Result of FASTA (omim) for
pF1KB7299
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7299, 1224 aa
1>>>pF1KB7299 1224 - 1224 aa - 1224 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7460+/-0.000376; mu= 18.4724+/- 0.024
mean_var=150.4236+/-29.873, 0's: 0 Z-trim(119.5): 339 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.104572
statistics sampled from 33112 (33512) to 33112 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.393), width: 16
Scan time: 15.810
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_620687 (OMIM: 607510) A disintegrin and metallo (1224) 8841 1346.5 0
NP_955387 (OMIM: 607512,615458) A disintegrin and (1221) 5035 772.3 0
NP_001313287 (OMIM: 607512,615458) A disintegrin a (1049) 4595 705.8 3.6e-202
XP_011521225 (OMIM: 607512,615458) PREDICTED: A di (1049) 4595 705.8 3.6e-202
XP_011521226 (OMIM: 607512,615458) PREDICTED: A di ( 978) 3973 612.0 6.1e-174
XP_016878478 (OMIM: 607512,615458) PREDICTED: A di ( 809) 3862 595.1 5.9e-169
XP_016878477 (OMIM: 607512,615458) PREDICTED: A di ( 809) 3862 595.1 5.9e-169
NP_112217 (OMIM: 606184) A disintegrin and metallo (1594) 2209 346.0 1.1e-93
XP_011541423 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 863) 2203 344.9 1.4e-93
XP_011541419 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 966) 2203 344.9 1.5e-93
NP_922932 (OMIM: 605008) A disintegrin and metallo (1117) 2203 345.0 1.6e-93
XP_011541416 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr (1117) 2203 345.0 1.6e-93
XP_011541415 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr (1117) 2203 345.0 1.6e-93
NP_055087 (OMIM: 605009) A disintegrin and metallo (1686) 2159 338.5 2.2e-91
XP_005254194 (OMIM: 605009) PREDICTED: A disintegr (1689) 2159 338.5 2.2e-91
XP_016865394 (OMIM: 606184) PREDICTED: A disintegr (1631) 2119 332.5 1.4e-89
XP_016865395 (OMIM: 606184) PREDICTED: A disintegr (1467) 2109 330.9 3.7e-89
XP_011541425 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 738) 2064 323.8 2.5e-87
XP_016882827 (OMIM: 277600,608990) PREDICTED: A di (1103) 2035 319.6 6.9e-86
NP_112219 (OMIM: 277600,608990) A disintegrin and (1103) 2035 319.6 6.9e-86
NP_891550 (OMIM: 605421) A disintegrin and metallo (1935) 1993 313.5 8.3e-84
XP_011537056 (OMIM: 611681) PREDICTED: A disintegr (1911) 1848 291.7 3.2e-77
XP_011541426 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 673) 1795 283.2 3.9e-75
NP_079279 (OMIM: 611681) A disintegrin and metallo (1910) 1709 270.7 6.5e-71
XP_005254929 (OMIM: 607511,613195) PREDICTED: A di (1122) 1698 268.8 1.4e-70
XP_006722980 (OMIM: 277600,608990) PREDICTED: A di ( 784) 1690 267.4 2.5e-70
XP_011541422 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 868) 1671 264.6 2e-69
XP_011541421 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 892) 1671 264.6 2e-69
NP_001305710 (OMIM: 605421) A disintegrin and meta (1907) 1639 260.1 9.8e-68
XP_016877464 (OMIM: 607511,613195) PREDICTED: A di (1166) 1611 255.7 1.3e-66
NP_598377 (OMIM: 607513) A disintegrin and metallo (1213) 1609 255.4 1.6e-66
XP_011541424 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 827) 1598 253.6 4e-66
XP_016882829 (OMIM: 277600,608990) PREDICTED: A di ( 624) 1509 240.0 3.6e-62
XP_016882828 (OMIM: 277600,608990) PREDICTED: A di ( 626) 1504 239.3 6.1e-62
XP_011541417 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr (1067) 1364 218.4 2e-55
XP_011541427 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 628) 1356 217.0 3.2e-55
XP_011530724 (OMIM: 605011) PREDICTED: A disintegr (1177) 1360 217.8 3.3e-55
XP_011530723 (OMIM: 605011) PREDICTED: A disintegr (1186) 1360 217.8 3.3e-55
NP_055058 (OMIM: 605011) A disintegrin and metallo (1205) 1360 217.8 3.3e-55
XP_011541418 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr (1021) 1356 217.2 4.5e-55
XP_011541549 (OMIM: 607513) PREDICTED: A disintegr ( 827) 1332 213.5 4.8e-54
XP_011541550 (OMIM: 607513) PREDICTED: A disintegr ( 827) 1332 213.5 4.8e-54
XP_016864663 (OMIM: 607513) PREDICTED: A disintegr ( 886) 1332 213.5 5e-54
XP_011541548 (OMIM: 607513) PREDICTED: A disintegr ( 984) 1332 213.5 5.4e-54
XP_011537602 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr (1056) 1319 211.6 2.2e-53
XP_016865552 (OMIM: 225410,604539) PREDICTED: A di (1046) 1305 209.5 9.5e-53
NP_055059 (OMIM: 225410,604539) A disintegrin and (1211) 1305 209.5 1.1e-52
XP_016875468 (OMIM: 611681) PREDICTED: A disintegr (1506) 1299 208.7 2.3e-52
XP_011537605 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 820) 1279 205.5 1.2e-51
NP_631894 (OMIM: 607506) A disintegrin and metallo (1226) 1279 205.6 1.6e-51
>>NP_620687 (OMIM: 607510) A disintegrin and metalloprot (1224 aa)
initn: 8841 init1: 8841 opt: 8841 Z-score: 7211.6 bits: 1346.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8841; 100.0% identity (100.0% similar) in 1224 aa overlap (1-1224:1-1224)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKPRARGWRGLAALWMLLAQVAEQAPACAMGPAAAAPGSPSVPRPPPPAERPGWMEKGEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 MKPRARGWRGLAALWMLLAQVAEQAPACAMGPAAAAPGSPSVPRPPPPAERPGWMEKGEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFHMDLRTSSSLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 DLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFHMDLRTSSSLVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSGMIRTEEADYFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 PGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSGMIRTEEADYFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWELAHQPLHSSDLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 RPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWELAHQPLHSSDLRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRSHRNEELNVETLVVVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRSHRNEELNVETLVVVDK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 TLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTIN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 EDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 KFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 LWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 TCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 TCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSRRF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 RGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDGICERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 RGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDGICERV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 GCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 VSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 ELLFQGRNPGVAWEYSMPRLGTEKQPPAQPSYTWAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ELLFQGRNPGVAWEYSMPRLGTEKQPPAQPSYTWAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDL
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910 920 930 940 950 960
pF1KB7 KFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 DSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 DSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 RAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 RAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 KYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 SCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAEKKDAFCKDYFHWCYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 SCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAEKKDAFCKDYFHWCYLV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KB7 PQHGMCSHKFYGKQCCKTCSKSNL
::::::::::::::::::::::::
NP_620 PQHGMCSHKFYGKQCCKTCSKSNL
1210 1220
>>NP_955387 (OMIM: 607512,615458) A disintegrin and meta (1221 aa)
initn: 4672 init1: 3042 opt: 5035 Z-score: 4108.4 bits: 772.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5035; 56.2% identity (79.7% similar) in 1226 aa overlap (9-1221:20-1219)
10 20 30 40
pF1KB7 MKPRARGWRGLAALWMLLAQVAEQAPACAMGPAAAAPGSPSVPRPPPPA
::::. :..::. : . :..: . : .
NP_955 MECALLLACAFPAAGSGPPRGLAG----LGRVAKALQLCCLCCASVAAALAS----DSSS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ERPGWMEKGEYDLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFH
: . .: .:. ::: :.:.::.:.:. :..:.. .. ::: :... ...:
NP_955 GASGLND--DYVFVTPVEVDSAGSYISHDILHNGRKKRSAQNAR-SSLHYRFSAFGQELH
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 MDLRTSSSLVAPGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSG
..:. :. ... ::::.::: :.. .: : . ::::: .:. .::::.::: ::::
NP_955 LELKPSA-ILSSHFIVQVLGKDGASETQK-PEVQQCFYQGFIRNDSSSSVAVSTCAGLSG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 MIRTEEADYFLRPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWEL-
.:::.. .... :::. :. . . .. .. ::::::..: . ..:..
NP_955 LIRTRKNEFLISPLPQLLAQEHNYSSPAGHHPHVLYKRTAEEKIQRYRGYPGSGRNYPGY
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 --AHQPLHSSDLRLGLP-----QKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSL
.: : :.:. : :::::::::::: :.:: :: .. ::: : : .::
NP_955 SPSHIP-HASQSRETEYHHRRLQKQHFCGRRKKYAPKPPTEDTYLRFDEYGSSGRPRRSA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LRSHRNEELNVETLVVVDKKMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVG
.:... ::::::::.::::...::. :.:::.::..::::.::::::::..::...:.
NP_955 GKSQKG--LNVETLVVADKKMVEKHGKGNVTTYILTVMNMVSGLFKDGTIGSDINVVVVS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 LILLEDEQPGLVISHHADHTLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDT
:::::.: ::.:.::::..:.:::::::.:.::.: ::::::::::.::::::::::::
NP_955 LILLEQEPGGLLINHHADQSLNSFCQWQSALIGKNGKRHDHAILLTGFDICSWKNEPCDT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 LGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEGNIMSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:.::::::::
NP_955 LGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNPCRKAEGNIMSPT
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 LAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQ
:.: ::::::: ::::::.::::: :: ::.:.:: . .::::.::::..:::.::::::
NP_955 LTGNNGVFSWSSCSRQYLKKFLSTPQAGCLVDEPKQAGQYKYPDKLPGQIYDADTQCKWQ
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 FGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEG
:: ::::: : : :::::.:::::.:..::::::::::::.:: .:::: :::::.:. :
NP_955 FGAKAKLCSLGFVKDICKSLWCHRVGHRCETKFMPAAEGTVCGLSMWCRQGQCVKFGELG
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 PKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCP
:.: ::.:: ::.:: :::::::::. . : :.::::..:: :: ::.: .::: . :
NP_955 PRPIHGQWSAWSKWSECSRTCGGGVKFQERHCNNPKPQYGGLFCPGSSRIYQLCNINPCN
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 RDSVDFRAAQCAEHNSRRFRGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDG
..:.:::: ::::.::. ::: :.:::::.::..: ::::: ::.:.:::..:.:::::
NP_955 ENSLDFRAQQCAEYNSKPFRGWFYQWKPYTKVEEEDRCKLYCKAENFEFFFAMSGKVKDG
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pF1KB7 CCKTCSKSNL
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XP_016 CCKSCTRKI
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NP_112 EEYITRFLDRGWGFCLDDIPKK-KGLKSKVIAPGVIYDVHHQCQLQYGPNATFCQE--VE
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NP_112 NVCQTLWCSVKGF-CRSKLDAAADGTQCGEKKWCMAGKCITVGKK-PESIPGGWGRWSPW
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NP_112 SHCSRTCGAGVQSAERLCNNPEPKFGGKYCTGERKRYRLCNVHPCRSEAPTFRQMQCSEF
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NP_112 DTVPYKNELYHWFPI--FNPAHPCELYCRPIDGQFSEKMLDAVIDGTPCFEGGNSRNVCI
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NP_112 NGICKMVGCDYEIDSNATEDRCGVCLGDGSSCQTVRKMF-KQKEGSGYVDIGLIPKGARD
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