Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7305
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7305, 810 aa
1>>>pF1KB7305 810 - 810 aa - 810 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2621+/-0.00137; mu= -2.7363+/- 0.081
mean_var=307.8236+/-67.488, 0's: 0 Z-trim(108.1): 114 B-trim: 82 in 2/50
Lambda= 0.073101
statistics sampled from 9918 (10005) to 9918 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 5238 567.3 3.6e-161
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 2961 327.2 7e-89
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 2340 261.7 3.6e-69
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 2330 260.6 7.4e-69
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 890 108.9 4.8e-23
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 837 103.2 1.9e-21
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 589 77.2 1.9e-13
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 589 77.2 2e-13
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 589 77.2 2e-13
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 583 76.5 2.9e-13
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 525 70.3 1.5e-11
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 525 70.3 1.6e-11
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 505 67.9 4.1e-11
>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (810 aa)
initn: 5238 init1: 5238 opt: 5238 Z-score: 3007.1 bits: 567.3 E(32554): 3.6e-161
Smith-Waterman score: 5238; 100.0% identity (100.0% similar) in 810 aa overlap (1-810:1-810)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVTNKMTAAFRNPSGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVTNKMTAAFRNPSGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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CCDS30 SSASSNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQ
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SMPIKDQYSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 PFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESET
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KB7 EDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
790 800 810
>>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa)
initn: 3041 init1: 2909 opt: 2961 Z-score: 1709.2 bits: 327.2 E(32554): 7e-89
Smith-Waterman score: 5206; 98.7% identity (98.7% similar) in 821 aa overlap (1-810:1-821)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVTNKMTAAFRNPSGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MVTNKMTAAFRNPSGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SSASSNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSASSNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SMPIKDQYSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SMPIKDQYSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 KEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEK-----------HKCSSNYNEDFVLQLEKELVQ
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS76 KEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESASLADRLIQHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQ
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470 480 490 500 510 520
pF1KB7 ARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELR
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 QQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMME
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 METQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 METQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMA
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 VRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHELRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHELRC
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 LKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLD
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810
pF1KB7 PAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
790 800 810 820
>>CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (805 aa)
initn: 2989 init1: 2186 opt: 2340 Z-score: 1355.3 bits: 261.7 E(32554): 3.6e-69
Smith-Waterman score: 3272; 67.8% identity (83.1% similar) in 769 aa overlap (49-760:1-760)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
CCDS54 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
CCDS54 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
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pF1KB7 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
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pF1KB7 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
CCDS54 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
CCDS54 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
CCDS54 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
330 340 350 360 370 380
440 450
pF1KB7 LLKQRIETLEK----------------------------------HKCSSN---------
::::::::::: ..:::
CCDS54 LLKQRIETLEKESAALADRLIQGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQS
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KB7 -------------YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDE
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::
CCDS54 TIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDE
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 NNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNE
::.:.::::: :.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:
CCDS54 NNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGE
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 LQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQ
::::::..:::::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.::
CCDS54 LQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQ
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 NKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQ
:::: :::::..::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:
CCDS54 NKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQ
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 GQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSS
::::.:::.::: :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::
CCDS54 GQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSS
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 DEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPR
::... .::: :.
CCDS54 DEELLG-----VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQ
750 760 770 780 790 800
>>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (794 aa)
initn: 2972 init1: 2207 opt: 2330 Z-score: 1349.7 bits: 260.6 E(32554): 7.4e-69
Smith-Waterman score: 3294; 68.7% identity (84.3% similar) in 758 aa overlap (49-760:1-749)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
CCDS12 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS12 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
CCDS12 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
CCDS12 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
CCDS12 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
CCDS12 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
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CCDS41 DMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFD
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CCDS41 IIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEM
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CCDS41 DI-SKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHT
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CCDS41 K----IQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLL
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CCDS41 RDLNCNPNNKAKIGNKP
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