRVS-----FSPARSRA-LRLTAFASLSVEL
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710
pF1KB7 SLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQ---INCE-VTDNSGVVQ--LDCSIGY
:: : .::: . : ...: :: : :. :. .. ..:: . ..: ... :.:...
NP_001 SLSNLEEDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQIPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSS
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 IYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHA--TCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYE
. ...... .: . :. .:: ::.::. : :. . .:. ::. :
NP_001 PIFKAGHSVALQMMFN--TLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDS-DLLEDNSATTIIPILYP
790 800 810 820 830
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 VKLTVHGFVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS
... .. . : .: : . :. .:..: . . . :.. . . ::.
NP_001 INILIQD--QEDSTLYVSFTPKGPKIHQVKHMYQVRIQPSIHDHNIPTLEAVVGVPQ--P
840 850 860 870 880 890
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 PQTDKLFNILDVQTTTG-ECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIK
:. . . .:: ::.:. .:. .: : : . : . : ..
NP_001 PSEGPITHQWSVQMEPPVPCHYEDLERL-----PDAAEPCLPGAL-FRCPVVFRQEILVQ
900 910 920 930 940
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 ADPHCLNFLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIE
. .. : :..: :: ..: : : .. .:. .:.. ..
NP_001 V----IGTLELVGEIE----ASSMFSLC---SSLSISFNSSKHFHLYGS-----------
950 960 970 980
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 LNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSI
. ..:.:... . :... . ..:. . ::..:::: :..:.:::::. :
NP_001 ---NASLAQVVMK-VDVVYEKQMLYLYVLSG--IGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEK
990 1000 1010 1020 1030 1040
1020 1030
pF1KB7 LQEENRRDSWSYINSKSNDD
..
NP_001 MEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEAGDPGCLKPLHEKDSESGGGKD
1050 1060 1070 1080
1032 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:45:33 2016 done: Sat Nov 5 08:45:35 2016
Total Scan time: 12.980 Total Display time: 0.430
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]