FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7299, 1224 aa
1>>>pF1KB7299 1224 - 1224 aa - 1224 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5911+/-0.000893; mu= 19.5012+/- 0.055
mean_var=142.2298+/-27.769, 0's: 0 Z-trim(112.2): 112 B-trim: 51 in 1/49
Lambda= 0.107542
statistics sampled from 12839 (12960) to 12839 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 4.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224) 8841 1384.1 0
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CCDS3983.2 ADAMTS6 gene_id:11174|Hs108|chr5 (1117) 2203 354.1 1.1e-96
CCDS32303.1 ADAMTS7 gene_id:11173|Hs108|chr15 (1686) 2159 347.5 1.7e-94
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CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205) 1360 223.4 2.7e-57
CCDS4444.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 (1211) 1305 214.8 1e-54
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CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 ( 950) 1266 208.7 5.7e-53
CCDS7306.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1223) 1267 209.0 6.1e-53
CCDS33524.1 ADAMTS1 gene_id:9510|Hs108|chr21 ( 967) 1168 193.5 2.2e-48
CCDS10383.1 ADAMTS17 gene_id:170691|Hs108|chr15 (1095) 1110 184.6 1.2e-45
CCDS62529.1 ADAMTS10 gene_id:81794|Hs108|chr19 ( 590) 1021 170.5 1.1e-41
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CCDS30852.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 ( 877) 965 162.0 6.1e-39
CCDS955.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1074) 965 162.0 7.1e-39
CCDS41732.1 ADAMTS8 gene_id:11095|Hs108|chr11 ( 889) 888 150.0 2.4e-35
CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 ( 837) 827 140.5 1.7e-32
CCDS10238.2 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 (1018) 828 140.8 1.7e-32
CCDS6972.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1371) 825 140.4 2.9e-32
CCDS6970.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1427) 825 140.4 3e-32
CCDS72908.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1097) 797 136.0 5.1e-31
CCDS12071.1 ADAMTSL5 gene_id:339366|Hs108|chr19 ( 471) 733 125.7 2.7e-28
CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 ( 951) 700 120.9 1.5e-26
CCDS34311.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 ( 566) 657 114.0 1.1e-24
CCDS6485.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 ( 525) 632 110.1 1.5e-23
CCDS73773.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1682) 625 109.5 7.4e-23
CCDS10326.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1691) 625 109.5 7.4e-23
CCDS47954.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 (1762) 592 104.4 2.7e-21
CCDS32114.1 PAPLN gene_id:89932|Hs108|chr14 (1251) 572 101.1 1.8e-20
CCDS6971.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1340) 532 95.0 1.4e-18
CCDS66817.1 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 ( 658) 511 91.4 8e-18
>>CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224 aa)
initn: 8841 init1: 8841 opt: 8841 Z-score: 7414.7 bits: 1384.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8841; 100.0% identity (100.0% similar) in 1224 aa overlap (1-1224:1-1224)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKPRARGWRGLAALWMLLAQVAEQAPACAMGPAAAAPGSPSVPRPPPPAERPGWMEKGEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKPRARGWRGLAALWMLLAQVAEQAPACAMGPAAAAPGSPSVPRPPPPAERPGWMEKGEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFHMDLRTSSSLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFHMDLRTSSSLVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSGMIRTEEADYFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSGMIRTEEADYFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWELAHQPLHSSDLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWELAHQPLHSSDLRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRSHRNEELNVETLVVVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRSHRNEELNVETLVVVDK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTIN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLH
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pF1KB7 KFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKA
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pF1KB7 LWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSR
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610 620 630 640 650 660
pF1KB7 TCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSRRF
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pF1KB7 RGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDGICERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDGICERV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMN
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pF1KB7 VSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIV
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pF1KB7 ELLFQGRNPGVAWEYSMPRLGTEKQPPAQPSYTWAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELLFQGRNPGVAWEYSMPRLGTEKQPPAQPSYTWAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDL
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pF1KB7 KFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 DSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 RAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAE
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pF1KB7 KYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB7 SCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAEKKDAFCKDYFHWCYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAEKKDAFCKDYFHWCYLV
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1210 1220
pF1KB7 PQHGMCSHKFYGKQCCKTCSKSNL
::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQHGMCSHKFYGKQCCKTCSKSNL
1210 1220
>>CCDS10926.1 ADAMTS18 gene_id:170692|Hs108|chr16 (1221 aa)
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Smith-Waterman score: 5035; 56.2% identity (79.7% similar) in 1226 aa overlap (9-1221:20-1219)
10 20 30 40
pF1KB7 MKPRARGWRGLAALWMLLAQVAEQAPACAMGPAAAAPGSPSVPRPPPPA
::::. :..::. : . :..: . : .
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pF1KB7 ERPGWMEKGEYDLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFH
: . .: .:. ::: :.:.::.:.:. :..:.. .. ::: :... ...:
CCDS10 GASGLND--DYVFVTPVEVDSAGSYISHDILHNGRKKRSAQNAR-SSLHYRFSAFGQELH
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pF1KB7 MDLRTSSSLVAPGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSG
..:. :. ... ::::.::: :.. .: : . ::::: .:. .::::.::: ::::
CCDS10 LELKPSA-ILSSHFIVQVLGKDGASETQK-PEVQQCFYQGFIRNDSSSSVAVSTCAGLSG
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 MIRTEEADYFLRPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWEL-
.:::.. .... :::. :. . . .. .. ::::::..: . ..:..
CCDS10 LIRTRKNEFLISPLPQLLAQEHNYSSPAGHHPHVLYKRTAEEKIQRYRGYPGSGRNYPGY
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 --AHQPLHSSDLRLGLP-----QKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSL
.: : :.:. : :::::::::::: :.:: :: .. ::: : : .::
CCDS10 SPSHIP-HASQSRETEYHHRRLQKQHFCGRRKKYAPKPPTEDTYLRFDEYGSSGRPRRSA
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pF1KB7 LRSHRNEELNVETLVVVDKKMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVG
.:... ::::::::.::::...::. :.:::.::..::::.::::::::..::...:.
CCDS10 GKSQKG--LNVETLVVADKKMVEKHGKGNVTTYILTVMNMVSGLFKDGTIGSDINVVVVS
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pF1KB7 LILLEDEQPGLVISHHADHTLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDT
:::::.: ::.:.::::..:.:::::::.:.::.: ::::::::::.::::::::::::
CCDS10 LILLEQEPGGLLINHHADQSLNSFCQWQSALIGKNGKRHDHAILLTGFDICSWKNEPCDT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:.::::::::
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pF1KB7 LAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQ
:.: ::::::: ::::::.::::: :: ::.:.:: . .::::.::::..:::.::::::
CCDS10 LTGNNGVFSWSSCSRQYLKKFLSTPQAGCLVDEPKQAGQYKYPDKLPGQIYDADTQCKWQ
470 480 490 500 510 520
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pF1KB7 FGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEG
:: ::::: : : :::::.:::::.:..::::::::::::.:: .:::: :::::.:. :
CCDS10 FGAKAKLCSLGFVKDICKSLWCHRVGHRCETKFMPAAEGTVCGLSMWCRQGQCVKFGELG
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pF1KB7 PKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCP
:.: ::.:: ::.:: :::::::::. . : :.::::..:: :: ::.: .::: . :
CCDS10 PRPIHGQWSAWSKWSECSRTCGGGVKFQERHCNNPKPQYGGLFCPGSSRIYQLCNINPCN
590 600 610 620 630 640
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pF1KB7 RDSVDFRAAQCAEHNSRRFRGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDG
..:.:::: ::::.::. ::: :.:::::.::..: ::::: ::.:.:::..:.:::::
CCDS10 ENSLDFRAQQCAEYNSKPFRGWFYQWKPYTKVEEEDRCKLYCKAENFEFFFAMSGKVKDG
650 660 670 680 690 700
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pF1KB7 TPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQY
:::: .. .:::::.:: ::::. ::: :: :.::::.:.::.: ...::: ..:..:.:
CCDS10 TPCSPNKNDVCIDGVCELVGCDHELGSKAVSDACGVCKGDNSTCKFYKGLYLNQHKANEY
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pF1KB7 YHMVTIPSGARSIRIYEMNVSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRS
: .: ::.:::::.: :..::.::..::. ..:::.: :..::::.. :.::::.:.::
CCDS10 YPVVLIPAGARSIEIQELQVSSSYLAVRSLSQKYYLTGGWSIDWPGEFPFAGTTFEYQRS
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.:.:: : : :::::::. :.:.::.:::.::.:..:.. . ::: .:.:::.::.:
CCDS10 FNRPERLYAPGPTNETLVFEILMQGKNPGIAWKYALPKV-MNGTPPATKRPAYTWSIVQS
830 840 850 860 870 880
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pF1KB7 ECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSAC
::::::::: ..:. : :: . ::: :::. ::.::: :.. .:: : :.::.:
CCDS10 ECSVSCGGGYINVKAICLRDQNTQVNSSFCSAKTKPVTEPKICNAFSCPAYWMPGEWSTC
890 900 910 920 930 940
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pF1KB7 SRTCGGGAQSRPVQCTRRVHYDSEP-VPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAEC
:..:.:: ::: .::... ...: : :::: .:.. :::::..::: :: :::..:
CCDS10 SKACAGGQQSRKIQCVQKKPFQKEEAVLHSLCPVSTPTQVQACNSHACPPQWSLGPWSQC
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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CCDS32 CGVQVYPELESRRERW----EQRQQWRRPRLRR---LHQRSV-----SKEKWVETLVVAD
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