Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7288
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7288, 1211 aa
1>>>pF1KB7288 1211 - 1211 aa - 1211 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0374+/-0.000942; mu= 11.3872+/- 0.057
mean_var=180.6848+/-36.149, 0's: 0 Z-trim(112.8): 90 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.095414
statistics sampled from 13386 (13477) to 13386 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 5.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4444.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 (1211) 8627 1200.7 0
CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205) 4441 624.5 4.9e-178
CCDS7306.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1223) 4202 591.6 3.9e-168
CCDS7307.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1226) 4192 590.2 1e-167
CCDS34311.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 ( 566) 3788 534.3 3.1e-151
CCDS2903.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1935) 1649 240.3 3.5e-62
CCDS82801.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1907) 1612 235.2 1.2e-60
CCDS31778.2 ADAMTS20 gene_id:80070|Hs108|chr12 (1910) 1603 234.0 2.8e-60
CCDS4146.1 ADAMTS19 gene_id:171019|Hs108|chr5 (1207) 1472 215.8 5.2e-55
CCDS33524.1 ADAMTS1 gene_id:9510|Hs108|chr21 ( 967) 1443 211.7 7e-54
CCDS32303.1 ADAMTS7 gene_id:11173|Hs108|chr15 (1686) 1436 210.9 2.1e-53
CCDS34140.1 ADAMTS12 gene_id:81792|Hs108|chr5 (1594) 1347 198.7 9.8e-50
CCDS10926.1 ADAMTS18 gene_id:170692|Hs108|chr16 (1221) 1334 196.8 2.8e-49
CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 ( 950) 1324 195.3 5.9e-49
CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224) 1305 192.8 4.4e-48
CCDS13579.1 ADAMTS5 gene_id:11096|Hs108|chr21 ( 930) 1212 179.9 2.5e-44
CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 ( 837) 1151 171.5 7.9e-42
CCDS3983.2 ADAMTS6 gene_id:11174|Hs108|chr5 (1117) 1149 171.3 1.2e-41
CCDS12206.1 ADAMTS10 gene_id:81794|Hs108|chr19 (1103) 1061 159.2 5.2e-38
CCDS10383.1 ADAMTS17 gene_id:170691|Hs108|chr15 (1095) 972 146.9 2.5e-34
CCDS41732.1 ADAMTS8 gene_id:11095|Hs108|chr11 ( 889) 917 139.3 4.1e-32
CCDS6972.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1371) 875 133.7 3.2e-30
CCDS6970.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1427) 875 133.7 3.2e-30
CCDS6971.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1340) 708 110.7 2.6e-23
CCDS6485.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 ( 525) 602 95.8 3.1e-19
CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 ( 951) 587 93.9 2e-18
CCDS12071.1 ADAMTSL5 gene_id:339366|Hs108|chr19 ( 471) 506 82.5 2.7e-15
CCDS32114.1 PAPLN gene_id:89932|Hs108|chr14 (1251) 499 81.9 1.1e-14
CCDS30852.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 ( 877) 493 80.9 1.5e-14
CCDS955.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1074) 493 81.0 1.8e-14
CCDS73773.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1682) 467 77.6 3e-13
CCDS10326.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1691) 467 77.6 3e-13
CCDS10238.2 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 (1018) 444 74.2 1.8e-12
CCDS47954.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 (1762) 442 74.1 3.3e-12
CCDS72908.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1097) 404 68.7 8.7e-11
>>CCDS4444.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 (1211 aa)
initn: 8627 init1: 8627 opt: 8627 Z-score: 6423.9 bits: 1200.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8627; 100.0% identity (100.0% similar) in 1211 aa overlap (1-1211:1-1211)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDPPAGAARRLLCPALLLLLLLLPPPLLPPPPPPANARLAAAADPPGGPLGHGAERILAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDPPAGAARRLLCPALLLLLLLLPPPLLPPPPPPANARLAAAADPPGGPLGHGAERILAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PVRTDAQGRLVSHVVSAATSRAGVRARRAAPVRTPSFPGGNEEEPGSHLFYNVTVFGRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PVRTDAQGRLVSHVVSAATSRAGVRARRAAPVRTPSFPGGNEEEPGSHLFYNVTVFGRDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HLRLRPNARLVAPGATMEWQGEKGTTRVEPLLGSCLYVGDVAGLAEASSVALSNCDGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HLRLRPNARLVAPGATMEWQGEKGTTRVEPLLGSCLYVGDVAGLAEASSVALSNCDGLAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LIRMEEEEFFIEPLEKGLAAQEAEQGRVHVVYRRPPTSPPLGGPQALDTGASLDSLDSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIRMEEEEFFIEPLEKGLAAQEAEQGRVHVVYRRPPTSPPLGGPQALDTGASLDSLDSLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RALGVLEEHANSSRRRARRHAADDDYNIEVLLGVDDSVVQFHGKEHVQKYLLTLMNIVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RALGVLEEHANSSRRRARRHAADDDYNIEVLLGVDDSVVQFHGKEHVQKYLLTLMNIVNE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IYHDESLGAHINVVLVRIILLSYGKSMSLIEIGNPSQSLENVCRWAYLQQKPDTGHDEYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IYHDESLGAHINVVLVRIILLSYGKSMSLIEIGNPSQSLENVCRWAYLQQKPDTGHDEYH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DHAIFLTRQDFGPSGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSSAFVVAHETGHVLGMEHDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DHAIFLTRQDFGPSGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSSAFVVAHETGHVLGMEHDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QGNRCGDEVRLGSIMAPLVQAAFHRFHWSRCSQQELSRYLHSYDCLLDDPFAHDWPALPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QGNRCGDEVRLGSIMAPLVQAAFHRFHWSRCSQQELSRYLHSYDCLLDDPFAHDWPALPQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LPGLHYSMNEQCRFDFGLGYMMCTAFRTFDPCKQLWCSHPDNPYFCKTKKGPPLDGTMCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPGLHYSMNEQCRFDFGLGYMMCTAFRTFDPCKQLWCSHPDNPYFCKTKKGPPLDGTMCA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 PGKHCFKGHCIWLTPDILKRDGSWGAWSPFGSCSRTCGTGVKFRTRQCDNPHPANGGRTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGKHCFKGHCIWLTPDILKRDGSWGAWSPFGSCSRTCGTGVKFRTRQCDNPHPANGGRTC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SGLAYDFQLCSRQDCPDSLADFREEQCRQWDLYFEHGDAQHHWLPHEHRDAKERCHLYCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGLAYDFQLCSRQDCPDSLADFREEQCRQWDLYFEHGDAQHHWLPHEHRDAKERCHLYCE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 SRETGEVVSMKRMVHDGTRCSYKDAFSLCVRGDCRKVGCDGVIGSSKQEDKCGVCGGDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRETGEVVSMKRMVHDGTRCSYKDAFSLCVRGDCRKVGCDGVIGSSKQEDKCGVCGGDNS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 HCKVVKGTFTRSPKKHGYIKMFEIPAGARHLLIQEVDATSHHLAVKNLETGKFILNEEND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HCKVVKGTFTRSPKKHGYIKMFEIPAGARHLLIQEVDATSHHLAVKNLETGKFILNEEND
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 VDASSKTFIAMGVEWEYRDEDGRETLQTMGPLHGTITVLVIPVGDTRVSLTYKYMIHEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VDASSKTFIAMGVEWEYRDEDGRETLQTMGPLHGTITVLVIPVGDTRVSLTYKYMIHEDS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LNVDDNNVLEEDSVVYEWALKKWSPCSKPCGGGSQFTKYGCRRRLDHKMVHRGFCAALSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNVDDNNVLEEDSVVYEWALKKWSPCSKPCGGGSQFTKYGCRRRLDHKMVHRGFCAALSK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 PKAIRRACNPQECSQPVWVTGEWEPCSQTCGRTGMQVRSVRCIQPLHDNTTRSVHAKHCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PKAIRRACNPQECSQPVWVTGEWEPCSQTCGRTGMQVRSVRCIQPLHDNTTRSVHAKHCN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 DARPESRRACSRELCPGRWRAGPWSQCSVTCGNGTQERPVLCRTADDSFGICQEERPETA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DARPESRRACSRELCPGRWRAGPWSQCSVTCGNGTQERPVLCRTADDSFGICQEERPETA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 RTCRLGPCPRNISDPSKKSYVVQWLSRPDPDSPIRKISSKGHCQGDKSIFCRMEVLSRYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RTCRLGPCPRNISDPSKKSYVVQWLSRPDPDSPIRKISSKGHCQGDKSIFCRMEVLSRYC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 SIPGYNKLCCKSCNLYNNLTNVEGRIEPPPGKHNDIDVFMPTLPVPTVAMEVRPSPSTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SIPGYNKLCCKSCNLYNNLTNVEGRIEPPPGKHNDIDVFMPTLPVPTVAMEVRPSPSTPL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 EVPLNASSTNATEDHPETNAVDEPYKIHGLEDEVQPPNLIPRRPSPYEKTRNQRIQELID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EVPLNASSTNATEDHPETNAVDEPYKIHGLEDEVQPPNLIPRRPSPYEKTRNQRIQELID
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KB7 EMRKKEMLGKF
:::::::::::
CCDS44 EMRKKEMLGKF
1210
>>CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205 aa)
initn: 4410 init1: 3166 opt: 4441 Z-score: 3309.8 bits: 624.5 E(32554): 4.9e-178
Smith-Waterman score: 4732; 59.0% identity (78.3% similar) in 1136 aa overlap (49-1151:35-1105)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 LLLLLPPPLLPPPPPPANARLAAAADPPGGPLGHGAERILAVPVRTDAQGRLVSHVVSAA
:. . : :..:: :. .:: .::..::.
CCDS35 SLWLIAAALVEVRTSADGQAGNEEMVQIDLPIKRYREYELVTPVSTNLEGRYLSHTLSAS
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 TSRAGVRARRAAPVRTPSFPGGNEEEPGSHLFYNVTVFGRDLHLRLRPNARLVAPGATME
.. ..: . : .::.:.:.::.:.::::.::..::::::..:
CCDS35 HKKRSARDVSSNP---------------EQLFFNITAFGKDFHLRLKPNTQLVAPGAVVE
70 80 90 100
140 150 160 170
pF1KB7 WQ------G---------EKGTT-----RVEPLLGSCLYVGDVAGLAEASSVALSNCDGL
:. : . :.. :.::: .: ::::.. . ..:::.::::::
CCDS35 WHETSLVPGNITDPINNHQPGSATYRIRRTEPLQTNCAYVGDIVDIP-GTSVAISNCDGL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 AGLIRMEEEEFFIEPLEKGLAAQEAEQGRVHVVYRRPPT-SPPLGGPQALDTGAS-LDSL
::.:. ..::.::::::.: .: :.::.::::.: . . :. . . : :..:
CCDS35 AGMIKSDNEEYFIEPLERGKQMEE-EKGRIHVVYKRSAVEQAPIDMSKDFHYRESDLEGL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DSLSRALGVLEEHANSSRRRARRHAADDDYNIEVLLGVDDSVVQFHGKEHVQKYLLTLMN
:.:. . : .... : . :: ::::...:::::::::::::::.::::::::.:::::::
CCDS35 DDLGTVYGNIHQQLNETMRR-RRHAGENDYNIEVLLGVDDSVVRFHGKEHVQNYLLTLMN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IVNEIYHDESLGAHINVVLVRIILLSYGKSMSLIEIGNPSQSLENVCRWAYLQQKPDTGH
::::::::::::.::::::::.:.:.:.::.:::: ::::.::::::::: ::. : .:
CCDS35 IVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPSRSLENVCRWASQQQRSDLNH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 DEYHDHAIFLTRQDFGPSGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSSAFVVAHETGHVLGM
.:.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SEHHDHAIFLTRQDFGPAGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSSAFVVAHETGHVLGM
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 EHDGQGNRCGDEVRLGSIMAPLVQAAFHRFHWSRCSQQELSRYLHSYDCLLDDPFAHDWP
::::::::::::. .::.:::::::::::.:::::: :::.::.::::::::::: ::::
CCDS35 EHDGQGNRCGDETAMGSVMAPLVQAAFHRYHWSRCSGQELKRYIHSYDCLLDDPFDHDWP
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ALPQLPGLHYSMNEQCRFDFGLGYMMCTAFRTFDPCKQLWCSHPDNPYFCKTKKGPPLDG
::.:::..:::.::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KLPELPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRTFDPCKQLWCSHPDNPYFCKTKKGPPLDG
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 TMCAPGKHCFKGHCIWLTPDILKRDGSWGAWSPFGSCSRTCGTGVKFRTRQCDNPHPANG
: :: :: :.::::.: . . :.::.::.:. ::::::::::::.::::::.:: : ::
CCDS35 TECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQDGNWGSWTKFGSCSRTCGTGVRFRTRQCNNPMPING
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 GRTCSGLAYDFQLCSRQDCPDSLADFREEQCRQWDLYFEHGDAQHHWLPHEHRDAKERCH
:. : :. ...:::. ..: . ::: .::.: . .::. ...:::::.:: : :.:::
CCDS35 GQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFEDFRAQQCQQRNSHFEYQNTKHHWLPYEHPDPKKRCH
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 LYCESRETGEVVSMKRMVHDGTRCSYKDAFSLCVRGDCRKVGCDGVIGSSKQEDKCGVCG
:::.:.:::.:. ::..:::::.::::: .:.::::.: ::::: :::.: ::::::::
CCDS35 LYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHCSYKDPYSICVRGECVKVGCDKEIGSNKVEDKCGVCG
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 GDNSHCKVVKGTFTRSPKKHGYIKMFEIPAGARHLLIQEVDATSHHLAVKNLETGKFILN
::::::..:::::::.:.: ::.:::.:: ::::.:::: .:. : ::.:: ::..:::
CCDS35 GDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGARHVLIQEDEASPHILAIKNQATGHYILN
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 EENDVDASSKTFIAMGVEWEYRDEDGRETLQTMGPLHGTITVLVIPV-GDTRVSLTYKYM
... .:.:.::: .::::.: :: :.:.: :::: . ::.:: .::: ::::::.
CCDS35 GKGE-EAKSRTFIDLGVEWDYNIEDDIESLHTDGPLHDPVIVLIIPQENDTRSSLTYKYI
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 IHEDSL-NVDDNNVLEEDSVVYEWALKKWSPCSKPCGGGSQFTKYGCRRRLDHKMVHRGF
:::::. ....:::..:. ..:::::.:: :::::::: :.:::::::. :.:::::.:
CCDS35 IHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQCSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSF
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 CAALSKPKAIRRACNPQECSQPVWVTGEWEPCSQTCGRTGMQVRSVRCIQPLHDNTTRSV
: : .::: ::: :: :::..:.::. ::: :..::: .:.:.:.:::.::: :.:.:::
CCDS35 CEANKKPKPIRRMCNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSV
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 HAKHCNDARPESRRACSRELCPGRWRAGPWSQCSVTCGNGTQERPVLCRTADDSFGICQE
:.:.: :::::: :.: ::..:..::::.::::::.::. : ::::..: :.
CCDS35 HSKYCMGDRPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGEGTEVRQVLCRAGDH----CDG
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 ERPETARTCRLGPCPRNISDPSKKSYVVQWLSRPDPDSPIRKISSKGHCQGDKSIFCRME
:.::..:.:.: :: : : : :::::::.::
CCDS35 EKPESVRACQLPPCN---------------------DEP---------CLGDKSIFCQME
1010 1020 1030
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB7 VLSRYCSIPGYNKLCCKSCNLYNNLTNVEGRIEPPPG------KHNDIDVFMPT-LPVPT
::.:::::::::::::.::. .. ::: :.:. . :. ::
CCDS35 VLARYCSIPGYNKLCCESCSKRSSTL-------PPPYLLEAAETHDDV-ISNPSDLPRSL
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CCDS82 -RSINSATDPWPAFASSSSSSTSSQAHYRLSAFGQQFLFNLTANAGFIAPLFTVTLLGTP
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CCDS82 LSTAFTIAHELGHVFNMPHD-DNNKCKEEGVKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRKYIT
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CCDS82 HFNINGLLPNVRWVPKYSGILMKDRCKLFCRVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCG-QDTNDIC
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CCDS82 NIDVRQHSFSGETD-DDNYLALSSSK-GEFLLNG-NFVVTMAKREIRIGNAVVEYSGSET
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. : ... .. . . :. :: . .: :.:. .:. . : .
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>>CCDS31778.2 ADAMTS20 gene_id:80070|Hs108|chr12 (1910 aa)
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pF1KB7 G--EKGTTRVE--PL-LGSCLYVGDVAGLAEASSVALSNCDGLAGLIRMEEEEFFIEPLE
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CCDS31 GTPERGAWESDAGPSDLRHCFYRGQVNSQEDYKAV-VSLCGGLTGTFKGQNGEYFLEPIM
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pF1KB7 KGLAAQEAEQG--RVHVVYRRPPTSPPL--------GGPQALDTGASLDSLDSLSRALGV
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CCDS31 KA-DGNEYEDGHNKPHLIYRQDLNNSFLQTLKYCSVSESQIKETSLPFHTYSNMNEDLNV
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CCDS31 MKERVLGHTSKNVPLKDERRHSRKKRLISYPRYIEIMVTADAKVVSAHGS-NLQNYILTL
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CCDS31 MSIVATIYKDPSIGNLIHIVVVKLVMIHREEEGPVINF-DGATTLKNFCSWQQTQNDLDD
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: .:: :...::.:. : .: : . . .: :..:: .:.: :. :::..:::
CCDS31 VHPSHHDTAVLITREDICSSKEKCNMLGLSYLGTICDPLQSCFINEEKGLISAFTIAHEL
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pF1KB7 GHVLGMEHDGQGNRCGD-EVRLGSIMAPLVQAAFHRFHWSRCSQQELSRYLHS-Y-DCLL
::.::..:: .. :: . .: .::: .. . . :: ::.. ....: . : .:::
CCDS31 GHTLGVQHD-DNPRCKEMKVTKYHVMAPALSFHMSPWSWSNCSRKYVTEFLDTGYGECLL
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pF1KB7 DDPFAHDWPALP-QLPGLHYSMNEQCRFDFGLGYMMCTAFRTFDPCKQLWCSHPDNPYF-
: : .. :: .::: .:. :.::.. :: : .:: .. : .:::. .. .
CCDS31 DKP-DEEIYNLPSELPGSRYDGNKQCELAFGPGSQMCP---HINICMHLWCTSTEKLHKG
470 480 490 500 510 520
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pF1KB7 CKTKKGPPLDGTMCAPGKHCFKGHCIWLTPDILKRDGSWGAWSPFGSCSRTCGTGVKFRT
: :.. :: ::: :.:: :: .: :. . .: :: : :..::::::: :.. :
CCDS31 CFTQHVPPADGTDCGPGMHCRHGLCVNKETETRPVNGEWGPWEPYSSCSRTCGGGIESAT
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pF1KB7 RQCDNPHPANGGRTCSGLAYDFQLCSRQDCPDSLADFREEQCRQWDLYFEHGDAQH----
:.:. :.: ::: : : . :. :. ..:: . ::::.:: :. .: : .
CCDS31 RRCNRPEPRNGGNYCVGRRMKFRSCNTDSCPKGTQDFREKQCS--DFNGKHLDISGIPSN
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pF1KB7 -HWLP-HEHRDAKERCHLYCESRETGEVVSMKRMVHDGTRCSYKDAFSLCVRGDCRKVGC
.::: . .:.::.:::. :. .: ::.::: :. .. ..::.:.: .::
CCDS31 VRWLPRYSGIGTKDRCKLYCQVAGTNYFYLLKDMVEDGTPCG-TETHDICVQGQCMAAGC
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CCDS31 DHVLNSSAKIDKCGVCGGDNSSCKTITGVFNSS--HYGYNVVVKIPAGATNVDIRQYSYS
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CCDS31 GQPDDSYLALSDAE-GNFLFNGNFLLSTSKKEINVQGTRTVIEYSGSNNAVERINSTNRQ
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. . . :. ::. :. .: :.:. ::: : .. : : :.: :
CCDS31 EKELILQVLCVGNL-----YNPDVHY-SFNIP----LEERSDMFTWDPYGPWEGCTKMCQ
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CCDS31 G-LQRRNITCIHKSDHSVVSDKECDHLPLPSFVTQSCNT-DCELRWHVIGKSE-CSSQCG
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170 180 190 200 210
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CCDS41 EPLFMWTHTSWEDCDATCGGGERKTTVSCTKIMSKNISIVDNEKCKYLTKPEPQIRKCNE
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CCDS41 EGQDCMTVWEAGVWSECSVKCGKGIRHRTVRCTNPRKK---CVLSTRPREAEDCEDYSKC
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CCDS33 MAEFHGS-GLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVT-SNAAL
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CCDS33 VIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHD-DAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSP
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CCDS33 SWGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKT
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CCDS33 DFCTMAECS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]