Result of FASTA (omim) for
pF1KB7329
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7329, 900 aa
1>>>pF1KB7329 900 - 900 aa - 900 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2003+/-0.000357; mu= 13.1835+/- 0.022
mean_var=117.4914+/-24.291, 0's: 0 Z-trim(116.8): 8 B-trim: 1082 in 1/52
Lambda= 0.118324
statistics sampled from 28264 (28272) to 28264 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 14.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_861524 (OMIM: 610887) DNA polymerase nu [Homo s ( 900) 5928 1023.4 0
XP_011510656 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymer (1828) 477 93.0 1.4e-17
XP_016861054 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymer (2201) 477 93.1 1.6e-17
XP_011510650 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymer (2420) 477 93.1 1.8e-17
XP_011510645 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymer (2545) 477 93.1 1.9e-17
NP_955452 (OMIM: 604419) DNA polymerase theta [Hom (2590) 477 93.1 1.9e-17
XP_011510649 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymer (2591) 477 93.1 1.9e-17
>>NP_861524 (OMIM: 610887) DNA polymerase nu [Homo sapie (900 aa)
initn: 5928 init1: 5928 opt: 5928 Z-score: 5470.2 bits: 1023.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5928; 100.0% identity (100.0% similar) in 900 aa overlap (1-900:1-900)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENYEALVGFDLCNTPLSSVAQKIMSAMHSGDLVDSKTWGKSTETMEVINKSSVKYSVQL
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NP_861 MENYEALVGFDLCNTPLSSVAQKIMSAMHSGDLVDSKTWGKSTETMEVINKSSVKYSVQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EDRKTQSPEKKDLKSLRSQTSRGSAKLSPQSFSVRLTDQLSADQKQKSISSLTLSSCLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 EDRKTQSPEKKDLKSLRSQTSRGSAKLSPQSFSVRLTDQLSADQKQKSISSLTLSSCLIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QYNQEASVLQKKGHKRKHFLMENINNENKGSINLKRKHITYNNLSEKTSKQMALEEDTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 QYNQEASVLQKKGHKRKHFLMENINNENKGSINLKRKHITYNNLSEKTSKQMALEEDTDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AEGYLNSGNSGALKKHFCDIRHLDDWAKSQLIEMLKQAAALVITVMYTDGSTQLGADQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 AEGYLNSGNSGALKKHFCDIRHLDDWAKSQLIEMLKQAAALVITVMYTDGSTQLGADQTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VSSVRGIVVLVKRQAEGGHGCPDAPACGPVLEGFVSDDPCIYIQIEHSAIWDQEQEAHQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 VSSVRGIVVLVKRQAEGGHGCPDAPACGPVLEGFVSDDPCIYIQIEHSAIWDQEQEAHQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FARNVLFQTMKCKCPVICFNAKDFVRIVLQFFGNDGSWKHVADFIGLDPRIAAWLIDPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 FARNVLFQTMKCKCPVICFNAKDFVRIVLQFFGNDGSWKHVADFIGLDPRIAAWLIDPSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ATPSFEDLVEKYCEKSITVKVNSTYGNSSRNIVNQNVRENLKTLYRLTMDLCSKLKDYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 ATPSFEDLVEKYCEKSITVKVNSTYGNSSRNIVNQNVRENLKTLYRLTMDLCSKLKDYGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 WQLFRTLELPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 WQLFRTLELPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 NNQLREILFGKLKLHLLSQRNSLPRTGLQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKIILEYRQVHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 NNQLREILFGKLKLHLLSQRNSLPRTGLQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKIILEYRQVHK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 IKSTFVDGLLACMKKGSISSTWNQTGTVTGRLSAKHPNIQGISKHPIQITTPKNFKGKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 IKSTFVDGLLACMKKGSISSTWNQTGTVTGRLSAKHPNIQGISKHPIQITTPKNFKGKED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 KILTISPRAMFVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 KILTISPRAMFVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 WKDVPVEQVTHADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 WKDVPVEQVTHADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 FARAAIAQCHQTGCVVSIMGRRRPLPRIHAHDQQLRAQAERQAVNFVVQGSAADLCKLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 FARAAIAQCHQTGCVVSIMGRRRPLPRIHAHDQQLRAQAERQAVNFVVQGSAADLCKLAM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 IHVFTAVAASHTLTARLVAQIHDELLFEVEDPQIPECAALVRRTMESLEQVQALELQLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 IHVFTAVAASHTLTARLVAQIHDELLFEVEDPQIPECAALVRRTMESLEQVQALELQLQV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 PLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNSLAAPGSPASTQPPPLHFSPSFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_861 PLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNSLAAPGSPASTQPPPLHFSPSFCL
850 860 870 880 890 900
>>XP_011510656 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymerase (1828 aa)
initn: 947 init1: 357 opt: 477 Z-score: 436.6 bits: 93.0 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 781; 29.4% identity (58.4% similar) in 608 aa overlap (348-855:1225-1823)
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 CFNAKDFVRIVLQFFGNDGSWKHVADFIGLDPRIAAWLIDPSDATPSFEDLVEKYCEKSI
::..: ::.::.. :.....: .. . .
XP_011 KECSVVIYDFIQSYKILLLSCGISLEQSYEDPKVACWLLDPDSQEPTLHSIVTSFLPHEL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
380 390 400 410 420
pF1KB7 TV--KVNSTYGNSSRNIVNQN-----VRENLKTLYRL-TMD-LCSKLKDYGLWQLFRTLE
. .... : .: .. . : ..... . .:. : : :. .: ..:: .:
XP_011 PLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVESILIFNSMNQLNSLLQKENLQDVFRKVE
1260 1270 1280 1290 1300 1310
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITSNNQLREIL
.: ::..: ..: . : :. . .. :.: .: .:. .::. : .::.... :.:
XP_011 MPSQYCLALLELNGIGFSTAECESQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGHSFSFTSSDDIAEVL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
490 500 510 520 530
pF1KB7 FGKLKL----HLLSQ--RNSL--PRTG--------LQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKII
: .::: .. .: ...: : : : . :::. ::: :. ::::: .:
XP_011 FLELKLPPNREMKNQGSKKTLGSTRRGIDNGRKLRLGRQFSTSKDVLNKLKALHPLPGLI
1380 1390 1400 1410 1420 1430
540 550 560 570 580
pF1KB7 LEYRQVHKIKSTFVDGLL--ACMKKG-SISSTW--NQTGTVTGRLSAKHPNIQGIS----
::.:.. . . : : :.. .. . .:. :.:::.. .::::..
XP_011 LEWRRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQNVPRDFE
1440 1450 1460 1470 1480 1490
590 600 610
pF1KB7 -KHPIQI--TTPKNF---------KGKEDKILTISPRAM---------------------
: : . . :.. .:: : ....:: .
XP_011 IKMPTLVGESPPSQAVGKGLLPMGRGKYKKGFSVNPRCQAQMEERAADRGMPFSISMRHA
1500 1510 1520 1530 1540 1550
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 FVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQWKDVPVEQVT
:: : ..::::.::.:::::.::: : .:..... . ::: .....:: . :.:
XP_011 FVPFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQVLNTGA--DVFRSIAAEWKMIEPESVG
1560 1570 1580 1590 1600 1610
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 HADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKDFARAAIAQCH
:.:.:.. :...:: : . :. .:. ..:: ...:: ..: :..: .. .:.
XP_011 DDLRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGEQMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCK
1620 1630 1640 1650 1660 1670
740 750 760 770 780
pF1KB7 QTGCVVSIMGRRRPLPRIHAHDQQLRAQAERQAVNFVVQGSAADLCKLAMIHV------F
. : : .:.:::: :: :. .. .:.:::::.: .:::::::. :.: ... :
XP_011 RDGFVQTILGRRRYLPGIKDNNPYRKAHAERQAINTIVQGSAADIVKIATVNIQKQLETF
1680 1690 1700 1710 1720 1730
790 800 810
pF1KB7 TAVAASHT-------------LTAR--------------LVAQIHDELLFEVEDPQIPEC
.. :: :. . .. :.:::::.:: . .. .
XP_011 HSTFKSHGHREGMLQSDQTVGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEEDVVQV
1740 1750 1760 1770 1780 1790
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 AALVRRTMESLEQVQALELQLQVPLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNS
: .:. ::: ..:.: :::... : :::.:
XP_011 AQIVKNEMES-------AVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV
1800 1810 1820
880 890 900
pF1KB7 LAAPGSPASTQPPPLHFSPSFCL
>>XP_016861054 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymerase (2201 aa)
initn: 947 init1: 357 opt: 477 Z-score: 435.4 bits: 93.1 E(85289): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 781; 29.4% identity (58.4% similar) in 608 aa overlap (348-855:1598-2196)
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 CFNAKDFVRIVLQFFGNDGSWKHVADFIGLDPRIAAWLIDPSDATPSFEDLVEKYCEKSI
::..: ::.::.. :.....: .. . .
XP_016 KECSVVIYDFIQSYKILLLSCGISLEQSYEDPKVACWLLDPDSQEPTLHSIVTSFLPHEL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
380 390 400 410 420
pF1KB7 TV--KVNSTYGNSSRNIVNQN-----VRENLKTLYRL-TMD-LCSKLKDYGLWQLFRTLE
. .... : .: .. . : ..... . .:. : : :. .: ..:: .:
XP_016 PLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVESILIFNSMNQLNSLLQKENLQDVFRKVE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITSNNQLREIL
.: ::..: ..: . : :. . .. :.: .: .:. .::. : .::.... :.:
XP_016 MPSQYCLALLELNGIGFSTAECESQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGHSFSFTSSDDIAEVL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
490 500 510 520 530
pF1KB7 FGKLKL----HLLSQ--RNSL--PRTG--------LQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKII
: .::: .. .: ...: : : : . :::. ::: :. ::::: .:
XP_016 FLELKLPPNREMKNQGSKKTLGSTRRGIDNGRKLRLGRQFSTSKDVLNKLKALHPLPGLI
1750 1760 1770 1780 1790 1800
540 550 560 570 580
pF1KB7 LEYRQVHKIKSTFVDGLL--ACMKKG-SISSTW--NQTGTVTGRLSAKHPNIQGIS----
::.:.. . . : : :.. .. . .:. :.:::.. .::::..
XP_016 LEWRRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQNVPRDFE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
590 600 610
pF1KB7 -KHPIQI--TTPKNF---------KGKEDKILTISPRAM---------------------
: : . . :.. .:: : ....:: .
XP_016 IKMPTLVGESPPSQAVGKGLLPMGRGKYKKGFSVNPRCQAQMEERAADRGMPFSISMRHA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 FVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQWKDVPVEQVT
:: : ..::::.::.:::::.::: : .:..... . ::: .....:: . :.:
XP_016 FVPFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQVLNTGA--DVFRSIAAEWKMIEPESVG
1930 1940 1950 1960 1970 1980
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 HADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKDFARAAIAQCH
:.:.:.. :...:: : . :. .:. ..:: ...:: ..: :..: .. .:.
XP_016 DDLRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGEQMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCK
1990 2000 2010 2020 2030 2040
740 750 760 770 780
pF1KB7 QTGCVVSIMGRRRPLPRIHAHDQQLRAQAERQAVNFVVQGSAADLCKLAMIHV------F
. : : .:.:::: :: :. .. .:.:::::.: .:::::::. :.: ... :
XP_016 RDGFVQTILGRRRYLPGIKDNNPYRKAHAERQAINTIVQGSAADIVKIATVNIQKQLETF
2050 2060 2070 2080 2090 2100
790 800 810
pF1KB7 TAVAASHT-------------LTAR--------------LVAQIHDELLFEVEDPQIPEC
.. :: :. . .. :.:::::.:: . .. .
XP_016 HSTFKSHGHREGMLQSDQTVGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEEDVVQV
2110 2120 2130 2140 2150 2160
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 AALVRRTMESLEQVQALELQLQVPLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNS
: .:. ::: ..:.: :::... : :::.:
XP_016 AQIVKNEMES-------AVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV
2170 2180 2190 2200
880 890 900
pF1KB7 LAAPGSPASTQPPPLHFSPSFCL
>>XP_011510650 (OMIM: 604419) PREDICTED: DNA polymerase (2420 aa)
initn: 947 init1: 357 opt: 477 Z-score: 434.8 bits: 93.1 E(85289): 1.8e-17
Smith-Waterman score: 781; 29.4% identity (58.4% similar) in 608 aa overlap (348-855:1817-2415)
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 CFNAKDFVRIVLQFFGNDGSWKHVADFIGLDPRIAAWLIDPSDATPSFEDLVEKYCEKSI
::..: ::.::.. :.....: .. . .
XP_011 KECSVVIYDFIQSYKILLLSCGISLEQSYEDPKVACWLLDPDSQEPTLHSIVTSFLPHEL
1790 1800 1810 1820 1830 1840
380 390 400 410 420
pF1KB7 TV--KVNSTYGNSSRNIVNQN-----VRENLKTLYRL-TMD-LCSKLKDYGLWQLFRTLE
. .... : .: .. . : ..... . .:. : : :. .: ..:: .:
XP_011 PLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVESILIFNSMNQLNSLLQKENLQDVFRKVE
1850 1860 1870 1880 1890 1900
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITSNNQLREIL
.: ::..: ..: . : :. . .. :.: .: .:. .::. : .::.... :.:
XP_011 MPSQYCLALLELNGIGFSTAECESQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGHSFSFTSSDDIAEVL
1910 1920 1930 1940 1950 1960
490 500 510 520 530
pF1KB7 FGKLKL----HLLSQ--RNSL--PRTG--------LQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKII
: .::: .. .: ...: : : : . :::. ::: :. ::::: .:
XP_011 FLELKLPPNREMKNQGSKKTLGSTRRGIDNGRKLRLGRQFSTSKDVLNKLKALHPLPGLI
1970 1980 1990 2000 2010 2020
540 550 560 570 580
pF1KB7 LEYRQVHKIKSTFVDGLL--ACMKKG-SISSTW--NQTGTVTGRLSAKHPNIQGIS----
::.:.. . . : : :.. .. . .:. :.:::.. .::::..
XP_011 LEWRRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQNVPRDFE
2030 2040 2050 2060 2070 2080
590 600 610
pF1KB7 -KHPIQI--TTPKNF---------KGKEDKILTISPRAM---------------------
: : . . :.. .:: : ....:: .
XP_011 IKMPTLVGESPPSQAVGKGLLPMGRGKYKKGFSVNPRCQAQMEERAADRGMPFSISMRHA
2090 2100 2110 2120 2130 2140
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 FVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQWKDVPVEQVT
:: : ..::::.::.:::::.::: : .:..... . ::: .....:: . :.:
XP_011 FVPFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQVLNTGA--DVFRSIAAEWKMIEPESVG
2150 2160 2170 2180 2190 2200
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 HADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKDFARAAIAQCH
:.:.:.. :...:: : . :. .:. ..:: ...:: ..: :..: .. .:.
XP_011 DDLRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGEQMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCK
2210 2220 2230 2240 2250 2260
740 750 760 770 780
pF1KB7 QTGCVVSIMGRRRPLPRIHAHDQQLRAQAERQAVNFVVQGSAADLCKLAMIHV------F
. : : .:.:::: :: :. .. .:.:::::.: .:::::::. :.: ... :
XP_011 RDGFVQTILGRRRYLPGIKDNNPYRKAHAERQAINTIVQGSAADIVKIATVNIQKQLETF
2270 2280 2290 2300 2310 2320
790 800 810
pF1KB7 TAVAASHT-------------LTAR--------------LVAQIHDELLFEVEDPQIPEC
.. :: :. . .. :.:::::.:: . .. .
XP_011 HSTFKSHGHREGMLQSDQTVGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEEDVVQV
2330 2340 2350 2360 2370 2380
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 AALVRRTMESLEQVQALELQLQVPLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNS
: .:. ::: ..:.: :::... : :::.:
XP_011 AQIVKNEMES-------AVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV
2390 2400 2410 2420
880 890 900
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10 20 30
pF1KB7 MENYEALVGFDLCNTPLSSVAQKIMSAMHSGDLVDSKTW
.: ..:: . : :. :. .. :.
XP_011 EKSKLTGTRQNHSFIWSGASFDLSPGLQRILDKVSSPLENEKLKSMTINFSS--LNRKN-
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pF1KB7 GKSTETMEVINKSSVKYSVQLEDRKTQSPEKKDLKSLRSQTSRG-SAKLSPQSFSVRLTD
. .: .:::.. .: .:: . .... :. .. :...... ...: :.. : . :
XP_011 TELNEEQEVISNLETK-QVQGISFSSNNEVKSKIEMLENNANHDETSSLLPRKESNIVDD
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. . : :.::. . : : . .::: :.: .:.
XP_011 NGLIPPTPIPTSASKLTFPGILETPVNPWKTNNVLQPGESYLFGSPSDIKNHDLSPGSRN
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pF1KB7 HFLMENINNENKGSINLKRKHITYNNLSEKTSKQMALEEDTDDAEGYLNSGNSGALKKHF
: .. .... :..:.. . . : ..:..... . ..: . . . . ::.:
XP_011 GFKDNSPISDTSFSLQLSQDGLQLTPAS-SSSESLSIIDVASDQNLFQTFIKEWRCKKRF
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pF1KB7 -----CD-IRHLDDWAKSQLIEMLKQAAALVITVMYTDGSTQLGADQTPVSSVRGIVV--
:. :: : . . . .:::.. . :: : :.: : :..:
XP_011 SISLACEKIRSLTSSKTATIGSRFKQASSPQEIPIRDDGFPIKGCDDTLVV---GLAVCW
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. : : :. .: : : :: . .. . .: . .
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. : . .: :. .. . .:.: : : .. . ::..: ::.::.. :
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.....: .. . . . .... : .: .. . : ..... . .:. : :
XP_011 TLHSIVTSFLPHELPLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVESILIFNSMNQLNSL
2010 2020 2030 2040 2050 2060
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pF1KB7 LKDYGLWQLFRTLELPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGE
:. .: ..:: .:.: ::..: ..: . : :. . .. :.: .: .:. .::.
XP_011 LQKENLQDVFRKVEMPSQYCLALLELNGIGFSTAECESQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGH
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pF1KB7 RFLITSNNQLREILFGKLKLHLLSQRNSLPRTGLQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKIILE
: .::.... .: ::: :. ::::: .:::
XP_011 SFSFTSSDDI------------------------------AEDVLNKLKALHPLPGLILE
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pF1KB7 YRQVHKIKSTFVDGLL--ACMKKG-SISSTW--NQTGTVTGRLSAKHPNIQGIS-----K
.:.. . . : : :.. .. . .:. :.:::.. .::::.. :
XP_011 WRRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQNVPRDFEIK
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: . .: :.. .:: : ....:: . ::
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pF1KB7 SSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQWKDVPVEQVTHA
: ..::::.::.:::::.::: : .:..... . ::: .....:: . :.:
XP_011 PFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQVLNTGA--DVFRSIAAEWKMIEPESVGDD
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pF1KB7 DREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKDFARAAIAQCHQT
:.:.:.. :...:: : . :. .:. ..:: ...:: ..: :..: .. .:..
XP_011 LRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGEQMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCKRD
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: : .:.:::: :: :. .. .:.:::::.: .:::::::. :.: ... : .
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pF1KB7 VAASHT-------------LTAR--------------LVAQIHDELLFEVEDPQIPECAA
. :: :. . .. :.:::::.:: . .. . :
XP_011 TFKSHGHREGMLQSDQTVGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEEDVVQVAQ
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pF1KB7 LVRRTMESLEQVQALELQLQVPLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNSLA
.:. ::: ..:.: :::... : :::.:
XP_011 IVKNEMES-------AVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV
2520 2530 2540
880 890 900
pF1KB7 APGSPASTQPPPLHFSPSFCL
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::..: ::.::.. :.....: .. . .
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pF1KB7 TV--KVNSTYGNSSRNIVNQN-----VRENLKTLYRL-TMD-LCSKLKDYGLWQLFRTLE
. .... : .: .. . : ..... . .:. : : :. .: ..:: .:
NP_955 PLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVESILIFNSMNQLNSLLQKENLQDVFRKVE
2020 2030 2040 2050 2060 2070
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pF1KB7 LPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITSNNQLREIL
.: ::..: ..: . : :. . .. :.: .: .:. .::. : .::.... :.:
NP_955 MPSQYCLALLELNGIGFSTAECESQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGHSFSFTSSDDIAEVL
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pF1KB7 FGKLKL----HLLSQ--RNSL--PRTG--------LQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKII
: .::: .. .: ...: : : : . :::. ::: :. ::::: .:
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pF1KB7 LEYRQVHKIKSTFVDGLL--ACMKKG-SISSTW--NQTGTVTGRLSAKHPNIQGIS----
::.:.. . . : : :.. .. . .:. :.:::.. .::::..
NP_955 LEWRRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQNVPRDFE
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pF1KB7 -KHPIQI--TTPKNF---------KGKEDKILTISPRAM---------------------
: : . . :.. .:: : ....:: .
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2260 2270 2280 2290 2300 2310
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pF1KB7 FVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQWKDVPVEQVT
:: : ..::::.::.:::::.::: : .:..... . ::: .....:: . :.:
NP_955 FVPFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQVLNTGA--DVFRSIAAEWKMIEPESVG
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pF1KB7 HADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKDFARAAIAQCH
:.:.:.. :...:: : . :. .:. ..:: ...:: ..: :..: .. .:.
NP_955 DDLRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGEQMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCK
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. : : .:.:::: :: :. .. .:.:::::.: .:::::::. :.: ... :
NP_955 RDGFVQTILGRRRYLPGIKDNNPYRKAHAERQAINTIVQGSAADIVKIATVNIQKQLETF
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pF1KB7 TAVAASH-----------TLTAR---------------LVAQIHDELLFEVEDPQIPECA
.. :: : .: .. :.:::::.:: . .. . :
NP_955 HSTFKSHGHREGMLQSDQTGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEEDVVQVA
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.:. ::: ..:.: :::... : :::.:
NP_955 QIVKNEMES-------AVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV
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pF1KB7 CFNAKDFVRIVLQFFGNDGSWKHVADFIGLDPRIAAWLIDPSDATPSFEDLVEKYCEKSI
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XP_011 KECSVVIYDFIQSYKILLLSCGISLEQSYEDPKVACWLLDPDSQEPTLHSIVTSFLPHEL
1960 1970 1980 1990 2000 2010
380 390 400 410 420
pF1KB7 TV--KVNSTYGNSSRNIVNQN-----VRENLKTLYRL-TMD-LCSKLKDYGLWQLFRTLE
. .... : .: .. . : ..... . .:. : : :. .: ..:: .:
XP_011 PLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVESILIFNSMNQLNSLLQKENLQDVFRKVE
2020 2030 2040 2050 2060 2070
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LPLIPILAVMESHAIQVNKEEMEKTSALLGARLKELEQEAHFVAGERFLITSNNQLREIL
.: ::..: ..: . : :. . .. :.: .: .:. .::. : .::.... :.:
XP_011 MPSQYCLALLELNGIGFSTAECESQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGHSFSFTSSDDIAEVL
2080 2090 2100 2110 2120 2130
490 500 510 520 530
pF1KB7 FGKLKL----HLLSQ--RNSL--PRTG--------LQKYPSTSEAVLNALRDLHPLPKII
: .::: .. .: ...: : : : . :::. ::: :. ::::: .:
XP_011 FLELKLPPNREMKNQGSKKTLGSTRRGIDNGRKLRLGRQFSTSKDVLNKLKALHPLPGLI
2140 2150 2160 2170 2180 2190
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pF1KB7 LEYRQVHKIKSTFVDGLL--ACMKKG-SISSTW--NQTGTVTGRLSAKHPNIQGIS----
::.:.. . . : : :.. .. . .:. :.:::.. .::::..
XP_011 LEWRRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQNVPRDFE
2200 2210 2220 2230 2240 2250
590 600 610
pF1KB7 -KHPIQI--TTPKNF---------KGKEDKILTISPRAM---------------------
: : . . :.. .:: : ....:: .
XP_011 IKMPTLVGESPPSQAVGKGLLPMGRGKYKKGFSVNPRCQAQMEERAADRGMPFSISMRHA
2260 2270 2280 2290 2300 2310
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 FVSSKGHTFLAADFSQIELRILTHLSGDPELLKLFQESERDDVFSTLTSQWKDVPVEQVT
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XP_011 FVPFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQVLNTGA--DVFRSIAAEWKMIEPESVG
2320 2330 2340 2350 2360 2370
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 HADREQTKKVVYAVVYGAGKERLAACLGVPIQEAAQFLESFLQKYKKIKDFARAAIAQCH
:.:.:.. :...:: : . :. .:. ..:: ...:: ..: :..: .. .:.
XP_011 DDLRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGEQMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCK
2380 2390 2400 2410 2420 2430
740 750 760 770 780
pF1KB7 QTGCVVSIMGRRRPLPRIHAHDQQLRAQAERQAVNFVVQGSAADLCKLAMIHV------F
. : : .:.:::: :: :. .. .:.:::::.: .:::::::. :.: ... :
XP_011 RDGFVQTILGRRRYLPGIKDNNPYRKAHAERQAINTIVQGSAADIVKIATVNIQKQLETF
2440 2450 2460 2470 2480 2490
790 800 810
pF1KB7 TAVAASHT-------------LTAR--------------LVAQIHDELLFEVEDPQIPEC
.. :: :. . .. :.:::::.:: . .. .
XP_011 HSTFKSHGHREGMLQSDQTVGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEEDVVQV
2500 2510 2520 2530 2540 2550
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 AALVRRTMESLEQVQALELQLQVPLKVSLSAGRSWGHLVPLQEAWGPPPGPCRTESPSNS
: .:. ::: ..:.: :::... : :::.:
XP_011 AQIVKNEMES-------AVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV
2560 2570 2580 2590
880 890 900
pF1KB7 LAAPGSPASTQPPPLHFSPSFCL
900 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]