Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7302
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7302, 1251 aa
1>>>pF1KB7302 1251 - 1251 aa - 1251 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8705+/-0.00106; mu= -3.8027+/- 0.065
mean_var=396.1622+/-78.645, 0's: 0 Z-trim(116.0): 33 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.064437
statistics sampled from 16508 (16541) to 16508 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.508), width: 16
Scan time: 6.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42169.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1251) 8433 798.8 0
CCDS67042.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1245) 8370 793.0 0
CCDS6244.1 CNGB3 gene_id:54714|Hs108|chr8 ( 809) 2415 239.2 3.2e-62
CCDS45495.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 ( 299) 1998 200.1 6.9e-51
CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 676) 960 103.9 1.4e-21
CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 694) 944 102.4 4.1e-21
CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 690) 922 100.4 1.7e-20
CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 759) 922 100.4 1.8e-20
CCDS14701.1 CNGA2 gene_id:1260|Hs108|chrX ( 664) 881 96.6 2.3e-19
CCDS31408.1 CNGA4 gene_id:1262|Hs108|chr11 ( 575) 836 92.3 3.8e-18
>>CCDS42169.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1251 aa)
initn: 8433 init1: 8433 opt: 8433 Z-score: 4251.5 bits: 798.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8433; 100.0% identity (100.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1251)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETESESMPPEESFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETESESMPPEESFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSRRVLTWLMKGVEKVIPQPVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSRRVLTWLMKGVEKVIPQPVHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQDTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQDTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RDEPAVATGAASDPAPPGRPQEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RDEPAVATGAASDPAPPGRPQEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AQTSSLPPTRDPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTISILPGGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AQTSSLPPTRDPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTISILPGGQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EPDLVLEEVEPPWEDAHQDVSTSPQGTEVVPAYEEENKAVEKMPRELSRIEEEKEDEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPDLVLEEVEPPWEDAHQDVSTSPQGTEVVPAYEEENKAVEKMPRELSRIEEEKEDEEEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EEEEEEEEEEEVTEVLLDSCVVSQVGVGQSEEDGTRPQSTSDQKLWEEVGEEAKKEAEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEEEEEEEEEEVTEVLLDSCVVSQVGVGQSEEDGTRPQSTSDQKLWEEVGEEAKKEAEEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 AKEEAEEVAEEEAEKEPQDWAETKEEPEAEAEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AKEEAEEVAEEEAEKEPQDWAETKEEPEAEAEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 AEENPPSTVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEENPPSTVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 PTTPKDTDGQDRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PTTPKDTDGQDRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SPAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 FFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGGD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 IITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 KTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDST
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 VKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 ALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 TLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 RRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 ALEAAAKQQELVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALEAAAKQQELVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 PPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKAE
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS67042.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1245 aa)
initn: 7132 init1: 7132 opt: 8370 Z-score: 4219.9 bits: 793.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8370; 99.5% identity (99.5% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1245)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETESESMPPEESFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETESESMPPEESFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSRRVLTWLMKGVEKVIPQPVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSRRVLTWLMKGVEKVIPQPVHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQDTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQDTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RDEPAVATGAASDPAPPGRPQEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQ
:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RDEPAVAT------APPGRPQEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQ
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AQTSSLPPTRDPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTISILPGGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AQTSSLPPTRDPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTISILPGGQV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EPDLVLEEVEPPWEDAHQDVSTSPQGTEVVPAYEEENKAVEKMPRELSRIEEEKEDEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EPDLVLEEVEPPWEDAHQDVSTSPQGTEVVPAYEEENKAVEKMPRELSRIEEEKEDEEEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EEEEEEEEEEEVTEVLLDSCVVSQVGVGQSEEDGTRPQSTSDQKLWEEVGEEAKKEAEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EEEEEEEEEEEVTEVLLDSCVVSQVGVGQSEEDGTRPQSTSDQKLWEEVGEEAKKEAEEK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 AKEEAEEVAEEEAEKEPQDWAETKEEPEAEAEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AKEEAEEVAEEEAEKEPQDWAETKEEPEAEAEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLM
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 AEENPPSTVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AEENPPSTVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSD
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550 560 570 580 590 600
pF1KB7 PTTPKDTDGQDRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PTTPKDTDGQDRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKP
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SPAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SPAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWL
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 FFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGGD
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 IITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLE
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAV
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 KTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDST
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 VKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKV
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 ALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLV
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 TLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 RRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 ALEAAAKQQELVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ALEAAAKQQELVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSP
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 PPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKAE
1200 1210 1220 1230 1240
>>CCDS6244.1 CNGB3 gene_id:54714|Hs108|chr8 (809 aa)
initn: 2219 init1: 2136 opt: 2415 Z-score: 1230.6 bits: 239.2 E(32554): 3.2e-62
Smith-Waterman score: 2428; 46.2% identity (72.2% similar) in 853 aa overlap (409-1248:14-809)
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 SCVVSQVGVGQSEEDGTRPQSTSDQKLWEEVGEEAKKEAEEKAKEEAEEVAEEEAEKEPQ
.::. ..: . .::. . ... . :
CCDS62 MFKSLTKVNKVKPIGENNENEQSSRRNEEGSHPSNQSQQTTAQ
10 20 30 40
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 DWAETKEEPEAEAEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLMAEENPPSTVLPPPSPAKS
. :.: : : ....:.:...:.....: ....: . . :.: ..
CCDS62 E--ENKGE---EKSLKTKSTPVTSEEPHTNIQDK-------LSKKNSSGDLTTNPDPQNA
50 60 70 80 90
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 DTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSDPTTPKDTDGQDRAASTAS
. .:: .: : : ..:.. :..: :.. ..
CCDS62 ------AEPTGT----VP-------EQKEMDPGKE------GPNSP-----QNKPPAAPV
100 110 120
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 TNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKPSPAKKAPEPAPDTKPAEA
: . .:..::: ...:: :.::.. :..: :. :: : .: .: ..
CCDS62 INE-YADAQLHNLVKRMRQRTALYKKKLVEGDLSS----PEASPQTAKPTAVPPVKESDD
130 140 150 160 170
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 EPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKY----QFPQSIDPLTNLMYVLWLFFVVMAWNWNCWLI
.:.: :: .: : :. : .: ..:.::: :. .:.:::..:..:.:::: .:
CCDS62 KPTE--HYYRLLWFKVKKMPLTEYLKRIKLPNSIDSYTDRLYLLWLLLVTLAYNWNCCFI
180 190 200 210 220 230
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 PVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGGDIITDKKDMRNNYLK
:.: .::::: ::::.::. : .::.::. :. .: :::::::::::.:....:..:
CCDS62 PLRLVFPYQTADNIHYWLIADIICDIIYLYDMLFIQPRLQFVRGGDIIVDSNELRKHYRT
240 250 260 270 280 290
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 SRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLESILSKAYVYRVIRT
: .:..:. :..:.:. :: : ::..: : ::: .::::: .::::..:::.::::::
CCDS62 STKFQLDVASIIPFDICYLFFGFNPMFRANRMLKYTSFFEFNHHLESIMDKAYIYRVIRT
300 310 320 330 340 350
800 810 820 830 840 850
pF1KB7 TAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKT
:.:::. ::.:.:.::::: :.:.:.:.::::: :: :.::::.::.:::::::::.:.:
CCDS62 TGYLLFILHINACVYYWASNYEGIGTTRWVYDGEGNEYLRCYYWAVRTLITIGGLPEPQT
360 370 380 390 400 410
860 870 880 890 900 910
pF1KB7 LFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQ
::::::::::.:.:::.:: .:::::::.:::::.:.:.:.:::.:. ::: :.::: ::
CCDS62 LFEIVFQLLNFFSGVFVFSSLIGQMRDVIGAATANQNYFRACMDDTIAYMNNYSIPKLVQ
420 430 440 450 460 470
920 930 940 950 960 970
pF1KB7 NRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDM
.::.::::::: :: :::::.:. :: ..: ::::::..:.::: ::.::: :::.::
CCDS62 KRVRTWYEYTWDSQRMLDESDLLKTLPTTVQLALAIDVNFSIISKVDLFKGCDTQMIYDM
480 490 500 510 520 530
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB7 LKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLL
: ::.::.:::.:.::::::::.:::::. :.::::::::: .:::::::::::::::::
CCDS62 LLRLKSVLYLPGDFVCKKGEIGKEMYIIKHGEVQVLGGPDGTKVLVTLKAGSVFGEISLL
540 550 560 570 580 590
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 AVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKARRMLRSNNK-----
:.:::::::::::::::.::. :::: :.:::::::.:...: :::: .:... :
CCDS62 AAGGGNRRTANVVAHGFANLLTLDKKTLQEILVHYPDSERILMKKARVLLKQKAKTAEAT
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pF1KB7 PKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELAALEAAAKQQ
: .. .:..::. :::::.. :. ::: ..::.: .::. : . ...
CCDS62 PPRKDLALLFPPKEETPKLFKTLLGGTGK--------ASLARL-LKLKREQAAQKKENSE
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pF1KB7 ELVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPP--SSPPPASLGR
:..: ..: . :. . ... . :: : : : : : . : .. : : .
CCDS62 GGEEEGKENEDKQKENEDKQKENEDKGKENE-DKDKGREPEEKPLDRPECTASPIAVEEE
710 720 730 740 750 760
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pF1KB7 PEGEEEG--PAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKAE
:.. .. : ..:. : :.:. : ::..:.... :. ..
CCDS62 PHSVRRTVLPRGTSRQSLIISMAPSAEGGEEVLTIEVKEKAKQ
770 780 790 800
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CCDS45 MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETESESMPPEESFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSRRVLTWLMKGVEKVIPQPVHS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQDTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RDEPAVATGAASDPAPPGRPQEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQ
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CCDS45 AQTSSLPPTRDPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTRVMGAGGL
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CCDS42 SFPDRFRGAELKEVSSQESNAQANVGSQEPADRGR---------RKKTKKKDAI--VVDP
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pF1KB7 MAFFEFNSRLESILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVG
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CCDS42 SRLFEFFDRTETRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNIS
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pF1KB7 --------NSYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRD
.:: :... :: ::: : : : .: ......::. :....:.. .
CCDS42 IPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGS
330 340 350 360 370 380
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pF1KB7 VVGAATAGQTYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLP
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CCDS42 MISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLP
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CCDS42 DKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYI
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CCDS42 INEGKLAVVAD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLS
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: :: : :..:::..: :..:.:..: ..: :: . :::. :: .. . . :
CCDS42 KDDLMEALTEYPEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELA------RAGADPKDLEEKVEQLG
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. . . ..:.: : : : . ::. .: :.:.. : .: . :
CCDS42 S--SLDTLQTRFARL---LAEYNATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKT
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CCDS42 EDKQQ
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pF1KB7 DSCPLMAEENPPSTVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESP
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CCDS20 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSS
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: : : . : :. .. : . : :. . . . ... ::
CCDS20 SFPDRFRGAELKEVSSQESNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKK
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. .:: .::.: :: ... .: .:. : : . . ::..:: :..
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: ::. : ..: :.. : ...: . . ..: . .::.:.:::.: :. :::::.: :
CCDS20 YVLDVLV-RARTGFLEQGLMVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPE
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pF1KB7 LRLPRCLKYMAFFEFNSRLESILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGS
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CCDS20 VRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGT
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::: ... .:: :... :: ::: : : : .: ......::. :
CCDS20 DSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIF
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pF1KB7 SVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLD
....:.. .... .:... ... .:: .::.: :. :....:: :..: : .. .:
CCDS20 ATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVD
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pF1KB7 ESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKK
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CCDS20 EKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKK
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pF1KB7 GEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGG---GNRRTANVVAH
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CCDS20 GDIGKEMYIINEGKLAVVAD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSI
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pF1KB7 GFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGT-PKL
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CCDS20 GYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELA------RAGADPKD
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pF1KB7 FNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELAALEAAAKQQ--ELVEQAKSSQDVKGEEG
.. . . :. . . ..:.: : : : . ::. .: :.:.. : .:
CCDS20 LEEKVEQLGS--SLDTLQTRFARL---LAEYNATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADG
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pF1KB7 SAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSPPPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRIC
. :
CCDS20 EVPGDATKTEDKQQ
690
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CCDS43 QQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSASTSEESENENPHARGSFSYKSLR
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pF1KB7 KDTDGQDRA---ASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKPS
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CCDS43 KGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQEP----EEKKKKKKEKKSKSD---DKNENKND
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pF1KB7 PAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWLF
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CCDS43 PEKKKKK-----KDKEKKKKEE---------KSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYN-WLF
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pF1KB7 FVVMA--WNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGG
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CCDS43 CITLPVMYNWT--MVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFV-RTRTGYLEQG
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pF1KB7 DIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVN-PLLRLPRCLKYMAFFEFNSR
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CCDS43 LLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQR
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:. . ..:. . :.. .: :.:..: : :.:. ::: ...
CCDS43 TETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLAR
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CCDS43 KYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAAR
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pF1KB7 TYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAI
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CCDS43 AEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAI
410 420 430 440 450 460
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pF1KB7 DVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVL
.:. . ..:: .: :. .. ... .:. :: :.::.::::.::::::::. :.. :.
CCDS43 NVHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVV
470 480 490 500 510 520
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pF1KB7 GGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGG---GNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILV
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CCDS43 AD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALT
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CCDS43 EYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILA
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pF1KB7 STVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVV--AWSDPTTP
::::.. . : :.: . ..: .
CCDS47 QQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSASTSEESENENPHARGSFSYKSLR
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pF1KB7 KDTDGQDRA---ASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKPS
: .: . .. : : ... :: .:. .: ::: : :.. : .
CCDS47 KGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQEP----EEKKKKKKEKKSKSD---DKNENKND
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CCDS47 PEKKKKK-----KDKEKKKKEE---------KSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYN-WLF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]